MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	ATGAGG	2	12	1092	1103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238618481
2	NC_012726	GTATTG	2	12	1986	1997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238618481
3	NC_012726	AATTGC	2	12	3086	3097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618483
4	NC_012726	TTTAAG	2	12	3368	3379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618484
5	NC_012726	CCTCTG	2	12	4504	4515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	238618486
6	NC_012726	ATTGAT	2	12	5012	5023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618487
7	NC_012726	TAGTCT	2	12	5323	5334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618487
8	NC_012726	CAATGG	2	12	8395	8406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238618491
9	NC_012726	TATTCG	2	12	13531	13542	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618495
10	NC_012726	GTATTT	2	12	18080	18091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238618499
11	NC_012726	CTATTC	2	12	18259	18270	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238618499
12	NC_012726	GTCACT	2	12	25966	25977	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238618507
13	NC_012726	TCCTCT	2	12	29564	29575	0 %	50 %	0 %	50 %	238618511
14	NC_012726	TTGATT	2	12	31608	31619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238618513
15	NC_012726	AGTGCA	2	12	31701	31712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238618513
16	NC_012726	TAAGAC	2	12	34596	34607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238618517
17	NC_012726	ACGTCT	2	12	34877	34888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238618517
18	NC_012726	TTTATC	2	12	36558	36569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618520
19	NC_012726	TCAGCT	2	12	38192	38203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238618523
20	NC_012726	AAGAAA	2	12	39889	39900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238618525
21	NC_012726	CATTGG	2	12	40207	40218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238618526
22	NC_012726	CTTAAA	2	12	44060	44071	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238618531
23	NC_012726	ATATTC	2	12	44110	44121	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618531
24	NC_012726	GGTGAG	2	12	45302	45313	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	238618533
25	NC_012726	CTTTCT	2	12	47528	47539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618535
26	NC_012726	GTTTTC	2	12	50038	50049	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238618538
27	NC_012726	TAAAAT	2	12	50113	50124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618538
28	NC_012726	TCTAAT	2	12	54158	54169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618542
29	NC_012726	TCTTTT	2	12	54343	54354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238618542
30	NC_012726	CCTCGT	2	12	55607	55618	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	238618543
31	NC_012726	CTTAAT	2	12	59334	59345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618546
32	NC_012726	GAGCTG	2	12	59836	59847	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238618546
33	NC_012726	TGATGC	2	12	60092	60103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238618546
34	NC_012726	AAATGT	2	12	60243	60254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238618546
35	NC_012726	ATAGTC	2	12	65021	65032	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618551
36	NC_012726	CTAGTA	2	12	65829	65840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618552
37	NC_012726	CCGATA	2	12	76143	76154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238618567
38	NC_012726	TTTCAT	2	12	78701	78712	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618570
39	NC_012726	TAGCAT	2	12	82550	82561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618574
40	NC_012726	ACTTTT	2	12	90241	90252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618581
41	NC_012726	AATGTA	2	12	90619	90630	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238618581
42	NC_012726	GGAAGT	2	12	92472	92483	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238618583
43	NC_012726	CTCATT	2	12	97506	97517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238618590
44	NC_012726	AAAGCC	2	12	98220	98231	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	238618591
45	NC_012726	TCTCTA	2	12	106182	106193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238618598
46	NC_012726	GTATTA	2	12	108513	108524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618601
47	NC_012726	CCAATA	2	12	108863	108874	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238618602
48	NC_012726	TATGCT	2	12	109527	109538	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618602
49	NC_012726	TTACAA	2	12	111371	111382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238618605
50	NC_012726	AGTATT	2	12	113029	113040	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618606
51	NC_012726	GTTATA	2	12	114631	114642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618609
52	NC_012726	TAAACA	2	12	116564	116575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238618611
53	NC_012726	TAGAGA	2	12	116714	116725	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618611
54	NC_012726	ACGCAT	2	12	120840	120851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238618616
55	NC_012726	CGGTGG	2	12	122661	122672	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	238618621
56	NC_012726	CATACC	2	12	127658	127669	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	238618625
57	NC_012726	CACATC	2	12	135545	135556	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	238618635
58	NC_012726	TAAGAG	2	12	136789	136800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618637
59	NC_012726	CTATCC	2	12	136893	136904	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238618637
60	NC_012726	GTAATT	2	12	138761	138772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618639
61	NC_012726	TGGTAT	2	12	140409	140420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238618641
62	NC_012726	GCTAAA	2	12	143718	143729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238618647
63	NC_012726	TTAGCT	2	12	148320	148331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618651
64	NC_012726	TAGGAA	2	12	150853	150864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618653
65	NC_012726	TGGTAA	2	12	152547	152558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618655
66	NC_012726	GGTAGT	2	12	160551	160562	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	238618664
67	NC_012726	CTAGAG	2	12	161143	161154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238618665
68	NC_012726	CATCTT	2	12	164879	164890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238618670
69	NC_012726	TGGAAA	2	12	166918	166929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618673
70	NC_012726	AATGAT	2	12	169848	169859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238618676
71	NC_012726	ATAAGG	2	12	170461	170472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618676
72	NC_012726	TTTCTG	2	12	171412	171423	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238618677
73	NC_012726	ATTTCT	2	12	179790	179801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618685
74	NC_012726	TAAGGA	2	12	183214	183225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618689
75	NC_012726	TTCCTC	2	12	185572	185583	0 %	50 %	0 %	50 %	238618693
76	NC_012726	GGAGAA	2	12	196525	196536	50 %	0 %	50 %	0 %	238618708
77	NC_012726	ATTCTC	2	12	199635	199646	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238618711
78	NC_012726	CAAAGG	2	12	201873	201884	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238618713
79	NC_012726	GGCTAA	2	12	202206	202217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238618713
80	NC_012726	TTCTAT	2	12	202540	202551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618714
81	NC_012726	TGAGGA	2	12	203771	203782	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238618715
82	NC_012726	AATGGT	2	12	204179	204190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618715
83	NC_012726	ACTTTT	2	12	206325	206336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618719
84	NC_012726	GAATAA	2	12	209478	209489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238618724
85	NC_012726	TAATTC	2	12	215268	215279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618730
86	NC_012726	TCTATA	2	12	215351	215362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618730
87	NC_012726	TTCAGT	2	12	217345	217356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618733
88	NC_012726	AGGTTT	2	12	218297	218308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238618734
89	NC_012726	TCCAAA	2	12	220498	220509	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238618736
90	NC_012726	TTCCAG	2	12	220926	220937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238618736
91	NC_012726	AATTAA	2	12	225894	225905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618743
92	NC_012726	AGTTTT	2	12	228501	228512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238618746
93	NC_012726	TTTACC	2	12	231476	231487	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238618747
94	NC_012726	TATTTT	2	12	232040	232051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238618748
95	NC_012726	CAGAAG	2	12	233331	233342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238618749
96	NC_012726	GCTGGA	2	12	234600	234611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238618750
97	NC_012726	GCTATT	2	12	236029	236040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618751
98	NC_012726	GTAATC	2	12	244463	244474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618761
99	NC_012726	GAAGAG	2	12	246213	246224	50 %	0 %	50 %	0 %	238618763
100	NC_012726	AATTAA	2	12	246226	246237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618763
101	NC_012726	AAAGAA	2	12	251275	251286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238618769
102	NC_012726	TATAGG	2	12	253065	253076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618771
103	NC_012726	TATGGG	2	12	253302	253313	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	238618771
104	NC_012726	GTAGCG	2	12	253937	253948	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238618772
105	NC_012726	TATTGT	2	12	255037	255048	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	238618774
106	NC_012726	GTTATA	2	12	255798	255809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618775
107	NC_012726	TAATCT	2	12	256684	256695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618776
108	NC_012726	AAGTTG	2	12	259789	259800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618780
109	NC_012726	TTCTAT	2	12	271464	271475	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238618791
110	NC_012726	AATAGG	2	12	271790	271801	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238618791
111	NC_012726	AGTTAC	2	12	274816	274827	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618795
112	NC_012726	TTTTTA	2	12	280454	280465	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	238618799
113	NC_012726	TTCATG	2	12	285459	285470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618804
114	NC_012726	CTAATG	2	12	285820	285831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618805
115	NC_012726	AAGAGA	2	12	290312	290323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618808
116	NC_012726	TACCGT	2	12	290594	290605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238618809
117	NC_012726	TTACTG	2	12	292118	292129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618810
118	NC_012726	TTAATC	2	12	296211	296222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238618817
119	NC_012726	GAGTAG	2	12	304828	304839	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238618829
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225	NC_012726	GATGCT	2	12	640032	640043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238619152
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229	NC_012726	ATAGCT	2	12	659452	659463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619170
230	NC_012726	GCAATA	2	12	659746	659757	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238619170
231	NC_012726	CATAGG	2	12	660765	660776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238619172
232	NC_012726	AATAGC	2	12	660944	660955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238619172
233	NC_012726	ATACCT	2	12	662504	662515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619173
234	NC_012726	GATAAG	2	12	667826	667837	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238619182
235	NC_012726	AGGAAT	2	12	669998	670009	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238619184
236	NC_012726	ATAGTG	2	12	670539	670550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619185
237	NC_012726	AGGATT	2	12	672917	672928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619188
238	NC_012726	TAAAGT	2	12	673147	673158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238619188
239	NC_012726	GATCTT	2	12	675057	675068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238619189
240	NC_012726	ACATGG	2	12	678922	678933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238619191
241	NC_012726	CATGAG	2	12	682385	682396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238619193
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245	NC_012726	ATTAAA	2	12	698015	698026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238619209
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252	NC_012726	TCCCTT	2	12	711935	711946	0 %	50 %	0 %	50 %	238619219
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254	NC_012726	TATTCT	2	12	717529	717540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238619226
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257	NC_012726	CTCATT	2	12	725886	725897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238619237
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259	NC_012726	AATCTG	2	12	735151	735162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619244
260	NC_012726	GAATTG	2	12	739347	739358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619252
261	NC_012726	ATAATT	2	12	739404	739415	50 %	50 %	0 %	0 %	238619252
262	NC_012726	TTCTCG	2	12	744582	744593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238619257
263	NC_012726	ACTTCC	2	12	745047	745058	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238619258
264	NC_012726	TTACCA	2	12	751543	751554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619265
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267	NC_012726	CTAATG	2	12	775761	775772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619290
268	NC_012726	TCTATT	2	12	776021	776032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238619290
269	NC_012726	ACTTAG	2	12	780397	780408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619294
270	NC_012726	ATAAAG	2	12	781314	781325	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238619295
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275	NC_012726	GCTGTA	2	12	804577	804588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238619314
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320	NC_012726	CTTAGC	2	12	955811	955822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238619466
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329	NC_012726	TAACGT	2	12	986843	986854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619496
330	NC_012726	ATTCCA	2	12	991897	991908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619499
331	NC_012726	TGGAGT	2	12	992886	992897	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	238619500
332	NC_012726	TACCAA	2	12	997125	997136	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238619504
333	NC_012726	TATAAT	2	12	998803	998814	50 %	50 %	0 %	0 %	238619504
334	NC_012726	GCTAAT	2	12	999014	999025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619505
335	NC_012726	CCCTAG	2	12	1003093	1003104	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238619509
336	NC_012726	GAAGTT	2	12	1014442	1014453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619522
337	NC_012726	GAAGGA	2	12	1016846	1016857	50 %	0 %	50 %	0 %	238619524
338	NC_012726	AGTGTA	2	12	1017079	1017090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238619524
339	NC_012726	TATTCT	2	12	1017379	1017390	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238619524
340	NC_012726	TACCAT	2	12	1018851	1018862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238619526
341	NC_012726	AGTAAT	2	12	1020802	1020813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238619528
342	NC_012726	GCTCAA	2	12	1034739	1034750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238619541
343	NC_012726	AAAGGG	2	12	1036530	1036541	50 %	0 %	50 %	0 %	238619543
344	NC_012726	TATCAA	2	12	1037539	1037550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238619545
345	NC_012726	TAGACT	2	12	1038034	1038045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238619546
346	NC_012726	AATATT	2	12	1039338	1039349	50 %	50 %	0 %	0 %	238619547
347	NC_012726	CTCACC	2	12	1039362	1039373	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	238619547
348	NC_012726	ATTTTC	2	12	1040548	1040559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238619548
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457	NC_012726	ATTTTC	2	12	1354772	1354783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238619898
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459	NC_012726	AAGAGA	2	12	1362200	1362211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238619906
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