MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 35526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012924	ACTT	2	8	241414	241421	25 %	50 %	0 %	25 %	253751138
4002	NC_012924	ACC	2	6	241446	241451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751138
4003	NC_012924	AGC	3	9	241479	241487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751138
4004	NC_012924	TCA	2	6	241571	241576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751138
4005	NC_012924	TGG	2	6	241593	241598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751138
4006	NC_012924	TTG	2	6	241679	241684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751138
4007	NC_012924	TGG	2	6	241689	241694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751138
4008	NC_012924	AAC	2	6	241758	241763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751138
4009	NC_012924	AAGG	2	8	241771	241778	50 %	0 %	50 %	0 %	253751138
4010	NC_012924	CAT	2	6	241818	241823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751138
4011	NC_012924	GA	3	6	242223	242228	50 %	0 %	50 %	0 %	253751139
4012	NC_012924	T	6	6	242286	242291	0 %	100 %	0 %	0 %	253751139
4013	NC_012924	TAT	2	6	242309	242314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751139
4014	NC_012924	ATT	3	9	242322	242330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751139
4015	NC_012924	CAT	2	6	242399	242404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751139
4016	NC_012924	TTC	2	6	242437	242442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751139
4017	NC_012924	GAG	2	6	242443	242448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
4018	NC_012924	CAA	2	6	242609	242614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751139
4019	NC_012924	ATG	2	6	242620	242625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751139
4020	NC_012924	TGG	2	6	242638	242643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751139
4021	NC_012924	CAC	2	6	242764	242769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751139
4022	NC_012924	AGG	2	6	242854	242859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
4023	NC_012924	ATG	2	6	242863	242868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751139
4024	NC_012924	AAAGA	2	10	242889	242898	80 %	0 %	20 %	0 %	253751139
4025	NC_012924	GAGC	2	8	242913	242920	25 %	0 %	50 %	25 %	253751139
4026	NC_012924	GGA	2	6	242987	242992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
4027	NC_012924	TGAT	2	8	243016	243023	25 %	50 %	25 %	0 %	253751139
4028	NC_012924	TGG	2	6	243044	243049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751139
4029	NC_012924	ATC	2	6	243108	243113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751139
4030	NC_012924	TGG	2	6	243356	243361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751139
4031	NC_012924	GAG	2	6	243451	243456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751139
4032	NC_012924	GAT	2	6	243463	243468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751140
4033	NC_012924	ATGG	2	8	243491	243498	25 %	25 %	50 %	0 %	253751140
4034	NC_012924	AG	3	6	243530	243535	50 %	0 %	50 %	0 %	253751140
4035	NC_012924	TAC	2	6	243615	243620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751140
4036	NC_012924	TCG	2	6	243703	243708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751140
4037	NC_012924	T	6	6	243745	243750	0 %	100 %	0 %	0 %	253751140
4038	NC_012924	ATGT	2	8	243768	243775	25 %	50 %	25 %	0 %	253751140
4039	NC_012924	TGT	2	6	243780	243785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751140
4040	NC_012924	TGG	2	6	244014	244019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751140
4041	NC_012924	GACA	2	8	244201	244208	50 %	0 %	25 %	25 %	253751140
4042	NC_012924	GAA	2	6	244274	244279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751140
4043	NC_012924	ACC	2	6	244413	244418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751141
4044	NC_012924	AG	3	6	244459	244464	50 %	0 %	50 %	0 %	253751141
4045	NC_012924	CAG	2	6	244505	244510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751141
4046	NC_012924	GATA	2	8	244528	244535	50 %	25 %	25 %	0 %	253751141
4047	NC_012924	TCCAT	2	10	244699	244708	20 %	40 %	0 %	40 %	253751141
4048	NC_012924	GTT	2	6	244755	244760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751141
4049	NC_012924	GAG	3	9	244820	244828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751141
4050	NC_012924	TCAA	2	8	245016	245023	50 %	25 %	0 %	25 %	253751141
4051	NC_012924	GAA	2	6	245042	245047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751141
4052	NC_012924	CAT	2	6	245072	245077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751141
4053	NC_012924	AT	3	6	245109	245114	50 %	50 %	0 %	0 %	253751141
4054	NC_012924	TTC	2	6	245115	245120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751141
4055	NC_012924	ACG	2	6	245145	245150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751142
4056	NC_012924	CTTGG	2	10	245151	245160	0 %	40 %	40 %	20 %	253751142
4057	NC_012924	AGC	2	6	245169	245174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751142
4058	NC_012924	A	6	6	245403	245408	100 %	0 %	0 %	0 %	253751142
4059	NC_012924	AAG	2	6	245413	245418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751142
4060	NC_012924	TGA	2	6	245515	245520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
4061	NC_012924	AG	3	6	245594	245599	50 %	0 %	50 %	0 %	253751142
4062	NC_012924	TCT	2	6	245668	245673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751142
4063	NC_012924	TAG	2	6	245700	245705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
4064	NC_012924	GAT	2	6	245715	245720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
4065	NC_012924	AT	3	6	245719	245724	50 %	50 %	0 %	0 %	253751142
4066	NC_012924	GTA	2	6	245725	245730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751142
4067	NC_012924	GAA	2	6	245769	245774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751142
4068	NC_012924	AG	3	6	245792	245797	50 %	0 %	50 %	0 %	253751142
4069	NC_012924	AGAA	2	8	245836	245843	75 %	0 %	25 %	0 %	253751142
4070	NC_012924	TCA	2	6	245864	245869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751142
4071	NC_012924	CTC	2	6	245911	245916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253751143
4072	NC_012924	AAT	2	6	245976	245981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751143
4073	NC_012924	ATC	2	6	246052	246057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751143
4074	NC_012924	GAGAA	2	10	246116	246125	60 %	0 %	40 %	0 %	253751143
4075	NC_012924	CTT	2	6	246181	246186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751143
4076	NC_012924	GGT	2	6	246259	246264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751143
4077	NC_012924	TGGT	2	8	246333	246340	0 %	50 %	50 %	0 %	253751143
4078	NC_012924	A	7	7	246347	246353	100 %	0 %	0 %	0 %	253751143
4079	NC_012924	TGG	2	6	246365	246370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751143
4080	NC_012924	ATA	2	6	246437	246442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751143
4081	NC_012924	TCAA	2	8	246461	246468	50 %	25 %	0 %	25 %	253751143
4082	NC_012924	CAT	2	6	246504	246509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751143
4083	NC_012924	TCCAA	2	10	246552	246561	40 %	20 %	0 %	40 %	253751143
4084	NC_012924	TGG	3	9	246687	246695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751143
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4087	NC_012924	CAG	2	6	246768	246773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751143
4088	NC_012924	ATCAT	2	10	246875	246884	40 %	40 %	0 %	20 %	253751143
4089	NC_012924	TTA	2	6	246978	246983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751144
4090	NC_012924	AT	3	6	246995	247000	50 %	50 %	0 %	0 %	253751144
4091	NC_012924	GAG	2	6	247002	247007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751144
4092	NC_012924	GAA	2	6	247048	247053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751144
4093	NC_012924	TGC	2	6	247071	247076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751144
4094	NC_012924	CAA	2	6	247137	247142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751144
4095	NC_012924	ATG	2	6	247251	247256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751144
4096	NC_012924	CAT	2	6	247269	247274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751144
4097	NC_012924	CAG	2	6	247380	247385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751144
4098	NC_012924	GT	3	6	247396	247401	0 %	50 %	50 %	0 %	253751144
4099	NC_012924	TGT	3	9	247399	247407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751144
4100	NC_012924	CAGG	2	8	247432	247439	25 %	0 %	50 %	25 %	253751144
4101	NC_012924	GTTC	2	8	247469	247476	0 %	50 %	25 %	25 %	253751144
4102	NC_012924	A	6	6	247650	247655	100 %	0 %	0 %	0 %	253751145
4103	NC_012924	TCAA	2	8	247774	247781	50 %	25 %	0 %	25 %	253751145
4104	NC_012924	TGA	2	6	247823	247828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751145
4105	NC_012924	TGG	2	6	247831	247836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751145
4106	NC_012924	AG	3	6	247847	247852	50 %	0 %	50 %	0 %	253751145
4107	NC_012924	GAA	2	6	247905	247910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751145
4108	NC_012924	ACT	2	6	247915	247920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751145
4109	NC_012924	TCA	2	6	247927	247932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751145
4110	NC_012924	AGA	2	6	247940	247945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751145
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4112	NC_012924	GA	3	6	248129	248134	50 %	0 %	50 %	0 %	253751145
4113	NC_012924	GGC	2	6	248156	248161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751145
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4115	NC_012924	TCA	2	6	248431	248436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751145
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4118	NC_012924	GCAG	2	8	248504	248511	25 %	0 %	50 %	25 %	253751145
4119	NC_012924	AAC	2	6	248518	248523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751145
4120	NC_012924	CTG	2	6	248545	248550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751145
4121	NC_012924	ATCA	2	8	248607	248614	50 %	25 %	0 %	25 %	253751145
4122	NC_012924	GGA	2	6	248640	248645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751145
4123	NC_012924	ACTCT	2	10	248659	248668	20 %	40 %	0 %	40 %	253751145
4124	NC_012924	TTG	2	6	248709	248714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751145
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4127	NC_012924	TTGG	2	8	248805	248812	0 %	50 %	50 %	0 %	253751145
4128	NC_012924	TGGCA	2	10	248915	248924	20 %	20 %	40 %	20 %	253751145
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4240	NC_012924	T	6	6	254409	254414	0 %	100 %	0 %	0 %	253751151
4241	NC_012924	AT	3	6	254629	254634	50 %	50 %	0 %	0 %	253751152
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4247	NC_012924	GAAA	2	8	255013	255020	75 %	0 %	25 %	0 %	253751152
4248	NC_012924	TTC	2	6	255080	255085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751152
4249	NC_012924	GTTG	2	8	255124	255131	0 %	50 %	50 %	0 %	253751152
4250	NC_012924	ATTG	2	8	255136	255143	25 %	50 %	25 %	0 %	253751152
4251	NC_012924	TTG	2	6	255246	255251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751152
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4253	NC_012924	CTT	2	6	255323	255328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751152
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4259	NC_012924	TTG	2	6	255940	255945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751153
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4284	NC_012924	AAG	2	6	256913	256918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751153
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4302	NC_012924	A	8	8	257934	257941	100 %	0 %	0 %	0 %	253751155
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4351	NC_012924	T	6	6	263206	263211	0 %	100 %	0 %	0 %	253751157
4352	NC_012924	TAT	2	6	263284	263289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751158
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4360	NC_012924	TTTC	2	8	263468	263475	0 %	75 %	0 %	25 %	253751158
4361	NC_012924	TAT	2	6	263740	263745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751159
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4365	NC_012924	GTT	2	6	263999	264004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751159
4366	NC_012924	GCAG	2	8	264097	264104	25 %	0 %	50 %	25 %	253751159
4367	NC_012924	GTC	2	6	264105	264110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751159
4368	NC_012924	CCA	2	6	264121	264126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751159
4369	NC_012924	CTT	2	6	264196	264201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751159
4370	NC_012924	AG	3	6	264256	264261	50 %	0 %	50 %	0 %	253751159
4371	NC_012924	TGC	2	6	264265	264270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751159
4372	NC_012924	TTGA	2	8	264284	264291	25 %	50 %	25 %	0 %	253751159
4373	NC_012924	CGC	2	6	264300	264305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253751159
4374	NC_012924	AGA	2	6	264343	264348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751159
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4376	NC_012924	AGA	2	6	264382	264387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751159
4377	NC_012924	GAA	2	6	264434	264439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751159
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4381	NC_012924	TGACC	2	10	264577	264586	20 %	20 %	20 %	40 %	253751159
4382	NC_012924	ACG	2	6	264606	264611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751159
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4389	NC_012924	AGA	2	6	265006	265011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751159
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4401	NC_012924	CCA	2	6	265616	265621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751160
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4407	NC_012924	AG	3	6	265824	265829	50 %	0 %	50 %	0 %	253751160
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4425	NC_012924	TCT	2	6	267051	267056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751161
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4466	NC_012924	CGAC	2	8	269727	269734	25 %	0 %	25 %	50 %	253751162
4467	NC_012924	GGT	2	6	269735	269740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751162
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4472	NC_012924	GGCGAC	2	12	270019	270030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253751162
4473	NC_012924	AGGCA	2	10	270088	270097	40 %	0 %	40 %	20 %	253751162
4474	NC_012924	CA	3	6	270127	270132	50 %	0 %	0 %	50 %	253751162
4475	NC_012924	TCT	2	6	270141	270146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751162
4476	NC_012924	GTG	2	6	270215	270220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751162
4477	NC_012924	CGA	2	6	270238	270243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751162
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4479	NC_012924	GCG	2	6	270413	270418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751162
4480	NC_012924	TTA	2	6	270475	270480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751162
4481	NC_012924	CAAA	2	8	270484	270491	75 %	0 %	0 %	25 %	253751162
4482	NC_012924	ACA	2	6	270531	270536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751162
4483	NC_012924	CTT	2	6	270550	270555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751162
4484	NC_012924	ACC	2	6	270596	270601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751162
4485	NC_012924	GTCC	2	8	270603	270610	0 %	25 %	25 %	50 %	253751162
4486	NC_012924	TCT	2	6	270626	270631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751162
4487	NC_012924	AGCTG	2	10	270682	270691	20 %	20 %	40 %	20 %	253751162
4488	NC_012924	TGC	2	6	270760	270765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751162
4489	NC_012924	GAA	3	9	270779	270787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751162
4490	NC_012924	CCA	2	6	271034	271039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751162
4491	NC_012924	CGT	2	6	271081	271086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751162
4492	NC_012924	GAT	2	6	271260	271265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751163
4493	NC_012924	AGAAA	2	10	271293	271302	80 %	0 %	20 %	0 %	253751163
4494	NC_012924	A	6	6	271300	271305	100 %	0 %	0 %	0 %	253751163
4495	NC_012924	ATT	2	6	271399	271404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751163
4496	NC_012924	CTA	2	6	271437	271442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751163
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4498	NC_012924	GGGCT	2	10	271540	271549	0 %	20 %	60 %	20 %	253751163
4499	NC_012924	TCTT	2	8	271579	271586	0 %	75 %	0 %	25 %	253751163
4500	NC_012924	CGG	3	9	271631	271639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751163

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