MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 49917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012586	GAC	2	6	178119	178124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818434
3502	NC_012586	CGA	2	6	178139	178144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818434
3503	NC_012586	GCC	2	6	178239	178244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3504	NC_012586	GTG	2	6	178248	178253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818435
3505	NC_012586	CGT	2	6	178304	178309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3506	NC_012586	CAG	2	6	178397	178402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3507	NC_012586	GCT	2	6	178421	178426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3508	NC_012586	CGA	2	6	178450	178455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3509	NC_012586	CGC	2	6	178456	178461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3510	NC_012586	CGC	2	6	178472	178477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3511	NC_012586	GGAG	2	8	178484	178491	25 %	0 %	75 %	0 %	227818435
3512	NC_012586	CGG	2	6	178607	178612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818435
3513	NC_012586	GCGCT	2	10	178638	178647	0 %	20 %	40 %	40 %	227818435
3514	NC_012586	GGGC	2	8	178649	178656	0 %	0 %	75 %	25 %	227818435
3515	NC_012586	CGG	4	12	178688	178699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818435
3516	NC_012586	CGT	2	6	178715	178720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3517	NC_012586	GTG	2	6	178728	178733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818435
3518	NC_012586	GCC	2	6	178770	178775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3519	NC_012586	CTG	2	6	178824	178829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3520	NC_012586	CGT	2	6	178838	178843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3521	NC_012586	CGC	2	6	178895	178900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3522	NC_012586	TGG	2	6	178906	178911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818435
3523	NC_012586	GCC	2	6	178976	178981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3524	NC_012586	GAC	2	6	178983	178988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3525	NC_012586	GAG	2	6	179010	179015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818435
3526	NC_012586	GTC	2	6	179016	179021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3527	NC_012586	ACG	2	6	179026	179031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3528	NC_012586	ATG	2	6	179085	179090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818435
3529	NC_012586	CGA	2	6	179138	179143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818435
3530	NC_012586	GCC	2	6	179172	179177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818435
3531	NC_012586	CAT	2	6	179200	179205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818436
3532	NC_012586	TC	3	6	179290	179295	0 %	50 %	0 %	50 %	227818436
3533	NC_012586	TCG	2	6	179319	179324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818436
3534	NC_012586	CAT	3	9	179368	179376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818436
3535	NC_012586	GAA	2	6	179524	179529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818436
3536	NC_012586	GC	3	6	179554	179559	0 %	0 %	50 %	50 %	227818436
3537	NC_012586	TCA	2	6	179568	179573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818436
3538	NC_012586	TCG	2	6	179577	179582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818436
3539	NC_012586	CGG	2	6	179623	179628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818436
3540	NC_012586	CGAT	2	8	179664	179671	25 %	25 %	25 %	25 %	227818436
3541	NC_012586	TGC	2	6	179679	179684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818436
3542	NC_012586	CG	3	6	179721	179726	0 %	0 %	50 %	50 %	227818436
3543	NC_012586	CATC	2	8	179752	179759	25 %	25 %	0 %	50 %	227818436
3544	NC_012586	ATC	2	6	179777	179782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818436
3545	NC_012586	GTC	3	9	179828	179836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818436
3546	NC_012586	CGG	2	6	179842	179847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818436
3547	NC_012586	ATC	2	6	179861	179866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818436
3548	NC_012586	GCC	2	6	179987	179992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818436
3549	NC_012586	AGG	2	6	179994	179999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818436
3550	NC_012586	ACA	2	6	180020	180025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818437
3551	NC_012586	CG	3	6	180029	180034	0 %	0 %	50 %	50 %	227818437
3552	NC_012586	ACG	2	6	180101	180106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818437
3553	NC_012586	GCT	2	6	180112	180117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818437
3554	NC_012586	GGC	2	6	180139	180144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818437
3555	NC_012586	TGA	2	6	180207	180212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818437
3556	NC_012586	CTG	2	6	180275	180280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818437
3557	NC_012586	CGG	2	6	180300	180305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818437
3558	NC_012586	GCT	2	6	180397	180402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818437
3559	NC_012586	CTT	2	6	180460	180465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818437
3560	NC_012586	GC	3	6	180540	180545	0 %	0 %	50 %	50 %	227818437
3561	NC_012586	CAT	2	6	180595	180600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818437
3562	NC_012586	GGCC	2	8	180601	180608	0 %	0 %	50 %	50 %	227818437
3563	NC_012586	CGG	2	6	180679	180684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818437
3564	NC_012586	CAT	3	9	180685	180693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818437
3565	NC_012586	CCG	2	6	180717	180722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818437
3566	NC_012586	ATC	2	6	180737	180742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818437
3567	NC_012586	TGA	2	6	180747	180752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818437
3568	NC_012586	GTG	2	6	180761	180766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818437
3569	NC_012586	GTC	2	6	180909	180914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818438
3570	NC_012586	TCG	3	9	180967	180975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818438
3571	NC_012586	GCG	2	6	180994	180999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818438
3572	NC_012586	CGG	2	6	181002	181007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818438
3573	NC_012586	CGG	2	6	181046	181051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818438
3574	NC_012586	GGA	2	6	181148	181153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818438
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3576	NC_012586	CAGCCG	2	12	181187	181198	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	227818438
3577	NC_012586	CCT	2	6	181313	181318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818438
3578	NC_012586	CGA	2	6	181369	181374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818438
3579	NC_012586	GTC	2	6	181395	181400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818438
3580	NC_012586	GGT	2	6	181430	181435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818438
3581	NC_012586	GCT	2	6	181444	181449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818438
3582	NC_012586	GCG	2	6	181522	181527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818438
3583	NC_012586	GGCC	2	8	181556	181563	0 %	0 %	50 %	50 %	227818438
3584	NC_012586	GCCG	2	8	181574	181581	0 %	0 %	50 %	50 %	227818438
3585	NC_012586	CGA	2	6	181772	181777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3586	NC_012586	CAAG	2	8	181797	181804	50 %	0 %	25 %	25 %	227818439
3587	NC_012586	CTG	2	6	181823	181828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3588	NC_012586	CGG	2	6	181849	181854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818439
3589	NC_012586	TCT	3	9	181860	181868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818439
3590	NC_012586	GCTCG	2	10	181894	181903	0 %	20 %	40 %	40 %	227818439
3591	NC_012586	GCCT	2	8	181910	181917	0 %	25 %	25 %	50 %	227818439
3592	NC_012586	TC	3	6	181925	181930	0 %	50 %	0 %	50 %	227818439
3593	NC_012586	GCC	2	6	181966	181971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818439
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3599	NC_012586	CGG	2	6	182119	182124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818439
3600	NC_012586	CGGG	2	8	182160	182167	0 %	0 %	75 %	25 %	227818439
3601	NC_012586	TCG	2	6	182169	182174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3602	NC_012586	CAT	2	6	182242	182247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818439
3603	NC_012586	CGG	2	6	182287	182292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818439
3604	NC_012586	GCG	2	6	182382	182387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818439
3605	NC_012586	GGC	2	6	182397	182402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818439
3606	NC_012586	GCC	2	6	182450	182455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818439
3607	NC_012586	ATC	2	6	182498	182503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818439
3608	NC_012586	GC	3	6	182529	182534	0 %	0 %	50 %	50 %	227818439
3609	NC_012586	GAA	2	6	182557	182562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818439
3610	NC_012586	GTCG	2	8	182590	182597	0 %	25 %	50 %	25 %	227818439
3611	NC_012586	TCG	2	6	182613	182618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3612	NC_012586	GC	3	6	182634	182639	0 %	0 %	50 %	50 %	227818439
3613	NC_012586	CTG	2	6	182678	182683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3614	NC_012586	CGG	2	6	182698	182703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818439
3615	NC_012586	ACGTCG	2	12	182739	182750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227818439
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3617	NC_012586	CAC	2	6	182765	182770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818439
3618	NC_012586	TGC	2	6	182772	182777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3619	NC_012586	TCT	2	6	182781	182786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818439
3620	NC_012586	TCG	2	6	182787	182792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818439
3621	NC_012586	CAAA	2	8	182841	182848	75 %	0 %	0 %	25 %	227818439
3622	NC_012586	CAGA	2	8	183263	183270	50 %	0 %	25 %	25 %	227818440
3623	NC_012586	ATC	2	6	183305	183310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818440
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3649	NC_012586	AGC	2	6	184822	184827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818442
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3651	NC_012586	CGGC	2	8	184909	184916	0 %	0 %	50 %	50 %	227818442
3652	NC_012586	CAT	2	6	184935	184940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818442
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3654	NC_012586	GATC	2	8	185015	185022	25 %	25 %	25 %	25 %	227818442
3655	NC_012586	GCA	2	6	185123	185128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818442
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3658	NC_012586	CG	4	8	185259	185266	0 %	0 %	50 %	50 %	227818442
3659	NC_012586	GAG	2	6	185313	185318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818442
3660	NC_012586	CG	3	6	185371	185376	0 %	0 %	50 %	50 %	227818442
3661	NC_012586	GCG	3	9	185374	185382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818442
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3668	NC_012586	CGG	2	6	185932	185937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818443
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3692	NC_012586	TCG	2	6	186772	186777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818443
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3723	NC_012586	G	6	6	188423	188428	0 %	0 %	100 %	0 %	227818444
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3725	NC_012586	ATC	2	6	188541	188546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818444
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3727	NC_012586	CTC	2	6	188589	188594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818444
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3729	NC_012586	TCG	2	6	188668	188673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818444
3730	NC_012586	CG	3	6	188672	188677	0 %	0 %	50 %	50 %	227818444
3731	NC_012586	GCT	2	6	188686	188691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818444
3732	NC_012586	GGCT	2	8	188721	188728	0 %	25 %	50 %	25 %	227818444
3733	NC_012586	CGC	2	6	188729	188734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818444
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3735	NC_012586	TCGC	2	8	188992	188999	0 %	25 %	25 %	50 %	227818444
3736	NC_012586	CGC	2	6	189039	189044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818444
3737	NC_012586	ACA	2	6	189152	189157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818445
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3981	NC_012586	TGC	2	6	200450	200455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818453
3982	NC_012586	CAC	2	6	200581	200586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818453
3983	NC_012586	CTG	2	6	200587	200592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818453
3984	NC_012586	CCG	2	6	200594	200599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818453
3985	NC_012586	GC	3	6	200605	200610	0 %	0 %	50 %	50 %	227818453
3986	NC_012586	TCG	3	9	200633	200641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818453
3987	NC_012586	TGG	2	6	200684	200689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818453
3988	NC_012586	GAG	2	6	200695	200700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818453
3989	NC_012586	GGC	2	6	200727	200732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818453
3990	NC_012586	CATC	2	8	200862	200869	25 %	25 %	0 %	50 %	227818453
3991	NC_012586	CG	3	6	200894	200899	0 %	0 %	50 %	50 %	227818453
3992	NC_012586	GCG	3	9	200954	200962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818453
3993	NC_012586	AGA	2	6	200972	200977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818453
3994	NC_012586	CGG	2	6	201039	201044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818453
3995	NC_012586	CGGC	2	8	201111	201118	0 %	0 %	50 %	50 %	227818453
3996	NC_012586	GC	3	6	201231	201236	0 %	0 %	50 %	50 %	227818453
3997	NC_012586	CGG	2	6	201255	201260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818453
3998	NC_012586	CGC	2	6	201278	201283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818453
3999	NC_012586	GC	3	6	201339	201344	0 %	0 %	50 %	50 %	227818453
4000	NC_012586	GCG	2	6	201542	201547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818453

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