MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 50796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012622	ATA	2	6	195303	195308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578045
4002	NC_012622	TTCC	2	8	195346	195353	0 %	50 %	0 %	50 %	229578045
4003	NC_012622	TCT	2	6	195380	195385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578045
4004	NC_012622	CTA	2	6	195391	195396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578045
4005	NC_012622	CAT	3	9	195466	195474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578045
4006	NC_012622	ATT	2	6	195506	195511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578045
4007	NC_012622	TGG	2	6	195533	195538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229578045
4008	NC_012622	AAC	2	6	195807	195812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578046
4009	NC_012622	ATT	3	9	195846	195854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578046
4010	NC_012622	GTT	2	6	195910	195915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229578046
4011	NC_012622	TAT	2	6	195960	195965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578046
4012	NC_012622	TCT	2	6	196054	196059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578046
4013	NC_012622	CTA	2	6	196105	196110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578046
4014	NC_012622	TCC	2	6	196239	196244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229578046
4015	NC_012622	AAC	2	6	196254	196259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578046
4016	NC_012622	T	6	6	196279	196284	0 %	100 %	0 %	0 %	229578046
4017	NC_012622	TAA	2	6	196287	196292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578046
4018	NC_012622	T	6	6	196346	196351	0 %	100 %	0 %	0 %	229578046
4019	NC_012622	TTA	2	6	196448	196453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578046
4020	NC_012622	CTA	2	6	196478	196483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578046
4021	NC_012622	TAC	2	6	196541	196546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578047
4022	NC_012622	TAA	2	6	196640	196645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578047
4023	NC_012622	TA	3	6	196718	196723	50 %	50 %	0 %	0 %	229578047
4024	NC_012622	TAT	2	6	196823	196828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578047
4025	NC_012622	T	6	6	196894	196899	0 %	100 %	0 %	0 %	229578047
4026	NC_012622	GT	3	6	196930	196935	0 %	50 %	50 %	0 %	229578047
4027	NC_012622	ACC	2	6	196951	196956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229578047
4028	NC_012622	AGT	2	6	196959	196964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578047
4029	NC_012622	TA	3	6	197060	197065	50 %	50 %	0 %	0 %	229578047
4030	NC_012622	TA	3	6	197106	197111	50 %	50 %	0 %	0 %	229578048
4031	NC_012622	CTT	2	6	197193	197198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578048
4032	NC_012622	TC	3	6	197226	197231	0 %	50 %	0 %	50 %	229578048
4033	NC_012622	TCC	2	6	197236	197241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229578048
4034	NC_012622	CAC	2	6	197286	197291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229578048
4035	NC_012622	TCC	2	6	197321	197326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229578048
4036	NC_012622	AT	3	6	197333	197338	50 %	50 %	0 %	0 %	229578049
4037	NC_012622	T	7	7	197362	197368	0 %	100 %	0 %	0 %	229578049
4038	NC_012622	TCCT	2	8	197400	197407	0 %	50 %	0 %	50 %	229578049
4039	NC_012622	TTTA	2	8	197411	197418	25 %	75 %	0 %	0 %	229578049
4040	NC_012622	TTA	2	6	197428	197433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578049
4041	NC_012622	ATTA	2	8	197498	197505	50 %	50 %	0 %	0 %	229578049
4042	NC_012622	TAT	2	6	197540	197545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578049
4043	NC_012622	CTGT	2	8	197546	197553	0 %	50 %	25 %	25 %	229578049
4044	NC_012622	CCTT	2	8	197664	197671	0 %	50 %	0 %	50 %	229578049
4045	NC_012622	GAATAA	2	12	197821	197832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229578049
4046	NC_012622	TTA	2	6	197875	197880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578049
4047	NC_012622	GTTTT	2	10	197887	197896	0 %	80 %	20 %	0 %	229578049
4048	NC_012622	AGT	2	6	197916	197921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578049
4049	NC_012622	CT	3	6	198033	198038	0 %	50 %	0 %	50 %	229578049
4050	NC_012622	TAA	2	6	198213	198218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578050
4051	NC_012622	TA	4	8	198261	198268	50 %	50 %	0 %	0 %	229578050
4052	NC_012622	TGA	2	6	198274	198279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578050
4053	NC_012622	AGA	2	6	198313	198318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578050
4054	NC_012622	GTG	2	6	198359	198364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229578050
4055	NC_012622	CTTT	2	8	198391	198398	0 %	75 %	0 %	25 %	229578050
4056	NC_012622	TAC	2	6	198482	198487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578050
4057	NC_012622	AGT	2	6	198535	198540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578050
4058	NC_012622	GA	4	8	198647	198654	50 %	0 %	50 %	0 %	229578050
4059	NC_012622	TA	3	6	198666	198671	50 %	50 %	0 %	0 %	229578050
4060	NC_012622	TAA	2	6	198682	198687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578050
4061	NC_012622	CAA	2	6	198755	198760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578050
4062	NC_012622	AG	3	6	198781	198786	50 %	0 %	50 %	0 %	229578050
4063	NC_012622	AGGA	2	8	198851	198858	50 %	0 %	50 %	0 %	229578050
4064	NC_012622	ATCT	2	8	198960	198967	25 %	50 %	0 %	25 %	229578050
4065	NC_012622	AGA	2	6	199027	199032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578050
4066	NC_012622	GTGG	2	8	199220	199227	0 %	25 %	75 %	0 %	229578050
4067	NC_012622	TGG	2	6	199243	199248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229578050
4068	NC_012622	AG	3	6	199291	199296	50 %	0 %	50 %	0 %	229578050
4069	NC_012622	AT	3	6	199336	199341	50 %	50 %	0 %	0 %	229578050
4070	NC_012622	TAG	2	6	199357	199362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578051
4071	NC_012622	ATT	2	6	199374	199379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578051
4072	NC_012622	AGA	2	6	199403	199408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578051
4073	NC_012622	GTAT	2	8	199508	199515	25 %	50 %	25 %	0 %	229578051
4074	NC_012622	GA	3	6	199525	199530	50 %	0 %	50 %	0 %	229578051
4075	NC_012622	AAG	2	6	199532	199537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578051
4076	NC_012622	AG	3	6	199645	199650	50 %	0 %	50 %	0 %	229578051
4077	NC_012622	TAT	3	9	199758	199766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578051
4078	NC_012622	ATG	2	6	199767	199772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578051
4079	NC_012622	AGA	2	6	199847	199852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578051
4080	NC_012622	AAT	2	6	199862	199867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578051
4081	NC_012622	A	7	7	199922	199928	100 %	0 %	0 %	0 %	229578051
4082	NC_012622	GGT	2	6	199929	199934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229578051
4083	NC_012622	GAG	2	6	200033	200038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229578051
4084	NC_012622	AT	3	6	200429	200434	50 %	50 %	0 %	0 %	229578052
4085	NC_012622	AT	3	6	200486	200491	50 %	50 %	0 %	0 %	229578052
4086	NC_012622	AGGT	2	8	200505	200512	25 %	25 %	50 %	0 %	229578052
4087	NC_012622	ATAA	2	8	200542	200549	75 %	25 %	0 %	0 %	229578052
4088	NC_012622	CAA	2	6	200550	200555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578052
4089	NC_012622	ATT	2	6	200629	200634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578052
4090	NC_012622	AGAA	2	8	200676	200683	75 %	0 %	25 %	0 %	229578052
4091	NC_012622	GTA	2	6	200738	200743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578052
4092	NC_012622	TTC	2	6	200832	200837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578052
4093	NC_012622	CAG	2	6	200846	200851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229578052
4094	NC_012622	ATT	2	6	200852	200857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578052
4095	NC_012622	AAC	2	6	200888	200893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578052
4096	NC_012622	TAA	2	6	200955	200960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578052
4097	NC_012622	AAT	2	6	201070	201075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578052
4098	NC_012622	TAG	3	9	201117	201125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578052
4099	NC_012622	ACATT	2	10	201131	201140	40 %	40 %	0 %	20 %	229578052
4100	NC_012622	AAC	2	6	201150	201155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578052
4101	NC_012622	ATTTC	2	10	201224	201233	20 %	60 %	0 %	20 %	229578052
4102	NC_012622	CTAT	2	8	201262	201269	25 %	50 %	0 %	25 %	229578052
4103	NC_012622	AGT	2	6	201309	201314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578052
4104	NC_012622	TTA	2	6	201372	201377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578052
4105	NC_012622	ATA	2	6	201448	201453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578052
4106	NC_012622	GAAA	2	8	201475	201482	75 %	0 %	25 %	0 %	229578052
4107	NC_012622	AT	3	6	201560	201565	50 %	50 %	0 %	0 %	229578052
4108	NC_012622	ACT	2	6	201598	201603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578052
4109	NC_012622	AGA	2	6	201630	201635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578052
4110	NC_012622	AAG	2	6	201711	201716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578053
4111	NC_012622	AG	3	6	201748	201753	50 %	0 %	50 %	0 %	229578053
4112	NC_012622	ATT	2	6	201766	201771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578053
4113	NC_012622	AATG	2	8	201816	201823	50 %	25 %	25 %	0 %	229578053
4114	NC_012622	GTT	2	6	201889	201894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229578053
4115	NC_012622	AAGG	2	8	201913	201920	50 %	0 %	50 %	0 %	229578053
4116	NC_012622	GTTG	2	8	201946	201953	0 %	50 %	50 %	0 %	229578053
4117	NC_012622	TTG	2	6	202010	202015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229578053
4118	NC_012622	TGG	2	6	202029	202034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229578053
4119	NC_012622	ATA	2	6	202064	202069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578053
4120	NC_012622	CAC	2	6	202106	202111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229578053
4121	NC_012622	ATTA	2	8	202173	202180	50 %	50 %	0 %	0 %	229578053
4122	NC_012622	ATA	2	6	202256	202261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578053
4123	NC_012622	TGA	2	6	202296	202301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578053
4124	NC_012622	AC	3	6	202391	202396	50 %	0 %	0 %	50 %	229578053
4125	NC_012622	TGG	2	6	202455	202460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229578053
4126	NC_012622	TAT	2	6	202517	202522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578053
4127	NC_012622	TGA	2	6	202533	202538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578053
4128	NC_012622	TA	3	6	202559	202564	50 %	50 %	0 %	0 %	229578053
4129	NC_012622	CAA	2	6	202614	202619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229578053
4130	NC_012622	AG	3	6	202636	202641	50 %	0 %	50 %	0 %	229578053
4131	NC_012622	CCT	2	6	202672	202677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229578053
4132	NC_012622	TTTGA	2	10	202685	202694	20 %	60 %	20 %	0 %	229578054
4133	NC_012622	CTT	2	6	202710	202715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578054
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4241	NC_012622	AAG	2	6	208298	208303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578060
4242	NC_012622	AT	3	6	208339	208344	50 %	50 %	0 %	0 %	229578060
4243	NC_012622	ATG	2	6	208405	208410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578060
4244	NC_012622	TAG	2	6	208448	208453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578060
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4246	NC_012622	TCC	2	6	208599	208604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229578061
4247	NC_012622	CTT	2	6	208668	208673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578061
4248	NC_012622	ATC	2	6	208800	208805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578061
4249	NC_012622	TCCAAA	2	12	208844	208855	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229578061
4250	NC_012622	AT	3	6	208892	208897	50 %	50 %	0 %	0 %	229578061
4251	NC_012622	ATTT	2	8	208909	208916	25 %	75 %	0 %	0 %	229578061
4252	NC_012622	CT	3	6	208921	208926	0 %	50 %	0 %	50 %	229578061
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4260	NC_012622	TGAAG	2	10	209248	209257	40 %	20 %	40 %	0 %	229578061
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4264	NC_012622	AAG	2	6	209532	209537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578062
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4280	NC_012622	A	6	6	210495	210500	100 %	0 %	0 %	0 %	229578063
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4369	NC_012622	TAT	2	6	215124	215129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578069
4370	NC_012622	TA	3	6	215192	215197	50 %	50 %	0 %	0 %	229578069
4371	NC_012622	TAA	2	6	215210	215215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578069
4372	NC_012622	ATA	2	6	215255	215260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578069
4373	NC_012622	ATA	2	6	215427	215432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578069
4374	NC_012622	ATT	2	6	215440	215445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578069
4375	NC_012622	TAC	2	6	215541	215546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578069
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4382	NC_012622	TAG	2	6	215753	215758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578070
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4389	NC_012622	A	7	7	216173	216179	100 %	0 %	0 %	0 %	229578071
4390	NC_012622	A	7	7	216206	216212	100 %	0 %	0 %	0 %	229578071
4391	NC_012622	ACT	2	6	216233	216238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229578071
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4403	NC_012622	AAG	2	6	216747	216752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578071
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4478	NC_012622	AAAT	2	8	220327	220334	75 %	25 %	0 %	0 %	229578073
4479	NC_012622	TATTTT	2	12	220390	220401	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229578073
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4483	NC_012622	CTT	2	6	220581	220586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578074
4484	NC_012622	TAT	2	6	220598	220603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578074
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4486	NC_012622	AT	4	8	220679	220686	50 %	50 %	0 %	0 %	229578074
4487	NC_012622	AGT	2	6	220689	220694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578074
4488	NC_012622	TA	3	6	220736	220741	50 %	50 %	0 %	0 %	229578074
4489	NC_012622	CTC	2	6	220760	220765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229578074
4490	NC_012622	ATA	2	6	220857	220862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578074
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4492	NC_012622	TCT	2	6	221023	221028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229578074
4493	NC_012622	CAG	2	6	221051	221056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229578074
4494	NC_012622	TG	3	6	221109	221114	0 %	50 %	50 %	0 %	229578074
4495	NC_012622	TTA	2	6	221131	221136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229578074
4496	NC_012622	AAG	2	6	221143	221148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229578074
4497	NC_012622	AGT	2	6	221201	221206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229578074
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4499	NC_012622	AAT	2	6	221238	221243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229578074
4500	NC_012622	CTTT	2	8	221247	221254	0 %	75 %	0 %	25 %	229578074

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