MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012471	CAACAG	2	12	240796	240807	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	225869719
4002	NC_012471	AGGCT	2	10	240808	240817	20 %	20 %	40 %	20 %	225869719
4003	NC_012471	CTTG	2	8	240818	240825	0 %	50 %	25 %	25 %	225869719
4004	NC_012471	GCTA	2	8	240864	240871	25 %	25 %	25 %	25 %	225869719
4005	NC_012471	TGC	2	6	240874	240879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4006	NC_012471	AGC	2	6	240887	240892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4007	NC_012471	TAT	2	6	240927	240932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869719
4008	NC_012471	A	6	6	241052	241057	100 %	0 %	0 %	0 %	225869719
4009	NC_012471	A	6	6	241063	241068	100 %	0 %	0 %	0 %	225869719
4010	NC_012471	CTA	2	6	241118	241123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869719
4011	NC_012471	AGC	2	6	241178	241183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4012	NC_012471	CAATC	2	10	241301	241310	40 %	20 %	0 %	40 %	225869719
4013	NC_012471	AGCTTT	2	12	241320	241331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225869719
4014	NC_012471	CTATT	2	10	241388	241397	20 %	60 %	0 %	20 %	225869719
4015	NC_012471	TGA	2	6	241448	241453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869719
4016	NC_012471	CTAC	2	8	241513	241520	25 %	25 %	0 %	50 %	225869719
4017	NC_012471	GCA	3	9	241539	241547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4018	NC_012471	CAG	2	6	241556	241561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4019	NC_012471	ATG	2	6	241651	241656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869719
4020	NC_012471	TGA	2	6	241790	241795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869719
4021	NC_012471	CAGG	2	8	241828	241835	25 %	0 %	50 %	25 %	225869719
4022	NC_012471	AGG	2	6	241970	241975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869719
4023	NC_012471	CAA	2	6	242098	242103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869719
4024	NC_012471	AGC	2	6	242148	242153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4025	NC_012471	CAA	2	6	242344	242349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869719
4026	NC_012471	A	7	7	242353	242359	100 %	0 %	0 %	0 %	225869719
4027	NC_012471	TTA	2	6	242417	242422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869719
4028	NC_012471	ATG	2	6	242449	242454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869719
4029	NC_012471	GCA	2	6	242505	242510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4030	NC_012471	TGTA	2	8	242518	242525	25 %	50 %	25 %	0 %	225869719
4031	NC_012471	TCA	2	6	242544	242549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869719
4032	NC_012471	CAG	2	6	242674	242679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4033	NC_012471	ACA	2	6	242717	242722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869719
4034	NC_012471	CTT	2	6	242724	242729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869719
4035	NC_012471	ATT	2	6	242737	242742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869719
4036	NC_012471	CAG	2	6	242767	242772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4037	NC_012471	TGA	2	6	242780	242785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869719
4038	NC_012471	TTTA	2	8	242805	242812	25 %	75 %	0 %	0 %	225869719
4039	NC_012471	GAC	2	6	242831	242836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4040	NC_012471	GAG	2	6	242854	242859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869719
4041	NC_012471	CAG	2	6	242865	242870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869719
4042	NC_012471	GCTA	2	8	243071	243078	25 %	25 %	25 %	25 %	225869720
4043	NC_012471	CTT	2	6	243092	243097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869720
4044	NC_012471	TGG	2	6	243166	243171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869720
4045	NC_012471	CAG	2	6	243185	243190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869720
4046	NC_012471	TAA	2	6	243196	243201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869720
4047	NC_012471	GTA	2	6	243272	243277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869720
4048	NC_012471	A	6	6	243277	243282	100 %	0 %	0 %	0 %	225869720
4049	NC_012471	CT	3	6	243316	243321	0 %	50 %	0 %	50 %	225869720
4050	NC_012471	CCTT	2	8	243352	243359	0 %	50 %	0 %	50 %	225869720
4051	NC_012471	ATA	2	6	243430	243435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869720
4052	NC_012471	GAT	2	6	243462	243467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869720
4053	NC_012471	TCA	2	6	243473	243478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869720
4054	NC_012471	CAG	2	6	243479	243484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869720
4055	NC_012471	CAA	2	6	243542	243547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869720
4056	NC_012471	TGA	2	6	243584	243589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869720
4057	NC_012471	CAA	2	6	243591	243596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869720
4058	NC_012471	ACG	2	6	243660	243665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869720
4059	NC_012471	TAG	2	6	243667	243672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869720
4060	NC_012471	GCT	2	6	243697	243702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869720
4061	NC_012471	TGA	2	6	243796	243801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869720
4062	NC_012471	A	6	6	243818	243823	100 %	0 %	0 %	0 %	225869720
4063	NC_012471	GTCT	2	8	243880	243887	0 %	50 %	25 %	25 %	225869720
4064	NC_012471	ATT	2	6	244391	244396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869721
4065	NC_012471	GAG	2	6	244472	244477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869721
4066	NC_012471	ATT	2	6	244499	244504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869721
4067	NC_012471	GGC	2	6	244562	244567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869721
4068	NC_012471	GGC	2	6	244613	244618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869721
4069	NC_012471	GAG	2	6	244658	244663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869721
4070	NC_012471	ATG	2	6	244757	244762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869721
4071	NC_012471	TGA	2	6	244768	244773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869721
4072	NC_012471	A	6	6	244808	244813	100 %	0 %	0 %	0 %	225869721
4073	NC_012471	CCG	2	6	244861	244866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869721
4074	NC_012471	CGT	2	6	244922	244927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869721
4075	NC_012471	CTG	2	6	244932	244937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869721
4076	NC_012471	TGAT	2	8	245094	245101	25 %	50 %	25 %	0 %	225869721
4077	NC_012471	TCGC	2	8	245151	245158	0 %	25 %	25 %	50 %	225869721
4078	NC_012471	CAT	2	6	245237	245242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869721
4079	NC_012471	AC	3	6	245268	245273	50 %	0 %	0 %	50 %	225869721
4080	NC_012471	TGA	2	6	245302	245307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869721
4081	NC_012471	CTT	2	6	245347	245352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869721
4082	NC_012471	CAG	2	6	245946	245951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869722
4083	NC_012471	TAGC	2	8	245970	245977	25 %	25 %	25 %	25 %	225869722
4084	NC_012471	ATG	2	6	245991	245996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869722
4085	NC_012471	AGA	2	6	246004	246009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869722
4086	NC_012471	TTTC	2	8	246043	246050	0 %	75 %	0 %	25 %	225869722
4087	NC_012471	A	7	7	246061	246067	100 %	0 %	0 %	0 %	225869722
4088	NC_012471	A	7	7	246184	246190	100 %	0 %	0 %	0 %	225869722
4089	NC_012471	CAA	2	6	246362	246367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4090	NC_012471	CAA	2	6	246407	246412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4091	NC_012471	CAA	2	6	246497	246502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4092	NC_012471	CAA	2	6	246587	246592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4093	NC_012471	CAA	2	6	246722	246727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4094	NC_012471	CAA	2	6	246767	246772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4095	NC_012471	CAA	2	6	246812	246817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869722
4096	NC_012471	A	6	6	246869	246874	100 %	0 %	0 %	0 %	225869722
4097	NC_012471	AGC	2	6	246957	246962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869722
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4099	NC_012471	CAAA	2	8	246999	247006	75 %	0 %	0 %	25 %	225869722
4100	NC_012471	CAG	2	6	247017	247022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869722
4101	NC_012471	GAA	2	6	247120	247125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869722
4102	NC_012471	A	6	6	247124	247129	100 %	0 %	0 %	0 %	225869722
4103	NC_012471	GCTTT	2	10	247749	247758	0 %	60 %	20 %	20 %	225869723
4104	NC_012471	TGT	3	9	247767	247775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869723
4105	NC_012471	A	6	6	247779	247784	100 %	0 %	0 %	0 %	225869723
4106	NC_012471	AAG	2	6	247871	247876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869723
4107	NC_012471	CAT	2	6	247882	247887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869723
4108	NC_012471	ATGG	2	8	247919	247926	25 %	25 %	50 %	0 %	225869723
4109	NC_012471	TGA	2	6	247952	247957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869723
4110	NC_012471	AAT	2	6	248089	248094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869723
4111	NC_012471	GATA	2	8	248123	248130	50 %	25 %	25 %	0 %	225869723
4112	NC_012471	AGGTA	2	10	248143	248152	40 %	20 %	40 %	0 %	225869723
4113	NC_012471	AAG	2	6	248250	248255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869723
4114	NC_012471	ACG	2	6	248269	248274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869723
4115	NC_012471	TCA	2	6	248301	248306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869723
4116	NC_012471	T	6	6	248317	248322	0 %	100 %	0 %	0 %	225869723
4117	NC_012471	CGA	2	6	248366	248371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869723
4118	NC_012471	ATG	2	6	248386	248391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869723
4119	NC_012471	TCA	2	6	248393	248398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869723
4120	NC_012471	TCT	2	6	248438	248443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869723
4121	NC_012471	CTTGA	2	10	248455	248464	20 %	40 %	20 %	20 %	225869723
4122	NC_012471	TAA	2	6	248465	248470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869723
4123	NC_012471	GAT	2	6	248539	248544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869724
4124	NC_012471	TC	3	6	248587	248592	0 %	50 %	0 %	50 %	225869724
4125	NC_012471	T	6	6	248596	248601	0 %	100 %	0 %	0 %	225869724
4126	NC_012471	TCT	2	6	248675	248680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869724
4127	NC_012471	TGG	2	6	248700	248705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869724
4128	NC_012471	CCTC	2	8	248706	248713	0 %	25 %	0 %	75 %	225869724
4129	NC_012471	ATCA	2	8	248826	248833	50 %	25 %	0 %	25 %	225869724
4130	NC_012471	TAT	2	6	248844	248849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869724
4131	NC_012471	AAT	2	6	248870	248875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869724
4132	NC_012471	CA	3	6	249532	249537	50 %	0 %	0 %	50 %	225869725
4133	NC_012471	TTA	2	6	249579	249584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869725
4134	NC_012471	CTG	2	6	249682	249687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869725
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4136	NC_012471	TGT	2	6	249794	249799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869726
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4140	NC_012471	TGCT	2	8	249920	249927	0 %	50 %	25 %	25 %	225869726
4141	NC_012471	A	6	6	249946	249951	100 %	0 %	0 %	0 %	225869726
4142	NC_012471	AAC	2	6	250017	250022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869726
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4144	NC_012471	T	6	6	250134	250139	0 %	100 %	0 %	0 %	225869726
4145	NC_012471	CTG	2	6	250162	250167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869726
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4152	NC_012471	GATG	2	8	250529	250536	25 %	25 %	50 %	0 %	225869727
4153	NC_012471	AATC	2	8	250571	250578	50 %	25 %	0 %	25 %	225869727
4154	NC_012471	ATC	2	6	250612	250617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869727
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4159	NC_012471	TGC	2	6	250934	250939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869727
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4171	NC_012471	AATGCT	3	18	251829	251846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225869729
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4176	NC_012471	CTG	2	6	252160	252165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869729
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4202	NC_012471	TTG	2	6	253630	253635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869730
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4230	NC_012471	CATT	2	8	255476	255483	25 %	50 %	0 %	25 %	225869731
4231	NC_012471	CTT	2	6	255506	255511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869731
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4234	NC_012471	A	6	6	255609	255614	100 %	0 %	0 %	0 %	225869731
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4238	NC_012471	ATCA	2	8	255987	255994	50 %	25 %	0 %	25 %	225869732
4239	NC_012471	GAG	2	6	256026	256031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869732
4240	NC_012471	A	6	6	256037	256042	100 %	0 %	0 %	0 %	225869732
4241	NC_012471	TTA	2	6	256102	256107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869732
4242	NC_012471	ACT	2	6	256144	256149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869732
4243	NC_012471	ATT	2	6	256212	256217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869732
4244	NC_012471	ATCAA	2	10	256218	256227	60 %	20 %	0 %	20 %	225869732
4245	NC_012471	CAGA	2	8	256269	256276	50 %	0 %	25 %	25 %	225869732
4246	NC_012471	TAT	2	6	256280	256285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869732
4247	NC_012471	GAC	2	6	256368	256373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869732
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4250	NC_012471	TTAT	2	8	256452	256459	25 %	75 %	0 %	0 %	225869732
4251	NC_012471	AGG	2	6	256468	256473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869732
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4255	NC_012471	AGCA	2	8	256668	256675	50 %	0 %	25 %	25 %	225869732
4256	NC_012471	TTG	2	6	256723	256728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869732
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4259	NC_012471	ATC	2	6	256890	256895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869732
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4264	NC_012471	TCG	2	6	257225	257230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869733
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4346	NC_012471	AG	3	6	265795	265800	50 %	0 %	50 %	0 %	225869739
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4352	NC_012471	GCT	2	6	265959	265964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869739
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4359	NC_012471	T	6	6	266269	266274	0 %	100 %	0 %	0 %	225869739
4360	NC_012471	CCA	2	6	266335	266340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869739
4361	NC_012471	AAC	2	6	266358	266363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869739
4362	NC_012471	TCA	2	6	266381	266386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869739
4363	NC_012471	ATC	2	6	266410	266415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869740
4364	NC_012471	CTG	2	6	266433	266438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869740
4365	NC_012471	CCA	2	6	266476	266481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869740
4366	NC_012471	CCAA	2	8	266500	266507	50 %	0 %	0 %	50 %	225869740
4367	NC_012471	ACAA	2	8	266578	266585	75 %	0 %	0 %	25 %	225869740
4368	NC_012471	TG	3	6	266600	266605	0 %	50 %	50 %	0 %	225869740
4369	NC_012471	GCTTG	2	10	266655	266664	0 %	40 %	40 %	20 %	225869740
4370	NC_012471	ATTG	2	8	266783	266790	25 %	50 %	25 %	0 %	225869740
4371	NC_012471	CATT	2	8	266822	266829	25 %	50 %	0 %	25 %	225869740
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4376	NC_012471	CAG	2	6	267096	267101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869741
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4395	NC_012471	TCA	2	6	268038	268043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869742
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4402	NC_012471	TCA	3	9	268291	268299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869742
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4479	NC_012471	TCA	2	6	273097	273102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869745
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4483	NC_012471	CTTGG	2	10	273236	273245	0 %	40 %	40 %	20 %	225869745
4484	NC_012471	TCA	2	6	273312	273317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869745
4485	NC_012471	AGC	2	6	273327	273332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869745
4486	NC_012471	CTTGG	2	10	273344	273353	0 %	40 %	40 %	20 %	225869745
4487	NC_012471	GAC	2	6	273419	273424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869745
4488	NC_012471	CGA	2	6	273460	273465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869745
4489	NC_012471	TGAAT	2	10	273466	273475	40 %	40 %	20 %	0 %	225869745
4490	NC_012471	CGA	2	6	273487	273492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869745
4491	NC_012471	GGCA	2	8	273524	273531	25 %	0 %	50 %	25 %	225869745
4492	NC_012471	CGG	2	6	273550	273555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869745
4493	NC_012471	TG	3	6	273615	273620	0 %	50 %	50 %	0 %	225869746
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4495	NC_012471	CAT	2	6	273651	273656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869746
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4497	NC_012471	ATAG	2	8	273690	273697	50 %	25 %	25 %	0 %	225869746
4498	NC_012471	CGC	2	6	273824	273829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869746
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4500	NC_012471	AATCA	2	10	273885	273894	60 %	20 %	0 %	20 %	225869746

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