MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptobacillus moniliformis DSM 12112 plasmid pSMON01

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013516	TTC	2	6	58	63	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
2	NC_013516	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
3	NC_013516	TCA	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687600
4	NC_013516	TAA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
5	NC_013516	TCT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
6	NC_013516	TGT	2	6	499	504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
7	NC_013516	TTG	2	6	652	657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
8	NC_013516	TAT	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
9	NC_013516	TCT	2	6	716	721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
10	NC_013516	TCT	2	6	746	751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
11	NC_013516	TTA	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
12	NC_013516	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
13	NC_013516	TTC	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
14	NC_013516	CAT	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687600
15	NC_013516	TAA	2	6	1122	1127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
16	NC_013516	AGC	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268687600
17	NC_013516	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
18	NC_013516	TAT	2	6	1261	1266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
19	NC_013516	TTC	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
20	NC_013516	TTC	2	6	1279	1284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
21	NC_013516	TTA	2	6	1379	1384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
22	NC_013516	AAT	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
23	NC_013516	TCA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687600
24	NC_013516	TTC	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
25	NC_013516	AAT	2	6	1756	1761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
26	NC_013516	TTC	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
27	NC_013516	AAT	2	6	1837	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
28	NC_013516	TTG	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
29	NC_013516	TTG	2	6	1866	1871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
30	NC_013516	CTT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687601
31	NC_013516	ATT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
32	NC_013516	TAC	2	6	2384	2389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687601
33	NC_013516	TAT	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
34	NC_013516	ATA	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
35	NC_013516	TAA	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
36	NC_013516	AAT	2	6	2504	2509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
37	NC_013516	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
38	NC_013516	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
39	NC_013516	ATA	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
40	NC_013516	AAT	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
41	NC_013516	TCA	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687601
42	NC_013516	TAT	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
43	NC_013516	ATA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
44	NC_013516	TTA	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
45	NC_013516	TCC	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268687602
46	NC_013516	ATA	2	6	3321	3326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
47	NC_013516	TAT	3	9	3462	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687602
48	NC_013516	AAT	2	6	3471	3476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
49	NC_013516	CTA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687602
50	NC_013516	CAT	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687602
51	NC_013516	TAA	2	6	3701	3706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
52	NC_013516	GTT	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687602
53	NC_013516	ATA	2	6	3842	3847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
54	NC_013516	ATT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
55	NC_013516	ATT	2	6	3952	3957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
56	NC_013516	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687603
57	NC_013516	ATT	3	9	4172	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
58	NC_013516	TTG	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687603
59	NC_013516	TTC	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687603
60	NC_013516	TAA	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
61	NC_013516	TAA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
62	NC_013516	ATA	2	6	4347	4352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
63	NC_013516	TAA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
64	NC_013516	AAT	2	6	4642	4647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
65	NC_013516	TTA	2	6	4650	4655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
66	NC_013516	ATT	2	6	4801	4806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
67	NC_013516	CTT	2	6	4836	4841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687604
68	NC_013516	TAA	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
69	NC_013516	TCA	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687604
70	NC_013516	ATT	2	6	5035	5040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
71	NC_013516	TAT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
72	NC_013516	TTG	2	6	5100	5105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687604
73	NC_013516	ATT	2	6	5122	5127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
74	NC_013516	TAA	2	6	5182	5187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
75	NC_013516	TCT	3	9	5237	5245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687604
76	NC_013516	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
77	NC_013516	TTC	2	6	5276	5281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687604
78	NC_013516	CCA	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268687604
79	NC_013516	ATT	2	6	5398	5403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
80	NC_013516	CCA	2	6	5429	5434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268687604
81	NC_013516	TCT	3	9	5456	5464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687604
82	NC_013516	TGA	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268687604
83	NC_013516	TTA	3	9	5589	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
84	NC_013516	TAT	2	6	5637	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
85	NC_013516	TAA	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
86	NC_013516	ATT	3	9	5764	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
87	NC_013516	ATT	2	6	5837	5842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
88	NC_013516	AAT	2	6	5853	5858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
89	NC_013516	ATA	3	9	5905	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
90	NC_013516	ATT	3	9	5941	5949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
91	NC_013516	TTA	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
92	NC_013516	TTA	2	6	6074	6079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
93	NC_013516	ATA	2	6	6093	6098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
94	NC_013516	ATT	2	6	6106	6111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
95	NC_013516	TAA	2	6	6117	6122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
96	NC_013516	ATA	2	6	6151	6156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
97	NC_013516	TAA	2	6	6214	6219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
98	NC_013516	AAT	2	6	6249	6254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687604
99	NC_013516	ATT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
100	NC_013516	TTA	2	6	6402	6407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687604
101	NC_013516	TAT	2	6	6434	6439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
102	NC_013516	TTA	2	6	6462	6467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
103	NC_013516	ATT	2	6	6524	6529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
104	NC_013516	ATA	2	6	6530	6535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
105	NC_013516	ATT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
106	NC_013516	ATT	2	6	6626	6631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
107	NC_013516	CTT	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687605
108	NC_013516	AAT	2	6	6840	6845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
109	NC_013516	TAA	2	6	6884	6889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
110	NC_013516	CTT	2	6	6916	6921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687605
111	NC_013516	AAT	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
112	NC_013516	TAA	2	6	6980	6985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
113	NC_013516	TCA	2	6	7047	7052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687605
114	NC_013516	TTA	2	6	7104	7109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
115	NC_013516	TAT	2	6	7123	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
116	NC_013516	TCT	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687605
117	NC_013516	GAA	2	6	7225	7230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268687605
118	NC_013516	AAC	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268687605
119	NC_013516	ATA	2	6	7295	7300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
120	NC_013516	TCT	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687605
121	NC_013516	TAA	2	6	7410	7415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
122	NC_013516	ATA	2	6	7430	7435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
123	NC_013516	ATT	2	6	7481	7486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
124	NC_013516	ATA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
125	NC_013516	TAT	2	6	7570	7575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
126	NC_013516	TTC	2	6	7586	7591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687605
127	NC_013516	ATT	2	6	7637	7642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
128	NC_013516	AAT	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
129	NC_013516	TAT	2	6	7685	7690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687605
130	NC_013516	TAA	2	6	7693	7698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
131	NC_013516	TCA	2	6	7782	7787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687605
132	NC_013516	ATA	2	6	7866	7871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687605
133	NC_013516	ATT	3	9	8175	8183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687606
134	NC_013516	AAT	2	6	8225	8230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687606
135	NC_013516	TTA	2	6	8240	8245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687606
136	NC_013516	AAT	2	6	8264	8269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687606
137	NC_013516	TCT	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687606
138	NC_013516	TCT	2	6	8300	8305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687606
139	NC_013516	ATT	2	6	8323	8328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687606
140	NC_013516	TAA	2	6	8413	8418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687606
141	NC_013516	TCT	2	6	8528	8533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687606
142	NC_013516	CTT	2	6	8541	8546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687606
143	NC_013516	ATT	2	6	8803	8808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607
144	NC_013516	TAA	2	6	8920	8925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
145	NC_013516	TTA	2	6	8954	8959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607
146	NC_013516	AAT	3	9	8965	8973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
147	NC_013516	AAT	2	6	9012	9017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
148	NC_013516	TCT	2	6	9050	9055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687607
149	NC_013516	TAA	2	6	9103	9108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
150	NC_013516	TTC	2	6	9130	9135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687607
151	NC_013516	TCA	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687607
152	NC_013516	CTT	2	6	9198	9203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687607
153	NC_013516	ACC	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268687607
154	NC_013516	TTC	2	6	9291	9296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687607
155	NC_013516	TTA	2	6	9365	9370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607
156	NC_013516	TTA	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607
157	NC_013516	TAA	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
158	NC_013516	ATT	2	6	9799	9804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607
159	NC_013516	TAA	2	6	9843	9848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
160	NC_013516	TTC	2	6	9877	9882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687607
161	NC_013516	TAA	2	6	9894	9899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
162	NC_013516	AAT	2	6	9934	9939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687607
163	NC_013516	ATT	2	6	9997	10002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607
164	NC_013516	TTA	2	6	10136	10141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687607

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.