MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis SC84

Total Repeats: 35526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012924	TGA	2	6	299987	299992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751188
5002	NC_012924	AG	3	6	300009	300014	50 %	0 %	50 %	0 %	253751188
5003	NC_012924	CATAG	2	10	300096	300105	40 %	20 %	20 %	20 %	253751188
5004	NC_012924	CGT	2	6	300134	300139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751188
5005	NC_012924	CAG	2	6	300197	300202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751188
5006	NC_012924	TTTC	2	8	300314	300321	0 %	75 %	0 %	25 %	253751188
5007	NC_012924	GCT	2	6	300335	300340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751188
5008	NC_012924	CCA	2	6	300365	300370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751188
5009	NC_012924	CCA	2	6	300380	300385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751188
5010	NC_012924	CAT	2	6	300389	300394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751188
5011	NC_012924	CAG	2	6	300458	300463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751188
5012	NC_012924	CCA	2	6	300536	300541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751188
5013	NC_012924	TCT	2	6	300559	300564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751188
5014	NC_012924	AAC	2	6	300654	300659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751188
5015	NC_012924	TGT	2	6	300767	300772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751188
5016	NC_012924	GAA	3	9	300844	300852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751188
5017	NC_012924	CCCAG	2	10	300920	300929	20 %	0 %	20 %	60 %	253751188
5018	NC_012924	AGG	2	6	300943	300948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751188
5019	NC_012924	ACC	3	9	300961	300969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751188
5020	NC_012924	CCG	2	6	301132	301137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253751188
5021	NC_012924	GCCA	2	8	301149	301156	25 %	0 %	25 %	50 %	253751188
5022	NC_012924	TGA	2	6	301217	301222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751188
5023	NC_012924	AGG	2	6	301264	301269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751188
5024	NC_012924	TCA	2	6	301352	301357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751188
5025	NC_012924	AGC	2	6	301359	301364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751188
5026	NC_012924	T	7	7	301379	301385	0 %	100 %	0 %	0 %	253751188
5027	NC_012924	TTC	2	6	301395	301400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751188
5028	NC_012924	AGA	2	6	301407	301412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751188
5029	NC_012924	GAAGAT	2	12	301419	301430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	253751188
5030	NC_012924	TCCA	2	8	301444	301451	25 %	25 %	0 %	50 %	253751188
5031	NC_012924	AGC	2	6	301476	301481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751188
5032	NC_012924	GACA	2	8	301500	301507	50 %	0 %	25 %	25 %	253751188
5033	NC_012924	CCTT	2	8	301537	301544	0 %	50 %	0 %	50 %	253751188
5034	NC_012924	TGA	2	6	301661	301666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751188
5035	NC_012924	TGT	2	6	301675	301680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751188
5036	NC_012924	GGTT	2	8	301685	301692	0 %	50 %	50 %	0 %	253751188
5037	NC_012924	CTTC	2	8	301943	301950	0 %	50 %	0 %	50 %	253751189
5038	NC_012924	TAA	2	6	302041	302046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751189
5039	NC_012924	GTA	2	6	302047	302052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751189
5040	NC_012924	CTT	2	6	302087	302092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751189
5041	NC_012924	GTT	2	6	302109	302114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751189
5042	NC_012924	GGT	2	6	302183	302188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751189
5043	NC_012924	CTTTT	2	10	302247	302256	0 %	80 %	0 %	20 %	253751189
5044	NC_012924	ATT	2	6	302506	302511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751190
5045	NC_012924	ACG	2	6	302516	302521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751190
5046	NC_012924	GAA	2	6	302572	302577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751190
5047	NC_012924	A	6	6	302582	302587	100 %	0 %	0 %	0 %	253751190
5048	NC_012924	TGGC	2	8	302687	302694	0 %	25 %	50 %	25 %	253751190
5049	NC_012924	GAT	2	6	302779	302784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751190
5050	NC_012924	TGG	2	6	302828	302833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751190
5051	NC_012924	ATG	2	6	302857	302862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751190
5052	NC_012924	AGA	2	6	302910	302915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751190
5053	NC_012924	CAG	2	6	303025	303030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751190
5054	NC_012924	T	6	6	303066	303071	0 %	100 %	0 %	0 %	253751190
5055	NC_012924	GGCA	2	8	303192	303199	25 %	0 %	50 %	25 %	253751190
5056	NC_012924	ACC	2	6	303299	303304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751191
5057	NC_012924	CAG	2	6	303407	303412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751191
5058	NC_012924	GCTT	2	8	303456	303463	0 %	50 %	25 %	25 %	253751191
5059	NC_012924	AGCAG	2	10	303478	303487	40 %	0 %	40 %	20 %	253751191
5060	NC_012924	GTCA	2	8	303572	303579	25 %	25 %	25 %	25 %	253751191
5061	NC_012924	TTCC	2	8	303602	303609	0 %	50 %	0 %	50 %	253751191
5062	NC_012924	GGT	2	6	303730	303735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751191
5063	NC_012924	ACG	2	6	303786	303791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751191
5064	NC_012924	GTG	3	9	303800	303808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751191
5065	NC_012924	CTG	2	6	303821	303826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751191
5066	NC_012924	GCG	2	6	303938	303943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751191
5067	NC_012924	GAT	2	6	303956	303961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751191
5068	NC_012924	GGT	2	6	303967	303972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751191
5069	NC_012924	AAAC	2	8	303987	303994	75 %	0 %	0 %	25 %	253751191
5070	NC_012924	CAACTG	2	12	304060	304071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253751192
5071	NC_012924	AAGA	2	8	304125	304132	75 %	0 %	25 %	0 %	253751192
5072	NC_012924	CGG	2	6	304145	304150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751192
5073	NC_012924	TGAT	2	8	304165	304172	25 %	50 %	25 %	0 %	253751192
5074	NC_012924	TTG	2	6	304176	304181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751192
5075	NC_012924	CT	3	6	304287	304292	0 %	50 %	0 %	50 %	253751192
5076	NC_012924	CTA	2	6	304304	304309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751192
5077	NC_012924	TTGGT	2	10	304384	304393	0 %	60 %	40 %	0 %	253751192
5078	NC_012924	AGAA	2	8	304421	304428	75 %	0 %	25 %	0 %	253751192
5079	NC_012924	TTA	2	6	304447	304452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751192
5080	NC_012924	AAG	2	6	304487	304492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751193
5081	NC_012924	GGT	2	6	304602	304607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751193
5082	NC_012924	TATC	2	8	304644	304651	25 %	50 %	0 %	25 %	253751193
5083	NC_012924	TGG	3	9	304688	304696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751193
5084	NC_012924	ACCC	2	8	304743	304750	25 %	0 %	0 %	75 %	253751193
5085	NC_012924	GGT	2	6	304759	304764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751193
5086	NC_012924	GGC	2	6	304776	304781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751193
5087	NC_012924	CGG	2	6	304959	304964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751193
5088	NC_012924	AGC	2	6	304971	304976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751193
5089	NC_012924	GAA	2	6	305076	305081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751194
5090	NC_012924	ATTACC	2	12	305082	305093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751194
5091	NC_012924	ACCC	2	8	305094	305101	25 %	0 %	0 %	75 %	253751194
5092	NC_012924	AGA	2	6	305119	305124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751194
5093	NC_012924	AGG	2	6	305176	305181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253751194
5094	NC_012924	ATG	2	6	305302	305307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751194
5095	NC_012924	GTG	2	6	305328	305333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751194
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5097	NC_012924	CAAAT	2	10	305379	305388	60 %	20 %	0 %	20 %	253751194
5098	NC_012924	CAAA	2	8	305459	305466	75 %	0 %	0 %	25 %	253751194
5099	NC_012924	TCA	2	6	305483	305488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751194
5100	NC_012924	ATG	2	6	305596	305601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751194
5101	NC_012924	CAA	2	6	305912	305917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751195
5102	NC_012924	TAT	2	6	305937	305942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751195
5103	NC_012924	ACT	2	6	305979	305984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751195
5104	NC_012924	ATT	2	6	306005	306010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253751195
5105	NC_012924	TGAG	2	8	306051	306058	25 %	25 %	50 %	0 %	253751195
5106	NC_012924	AGA	2	6	306109	306114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751195
5107	NC_012924	TCG	2	6	306115	306120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751195
5108	NC_012924	TCA	2	6	306254	306259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751195
5109	NC_012924	A	6	6	306350	306355	100 %	0 %	0 %	0 %	253751195
5110	NC_012924	AGA	2	6	306484	306489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751195
5111	NC_012924	CAT	2	6	306505	306510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751195
5112	NC_012924	GGC	2	6	306529	306534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751195
5113	NC_012924	AG	3	6	306536	306541	50 %	0 %	50 %	0 %	253751195
5114	NC_012924	GTG	2	6	306581	306586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751195
5115	NC_012924	CTC	2	6	306592	306597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253751195
5116	NC_012924	A	6	6	306621	306626	100 %	0 %	0 %	0 %	253751195
5117	NC_012924	AAG	2	6	307177	307182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751196
5118	NC_012924	TCTT	2	8	307223	307230	0 %	75 %	0 %	25 %	253751196
5119	NC_012924	GCA	2	6	307241	307246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751196
5120	NC_012924	GTC	2	6	307309	307314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751196
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5122	NC_012924	ACA	2	6	307464	307469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751197
5123	NC_012924	CA	3	6	307468	307473	50 %	0 %	0 %	50 %	253751197
5124	NC_012924	ACA	2	6	307487	307492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751197
5125	NC_012924	GCA	2	6	307561	307566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751197
5126	NC_012924	ACA	2	6	307583	307588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751197
5127	NC_012924	ATTG	2	8	307611	307618	25 %	50 %	25 %	0 %	253751197
5128	NC_012924	GAA	2	6	307669	307674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751197
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5131	NC_012924	GTC	2	6	307721	307726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751197
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5137	NC_012924	TGG	2	6	308094	308099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751197
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5152	NC_012924	GGT	2	6	308792	308797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751198
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5154	NC_012924	GATT	2	8	308844	308851	25 %	50 %	25 %	0 %	253751198
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5161	NC_012924	CATG	2	8	309199	309206	25 %	25 %	25 %	25 %	253751198
5162	NC_012924	A	6	6	309207	309212	100 %	0 %	0 %	0 %	253751198
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5168	NC_012924	CTGT	2	8	309645	309652	0 %	50 %	25 %	25 %	253751199
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5172	NC_012924	AGAGC	2	10	309776	309785	40 %	0 %	40 %	20 %	253751199
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5203	NC_012924	ATG	2	6	312096	312101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751202
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5221	NC_012924	CTTT	2	8	313172	313179	0 %	75 %	0 %	25 %	253751203
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5224	NC_012924	AAAC	2	8	313611	313618	75 %	0 %	0 %	25 %	253751203
5225	NC_012924	AAT	2	6	313635	313640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253751203
5226	NC_012924	A	6	6	313757	313762	100 %	0 %	0 %	0 %	253751204
5227	NC_012924	A	7	7	313766	313772	100 %	0 %	0 %	0 %	253751204
5228	NC_012924	ATC	2	6	313836	313841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751204
5229	NC_012924	AG	3	6	313882	313887	50 %	0 %	50 %	0 %	253751204
5230	NC_012924	GAAA	2	8	313933	313940	75 %	0 %	25 %	0 %	253751204
5231	NC_012924	T	6	6	313993	313998	0 %	100 %	0 %	0 %	253751204
5232	NC_012924	GACC	2	8	314033	314040	25 %	0 %	25 %	50 %	253751204
5233	NC_012924	GGT	2	6	314060	314065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751204
5234	NC_012924	ACCT	2	8	314120	314127	25 %	25 %	0 %	50 %	253751204
5235	NC_012924	TGA	2	6	314131	314136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751204
5236	NC_012924	TGT	2	6	314158	314163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253751204
5237	NC_012924	ACC	2	6	314190	314195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253751204
5238	NC_012924	GAA	2	6	314255	314260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751204
5239	NC_012924	GTC	2	6	314282	314287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253751204
5240	NC_012924	TCA	2	6	314297	314302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751204
5241	NC_012924	CAT	2	6	314311	314316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751204
5242	NC_012924	GGC	2	6	314317	314322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253751204
5243	NC_012924	AGA	2	6	314392	314397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751204
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5245	NC_012924	ATCT	2	8	314492	314499	25 %	50 %	0 %	25 %	253751204
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5368	NC_012924	ATCACT	2	12	320983	320994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751208
5369	NC_012924	AAG	2	6	321029	321034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751208
5370	NC_012924	AGA	2	6	321053	321058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751208
5371	NC_012924	TAC	2	6	321078	321083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751208
5372	NC_012924	AGA	2	6	321161	321166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751208
5373	NC_012924	GAA	2	6	321177	321182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751208
5374	NC_012924	TGA	2	6	321185	321190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751208
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5384	NC_012924	GAA	2	6	321630	321635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751209
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5400	NC_012924	TCC	2	6	322624	322629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253751210
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5402	NC_012924	TAC	2	6	322724	322729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751210
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5405	NC_012924	ACA	2	6	322854	322859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253751210
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5408	NC_012924	AGC	2	6	322972	322977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751210
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5456	NC_012924	TAAGGC	2	12	332315	332326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253751213
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5472	NC_012924	TTTAT	2	10	333352	333361	20 %	80 %	0 %	0 %	253751213
5473	NC_012924	GAA	2	6	333375	333380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253751213
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5475	NC_012924	CAT	2	6	333500	333505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751213
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5477	NC_012924	GAC	2	6	333740	333745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751213
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5479	NC_012924	TGCT	2	8	333943	333950	0 %	50 %	25 %	25 %	253751213
5480	NC_012924	CCT	2	6	334177	334182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253751214
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5482	NC_012924	AGTG	2	8	334341	334348	25 %	25 %	50 %	0 %	253751214
5483	NC_012924	CAG	2	6	334439	334444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751214
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5485	NC_012924	TGG	2	6	334520	334525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253751214
5486	NC_012924	AGC	2	6	334548	334553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253751214
5487	NC_012924	ATC	2	6	334602	334607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751214
5488	NC_012924	TCT	2	6	334738	334743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751214
5489	NC_012924	TTC	2	6	334791	334796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751214
5490	NC_012924	T	6	6	334802	334807	0 %	100 %	0 %	0 %	253751214
5491	NC_012924	TCA	2	6	334817	334822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253751214
5492	NC_012924	TG	3	6	334838	334843	0 %	50 %	50 %	0 %	253751214
5493	NC_012924	TCT	2	6	334885	334890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751214
5494	NC_012924	ATTGG	2	10	334912	334921	20 %	40 %	40 %	0 %	253751214
5495	NC_012924	TGA	2	6	334945	334950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253751214
5496	NC_012924	T	7	7	334994	335000	0 %	100 %	0 %	0 %	253751214
5497	NC_012924	T	6	6	336462	336467	0 %	100 %	0 %	0 %	253751215
5498	NC_012924	AT	3	6	336512	336517	50 %	50 %	0 %	0 %	253751215
5499	NC_012924	CTT	2	6	336681	336686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751215
5500	NC_012924	TTC	2	6	336694	336699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253751215

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