MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 95920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013159	CGC	2	6	173785	173790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054245
4002	NC_013159	CGA	2	6	173796	173801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245
4003	NC_013159	GGCC	2	8	173814	173821	0 %	0 %	50 %	50 %	257054245
4004	NC_013159	ACC	2	6	173860	173865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054245
4005	NC_013159	CG	3	6	173884	173889	0 %	0 %	50 %	50 %	257054245
4006	NC_013159	TCG	2	6	174079	174084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4007	NC_013159	CCG	2	6	174100	174105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054246
4008	NC_013159	ACG	2	6	174208	174213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4009	NC_013159	CG	3	6	174219	174224	0 %	0 %	50 %	50 %	257054246
4010	NC_013159	CCG	2	6	174250	174255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054246
4011	NC_013159	CAA	2	6	174266	174271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054246
4012	NC_013159	TCA	2	6	174373	174378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054246
4013	NC_013159	GTCC	2	8	174391	174398	0 %	25 %	25 %	50 %	257054246
4014	NC_013159	AGG	2	6	174403	174408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054246
4015	NC_013159	GGT	2	6	174431	174436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054246
4016	NC_013159	GAC	2	6	174444	174449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4017	NC_013159	GTGAC	2	10	174478	174487	20 %	20 %	40 %	20 %	257054246
4018	NC_013159	GTTC	2	8	174520	174527	0 %	50 %	25 %	25 %	257054246
4019	NC_013159	CGC	2	6	174542	174547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054246
4020	NC_013159	ACA	2	6	174580	174585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054246
4021	NC_013159	GAG	2	6	174588	174593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054246
4022	NC_013159	GAA	2	6	174620	174625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054246
4023	NC_013159	CGA	2	6	174626	174631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4024	NC_013159	CCG	2	6	174640	174645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054246
4025	NC_013159	GGA	2	6	174725	174730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054246
4026	NC_013159	CAC	2	6	174734	174739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054246
4027	NC_013159	CGT	2	6	174782	174787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4028	NC_013159	CGGC	2	8	174817	174824	0 %	0 %	50 %	50 %	257054246
4029	NC_013159	CAA	2	6	174902	174907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054246
4030	NC_013159	TGG	2	6	174924	174929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054246
4031	NC_013159	GAG	2	6	174936	174941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054246
4032	NC_013159	TGG	2	6	174949	174954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054246
4033	NC_013159	CTA	2	6	174962	174967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054246
4034	NC_013159	CAG	2	6	174990	174995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4035	NC_013159	ACG	2	6	175060	175065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4036	NC_013159	GAC	2	6	175068	175073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4037	NC_013159	GGC	2	6	175124	175129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054246
4038	NC_013159	TCG	2	6	175132	175137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4039	NC_013159	GGC	2	6	175277	175282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054246
4040	NC_013159	GCG	2	6	175291	175296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054246
4041	NC_013159	ACC	2	6	175324	175329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054246
4042	NC_013159	GGA	2	6	175424	175429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054246
4043	NC_013159	AGC	2	6	175480	175485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054246
4044	NC_013159	GCTG	2	8	176022	176029	0 %	25 %	50 %	25 %	257054247
4045	NC_013159	GTCT	2	8	176150	176157	0 %	50 %	25 %	25 %	257054247
4046	NC_013159	AAC	2	6	176171	176176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054247
4047	NC_013159	CCA	2	6	176214	176219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054247
4048	NC_013159	GCG	2	6	176269	176274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054247
4049	NC_013159	CACG	2	8	176356	176363	25 %	0 %	25 %	50 %	257054247
4050	NC_013159	CTG	2	6	176393	176398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054247
4051	NC_013159	CG	3	6	176426	176431	0 %	0 %	50 %	50 %	257054247
4052	NC_013159	GTC	2	6	176441	176446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054247
4053	NC_013159	AC	3	6	176447	176452	50 %	0 %	0 %	50 %	257054247
4054	NC_013159	CATGG	2	10	176836	176845	20 %	20 %	40 %	20 %	257054248
4055	NC_013159	TCG	2	6	176940	176945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054248
4056	NC_013159	ATC	2	6	176954	176959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054248
4057	NC_013159	GGT	2	6	176966	176971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054248
4058	NC_013159	CCT	2	6	177006	177011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054248
4059	NC_013159	GTGG	2	8	177019	177026	0 %	25 %	75 %	0 %	257054248
4060	NC_013159	TG	3	6	177122	177127	0 %	50 %	50 %	0 %	257054248
4061	NC_013159	TGC	2	6	177346	177351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054249
4062	NC_013159	CG	3	6	177395	177400	0 %	0 %	50 %	50 %	257054249
4063	NC_013159	AACA	2	8	177438	177445	75 %	0 %	0 %	25 %	257054249
4064	NC_013159	GGT	2	6	177498	177503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054249
4065	NC_013159	CG	3	6	177512	177517	0 %	0 %	50 %	50 %	257054249
4066	NC_013159	CGT	2	6	177545	177550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054249
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4069	NC_013159	GCG	2	6	177665	177670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054249
4070	NC_013159	TGGCG	2	10	177679	177688	0 %	20 %	60 %	20 %	257054249
4071	NC_013159	CGC	2	6	177722	177727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054249
4072	NC_013159	CGT	2	6	178087	178092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054250
4073	NC_013159	GCG	2	6	178093	178098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054250
4074	NC_013159	ACGTCG	2	12	178113	178124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054250
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4078	NC_013159	GTG	2	6	178280	178285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054250
4079	NC_013159	GCG	2	6	178297	178302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054250
4080	NC_013159	CGA	2	6	178357	178362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054250
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4086	NC_013159	GGA	2	6	178762	178767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054250
4087	NC_013159	CTCGC	2	10	178772	178781	0 %	20 %	20 %	60 %	257054250
4088	NC_013159	GCG	2	6	178783	178788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054250
4089	NC_013159	GTC	2	6	178822	178827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054251
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4091	NC_013159	TG	3	6	178906	178911	0 %	50 %	50 %	0 %	257054251
4092	NC_013159	GGT	2	6	178930	178935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054251
4093	NC_013159	ACCG	2	8	178961	178968	25 %	0 %	25 %	50 %	257054251
4094	NC_013159	CGG	2	6	178971	178976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054251
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4096	NC_013159	CG	3	6	179006	179011	0 %	0 %	50 %	50 %	257054251
4097	NC_013159	TGG	2	6	179082	179087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054251
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4101	NC_013159	CCT	2	6	179163	179168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054251
4102	NC_013159	CGT	2	6	179179	179184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054251
4103	NC_013159	CAG	2	6	179236	179241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054251
4104	NC_013159	CGA	2	6	179304	179309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054251
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4108	NC_013159	GTC	2	6	179508	179513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054251
4109	NC_013159	CGC	2	6	179534	179539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054251
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4111	NC_013159	GC	3	6	179589	179594	0 %	0 %	50 %	50 %	257054252
4112	NC_013159	CAG	2	6	179603	179608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054252
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4116	NC_013159	TCG	2	6	179685	179690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054252
4117	NC_013159	TCGT	2	8	179696	179703	0 %	50 %	25 %	25 %	257054252
4118	NC_013159	CTC	2	6	179720	179725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054252
4119	NC_013159	GC	3	6	179731	179736	0 %	0 %	50 %	50 %	257054252
4120	NC_013159	CGA	2	6	179755	179760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054252
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4122	NC_013159	CG	3	6	179829	179834	0 %	0 %	50 %	50 %	257054252
4123	NC_013159	GCG	2	6	179861	179866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054252
4124	NC_013159	TCG	2	6	180063	180068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054253
4125	NC_013159	GTC	2	6	180075	180080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054253
4126	NC_013159	GGT	2	6	180110	180115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054253
4127	NC_013159	AAG	2	6	180126	180131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054253
4128	NC_013159	CG	3	6	180176	180181	0 %	0 %	50 %	50 %	257054253
4129	NC_013159	GC	3	6	180288	180293	0 %	0 %	50 %	50 %	257054253
4130	NC_013159	GT	3	6	180349	180354	0 %	50 %	50 %	0 %	257054254
4131	NC_013159	TTG	2	6	180359	180364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054254
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4135	NC_013159	GGT	2	6	180473	180478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054254
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4139	NC_013159	CGGCCG	2	12	180561	180572	0 %	0 %	50 %	50 %	257054254
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4141	NC_013159	CGG	2	6	180613	180618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054254
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4143	NC_013159	ACG	2	6	180702	180707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054254
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4145	NC_013159	CGA	2	6	180730	180735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054254
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4148	NC_013159	CGG	2	6	180948	180953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054254
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4152	NC_013159	CGA	2	6	181120	181125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054254
4153	NC_013159	TGG	2	6	181137	181142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054254
4154	NC_013159	TGC	2	6	181209	181214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054254
4155	NC_013159	TACGAC	2	12	181223	181234	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257054254
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4159	NC_013159	CGG	2	6	181351	181356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054254
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4165	NC_013159	CTG	2	6	181608	181613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054255
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4229	NC_013159	CGA	2	6	184776	184781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054258
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4231	NC_013159	GCGCTC	2	12	184885	184896	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	257054258
4232	NC_013159	GACG	2	8	184921	184928	25 %	0 %	50 %	25 %	257054258
4233	NC_013159	CGT	2	6	184953	184958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054258
4234	NC_013159	CGAC	2	8	184965	184972	25 %	0 %	25 %	50 %	257054258
4235	NC_013159	CG	3	6	185038	185043	0 %	0 %	50 %	50 %	257054258
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4238	NC_013159	CCAGCA	2	12	185091	185102	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257054258
4239	NC_013159	GCA	2	6	185139	185144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054258
4240	NC_013159	AGC	3	9	185147	185155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054258
4241	NC_013159	CCA	2	6	185160	185165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054258
4242	NC_013159	CAC	2	6	185194	185199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054258
4243	NC_013159	ACA	2	6	185265	185270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257054258
4244	NC_013159	GCC	2	6	185291	185296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054258
4245	NC_013159	AGGT	2	8	185297	185304	25 %	25 %	50 %	0 %	257054258
4246	NC_013159	GTG	2	6	185312	185317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054258
4247	NC_013159	GCC	2	6	185323	185328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054258
4248	NC_013159	GCACC	2	10	185400	185409	20 %	0 %	20 %	60 %	257054258
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4250	NC_013159	CGGT	2	8	185492	185499	0 %	25 %	50 %	25 %	257054258
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4255	NC_013159	CTT	2	6	185863	185868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054259
4256	NC_013159	TCG	2	6	185885	185890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054259
4257	NC_013159	TCCG	2	8	185975	185982	0 %	25 %	25 %	50 %	257054259
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4259	NC_013159	GCTC	2	8	186033	186040	0 %	25 %	25 %	50 %	257054259
4260	NC_013159	CCA	2	6	186132	186137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054259
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4262	NC_013159	CGG	2	6	186162	186167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054259
4263	NC_013159	CGTT	2	8	186215	186222	0 %	50 %	25 %	25 %	257054259
4264	NC_013159	GCC	2	6	186246	186251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054259
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4266	NC_013159	CTG	2	6	186340	186345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054259
4267	NC_013159	CAG	2	6	186370	186375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054259
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4270	NC_013159	GC	4	8	186500	186507	0 %	0 %	50 %	50 %	257054259
4271	NC_013159	AGCC	2	8	186526	186533	25 %	0 %	25 %	50 %	257054259
4272	NC_013159	TCT	2	6	186540	186545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054259
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4275	NC_013159	CCGGC	2	10	186607	186616	0 %	0 %	40 %	60 %	257054259
4276	NC_013159	CTC	2	6	186631	186636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054259
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4280	NC_013159	GCTCC	2	10	186842	186851	0 %	20 %	20 %	60 %	257054259
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4322	NC_013159	AGT	2	6	188917	188922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054262
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4352	NC_013159	CCGT	2	8	190016	190023	0 %	25 %	25 %	50 %	257054263
4353	NC_013159	CGT	2	6	190045	190050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054263
4354	NC_013159	TGG	2	6	190236	190241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054264
4355	NC_013159	GTC	2	6	190293	190298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054264
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4358	NC_013159	GCA	2	6	190393	190398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054264
4359	NC_013159	CAGCGG	2	12	190437	190448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	257054264
4360	NC_013159	TGC	3	9	190498	190506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054264
4361	NC_013159	ACC	2	6	190514	190519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054264
4362	NC_013159	CGT	2	6	190535	190540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054264
4363	NC_013159	TGG	2	6	190549	190554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054264
4364	NC_013159	GTG	2	6	190563	190568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054264
4365	NC_013159	TGC	2	6	190603	190608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054264
4366	NC_013159	CGG	2	6	190658	190663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054264
4367	NC_013159	CGG	2	6	190706	190711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054264
4368	NC_013159	CGA	2	6	190766	190771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054264
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4370	NC_013159	GTG	2	6	190815	190820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054264
4371	NC_013159	CGT	2	6	190823	190828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054264
4372	NC_013159	TCG	2	6	190849	190854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054264
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4382	NC_013159	GTC	2	6	191378	191383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054265
4383	NC_013159	CAG	2	6	191393	191398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054265
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4393	NC_013159	GTG	3	9	191792	191800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054265
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4422	NC_013159	GGC	2	6	193242	193247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054267
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4482	NC_013159	GCCGG	2	10	195105	195114	0 %	0 %	60 %	40 %	257054269
4483	NC_013159	GGT	2	6	195122	195127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054269
4484	NC_013159	GC	3	6	195162	195167	0 %	0 %	50 %	50 %	257054269
4485	NC_013159	TGCG	2	8	195192	195199	0 %	25 %	50 %	25 %	257054269
4486	NC_013159	GAG	2	6	195211	195216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054269
4487	NC_013159	CGA	2	6	195241	195246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054269
4488	NC_013159	GCCG	2	8	195251	195258	0 %	0 %	50 %	50 %	257054269
4489	NC_013159	CGG	2	6	195320	195325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054269
4490	NC_013159	GTCACC	2	12	195338	195349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	257054269
4491	NC_013159	GCT	2	6	195367	195372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054269
4492	NC_013159	GAG	2	6	195383	195388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054269
4493	NC_013159	TGG	2	6	195390	195395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054269
4494	NC_013159	CCGG	2	8	195408	195415	0 %	0 %	50 %	50 %	257054269
4495	NC_013159	GAC	2	6	195549	195554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054270
4496	NC_013159	TGT	2	6	195565	195570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054270
4497	NC_013159	GAG	2	6	195582	195587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054270
4498	NC_013159	GTG	2	6	195640	195645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054270
4499	NC_013159	ACG	2	6	195661	195666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054270
4500	NC_013159	CGG	2	6	195709	195714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054270

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