MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98

Total Repeats: 1316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013450	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269201692
2	NC_013450	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269201696
3	NC_013450	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201696
4	NC_013450	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269201696
5	NC_013450	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269201696
6	NC_013450	AGATGA	2	12	9656	9667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269201696
7	NC_013450	ACAATT	2	12	11259	11270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269201698
8	NC_013450	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269201698
9	NC_013450	GCTTTA	2	12	17450	17461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269201703
10	NC_013450	TTTGAA	2	12	18271	18282	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201703
11	NC_013450	TTGGTG	2	12	19115	19126	0 %	50 %	50 %	0 %	269201704
12	NC_013450	TAAAGG	2	12	20318	20329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269201705
13	NC_013450	TTGAAG	2	12	20515	20526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269201705
14	NC_013450	TGATTG	2	12	21719	21730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	269201706
15	NC_013450	TGAAAT	2	12	22050	22061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269201706
16	NC_013450	AAGGAA	2	12	22488	22499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269201707
17	NC_013450	TGAATT	2	12	25416	25427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201708
18	NC_013450	ATTTCA	2	12	27900	27911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269201710
19	NC_013450	ATCAGC	2	12	31215	31226	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269201713
20	NC_013450	AAAAGA	2	12	33856	33867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269201714
21	NC_013450	ACAAAT	2	12	34755	34766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	269201716
22	NC_013450	AATTAA	2	12	34846	34857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269201716
23	NC_013450	TTAATG	2	12	37791	37802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201718
24	NC_013450	AAGTCA	2	12	38996	39007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201720
25	NC_013450	AAAAAG	2	12	39110	39121	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269201720
26	NC_013450	GAAAAA	2	12	39423	39434	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269201720
27	NC_013450	AATTAT	2	12	41662	41673	50 %	50 %	0 %	0 %	269201722
28	NC_013450	ACCCTT	2	12	43501	43512	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	269201723
29	NC_013450	TTTAGC	2	12	45410	45421	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269201726
30	NC_013450	AAATAA	2	12	45461	45472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	269201726
31	NC_013450	GTTAGA	2	12	47584	47595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269201727
32	NC_013450	AAAAGA	2	12	47638	47649	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269201727
33	NC_013450	GCTAAA	2	12	50426	50437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201729
34	NC_013450	CATAAA	2	12	54353	54364	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	269201735
35	NC_013450	TCACAA	2	12	55145	55156	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	269201736
36	NC_013450	TTACCT	2	12	55525	55536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269201737
37	NC_013450	CCATCA	2	12	55612	55623	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	269201737
38	NC_013450	TAAAAA	2	12	57118	57129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	269201738
39	NC_013450	CACACC	2	12	57595	57606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269201738
40	NC_013450	TTCATC	2	12	61756	61767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269201743
41	NC_013450	TTTACC	2	12	62167	62178	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269201743
42	NC_013450	CTGTCG	2	12	62391	62402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269201743
43	NC_013450	TTTCAT	2	12	62880	62891	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269201743
44	NC_013450	TAAATC	2	12	63370	63381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269201743
45	NC_013450	TTTGTC	2	12	64769	64780	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	269201746
46	NC_013450	CTTTTT	2	12	64790	64801	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	269201746
47	NC_013450	AACCAG	2	12	66223	66234	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269201747
48	NC_013450	ATCAAT	2	12	67638	67649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269201750
49	NC_013450	TAAAGA	2	12	69909	69920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269201754
50	NC_013450	AACCAC	2	12	73781	73792	50 %	0 %	0 %	50 %	269201756
51	NC_013450	AACCGA	2	12	77092	77103	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269201758
52	NC_013450	ATAGAT	2	12	81992	82003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269201761
53	NC_013450	TATCAT	2	12	82759	82770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269201762
54	NC_013450	TTTATT	2	12	83167	83178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	269201763
55	NC_013450	TATTTG	2	12	83253	83264	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	269201763
56	NC_013450	TAAATA	2	12	84686	84697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269201763
57	NC_013450	TAAGCC	2	12	88391	88402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269201765
58	NC_013450	ATCGCA	2	12	89606	89617	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269201766
59	NC_013450	TTTGAA	2	12	90637	90648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201767
60	NC_013450	CAATGG	2	12	99595	99606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269201773
61	NC_013450	TGAAGA	2	12	100429	100440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269201774
62	NC_013450	TTTCAT	2	12	101110	101121	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269201775
63	NC_013450	TGTATA	2	12	105330	105341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201780
64	NC_013450	TCGAAA	2	12	106831	106842	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201782
65	NC_013450	CTATTG	2	12	109417	109428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269201784
66	NC_013450	CATATG	2	12	110620	110631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269201785
67	NC_013450	GGTATG	2	12	113664	113675	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	269201788
68	NC_013450	CAGATT	2	12	116262	116273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269201790
69	NC_013450	AGATAT	2	12	123640	123651	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269201797
70	NC_013450	ATGCCT	2	12	124779	124790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269201798
71	NC_013450	TGAAAG	2	12	125419	125430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269201798
72	NC_013450	GATATG	2	12	132919	132930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269201804
73	NC_013450	ATTTGA	2	12	136825	136836	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201807
74	NC_013450	GATTTT	2	12	141336	141347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	269201812
75	NC_013450	ACAAAG	2	12	145856	145867	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269201816
76	NC_013450	TGTAAT	2	12	146880	146891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201817
77	NC_013450	AAAGAT	2	12	147869	147880	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269201819
78	NC_013450	CAATAT	2	12	150341	150352	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269201820
79	NC_013450	TTGGTA	2	12	154485	154496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	269201825
80	NC_013450	GCGATT	2	12	154505	154516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269201825
81	NC_013450	AAATTT	2	12	154603	154614	50 %	50 %	0 %	0 %	269201825
82	NC_013450	CGTTAA	2	12	160585	160596	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269201829
83	NC_013450	CTATTA	2	12	162436	162447	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269201829
84	NC_013450	TATGAT	2	12	163970	163981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201829
85	NC_013450	TTGAAA	2	12	164422	164433	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269201829
86	NC_013450	AACATT	2	12	166862	166873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269201829
87	NC_013450	AGCAAC	2	12	170351	170362	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269201833
88	NC_013450	TGTTTG	2	12	170399	170410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	269201833
89	NC_013450	CACCTT	2	12	172403	172414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	269201835
90	NC_013450	ACCTTT	2	12	172908	172919	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269201835
91	NC_013450	GTAAAT	2	12	176647	176658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269201838
92	NC_013450	ATTTTA	2	12	178242	178253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269201840
93	NC_013450	TATCTT	2	12	182856	182867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269201843
94	NC_013450	ATTTGG	2	12	183869	183880	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	269201844
95	NC_013450	GAGTTT	2	12	187212	187223	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	269201845
96	NC_013450	TATACA	2	12	191213	191224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	269201848
97	NC_013450	TTATTT	2	12	193245	193256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	269201850
98	NC_013450	ATTTAT	2	12	193824	193835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269201850
99	NC_013450	CCCTGA	2	12	196582	196593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	269201853
100	NC_013450	TCCTGA	2	12	197401	197412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269201853
101	NC_013450	TCAATT	2	12	199552	199563	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269201855
102	NC_013450	AAAAAT	2	12	204359	204370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	269201858
103	NC_013450	AGGACA	2	12	206219	206230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	269201860
104	NC_013450	ACATTT	2	12	206555	206566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269201860
105	NC_013450	TTCTTG	2	12	211484	211495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	269201864
106	NC_013450	GGACGT	2	12	221986	221997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269201873
107	NC_013450	TGGTAT	2	12	251164	251175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	269201894
108	NC_013450	ACGATG	2	12	261148	261159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269201903
109	NC_013450	AGAATC	2	12	268706	268717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201908
110	NC_013450	AAGTAA	2	12	272129	272140	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269201913
111	NC_013450	ATAAAG	2	12	273110	273121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269201914
112	NC_013450	GACATT	2	12	274801	274812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269201915
113	NC_013450	GATTTC	2	12	276620	276631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269201917
114	NC_013450	TTCATA	2	12	277190	277201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	269201918
115	NC_013450	GATTAT	2	12	281633	281644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269201923
116	NC_013450	ATGGTG	2	12	281766	281777	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	269201923
117	NC_013450	CAGCAA	2	12	282153	282164	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	269201923
118	NC_013450	TCTTCA	2	12	287733	287744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	269201928
119	NC_013450	TTATCT	2	12	287829	287840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	269201928
120	NC_013450	GAAAAA	2	12	290091	290102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269201931
121	NC_013450	GATACA	2	12	291256	291267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201931
122	NC_013450	TAATTA	2	12	293583	293594	50 %	50 %	0 %	0 %	269201933
123	NC_013450	ACAAGA	2	12	294423	294434	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269201934
124	NC_013450	AGGACA	2	12	294801	294812	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	269201934
125	NC_013450	TAAATT	2	12	297651	297662	50 %	50 %	0 %	0 %	269201935
126	NC_013450	TGAAGA	2	12	297912	297923	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	269201935
127	NC_013450	TAAAAC	2	12	304361	304372	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	269201942
128	NC_013450	CTGAAT	2	12	311394	311405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269201953
129	NC_013450	GAAAAA	2	12	315589	315600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269201956
130	NC_013450	TTTATT	2	12	316174	316185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	269201957
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132	NC_013450	GAAACA	2	12	318257	318268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269201958
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134	NC_013450	AATGCA	2	12	331196	331207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201968
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141	NC_013450	TAATAT	2	12	350725	350736	50 %	50 %	0 %	0 %	269201989
142	NC_013450	GATGCT	2	12	354416	354427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269201993
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144	NC_013450	TTTAAA	2	12	355361	355372	50 %	50 %	0 %	0 %	269201993
145	NC_013450	AAGTAC	2	12	356711	356722	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269201996
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147	NC_013450	AGGACA	2	12	361934	361945	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	269202002
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149	NC_013450	GCAAAA	2	12	368795	368806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	269202006
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228	NC_013450	GCTGAA	2	12	538012	538023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269202161
229	NC_013450	AGCTAA	2	12	538347	538358	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	269202161
230	NC_013450	CAGTAG	2	12	539376	539387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269202163
231	NC_013450	ACGATG	2	12	543619	543630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269202165
232	NC_013450	GTTTAG	2	12	544042	544053	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	269202165
233	NC_013450	AAGTTG	2	12	547067	547078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269202166
234	NC_013450	CTGGTA	2	12	547850	547861	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	269202166
235	NC_013450	TTGTAC	2	12	548707	548718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269202168
236	NC_013450	ACGACT	2	12	549574	549585	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202170
237	NC_013450	AACGTG	2	12	550547	550558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269202170
238	NC_013450	TTCGAA	2	12	551068	551079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202170
239	NC_013450	TACAGC	2	12	553314	553325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202172
240	NC_013450	TTGCTA	2	12	553595	553606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269202172
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248	NC_013450	GACTCA	2	12	568443	568454	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
249	NC_013450	GACTCA	2	12	568461	568472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
250	NC_013450	GACTCA	2	12	568491	568502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
251	NC_013450	GACTCA	2	12	568563	568574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
252	NC_013450	GACTCA	2	12	568617	568628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
253	NC_013450	TCAGAT	2	12	568674	568685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202184
254	NC_013450	GACTCA	2	12	568761	568772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
255	NC_013450	GATTCA	2	12	568779	568790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202184
256	NC_013450	GATTCA	2	12	568815	568826	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202184
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258	NC_013450	TCAGAT	2	12	568854	568865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202184
259	NC_013450	GACTCA	2	12	568869	568880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
260	NC_013450	GACTCA	2	12	568905	568916	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202184
261	NC_013450	GATTCA	2	12	568971	568982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202184
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270	NC_013450	GACTCA	2	12	573021	573032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202185
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280	NC_013450	GATTCA	2	12	573255	573266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202185
281	NC_013450	TCAGAT	2	12	573276	573287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202185
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283	NC_013450	GATTCA	2	12	573315	573326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	269202185
284	NC_013450	GACTCA	2	12	573351	573362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	269202185
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340	NC_013450	TTATAA	2	12	671321	671332	50 %	50 %	0 %	0 %	269202282
341	NC_013450	CATTGC	2	12	675467	675478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	269202285
342	NC_013450	GTAAAA	2	12	677737	677748	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269202287
343	NC_013450	ATTTAT	2	12	680197	680208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269202288
344	NC_013450	AATTGA	2	12	680276	680287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	269202288
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453	NC_013450	TAAAAG	2	12	898221	898232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	269202534
454	NC_013450	GAAAAA	2	12	898619	898630	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	269202534
455	NC_013450	CGTGCG	2	12	903805	903816	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	269202539
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457	NC_013450	TAAAAT	2	12	907634	907645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	269202545
458	NC_013450	TGTAAT	2	12	912395	912406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	269202551
459	NC_013450	TTTTAA	2	12	913003	913014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	269202553
460	NC_013450	GTACTT	2	12	915475	915486	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	269202556
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