MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptobacillus moniliformis DSM 12112 plasmid pSMON01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013516	TC	3	6	7	12	0 %	50 %	0 %	50 %	268687600
2	NC_013516	AT	3	6	479	484	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
3	NC_013516	TA	3	6	558	563	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
4	NC_013516	TA	3	6	796	801	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
5	NC_013516	TC	3	6	860	865	0 %	50 %	0 %	50 %	268687600
6	NC_013516	TA	3	6	1308	1313	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
7	NC_013516	TA	3	6	1455	1460	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
8	NC_013516	TA	3	6	2480	2485	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
9	NC_013516	AT	3	6	2570	2575	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
10	NC_013516	TA	3	6	2576	2581	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
11	NC_013516	AT	3	6	2728	2733	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
12	NC_013516	AT	3	6	2738	2743	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
13	NC_013516	AT	3	6	2833	2838	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
14	NC_013516	AT	3	6	2866	2871	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
15	NC_013516	TA	4	8	2980	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
16	NC_013516	AT	3	6	3010	3015	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
17	NC_013516	AT	3	6	3084	3089	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
18	NC_013516	TA	3	6	3176	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
19	NC_013516	AT	5	10	3270	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
20	NC_013516	AT	3	6	3530	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
21	NC_013516	AT	3	6	3578	3583	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
22	NC_013516	AT	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
23	NC_013516	AT	3	6	3722	3727	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
24	NC_013516	AT	3	6	3791	3796	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
25	NC_013516	TA	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
26	NC_013516	TA	3	6	4221	4226	50 %	50 %	0 %	0 %	268687603
27	NC_013516	AT	3	6	4284	4289	50 %	50 %	0 %	0 %	268687603
28	NC_013516	TA	3	6	4560	4565	50 %	50 %	0 %	0 %	268687603
29	NC_013516	AT	3	6	4956	4961	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
30	NC_013516	CT	3	6	5111	5116	0 %	50 %	0 %	50 %	268687604
31	NC_013516	TA	5	10	5538	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
32	NC_013516	TC	3	6	5598	5603	0 %	50 %	0 %	50 %	268687604
33	NC_013516	AT	3	6	5781	5786	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
34	NC_013516	TA	3	6	5892	5897	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
35	NC_013516	TA	3	6	5986	5991	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
36	NC_013516	AT	3	6	6123	6128	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
37	NC_013516	TA	4	8	6241	6248	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
38	NC_013516	AT	3	6	6352	6357	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
39	NC_013516	AT	3	6	6376	6381	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
40	NC_013516	TA	3	6	6394	6399	50 %	50 %	0 %	0 %	268687604
41	NC_013516	AT	5	10	6642	6651	50 %	50 %	0 %	0 %	268687605
42	NC_013516	AT	3	6	6656	6661	50 %	50 %	0 %	0 %	268687605
43	NC_013516	TA	3	6	7169	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	268687605
44	NC_013516	TA	3	6	7351	7356	50 %	50 %	0 %	0 %	268687605
45	NC_013516	AT	3	6	7594	7599	50 %	50 %	0 %	0 %	268687605
46	NC_013516	AT	3	6	7677	7682	50 %	50 %	0 %	0 %	268687605
47	NC_013516	TA	4	8	8512	8519	50 %	50 %	0 %	0 %	268687606
48	NC_013516	AT	3	6	8609	8614	50 %	50 %	0 %	0 %	268687606
49	NC_013516	TA	3	6	9823	9828	50 %	50 %	0 %	0 %	268687607

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.