MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 35943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012926	A	6	6	146	151	100 %	0 %	0 %	0 %	253754648
2	NC_012926	A	7	7	162	168	100 %	0 %	0 %	0 %	253754648
3	NC_012926	TAC	2	6	265	270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754648
4	NC_012926	AAG	2	6	277	282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754648
5	NC_012926	CTC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754648
6	NC_012926	AAT	2	6	398	403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754648
7	NC_012926	ATT	2	6	463	468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754648
8	NC_012926	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754648
9	NC_012926	TCA	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754648
10	NC_012926	A	7	7	629	635	100 %	0 %	0 %	0 %	253754648
11	NC_012926	ACTT	2	8	651	658	25 %	50 %	0 %	25 %	253754648
12	NC_012926	TGA	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754648
13	NC_012926	TC	3	6	677	682	0 %	50 %	0 %	50 %	253754648
14	NC_012926	TAA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754648
15	NC_012926	CAA	2	6	693	698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754648
16	NC_012926	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754648
17	NC_012926	A	7	7	738	744	100 %	0 %	0 %	0 %	253754648
18	NC_012926	GAA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754648
19	NC_012926	CTATC	2	10	926	935	20 %	40 %	0 %	40 %	253754648
20	NC_012926	ACGT	2	8	957	964	25 %	25 %	25 %	25 %	253754648
21	NC_012926	TGC	2	6	1039	1044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754648
22	NC_012926	ACAA	2	8	1066	1073	75 %	0 %	0 %	25 %	253754648
23	NC_012926	CG	3	6	1186	1191	0 %	0 %	50 %	50 %	253754648
24	NC_012926	GACA	2	8	1222	1229	50 %	0 %	25 %	25 %	253754648
25	NC_012926	ATGC	2	8	1283	1290	25 %	25 %	25 %	25 %	253754648
26	NC_012926	AATAA	2	10	1295	1304	80 %	20 %	0 %	0 %	253754648
27	NC_012926	CTC	2	6	1310	1315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754648
28	NC_012926	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754648
29	NC_012926	A	6	6	1354	1359	100 %	0 %	0 %	0 %	253754648
30	NC_012926	TAA	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
31	NC_012926	AT	3	6	1551	1556	50 %	50 %	0 %	0 %	253754649
32	NC_012926	A	6	6	1597	1602	100 %	0 %	0 %	0 %	253754649
33	NC_012926	TTA	2	6	1770	1775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754649
34	NC_012926	AAG	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754649
35	NC_012926	ACAA	2	8	1954	1961	75 %	0 %	0 %	25 %	253754649
36	NC_012926	GTC	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754649
37	NC_012926	TGA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754649
38	NC_012926	TGT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754649
39	NC_012926	TC	3	6	2144	2149	0 %	50 %	0 %	50 %	253754649
40	NC_012926	GAT	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754649
41	NC_012926	TCT	2	6	2196	2201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754649
42	NC_012926	AAT	2	6	2207	2212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
43	NC_012926	TTA	2	6	2255	2260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754649
44	NC_012926	TACC	2	8	2266	2273	25 %	25 %	0 %	50 %	253754649
45	NC_012926	ACCG	2	8	2279	2286	25 %	0 %	25 %	50 %	253754649
46	NC_012926	AAC	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754649
47	NC_012926	TCT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754649
48	NC_012926	TAA	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
49	NC_012926	TGT	2	6	2416	2421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754649
50	NC_012926	ACTT	2	8	2519	2526	25 %	50 %	0 %	25 %	253754649
51	NC_012926	TCT	2	6	2579	2584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754649
52	NC_012926	GTCC	2	8	2585	2592	0 %	25 %	25 %	50 %	253754649
53	NC_012926	AAT	2	6	2609	2614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754649
54	NC_012926	TA	4	8	2761	2768	50 %	50 %	0 %	0 %	253754650
55	NC_012926	CTG	2	6	2797	2802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754650
56	NC_012926	CATAT	2	10	2805	2814	40 %	40 %	0 %	20 %	253754650
57	NC_012926	AAAG	2	8	2823	2830	75 %	0 %	25 %	0 %	253754650
58	NC_012926	A	6	6	2881	2886	100 %	0 %	0 %	0 %	253754650
59	NC_012926	AGT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754650
60	NC_012926	TTA	2	6	3005	3010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
61	NC_012926	TA	3	6	3061	3066	50 %	50 %	0 %	0 %	253754650
62	NC_012926	AG	3	6	3086	3091	50 %	0 %	50 %	0 %	253754650
63	NC_012926	AT	3	6	3105	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	253754650
64	NC_012926	A	7	7	3201	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	253754650
65	NC_012926	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
66	NC_012926	TGA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754650
67	NC_012926	T	6	6	3333	3338	0 %	100 %	0 %	0 %	253754650
68	NC_012926	TGG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754650
69	NC_012926	GAAG	2	8	3407	3414	50 %	0 %	50 %	0 %	253754650
70	NC_012926	TTA	2	6	3474	3479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
71	NC_012926	TCT	2	6	3495	3500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253754650
72	NC_012926	ATT	3	9	3554	3562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754650
73	NC_012926	GA	3	6	3574	3579	50 %	0 %	50 %	0 %	253754650
74	NC_012926	GTAT	2	8	3622	3629	25 %	50 %	25 %	0 %	253754650
75	NC_012926	AGG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754650
76	NC_012926	TCA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754651
77	NC_012926	TAA	2	6	3719	3724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253754651
78	NC_012926	ATG	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754651
79	NC_012926	TGG	2	6	4169	4174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754652
80	NC_012926	AAC	2	6	4175	4180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754652
81	NC_012926	AATG	2	8	4188	4195	50 %	25 %	25 %	0 %	253754652
82	NC_012926	GAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754652
83	NC_012926	TGT	2	6	4245	4250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253754652
84	NC_012926	ATT	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754652
85	NC_012926	ATT	2	6	4301	4306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754652
86	NC_012926	CAG	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
87	NC_012926	TCG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754653
88	NC_012926	TCA	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754653
89	NC_012926	AAAT	2	8	4657	4664	75 %	25 %	0 %	0 %	253754653
90	NC_012926	AG	3	6	4819	4824	50 %	0 %	50 %	0 %	253754653
91	NC_012926	CAA	2	6	4828	4833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253754653
92	NC_012926	A	6	6	4851	4856	100 %	0 %	0 %	0 %	253754653
93	NC_012926	A	6	6	4908	4913	100 %	0 %	0 %	0 %	253754653
94	NC_012926	AGA	2	6	4927	4932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
95	NC_012926	GAA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
96	NC_012926	A	6	6	4974	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	253754653
97	NC_012926	TGA	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754653
98	NC_012926	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
99	NC_012926	GTG	3	9	5117	5125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754653
100	NC_012926	GAA	3	9	5141	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
101	NC_012926	CGA	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
102	NC_012926	CTTG	2	8	5245	5252	0 %	50 %	25 %	25 %	253754653
103	NC_012926	CAG	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754653
104	NC_012926	AGG	2	6	5283	5288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253754653
105	NC_012926	CTC	2	6	5322	5327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253754653
106	NC_012926	GAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754653
107	NC_012926	AAG	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
108	NC_012926	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754653
109	NC_012926	CAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253754653
110	NC_012926	A	6	6	5665	5670	100 %	0 %	0 %	0 %	253754654
111	NC_012926	GATT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	253754654
112	NC_012926	AAACA	2	10	5719	5728	80 %	0 %	0 %	20 %	253754654
113	NC_012926	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253754654
114	NC_012926	A	6	6	5836	5841	100 %	0 %	0 %	0 %	253754654
115	NC_012926	ATGA	2	8	5868	5875	50 %	25 %	25 %	0 %	253754654
116	NC_012926	TTA	2	6	5906	5911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754654
117	NC_012926	TAG	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754654
118	NC_012926	GAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253754654
119	NC_012926	TGG	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253754654
120	NC_012926	TGTCT	2	10	6110	6119	0 %	60 %	20 %	20 %	253754654
121	NC_012926	GAA	2	6	6195	6200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253754654
122	NC_012926	GAT	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754654
123	NC_012926	ATCA	2	8	6275	6282	50 %	25 %	0 %	25 %	253754655
124	NC_012926	AATC	2	8	6299	6306	50 %	25 %	0 %	25 %	253754655
125	NC_012926	TTA	3	9	6317	6325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754655
126	NC_012926	ATG	2	6	6414	6419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
127	NC_012926	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253754655
128	NC_012926	T	6	6	6476	6481	0 %	100 %	0 %	0 %	253754655
129	NC_012926	GAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
130	NC_012926	GTTT	2	8	6505	6512	0 %	75 %	25 %	0 %	253754655
131	NC_012926	TCAA	2	8	6532	6539	50 %	25 %	0 %	25 %	253754655
132	NC_012926	A	6	6	6722	6727	100 %	0 %	0 %	0 %	253754655
133	NC_012926	T	6	6	6821	6826	0 %	100 %	0 %	0 %	253754655
134	NC_012926	GAGAT	2	10	6828	6837	40 %	20 %	40 %	0 %	253754655
135	NC_012926	TC	3	6	6903	6908	0 %	50 %	0 %	50 %	253754655
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137	NC_012926	TAG	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253754655
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