MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 35526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012924	CCAA	2	8	212078	212085	50 %	0 %	0 %	50 %	253751114
3502	NC_012924	GAT	2	6	212112	212117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751114
3503	NC_012924	ATC	2	6	212136	212141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751114
3504	NC_012924	TCC	2	6	212152	212157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253751114
3505	NC_012924	TGG	2	6	212189	212194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751114
3506	NC_012924	ATTC	2	8	212213	212220	25 %	50 %	0 %	25 %	253751114
3507	NC_012924	AGG	2	6	212254	212259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751114
3508	NC_012924	TTC	2	6	212268	212273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751114
3509	NC_012924	GTT	2	6	212338	212343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751114
3510	NC_012924	CTT	2	6	212405	212410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751114
3511	NC_012924	GA	3	6	212430	212435	50 %	0 %	50 %	0 %	253751114
3512	NC_012924	T	6	6	212500	212505	0 %	100 %	0 %	0 %	253751114
3513	NC_012924	TGT	2	6	212558	212563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751114
3514	NC_012924	CTT	2	6	212579	212584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751114
3515	NC_012924	GTC	2	6	212595	212600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751114
3516	NC_012924	CAG	2	6	212630	212635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751114
3517	NC_012924	CAG	2	6	212667	212672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751114
3518	NC_012924	ATGA	2	8	212736	212743	50 %	25 %	25 %	0 %	253751114
3519	NC_012924	AAT	2	6	212874	212879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751114
3520	NC_012924	T	6	6	212888	212893	0 %	100 %	0 %	0 %	253751114
3521	NC_012924	T	6	6	213101	213106	0 %	100 %	0 %	0 %	253751114
3522	NC_012924	GACCA	2	10	213156	213165	40 %	0 %	20 %	40 %	253751114
3523	NC_012924	TGC	2	6	213179	213184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751114
3524	NC_012924	GCT	2	6	213206	213211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751114
3525	NC_012924	TCT	2	6	213256	213261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751114
3526	NC_012924	AAT	2	6	213294	213299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751114
3527	NC_012924	TCA	2	6	213307	213312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751114
3528	NC_012924	GTCT	2	8	213321	213328	0 %	50 %	25 %	25 %	253751114
3529	NC_012924	AAT	2	6	213378	213383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751114
3530	NC_012924	GTA	2	6	213786	213791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751115
3531	NC_012924	TG	3	6	213841	213846	0 %	50 %	50 %	0 %	253751115
3532	NC_012924	CAG	2	6	213854	213859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751115
3533	NC_012924	TTGT	2	8	213879	213886	0 %	75 %	25 %	0 %	253751115
3534	NC_012924	CTT	2	6	213899	213904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751115
3535	NC_012924	TAAG	2	8	213942	213949	50 %	25 %	25 %	0 %	253751115
3536	NC_012924	CTGT	2	8	214057	214064	0 %	50 %	25 %	25 %	253751115
3537	NC_012924	ACA	2	6	214075	214080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751115
3538	NC_012924	ATG	2	6	214114	214119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751115
3539	NC_012924	A	7	7	214200	214206	100 %	0 %	0 %	0 %	253751115
3540	NC_012924	AAG	2	6	214243	214248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751115
3541	NC_012924	GTG	2	6	214256	214261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751115
3542	NC_012924	GTTTT	2	10	214265	214274	0 %	80 %	20 %	0 %	253751115
3543	NC_012924	T	6	6	214271	214276	0 %	100 %	0 %	0 %	253751115
3544	NC_012924	AAT	2	6	214306	214311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751116
3545	NC_012924	CCATA	2	10	214367	214376	40 %	20 %	0 %	40 %	253751116
3546	NC_012924	TGCT	2	8	214388	214395	0 %	50 %	25 %	25 %	253751116
3547	NC_012924	CTT	2	6	214483	214488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751116
3548	NC_012924	AGA	2	6	214497	214502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751116
3549	NC_012924	TCT	2	6	214537	214542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751116
3550	NC_012924	TTGG	2	8	214563	214570	0 %	50 %	50 %	0 %	253751116
3551	NC_012924	CTTC	2	8	214571	214578	0 %	50 %	0 %	50 %	253751116
3552	NC_012924	TCT	2	6	214628	214633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751116
3553	NC_012924	GACA	2	8	214692	214699	50 %	0 %	25 %	25 %	253751116
3554	NC_012924	T	6	6	214734	214739	0 %	100 %	0 %	0 %	253751116
3555	NC_012924	TGG	2	6	214759	214764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751116
3556	NC_012924	AG	3	6	214781	214786	50 %	0 %	50 %	0 %	253751116
3557	NC_012924	T	6	6	214802	214807	0 %	100 %	0 %	0 %	253751116
3558	NC_012924	T	7	7	214817	214823	0 %	100 %	0 %	0 %	253751116
3559	NC_012924	ATC	2	6	214827	214832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751116
3560	NC_012924	TCT	2	6	214861	214866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751116
3561	NC_012924	GCTT	2	8	215001	215008	0 %	50 %	25 %	25 %	253751116
3562	NC_012924	CAT	2	6	215139	215144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751116
3563	NC_012924	GGA	2	6	215358	215363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751117
3564	NC_012924	ATT	2	6	215518	215523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751117
3565	NC_012924	AGA	2	6	215585	215590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751117
3566	NC_012924	GTC	2	6	215628	215633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751117
3567	NC_012924	GAT	2	6	215720	215725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751117
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3569	NC_012924	CGG	2	6	215792	215797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751117
3570	NC_012924	ATG	2	6	215932	215937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751117
3571	NC_012924	AAG	2	6	216082	216087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751117
3572	NC_012924	GAA	2	6	216246	216251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751117
3573	NC_012924	AAG	2	6	216678	216683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751118
3574	NC_012924	GAT	2	6	216728	216733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751118
3575	NC_012924	AAG	3	9	216802	216810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751118
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3578	NC_012924	GAC	3	9	216944	216952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751118
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3580	NC_012924	GTT	2	6	217074	217079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751118
3581	NC_012924	TCA	2	6	217095	217100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751118
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3583	NC_012924	ACA	2	6	217275	217280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751118
3584	NC_012924	ATG	2	6	217294	217299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751118
3585	NC_012924	AGC	2	6	217319	217324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751118
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3587	NC_012924	AGCTC	2	10	217437	217446	20 %	20 %	20 %	40 %	253751118
3588	NC_012924	GGC	2	6	217460	217465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751118
3589	NC_012924	CAT	2	6	217505	217510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751118
3590	NC_012924	TTTA	2	8	218050	218057	25 %	75 %	0 %	0 %	253751119
3591	NC_012924	T	7	7	218095	218101	0 %	100 %	0 %	0 %	253751119
3592	NC_012924	TGT	2	6	218110	218115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751119
3593	NC_012924	TGA	2	6	218128	218133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751119
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3597	NC_012924	TCCACG	2	12	218550	218561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	253751119
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3599	NC_012924	TCCT	2	8	218669	218676	0 %	50 %	0 %	50 %	253751119
3600	NC_012924	CAA	2	6	218695	218700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751119
3601	NC_012924	GTT	2	6	218729	218734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751119
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3603	NC_012924	TTC	2	6	218804	218809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
3604	NC_012924	AAAGTC	2	12	218810	218821	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	253751119
3605	NC_012924	ATG	2	6	218823	218828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751119
3606	NC_012924	GTG	2	6	218864	218869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751119
3607	NC_012924	TGG	3	9	218932	218940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751119
3608	NC_012924	TCA	2	6	218995	219000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751119
3609	NC_012924	CGGT	2	8	219027	219034	0 %	25 %	50 %	25 %	253751119
3610	NC_012924	TCT	2	6	219066	219071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
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3612	NC_012924	ACC	2	6	219147	219152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751119
3613	NC_012924	TTC	2	6	219161	219166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
3614	NC_012924	GTA	2	6	219224	219229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751119
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3616	NC_012924	CAGT	2	8	219282	219289	25 %	25 %	25 %	25 %	253751119
3617	NC_012924	TTC	2	6	219434	219439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751119
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3620	NC_012924	TGGT	2	8	219842	219849	0 %	50 %	50 %	0 %	253751120
3621	NC_012924	CAG	2	6	219879	219884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751120
3622	NC_012924	TGA	2	6	219888	219893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751120
3623	NC_012924	TCCAA	2	10	219974	219983	40 %	20 %	0 %	40 %	253751120
3624	NC_012924	AGC	2	6	220213	220218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751120
3625	NC_012924	CAA	2	6	220227	220232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751120
3626	NC_012924	CTT	2	6	220254	220259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
3627	NC_012924	TCT	2	6	220268	220273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
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3634	NC_012924	AGC	2	6	220474	220479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751120
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3636	NC_012924	ACC	2	6	220669	220674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751120
3637	NC_012924	CAAT	2	8	220683	220690	50 %	25 %	0 %	25 %	253751120
3638	NC_012924	GAT	2	6	220867	220872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751120
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3653	NC_012924	CTT	2	6	221730	221735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751120
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3657	NC_012924	A	6	6	222022	222027	100 %	0 %	0 %	0 %	253751121
3658	NC_012924	CAG	2	6	222072	222077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751121
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3669	NC_012924	TTGA	2	8	223032	223039	25 %	50 %	25 %	0 %	253751122
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3729	NC_012924	TGA	2	6	226206	226211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751125
3730	NC_012924	ATC	2	6	226253	226258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751125
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3732	NC_012924	GAG	2	6	226324	226329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751125
3733	NC_012924	AGGGC	2	10	226407	226416	20 %	0 %	60 %	20 %	253751125
3734	NC_012924	AGCAG	2	10	226440	226449	40 %	0 %	40 %	20 %	253751125
3735	NC_012924	GAT	2	6	226498	226503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751125
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3738	NC_012924	GA	3	6	226668	226673	50 %	0 %	50 %	0 %	253751125
3739	NC_012924	GAA	2	6	226693	226698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751125
3740	NC_012924	AGA	2	6	226722	226727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751125
3741	NC_012924	TGG	2	6	226751	226756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751125
3742	NC_012924	A	6	6	226766	226771	100 %	0 %	0 %	0 %	253751125
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3987	NC_012924	TGA	2	6	240541	240546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751137
3988	NC_012924	TTC	2	6	240581	240586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751137
3989	NC_012924	AGA	2	6	240628	240633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751137
3990	NC_012924	GGA	2	6	240649	240654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751137
3991	NC_012924	AAG	2	6	240694	240699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751137
3992	NC_012924	TGA	2	6	240998	241003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751138
3993	NC_012924	GCA	2	6	241006	241011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751138
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3995	NC_012924	CG	3	6	241102	241107	0 %	0 %	50 %	50 %	253751138
3996	NC_012924	GGCTT	2	10	241177	241186	0 %	40 %	40 %	20 %	253751138
3997	NC_012924	CTA	2	6	241201	241206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751138
3998	NC_012924	TGA	2	6	241266	241271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751138
3999	NC_012924	TCTT	2	8	241332	241339	0 %	75 %	0 %	25 %	253751138
4000	NC_012924	AGG	2	6	241403	241408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751138

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