MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 50642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012623	TTA	2	6	280515	280520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581015
5002	NC_012623	TTGA	2	8	280531	280538	25 %	50 %	25 %	0 %	229581015
5003	NC_012623	CT	3	6	280551	280556	0 %	50 %	0 %	50 %	229581015
5004	NC_012623	CTA	2	6	280641	280646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581015
5005	NC_012623	TCT	2	6	280707	280712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581015
5006	NC_012623	AT	3	6	280726	280731	50 %	50 %	0 %	0 %	229581015
5007	NC_012623	ATT	2	6	280814	280819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581015
5008	NC_012623	AAG	2	6	280820	280825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229581015
5009	NC_012623	TAA	2	6	280877	280882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581016
5010	NC_012623	CTA	2	6	280975	280980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581016
5011	NC_012623	AGT	2	6	280982	280987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581016
5012	NC_012623	TCT	2	6	281029	281034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581016
5013	NC_012623	CAT	2	6	281045	281050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581016
5014	NC_012623	GAA	2	6	281060	281065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229581016
5015	NC_012623	TA	3	6	281105	281110	50 %	50 %	0 %	0 %	229581016
5016	NC_012623	AGT	2	6	281148	281153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581016
5017	NC_012623	TAC	2	6	281345	281350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581016
5018	NC_012623	CAA	2	6	281353	281358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229581016
5019	NC_012623	GAT	2	6	281387	281392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581016
5020	NC_012623	ATA	2	6	281479	281484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581016
5021	NC_012623	ATG	2	6	281485	281490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581016
5022	NC_012623	CTA	2	6	281547	281552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581016
5023	NC_012623	ATA	2	6	281565	281570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581016
5024	NC_012623	AGT	3	9	281638	281646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581016
5025	NC_012623	AT	3	6	281771	281776	50 %	50 %	0 %	0 %	229581017
5026	NC_012623	T	6	6	281776	281781	0 %	100 %	0 %	0 %	229581017
5027	NC_012623	AT	3	6	281831	281836	50 %	50 %	0 %	0 %	229581017
5028	NC_012623	AGT	2	6	281968	281973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581017
5029	NC_012623	GCA	2	6	282020	282025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581017
5030	NC_012623	AGG	2	6	282067	282072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229581017
5031	NC_012623	TGT	2	6	282127	282132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229581017
5032	NC_012623	ATG	2	6	282243	282248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581017
5033	NC_012623	CAA	2	6	282251	282256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229581017
5034	NC_012623	GAT	2	6	282295	282300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581017
5035	NC_012623	AAAGT	2	10	282324	282333	60 %	20 %	20 %	0 %	229581017
5036	NC_012623	GCA	2	6	282365	282370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581017
5037	NC_012623	TGAT	2	8	282417	282424	25 %	50 %	25 %	0 %	229581017
5038	NC_012623	AG	3	6	282449	282454	50 %	0 %	50 %	0 %	229581017
5039	NC_012623	CAT	2	6	282476	282481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581017
5040	NC_012623	AGT	2	6	282562	282567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581017
5041	NC_012623	TAA	2	6	282594	282599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581017
5042	NC_012623	TGA	2	6	282618	282623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581017
5043	NC_012623	AGG	2	6	282627	282632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229581017
5044	NC_012623	AGG	2	6	282687	282692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229581017
5045	NC_012623	TTG	2	6	282705	282710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229581017
5046	NC_012623	TAA	2	6	282742	282747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581017
5047	NC_012623	TAG	2	6	282787	282792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581017
5048	NC_012623	AGATG	2	10	282808	282817	40 %	20 %	40 %	0 %	229581017
5049	NC_012623	ATA	2	6	282881	282886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581017
5050	NC_012623	AGC	3	9	282922	282930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581017
5051	NC_012623	AGA	2	6	282982	282987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229581017
5052	NC_012623	GA	3	6	283007	283012	50 %	0 %	50 %	0 %	229581017
5053	NC_012623	ATA	2	6	283013	283018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581017
5054	NC_012623	AGG	2	6	283066	283071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229581017
5055	NC_012623	CTA	2	6	283073	283078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581018
5056	NC_012623	T	6	6	283104	283109	0 %	100 %	0 %	0 %	229581018
5057	NC_012623	ACT	2	6	283146	283151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581018
5058	NC_012623	GGA	2	6	283170	283175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229581018
5059	NC_012623	AGA	2	6	283196	283201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229581018
5060	NC_012623	GAT	2	6	283221	283226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581018
5061	NC_012623	AGT	2	6	283227	283232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581018
5062	NC_012623	TAA	2	6	283274	283279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581018
5063	NC_012623	ATTA	2	8	283314	283321	50 %	50 %	0 %	0 %	229581018
5064	NC_012623	ATA	2	6	283384	283389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581018
5065	NC_012623	AG	3	6	283401	283406	50 %	0 %	50 %	0 %	229581018
5066	NC_012623	AT	3	6	283489	283494	50 %	50 %	0 %	0 %	229581018
5067	NC_012623	T	6	6	283522	283527	0 %	100 %	0 %	0 %	229581019
5068	NC_012623	TTC	2	6	283558	283563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581019
5069	NC_012623	TCT	2	6	283569	283574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581019
5070	NC_012623	CT	4	8	283590	283597	0 %	50 %	0 %	50 %	229581019
5071	NC_012623	CTTG	2	8	283673	283680	0 %	50 %	25 %	25 %	229581019
5072	NC_012623	ATTT	2	8	283742	283749	25 %	75 %	0 %	0 %	229581019
5073	NC_012623	T	6	6	283747	283752	0 %	100 %	0 %	0 %	229581019
5074	NC_012623	T	6	6	283842	283847	0 %	100 %	0 %	0 %	229581019
5075	NC_012623	CAT	2	6	283895	283900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581019
5076	NC_012623	CAA	2	6	284026	284031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229581019
5077	NC_012623	AAT	2	6	284058	284063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581019
5078	NC_012623	TTA	2	6	284094	284099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581019
5079	NC_012623	ATT	2	6	284103	284108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581019
5080	NC_012623	GTC	2	6	284156	284161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229581019
5081	NC_012623	TTA	2	6	284179	284184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581019
5082	NC_012623	AAG	2	6	284217	284222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229581019
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5084	NC_012623	CTA	2	6	284283	284288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581019
5085	NC_012623	TAG	2	6	284293	284298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581019
5086	NC_012623	ATT	2	6	284309	284314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581019
5087	NC_012623	AT	3	6	284386	284391	50 %	50 %	0 %	0 %	229581019
5088	NC_012623	TTC	2	6	284434	284439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581019
5089	NC_012623	AT	3	6	284527	284532	50 %	50 %	0 %	0 %	229581019
5090	NC_012623	TA	3	6	284792	284797	50 %	50 %	0 %	0 %	229581020
5091	NC_012623	GA	3	6	284809	284814	50 %	0 %	50 %	0 %	229581020
5092	NC_012623	GAGG	2	8	284817	284824	25 %	0 %	75 %	0 %	229581020
5093	NC_012623	CCTT	2	8	284859	284866	0 %	50 %	0 %	50 %	229581020
5094	NC_012623	ATC	2	6	284912	284917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581020
5095	NC_012623	AT	3	6	284930	284935	50 %	50 %	0 %	0 %	229581020
5096	NC_012623	CCCT	2	8	284973	284980	0 %	25 %	0 %	75 %	229581020
5097	NC_012623	TTA	2	6	285063	285068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581020
5098	NC_012623	TTCA	2	8	285077	285084	25 %	50 %	0 %	25 %	229581020
5099	NC_012623	CCT	2	6	285190	285195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229581021
5100	NC_012623	TCC	2	6	285232	285237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229581021
5101	NC_012623	TAA	2	6	285301	285306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581021
5102	NC_012623	TATG	2	8	285406	285413	25 %	50 %	25 %	0 %	229581021
5103	NC_012623	TTC	2	6	285418	285423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581021
5104	NC_012623	ATT	2	6	285479	285484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229581021
5105	NC_012623	TTC	2	6	285527	285532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581021
5106	NC_012623	ATTCT	2	10	285546	285555	20 %	60 %	0 %	20 %	229581021
5107	NC_012623	CT	3	6	285558	285563	0 %	50 %	0 %	50 %	229581021
5108	NC_012623	TGCTG	2	10	285572	285581	0 %	40 %	40 %	20 %	229581021
5109	NC_012623	GCT	2	6	285590	285595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229581021
5110	NC_012623	TG	3	6	285602	285607	0 %	50 %	50 %	0 %	229581021
5111	NC_012623	GCA	3	9	285719	285727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581021
5112	NC_012623	GAG	2	6	285743	285748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229581021
5113	NC_012623	TCC	2	6	285794	285799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229581021
5114	NC_012623	ATA	2	6	285844	285849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581021
5115	NC_012623	AT	3	6	285905	285910	50 %	50 %	0 %	0 %	229581021
5116	NC_012623	ACT	2	6	286001	286006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581021
5117	NC_012623	TGC	2	6	286099	286104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229581021
5118	NC_012623	TGC	2	6	286120	286125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229581021
5119	NC_012623	CTA	2	6	286170	286175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581021
5120	NC_012623	CTG	2	6	286179	286184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229581021
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5122	NC_012623	GTATT	2	10	286228	286237	20 %	60 %	20 %	0 %	229581021
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5370	NC_012623	CTTC	2	8	301248	301255	0 %	50 %	0 %	50 %	229581038
5371	NC_012623	GTC	2	6	301261	301266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229581038
5372	NC_012623	ATG	2	6	301284	301289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581038
5373	NC_012623	AT	3	6	301291	301296	50 %	50 %	0 %	0 %	229581038
5374	NC_012623	CT	4	8	301338	301345	0 %	50 %	0 %	50 %	229581038
5375	NC_012623	CAC	2	6	301450	301455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229581039
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5377	NC_012623	TAACT	2	10	301614	301623	40 %	40 %	0 %	20 %	229581039
5378	NC_012623	TCT	2	6	301652	301657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581039
5379	NC_012623	TCT	2	6	301686	301691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581039
5380	NC_012623	GCA	2	6	301758	301763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581039
5381	NC_012623	AT	3	6	301848	301853	50 %	50 %	0 %	0 %	229581039
5382	NC_012623	T	6	6	301872	301877	0 %	100 %	0 %	0 %	229581039
5383	NC_012623	CT	3	6	301903	301908	0 %	50 %	0 %	50 %	229581039
5384	NC_012623	TGA	2	6	301909	301914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581039
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5386	NC_012623	CTTA	2	8	301959	301966	25 %	50 %	0 %	25 %	229581039
5387	NC_012623	AG	3	6	302089	302094	50 %	0 %	50 %	0 %	229581039
5388	NC_012623	CTC	2	6	302100	302105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229581039
5389	NC_012623	GA	3	6	302254	302259	50 %	0 %	50 %	0 %	229581040
5390	NC_012623	AAG	2	6	302262	302267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229581040
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5393	NC_012623	TGAAG	2	10	302298	302307	40 %	20 %	40 %	0 %	229581040
5394	NC_012623	AGTA	2	8	302328	302335	50 %	25 %	25 %	0 %	229581040
5395	NC_012623	T	6	6	302346	302351	0 %	100 %	0 %	0 %	229581040
5396	NC_012623	ACG	2	6	302420	302425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581040
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5398	NC_012623	CCAATA	2	12	302434	302445	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229581040
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5402	NC_012623	A	7	7	302752	302758	100 %	0 %	0 %	0 %	229581040
5403	NC_012623	TGT	2	6	302880	302885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229581040
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5405	NC_012623	TAAG	2	8	302966	302973	50 %	25 %	25 %	0 %	229581040
5406	NC_012623	CAT	2	6	303073	303078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581040
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5409	NC_012623	GAC	2	6	303160	303165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229581040
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5411	NC_012623	GTA	2	6	303218	303223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229581040
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5423	NC_012623	GAAA	2	8	304802	304809	75 %	0 %	25 %	0 %	229581042
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5426	NC_012623	AATT	2	8	305037	305044	50 %	50 %	0 %	0 %	229581043
5427	NC_012623	AAT	2	6	305080	305085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581043
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5439	NC_012623	TTTCA	2	10	309664	309673	20 %	60 %	0 %	20 %	229581045
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5450	NC_012623	CTT	2	6	310384	310389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581045
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5481	NC_012623	CCT	2	6	311339	311344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229581046
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5492	NC_012623	CAA	2	6	311861	311866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229581047
5493	NC_012623	T	6	6	311889	311894	0 %	100 %	0 %	0 %	229581047
5494	NC_012623	ACCT	2	8	312447	312454	25 %	25 %	0 %	50 %	229581048
5495	NC_012623	TCT	2	6	312456	312461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581048
5496	NC_012623	ACA	2	6	312554	312559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229581048
5497	NC_012623	CTA	2	6	312594	312599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229581048
5498	NC_012623	TCT	2	6	312605	312610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229581048
5499	NC_012623	TAA	2	6	312662	312667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229581048
5500	NC_012623	TCC	2	6	312701	312706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229581048

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