MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 1430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	TGAAA	2	10	2747	2756	60 %	20 %	20 %	0 %	225869490
2	NC_012471	TGGTA	2	10	3613	3622	20 %	40 %	40 %	0 %	225869492
3	NC_012471	TTAGC	2	10	5692	5701	20 %	40 %	20 %	20 %	225869494
4	NC_012471	AGCAA	2	10	7025	7034	60 %	0 %	20 %	20 %	225869494
5	NC_012471	GCTTC	2	10	8631	8640	0 %	40 %	20 %	40 %	225869494
6	NC_012471	TTTTA	2	10	9757	9766	20 %	80 %	0 %	0 %	225869495
7	NC_012471	TGCTG	2	10	10065	10074	0 %	40 %	40 %	20 %	225869495
8	NC_012471	TTATC	2	10	12318	12327	20 %	60 %	0 %	20 %	225869499
9	NC_012471	GATTA	2	10	14154	14163	40 %	40 %	20 %	0 %	225869501
10	NC_012471	GTATG	2	10	15862	15871	20 %	40 %	40 %	0 %	225869502
11	NC_012471	GATTT	2	10	16447	16456	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
12	NC_012471	TATTG	2	10	16869	16878	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
13	NC_012471	GTATT	2	10	17144	17153	20 %	60 %	20 %	0 %	225869503
14	NC_012471	CTTTT	2	10	25692	25701	0 %	80 %	0 %	20 %	225869505
15	NC_012471	CTTGC	2	10	25901	25910	0 %	40 %	20 %	40 %	225869505
16	NC_012471	TTTTG	2	10	26118	26127	0 %	80 %	20 %	0 %	225869505
17	NC_012471	GCTTG	2	10	34350	34359	0 %	40 %	40 %	20 %	225869512
18	NC_012471	CAGCT	2	10	34712	34721	20 %	20 %	20 %	40 %	225869512
19	NC_012471	ATCTG	2	10	36097	36106	20 %	40 %	20 %	20 %	225869513
20	NC_012471	AAATG	2	10	36823	36832	60 %	20 %	20 %	0 %	225869513
21	NC_012471	ACAAG	2	10	39701	39710	60 %	0 %	20 %	20 %	225869516
22	NC_012471	AAGCA	2	10	39755	39764	60 %	0 %	20 %	20 %	225869516
23	NC_012471	GTGGA	2	10	41230	41239	20 %	20 %	60 %	0 %	225869517
24	NC_012471	AGCAG	2	10	45272	45281	40 %	0 %	40 %	20 %	225869520
25	NC_012471	TGACA	2	10	49785	49794	40 %	20 %	20 %	20 %	225869523
26	NC_012471	CTTGT	2	10	51530	51539	0 %	60 %	20 %	20 %	225869526
27	NC_012471	TTGGT	2	10	51749	51758	0 %	60 %	40 %	0 %	225869526
28	NC_012471	CTTTC	2	10	51913	51922	0 %	60 %	0 %	40 %	225869526
29	NC_012471	TTTTC	2	10	52299	52308	0 %	80 %	0 %	20 %	225869526
30	NC_012471	ATCCA	2	10	52715	52724	40 %	20 %	0 %	40 %	225869526
31	NC_012471	TGGTA	2	10	52970	52979	20 %	40 %	40 %	0 %	225869526
32	NC_012471	ATGGT	2	10	54254	54263	20 %	40 %	40 %	0 %	225869527
33	NC_012471	ATTCA	2	10	54938	54947	40 %	40 %	0 %	20 %	225869527
34	NC_012471	AACCA	2	10	57916	57925	60 %	0 %	0 %	40 %	225869529
35	NC_012471	ATTTA	2	10	62784	62793	40 %	60 %	0 %	0 %	225869531
36	NC_012471	TGAAG	2	10	63501	63510	40 %	20 %	40 %	0 %	225869531
37	NC_012471	TCATA	2	10	63654	63663	40 %	40 %	0 %	20 %	225869531
38	NC_012471	GAATT	2	10	63967	63976	40 %	40 %	20 %	0 %	225869532
39	NC_012471	AATTT	2	10	64183	64192	40 %	60 %	0 %	0 %	225869532
40	NC_012471	AAGCT	2	10	67781	67790	40 %	20 %	20 %	20 %	225869534
41	NC_012471	GAAAA	2	10	71577	71586	80 %	0 %	20 %	0 %	225869540
42	NC_012471	TTTGG	2	10	71991	72000	0 %	60 %	40 %	0 %	225869541
43	NC_012471	TTCAC	2	10	72347	72356	20 %	40 %	0 %	40 %	225869542
44	NC_012471	TGAAA	2	10	73427	73436	60 %	20 %	20 %	0 %	225869544
45	NC_012471	AAATA	2	10	78740	78749	80 %	20 %	0 %	0 %	225869556
46	NC_012471	CTTCC	2	10	78843	78852	0 %	40 %	0 %	60 %	225869556
47	NC_012471	TCCAA	2	10	79421	79430	40 %	20 %	0 %	40 %	225869556
48	NC_012471	AGAAT	2	10	79991	80000	60 %	20 %	20 %	0 %	225869556
49	NC_012471	CGATT	2	10	85852	85861	20 %	40 %	20 %	20 %	225869564
50	NC_012471	CAACC	2	10	95070	95079	40 %	0 %	0 %	60 %	225869566
51	NC_012471	AAGGA	2	10	96922	96931	60 %	0 %	40 %	0 %	225869567
52	NC_012471	TTCCT	2	10	107148	107157	0 %	60 %	0 %	40 %	225869575
53	NC_012471	ATTGA	2	10	114232	114241	40 %	40 %	20 %	0 %	225869578
54	NC_012471	TTTGG	2	10	116297	116306	0 %	60 %	40 %	0 %	225869580
55	NC_012471	AACAC	2	10	117681	117690	60 %	0 %	0 %	40 %	225869580
56	NC_012471	ATCAA	2	10	120801	120810	60 %	20 %	0 %	20 %	225869583
57	NC_012471	ACAAA	2	10	121850	121859	80 %	0 %	0 %	20 %	225869586
58	NC_012471	AATCG	2	10	125055	125064	40 %	20 %	20 %	20 %	225869590
59	NC_012471	TGATT	2	10	125436	125445	20 %	60 %	20 %	0 %	225869591
60	NC_012471	AAAGC	2	10	127991	128000	60 %	0 %	20 %	20 %	225869593
61	NC_012471	TCACT	2	10	128732	128741	20 %	40 %	0 %	40 %	225869594
62	NC_012471	TTTAT	2	10	130011	130020	20 %	80 %	0 %	0 %	225869595
63	NC_012471	ACGAT	2	10	130704	130713	40 %	20 %	20 %	20 %	225869595
64	NC_012471	GCTTT	2	10	130888	130897	0 %	60 %	20 %	20 %	225869595
65	NC_012471	TCATT	2	10	133553	133562	20 %	60 %	0 %	20 %	225869598
66	NC_012471	ACATC	2	10	138966	138975	40 %	20 %	0 %	40 %	225869602
67	NC_012471	TTTCC	2	10	142002	142011	0 %	60 %	0 %	40 %	225869604
68	NC_012471	CATGT	2	10	142021	142030	20 %	40 %	20 %	20 %	225869604
69	NC_012471	TTCTT	2	10	142594	142603	0 %	80 %	0 %	20 %	225869605
70	NC_012471	TTTGA	2	10	143226	143235	20 %	60 %	20 %	0 %	225869605
71	NC_012471	GAAAT	2	10	148353	148362	60 %	20 %	20 %	0 %	225869619
72	NC_012471	TCCAA	2	10	148555	148564	40 %	20 %	0 %	40 %	225869620
73	NC_012471	GGCAT	2	10	151378	151387	20 %	20 %	40 %	20 %	225869624
74	NC_012471	ATATT	2	10	153730	153739	40 %	60 %	0 %	0 %	225869630
75	NC_012471	AGAGG	2	10	154276	154285	40 %	0 %	60 %	0 %	225869631
76	NC_012471	CAAAA	2	10	157169	157178	80 %	0 %	0 %	20 %	225869636
77	NC_012471	CAAAA	2	10	163266	163275	80 %	0 %	0 %	20 %	225869643
78	NC_012471	GGGAT	2	10	164388	164397	20 %	20 %	60 %	0 %	225869646
79	NC_012471	GACTT	2	10	164445	164454	20 %	40 %	20 %	20 %	225869647
80	NC_012471	AGTCG	2	10	165765	165774	20 %	20 %	40 %	20 %	225869650
81	NC_012471	GAAAA	2	10	168156	168165	80 %	0 %	20 %	0 %	225869651
82	NC_012471	GACAG	2	10	174517	174526	40 %	0 %	40 %	20 %	225869656
83	NC_012471	AAATC	2	10	174684	174693	60 %	20 %	0 %	20 %	225869656
84	NC_012471	GCCTA	2	10	175449	175458	20 %	20 %	20 %	40 %	225869656
85	NC_012471	ACAAA	2	10	175634	175643	80 %	0 %	0 %	20 %	225869657
86	NC_012471	TAAAT	2	10	178366	178375	60 %	40 %	0 %	0 %	225869661
87	NC_012471	CAATT	2	10	178814	178823	40 %	40 %	0 %	20 %	225869662
88	NC_012471	TTAAT	2	10	179657	179666	40 %	60 %	0 %	0 %	225869664
89	NC_012471	ATTTT	2	10	180413	180422	20 %	80 %	0 %	0 %	225869666
90	NC_012471	GGGTA	2	10	180762	180771	20 %	20 %	60 %	0 %	225869666
91	NC_012471	CATTT	2	10	180937	180946	20 %	60 %	0 %	20 %	225869666
92	NC_012471	CATCC	2	10	181776	181785	20 %	20 %	0 %	60 %	225869667
93	NC_012471	GATTC	2	10	183138	183147	20 %	40 %	20 %	20 %	225869670
94	NC_012471	GCTTG	2	10	184447	184456	0 %	40 %	40 %	20 %	225869671
95	NC_012471	AAGTT	2	10	187331	187340	40 %	40 %	20 %	0 %	225869673
96	NC_012471	ATGCT	2	10	188289	188298	20 %	40 %	20 %	20 %	225869674
97	NC_012471	GCTTT	2	10	189781	189790	0 %	60 %	20 %	20 %	225869677
98	NC_012471	AGGTA	2	10	190175	190184	40 %	20 %	40 %	0 %	225869677
99	NC_012471	CTTGA	2	10	190487	190496	20 %	40 %	20 %	20 %	225869677
100	NC_012471	TTCAA	2	10	191933	191942	40 %	40 %	0 %	20 %	225869679
101	NC_012471	AAAGC	2	10	194700	194709	60 %	0 %	20 %	20 %	225869682
102	NC_012471	AAAAG	2	10	199158	199167	80 %	0 %	20 %	0 %	225869687
103	NC_012471	TTTTG	2	10	199690	199699	0 %	80 %	20 %	0 %	225869688
104	NC_012471	TGGAG	2	10	202449	202458	20 %	20 %	60 %	0 %	225869690
105	NC_012471	AAAAT	2	10	205881	205890	80 %	20 %	0 %	0 %	225869694
106	NC_012471	AAAGG	2	10	206372	206381	60 %	0 %	40 %	0 %	225869695
107	NC_012471	GAGCA	2	10	206967	206976	40 %	0 %	40 %	20 %	225869695
108	NC_012471	CAGCT	2	10	207536	207545	20 %	20 %	20 %	40 %	225869695
109	NC_012471	CAAGC	2	10	207654	207663	40 %	0 %	20 %	40 %	225869695
110	NC_012471	GGTCA	2	10	209582	209591	20 %	20 %	40 %	20 %	225869698
111	NC_012471	GTCGT	2	10	209856	209865	0 %	40 %	40 %	20 %	225869698
112	NC_012471	ATTAT	2	10	211088	211097	40 %	60 %	0 %	0 %	225869699
113	NC_012471	CTTGT	2	10	211779	211788	0 %	60 %	20 %	20 %	225869699
114	NC_012471	GTATT	2	10	211930	211939	20 %	60 %	20 %	0 %	225869699
115	NC_012471	GCCTA	2	10	214698	214707	20 %	20 %	20 %	40 %	225869700
116	NC_012471	AAAGG	2	10	216596	216605	60 %	0 %	40 %	0 %	225869700
117	NC_012471	AAGAG	2	10	216640	216649	60 %	0 %	40 %	0 %	225869700
118	NC_012471	ATTCA	2	10	217324	217333	40 %	40 %	0 %	20 %	225869701
119	NC_012471	TTTTA	2	10	219256	219265	20 %	80 %	0 %	0 %	225869703
120	NC_012471	CATAT	2	10	219443	219452	40 %	40 %	0 %	20 %	225869703
121	NC_012471	TTATG	2	10	219507	219516	20 %	60 %	20 %	0 %	225869703
122	NC_012471	TTGGA	2	10	224198	224207	20 %	40 %	40 %	0 %	225869708
123	NC_012471	TTTGA	2	10	227329	227338	20 %	60 %	20 %	0 %	225869710
124	NC_012471	TTACC	2	10	228352	228361	20 %	40 %	0 %	40 %	225869711
125	NC_012471	TTGGT	2	10	229025	229034	0 %	60 %	40 %	0 %	225869712
126	NC_012471	AGGGA	2	10	229643	229652	40 %	0 %	60 %	0 %	225869713
127	NC_012471	TTGGC	2	10	229898	229907	0 %	40 %	40 %	20 %	225869713
128	NC_012471	TGGAT	2	10	230716	230725	20 %	40 %	40 %	0 %	225869714
129	NC_012471	GATTG	2	10	233531	233540	20 %	40 %	40 %	0 %	225869715
130	NC_012471	AATTG	2	10	234725	234734	40 %	40 %	20 %	0 %	225869715
131	NC_012471	GCTTG	2	10	235954	235963	0 %	40 %	40 %	20 %	225869716
132	NC_012471	CTACA	2	10	238068	238077	40 %	20 %	0 %	40 %	225869718
133	NC_012471	AGGCT	2	10	240808	240817	20 %	20 %	40 %	20 %	225869719
134	NC_012471	CAATC	2	10	241301	241310	40 %	20 %	0 %	40 %	225869719
135	NC_012471	CTATT	2	10	241388	241397	20 %	60 %	0 %	20 %	225869719
136	NC_012471	GCTTT	2	10	247749	247758	0 %	60 %	20 %	20 %	225869723
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149	NC_012471	TACCT	2	10	267342	267351	20 %	40 %	0 %	40 %	225869741
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259	NC_012471	TGATT	2	10	443994	444003	20 %	60 %	20 %	0 %	225869890
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261	NC_012471	CAGGT	2	10	449071	449080	20 %	20 %	40 %	20 %	225869894
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