MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 35526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_012924	TAA	2	6	1353050	1353055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752122
23003	NC_012924	A	6	6	1353054	1353059	100 %	0 %	0 %	0 %	253752122
23004	NC_012924	CTC	2	6	1353078	1353083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752123
23005	NC_012924	TGT	2	6	1353095	1353100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752123
23006	NC_012924	GCAA	2	8	1353134	1353141	50 %	0 %	25 %	25 %	253752123
23007	NC_012924	CAG	2	6	1353210	1353215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752123
23008	NC_012924	ATC	2	6	1353316	1353321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752123
23009	NC_012924	GTT	2	6	1353372	1353377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752123
23010	NC_012924	ACC	2	6	1353382	1353387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752123
23011	NC_012924	AC	3	6	1353396	1353401	50 %	0 %	0 %	50 %	253752123
23012	NC_012924	GCT	2	6	1353461	1353466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752123
23013	NC_012924	CTA	2	6	1353497	1353502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752123
23014	NC_012924	T	6	6	1353576	1353581	0 %	100 %	0 %	0 %	253752123
23015	NC_012924	TGA	2	6	1353617	1353622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752123
23016	NC_012924	TGA	2	6	1353624	1353629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752123
23017	NC_012924	A	6	6	1353629	1353634	100 %	0 %	0 %	0 %	253752123
23018	NC_012924	GGCT	2	8	1353756	1353763	0 %	25 %	50 %	25 %	253752123
23019	NC_012924	ATC	2	6	1353850	1353855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752123
23020	NC_012924	TAG	2	6	1354041	1354046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752123
23021	NC_012924	T	6	6	1354162	1354167	0 %	100 %	0 %	0 %	253752123
23022	NC_012924	ATT	2	6	1354216	1354221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752123
23023	NC_012924	A	6	6	1354279	1354284	100 %	0 %	0 %	0 %	253752123
23024	NC_012924	GTA	2	6	1354311	1354316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752123
23025	NC_012924	CTA	2	6	1354320	1354325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752123
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23027	NC_012924	GAC	2	6	1354390	1354395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752123
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23029	NC_012924	T	6	6	1354510	1354515	0 %	100 %	0 %	0 %	253752123
23030	NC_012924	TGC	2	6	1354526	1354531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752123
23031	NC_012924	AAT	2	6	1354562	1354567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752123
23032	NC_012924	CAATAA	2	12	1354612	1354623	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	253752123
23033	NC_012924	ATTC	2	8	1354656	1354663	25 %	50 %	0 %	25 %	253752123
23034	NC_012924	ATAA	2	8	1354723	1354730	75 %	25 %	0 %	0 %	253752123
23035	NC_012924	ATAG	2	8	1354749	1354756	50 %	25 %	25 %	0 %	253752123
23036	NC_012924	AT	3	6	1354799	1354804	50 %	50 %	0 %	0 %	253752123
23037	NC_012924	GAT	2	6	1355559	1355564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752124
23038	NC_012924	CAT	2	6	1355615	1355620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752124
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23040	NC_012924	AATC	2	8	1355729	1355736	50 %	25 %	0 %	25 %	253752124
23041	NC_012924	CGT	2	6	1355799	1355804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752124
23042	NC_012924	A	6	6	1355850	1355855	100 %	0 %	0 %	0 %	253752124
23043	NC_012924	AAC	2	6	1356010	1356015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752125
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23046	NC_012924	GAAA	2	8	1356077	1356084	75 %	0 %	25 %	0 %	253752125
23047	NC_012924	AC	3	6	1356156	1356161	50 %	0 %	0 %	50 %	253752125
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23051	NC_012924	GCT	2	6	1356206	1356211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752125
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23053	NC_012924	TTA	2	6	1356269	1356274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752125
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23055	NC_012924	CTC	2	6	1356422	1356427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752125
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23058	NC_012924	TAT	2	6	1356522	1356527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752125
23059	NC_012924	A	6	6	1356660	1356665	100 %	0 %	0 %	0 %	253752125
23060	NC_012924	TCAA	2	8	1356696	1356703	50 %	25 %	0 %	25 %	253752125
23061	NC_012924	CCCT	2	8	1356810	1356817	0 %	25 %	0 %	75 %	253752125
23062	NC_012924	GGTA	2	8	1356865	1356872	25 %	25 %	50 %	0 %	253752125
23063	NC_012924	GACT	2	8	1356880	1356887	25 %	25 %	25 %	25 %	253752125
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23067	NC_012924	CTTT	2	8	1357299	1357306	0 %	75 %	0 %	25 %	253752125
23068	NC_012924	A	6	6	1357381	1357386	100 %	0 %	0 %	0 %	253752125
23069	NC_012924	TGG	2	6	1357399	1357404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253752125
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23073	NC_012924	GAA	2	6	1357751	1357756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752125
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23076	NC_012924	AGT	2	6	1357937	1357942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752125
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23079	NC_012924	CCAA	2	8	1358054	1358061	50 %	0 %	0 %	50 %	253752125
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23084	NC_012924	AAT	2	6	1358618	1358623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752126
23085	NC_012924	CAG	2	6	1358656	1358661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752126
23086	NC_012924	TGC	2	6	1358681	1358686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752126
23087	NC_012924	CTG	2	6	1358785	1358790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752126
23088	NC_012924	TC	3	6	1359001	1359006	0 %	50 %	0 %	50 %	253752126
23089	NC_012924	ACCA	2	8	1359131	1359138	50 %	0 %	0 %	50 %	253752126
23090	NC_012924	A	6	6	1359227	1359232	100 %	0 %	0 %	0 %	253752126
23091	NC_012924	TCA	2	6	1359268	1359273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752127
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23100	NC_012924	ACG	2	6	1359687	1359692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752127
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23102	NC_012924	TC	3	6	1359706	1359711	0 %	50 %	0 %	50 %	253752127
23103	NC_012924	TCC	2	6	1359769	1359774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253752127
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23107	NC_012924	TCT	2	6	1360269	1360274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752128
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23110	NC_012924	CTTCA	2	10	1360456	1360465	20 %	40 %	0 %	40 %	253752128
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23112	NC_012924	ATC	2	6	1360492	1360497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752128
23113	NC_012924	GAC	2	6	1360536	1360541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752128
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23115	NC_012924	TCA	2	6	1360658	1360663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752128
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23117	NC_012924	ACC	2	6	1360762	1360767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752128
23118	NC_012924	TGGA	2	8	1360774	1360781	25 %	25 %	50 %	0 %	253752128
23119	NC_012924	CAAC	2	8	1360875	1360882	50 %	0 %	0 %	50 %	253752128
23120	NC_012924	TCT	2	6	1360901	1360906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752128
23121	NC_012924	TCA	2	6	1360934	1360939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752128
23122	NC_012924	T	6	6	1360976	1360981	0 %	100 %	0 %	0 %	253752128
23123	NC_012924	ATTC	2	8	1360983	1360990	25 %	50 %	0 %	25 %	253752128
23124	NC_012924	TCT	2	6	1361004	1361009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752128
23125	NC_012924	TCT	2	6	1361072	1361077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752128
23126	NC_012924	AAG	2	6	1361110	1361115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752128
23127	NC_012924	T	6	6	1361120	1361125	0 %	100 %	0 %	0 %	253752128
23128	NC_012924	TTC	2	6	1361132	1361137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752128
23129	NC_012924	CTG	2	6	1361155	1361160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752128
23130	NC_012924	CAT	3	9	1361255	1361263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752129
23131	NC_012924	TGA	2	6	1361268	1361273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752129
23132	NC_012924	TCA	2	6	1361299	1361304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752129
23133	NC_012924	T	6	6	1361367	1361372	0 %	100 %	0 %	0 %	253752129
23134	NC_012924	GAT	2	6	1361376	1361381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752129
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23136	NC_012924	GCTCAG	2	12	1361534	1361545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253752129
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23141	NC_012924	GACA	2	8	1361695	1361702	50 %	0 %	25 %	25 %	253752129
23142	NC_012924	CAC	2	6	1361774	1361779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752129
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23145	NC_012924	CCA	2	6	1361924	1361929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752129
23146	NC_012924	ATCTT	2	10	1362004	1362013	20 %	60 %	0 %	20 %	253752129
23147	NC_012924	TCT	2	6	1362077	1362082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752129
23148	NC_012924	TTC	2	6	1362171	1362176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752129
23149	NC_012924	ATC	2	6	1362252	1362257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752129
23150	NC_012924	TAA	2	6	1362305	1362310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752129
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23152	NC_012924	A	6	6	1362400	1362405	100 %	0 %	0 %	0 %	253752130
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23154	NC_012924	A	6	6	1362420	1362425	100 %	0 %	0 %	0 %	253752130
23155	NC_012924	ACAT	2	8	1362470	1362477	50 %	25 %	0 %	25 %	253752130
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23161	NC_012924	CTTA	2	8	1363023	1363030	25 %	50 %	0 %	25 %	253752131
23162	NC_012924	AAG	2	6	1363122	1363127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752131
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23184	NC_012924	AATC	2	8	1364463	1364470	50 %	25 %	0 %	25 %	253752134
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23193	NC_012924	CAG	2	6	1364798	1364803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752134
23194	NC_012924	T	6	6	1364831	1364836	0 %	100 %	0 %	0 %	253752134
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23211	NC_012924	CAAT	2	8	1365707	1365714	50 %	25 %	0 %	25 %	253752134
23212	NC_012924	TTGC	2	8	1365772	1365779	0 %	50 %	25 %	25 %	253752134
23213	NC_012924	CTT	2	6	1365788	1365793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752134
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23217	NC_012924	GAT	2	6	1365921	1365926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752134
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23219	NC_012924	CCGCAA	2	12	1366004	1366015	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	253752134
23220	NC_012924	CAC	2	6	1366052	1366057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752134
23221	NC_012924	AGCA	2	8	1366173	1366180	50 %	0 %	25 %	25 %	253752134
23222	NC_012924	GTAA	2	8	1366245	1366252	50 %	25 %	25 %	0 %	253752134
23223	NC_012924	CAA	2	6	1366389	1366394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752134
23224	NC_012924	ACA	2	6	1366411	1366416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752134
23225	NC_012924	CAAG	2	8	1366427	1366434	50 %	0 %	25 %	25 %	253752134
23226	NC_012924	T	6	6	1366519	1366524	0 %	100 %	0 %	0 %	253752134
23227	NC_012924	GAT	2	6	1366599	1366604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752134
23228	NC_012924	TGC	3	9	1366653	1366661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752134
23229	NC_012924	ATC	2	6	1366675	1366680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752134
23230	NC_012924	TCA	2	6	1366777	1366782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752134
23231	NC_012924	AGA	2	6	1366800	1366805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752134
23232	NC_012924	AAAC	2	8	1367204	1367211	75 %	0 %	0 %	25 %	253752135
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23351	NC_012924	ATT	2	6	1376624	1376629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253752141
23352	NC_012924	GAG	2	6	1376652	1376657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253752141
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23363	NC_012924	TATCC	2	10	1377399	1377408	20 %	40 %	0 %	40 %	253752143
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23455	NC_012924	GAC	2	6	1386388	1386393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752150
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23465	NC_012924	AAG	2	6	1386704	1386709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752151
23466	NC_012924	GT	3	6	1386843	1386848	0 %	50 %	50 %	0 %	253752151
23467	NC_012924	GGAT	2	8	1386865	1386872	25 %	25 %	50 %	0 %	253752151
23468	NC_012924	AAT	2	6	1386925	1386930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752151
23469	NC_012924	ATCA	2	8	1387066	1387073	50 %	25 %	0 %	25 %	253752151
23470	NC_012924	TTG	2	6	1387193	1387198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253752151
23471	NC_012924	AAT	2	6	1387288	1387293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752151
23472	NC_012924	AAG	2	6	1387300	1387305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253752151
23473	NC_012924	GAGC	2	8	1387328	1387335	25 %	0 %	50 %	25 %	253752151
23474	NC_012924	GATAC	2	10	1387345	1387354	40 %	20 %	20 %	20 %	253752151
23475	NC_012924	AAT	2	6	1387369	1387374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253752151
23476	NC_012924	TCA	2	6	1387460	1387465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752151
23477	NC_012924	GAT	2	6	1387504	1387509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752151
23478	NC_012924	TTC	2	6	1387525	1387530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752151
23479	NC_012924	CTT	2	6	1387644	1387649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752151
23480	NC_012924	CAG	2	6	1387683	1387688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253752151
23481	NC_012924	TGC	2	6	1387840	1387845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752151
23482	NC_012924	ATTT	2	8	1388226	1388233	25 %	75 %	0 %	0 %	253752152
23483	NC_012924	GAT	2	6	1388240	1388245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253752152
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23485	NC_012924	AATC	2	8	1388282	1388289	50 %	25 %	0 %	25 %	253752152
23486	NC_012924	ACA	2	6	1388310	1388315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752152
23487	NC_012924	TTC	2	6	1388333	1388338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752152
23488	NC_012924	TCT	2	6	1388355	1388360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752152
23489	NC_012924	T	7	7	1388411	1388417	0 %	100 %	0 %	0 %	253752152
23490	NC_012924	T	6	6	1388450	1388455	0 %	100 %	0 %	0 %	253752152
23491	NC_012924	CAC	2	6	1388608	1388613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253752152
23492	NC_012924	TCCA	2	8	1388654	1388661	25 %	25 %	0 %	50 %	253752152
23493	NC_012924	TCG	2	6	1388685	1388690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253752152
23494	NC_012924	T	6	6	1388694	1388699	0 %	100 %	0 %	0 %	253752152
23495	NC_012924	CTT	2	6	1388770	1388775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253752152
23496	NC_012924	CGG	2	6	1388784	1388789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253752152
23497	NC_012924	CAA	2	6	1388836	1388841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253752152
23498	NC_012924	CGTC	2	8	1388848	1388855	0 %	25 %	25 %	50 %	253752152
23499	NC_012924	CCG	2	6	1388863	1388868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253752152
23500	NC_012924	ATC	2	6	1388898	1388903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253752152

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