MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 95920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013159	AGT	2	6	151439	151444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054223
3502	NC_013159	GCG	2	6	151461	151466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054223
3503	NC_013159	TCC	2	6	151486	151491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054223
3504	NC_013159	GGA	2	6	151520	151525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054223
3505	NC_013159	GCA	2	6	151559	151564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054223
3506	NC_013159	GGT	2	6	151574	151579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054223
3507	NC_013159	CTT	2	6	151617	151622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054223
3508	NC_013159	TCA	2	6	151706	151711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054223
3509	NC_013159	CG	3	6	151784	151789	0 %	0 %	50 %	50 %	257054223
3510	NC_013159	AGT	2	6	151847	151852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054223
3511	NC_013159	TCG	2	6	151894	151899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054223
3512	NC_013159	CCA	2	6	151922	151927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054223
3513	NC_013159	TGG	2	6	151961	151966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054223
3514	NC_013159	GAT	2	6	151974	151979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054223
3515	NC_013159	C	6	6	151995	152000	0 %	0 %	0 %	100 %	257054223
3516	NC_013159	CGG	2	6	152063	152068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054223
3517	NC_013159	GAG	2	6	152070	152075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054223
3518	NC_013159	TGG	2	6	152116	152121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054223
3519	NC_013159	GC	3	6	152215	152220	0 %	0 %	50 %	50 %	257054223
3520	NC_013159	CGTCGA	2	12	152246	152257	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054223
3521	NC_013159	TCGA	2	8	152275	152282	25 %	25 %	25 %	25 %	257054223
3522	NC_013159	C	6	6	152319	152324	0 %	0 %	0 %	100 %	257054223
3523	NC_013159	CGC	2	6	152375	152380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054223
3524	NC_013159	CCG	2	6	152481	152486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054223
3525	NC_013159	TGG	2	6	152643	152648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054224
3526	NC_013159	GCT	2	6	152704	152709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054224
3527	NC_013159	CGG	2	6	152737	152742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054224
3528	NC_013159	GC	3	6	152748	152753	0 %	0 %	50 %	50 %	257054224
3529	NC_013159	GGCG	2	8	152788	152795	0 %	0 %	75 %	25 %	257054224
3530	NC_013159	CGG	2	6	152908	152913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054224
3531	NC_013159	TGC	2	6	152919	152924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054224
3532	NC_013159	TTC	2	6	152939	152944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054224
3533	NC_013159	CTG	2	6	152978	152983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054224
3534	NC_013159	ATC	2	6	153017	153022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054224
3535	NC_013159	TCA	2	6	153051	153056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054224
3536	NC_013159	CG	3	6	153084	153089	0 %	0 %	50 %	50 %	257054224
3537	NC_013159	GCT	2	6	153302	153307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3538	NC_013159	TCG	2	6	153370	153375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3539	NC_013159	CGG	3	9	153390	153398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3540	NC_013159	TCGG	2	8	153448	153455	0 %	25 %	50 %	25 %	257054225
3541	NC_013159	ACC	2	6	153483	153488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054225
3542	NC_013159	GACCGT	2	12	153572	153583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3543	NC_013159	GGA	2	6	153593	153598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054225
3544	NC_013159	GC	3	6	153655	153660	0 %	0 %	50 %	50 %	257054225
3545	NC_013159	CGA	2	6	153779	153784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3546	NC_013159	GCTG	2	8	153806	153813	0 %	25 %	50 %	25 %	257054225
3547	NC_013159	AGC	2	6	153940	153945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3548	NC_013159	CGG	2	6	153953	153958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3549	NC_013159	GGGT	2	8	153962	153969	0 %	25 %	75 %	0 %	257054225
3550	NC_013159	GCA	2	6	153997	154002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3551	NC_013159	GAC	2	6	154038	154043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3552	NC_013159	ATC	2	6	154065	154070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054225
3553	NC_013159	GCG	2	6	154095	154100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3554	NC_013159	GAT	2	6	154106	154111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054225
3555	NC_013159	CTG	2	6	154134	154139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3556	NC_013159	CGG	2	6	154225	154230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3557	NC_013159	CTG	2	6	154233	154238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3558	NC_013159	CGA	2	6	154244	154249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3559	NC_013159	TGG	2	6	154305	154310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054225
3560	NC_013159	TTC	3	9	154362	154370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054225
3561	NC_013159	GAC	2	6	154377	154382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3562	NC_013159	TCGGGC	2	12	154397	154408	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	257054225
3563	NC_013159	ATC	2	6	154515	154520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054225
3564	NC_013159	CGG	2	6	154522	154527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3565	NC_013159	GTT	2	6	154568	154573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054225
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3567	NC_013159	CGG	2	6	154633	154638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3568	NC_013159	GGA	2	6	154640	154645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054225
3569	NC_013159	ACG	2	6	154672	154677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
3570	NC_013159	GGC	2	6	154685	154690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054225
3571	NC_013159	CAT	2	6	154784	154789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054225
3572	NC_013159	CGCCC	2	10	154798	154807	0 %	0 %	20 %	80 %	257054225
3573	NC_013159	ATC	2	6	154839	154844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054225
3574	NC_013159	CGA	2	6	154892	154897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054225
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3578	NC_013159	AGA	2	6	154987	154992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054225
3579	NC_013159	AAGG	2	8	155040	155047	50 %	0 %	50 %	0 %	257054225
3580	NC_013159	AGG	2	6	155059	155064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054225
3581	NC_013159	GC	3	6	155072	155077	0 %	0 %	50 %	50 %	257054225
3582	NC_013159	TCGTTG	2	12	155348	155359	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257054226
3583	NC_013159	CCGTTC	2	12	155405	155416	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	257054226
3584	NC_013159	CAGG	2	8	155461	155468	25 %	0 %	50 %	25 %	257054226
3585	NC_013159	GGC	2	6	155507	155512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054226
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3587	NC_013159	CG	3	6	155551	155556	0 %	0 %	50 %	50 %	257054226
3588	NC_013159	CGG	3	9	155574	155582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054226
3589	NC_013159	CGG	2	6	155619	155624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054226
3590	NC_013159	CCGG	2	8	155686	155693	0 %	0 %	50 %	50 %	257054226
3591	NC_013159	CGGC	2	8	155735	155742	0 %	0 %	50 %	50 %	257054226
3592	NC_013159	CGCAGC	3	18	155766	155783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257054226
3593	NC_013159	GCG	2	6	155801	155806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054226
3594	NC_013159	TGG	2	6	155874	155879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054226
3595	NC_013159	GCG	2	6	155937	155942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054226
3596	NC_013159	GGAC	2	8	155989	155996	25 %	0 %	50 %	25 %	257054226
3597	NC_013159	CAC	2	6	156004	156009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054226
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3599	NC_013159	CGG	2	6	156054	156059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054226
3600	NC_013159	CG	3	6	156064	156069	0 %	0 %	50 %	50 %	257054226
3601	NC_013159	GTC	2	6	156085	156090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054226
3602	NC_013159	AAG	2	6	156360	156365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054227
3603	NC_013159	CGG	2	6	156386	156391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054227
3604	NC_013159	GCA	2	6	156411	156416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054227
3605	NC_013159	GAACC	2	10	156493	156502	40 %	0 %	20 %	40 %	257054227
3606	NC_013159	TCA	2	6	156542	156547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257054227
3607	NC_013159	TTC	2	6	156589	156594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257054227
3608	NC_013159	A	6	6	156648	156653	100 %	0 %	0 %	0 %	257054227
3609	NC_013159	CGT	2	6	157533	157538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054228
3610	NC_013159	TGA	2	6	157544	157549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257054228
3611	NC_013159	GGAA	2	8	157670	157677	50 %	0 %	50 %	0 %	257054228
3612	NC_013159	CGGA	2	8	157690	157697	25 %	0 %	50 %	25 %	257054228
3613	NC_013159	GGA	2	6	157733	157738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054228
3614	NC_013159	TAA	2	6	157754	157759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257054228
3615	NC_013159	AAT	2	6	157868	157873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257054228
3616	NC_013159	AGCCGA	2	12	157877	157888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054228
3617	NC_013159	GCC	2	6	157890	157895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054228
3618	NC_013159	AGC	2	6	157908	157913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054228
3619	NC_013159	GGT	2	6	157969	157974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054228
3620	NC_013159	GCG	2	6	158225	158230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054229
3621	NC_013159	AAG	2	6	158282	158287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257054229
3622	NC_013159	CGG	2	6	158308	158313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054229
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3740	NC_013159	CGA	2	6	164463	164468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054235
3741	NC_013159	CGG	2	6	164472	164477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054235
3742	NC_013159	GCC	2	6	164478	164483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054235
3743	NC_013159	GCAC	2	8	164494	164501	25 %	0 %	25 %	50 %	257054235
3744	NC_013159	CGT	2	6	164505	164510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054235
3745	NC_013159	TGCGT	2	10	164523	164532	0 %	40 %	40 %	20 %	257054235
3746	NC_013159	CGA	2	6	164534	164539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054235
3747	NC_013159	GTG	2	6	164625	164630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054235
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3749	NC_013159	GGC	2	6	164718	164723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054235
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3753	NC_013159	TCGT	2	8	164803	164810	0 %	50 %	25 %	25 %	257054235
3754	NC_013159	CGT	2	6	164828	164833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054235
3755	NC_013159	TCG	2	6	164861	164866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054235
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3758	NC_013159	CGA	2	6	165066	165071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054236
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3763	NC_013159	CTG	2	6	165193	165198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054236
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3769	NC_013159	GCA	2	6	165348	165353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054236
3770	NC_013159	GGA	2	6	165414	165419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257054236
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3773	NC_013159	CGAC	2	8	165478	165485	25 %	0 %	25 %	50 %	257054237
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3781	NC_013159	GAACG	2	10	165630	165639	40 %	0 %	40 %	20 %	257054237
3782	NC_013159	TCG	2	6	165685	165690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054237
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3802	NC_013159	GC	3	6	166575	166580	0 %	0 %	50 %	50 %	257054238
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3852	NC_013159	GT	3	6	168069	168074	0 %	50 %	50 %	0 %	257054239
3853	NC_013159	CGG	2	6	168103	168108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054239
3854	NC_013159	GGT	2	6	168113	168118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054239
3855	NC_013159	CGC	2	6	168127	168132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054239
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3857	NC_013159	GTC	3	9	168158	168166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054239
3858	NC_013159	GTC	2	6	168228	168233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054240
3859	NC_013159	CTC	2	6	168297	168302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054240
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3982	NC_013159	CCA	2	6	173037	173042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257054245
3983	NC_013159	TCC	2	6	173087	173092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257054245
3984	NC_013159	GTG	2	6	173111	173116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257054245
3985	NC_013159	GCC	2	6	173173	173178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054245
3986	NC_013159	TGT	2	6	173253	173258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257054245
3987	NC_013159	GCC	2	6	173275	173280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054245
3988	NC_013159	CGA	2	6	173301	173306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245
3989	NC_013159	TCG	2	6	173369	173374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054245
3990	NC_013159	CCG	2	6	173450	173455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257054245
3991	NC_013159	CAG	2	6	173461	173466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245
3992	NC_013159	GCGT	2	8	173485	173492	0 %	25 %	50 %	25 %	257054245
3993	NC_013159	GAC	2	6	173497	173502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245
3994	NC_013159	GGC	2	6	173539	173544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257054245
3995	NC_013159	CTG	2	6	173602	173607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257054245
3996	NC_013159	CCGC	2	8	173618	173625	0 %	0 %	25 %	75 %	257054245
3997	NC_013159	AGC	2	6	173627	173632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245
3998	NC_013159	GC	3	6	173631	173636	0 %	0 %	50 %	50 %	257054245
3999	NC_013159	CGA	2	6	173682	173687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245
4000	NC_013159	GCA	2	6	173757	173762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257054245

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