MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012471	GTTG	2	8	178893	178900	0 %	50 %	50 %	0 %	225869662
3002	NC_012471	TAA	2	6	178914	178919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869662
3003	NC_012471	TCT	2	6	178922	178927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869662
3004	NC_012471	TA	3	6	178942	178947	50 %	50 %	0 %	0 %	225869662
3005	NC_012471	TCC	2	6	178981	178986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869662
3006	NC_012471	T	6	6	178989	178994	0 %	100 %	0 %	0 %	225869662
3007	NC_012471	TG	3	6	179024	179029	0 %	50 %	50 %	0 %	225869662
3008	NC_012471	AAC	2	6	179081	179086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869662
3009	NC_012471	TTA	2	6	179126	179131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869663
3010	NC_012471	AAT	2	6	179139	179144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869663
3011	NC_012471	TTG	2	6	179259	179264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869663
3012	NC_012471	T	6	6	179338	179343	0 %	100 %	0 %	0 %	225869663
3013	NC_012471	TCT	2	6	179361	179366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869663
3014	NC_012471	CTT	2	6	179374	179379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869663
3015	NC_012471	T	6	6	179398	179403	0 %	100 %	0 %	0 %	225869663
3016	NC_012471	TGT	2	6	179488	179493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869663
3017	NC_012471	ATTG	2	8	179643	179650	25 %	50 %	25 %	0 %	225869664
3018	NC_012471	TTAAT	2	10	179657	179666	40 %	60 %	0 %	0 %	225869664
3019	NC_012471	T	6	6	179807	179812	0 %	100 %	0 %	0 %	225869664
3020	NC_012471	GTCA	2	8	179874	179881	25 %	25 %	25 %	25 %	225869664
3021	NC_012471	TTG	2	6	179914	179919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869664
3022	NC_012471	TCG	2	6	179923	179928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869664
3023	NC_012471	T	6	6	179964	179969	0 %	100 %	0 %	0 %	225869664
3024	NC_012471	GTT	2	6	179980	179985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869664
3025	NC_012471	TAAA	2	8	180010	180017	75 %	25 %	0 %	0 %	225869665
3026	NC_012471	TA	3	6	180025	180030	50 %	50 %	0 %	0 %	225869665
3027	NC_012471	GCA	2	6	180035	180040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869665
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3029	NC_012471	TAA	2	6	180109	180114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869665
3030	NC_012471	T	6	6	180119	180124	0 %	100 %	0 %	0 %	225869665
3031	NC_012471	TCC	2	6	180139	180144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869666
3032	NC_012471	T	6	6	180168	180173	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3033	NC_012471	T	6	6	180276	180281	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3034	NC_012471	TGT	2	6	180284	180289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869666
3035	NC_012471	T	8	8	180301	180308	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3036	NC_012471	TTGC	2	8	180322	180329	0 %	50 %	25 %	25 %	225869666
3037	NC_012471	T	7	7	180373	180379	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3038	NC_012471	ATTTT	2	10	180413	180422	20 %	80 %	0 %	0 %	225869666
3039	NC_012471	CGA	2	6	180428	180433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869666
3040	NC_012471	TGG	2	6	180438	180443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869666
3041	NC_012471	AC	3	6	180475	180480	50 %	0 %	0 %	50 %	225869666
3042	NC_012471	TTGC	2	8	180537	180544	0 %	50 %	25 %	25 %	225869666
3043	NC_012471	ATC	2	6	180621	180626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869666
3044	NC_012471	ATG	2	6	180646	180651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869666
3045	NC_012471	CTT	2	6	180725	180730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869666
3046	NC_012471	GGGTA	2	10	180762	180771	20 %	20 %	60 %	0 %	225869666
3047	NC_012471	T	6	6	180780	180785	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3048	NC_012471	TACC	2	8	180823	180830	25 %	25 %	0 %	50 %	225869666
3049	NC_012471	CATTT	2	10	180937	180946	20 %	60 %	0 %	20 %	225869666
3050	NC_012471	TAA	2	6	180979	180984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869666
3051	NC_012471	GATA	2	8	181059	181066	50 %	25 %	25 %	0 %	225869666
3052	NC_012471	TGAT	2	8	181153	181160	25 %	50 %	25 %	0 %	225869666
3053	NC_012471	AAC	2	6	181197	181202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869666
3054	NC_012471	T	6	6	181239	181244	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3055	NC_012471	T	6	6	181249	181254	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3056	NC_012471	T	8	8	181258	181265	0 %	100 %	0 %	0 %	225869666
3057	NC_012471	AGT	2	6	181352	181357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869666
3058	NC_012471	TCT	2	6	181402	181407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869666
3059	NC_012471	TC	3	6	181412	181417	0 %	50 %	0 %	50 %	225869666
3060	NC_012471	AAC	2	6	181477	181482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869667
3061	NC_012471	CTA	2	6	181551	181556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869667
3062	NC_012471	TCT	2	6	181625	181630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869667
3063	NC_012471	GTA	2	6	181639	181644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869667
3064	NC_012471	TTG	2	6	181677	181682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869667
3065	NC_012471	CATCC	2	10	181776	181785	20 %	20 %	0 %	60 %	225869667
3066	NC_012471	GTT	2	6	181833	181838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869667
3067	NC_012471	TCA	2	6	181845	181850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869667
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3070	NC_012471	GCAG	2	8	182027	182034	25 %	0 %	50 %	25 %	225869668
3071	NC_012471	TGA	2	6	182036	182041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869668
3072	NC_012471	GGA	2	6	182114	182119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869668
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3074	NC_012471	CGGT	2	8	182184	182191	0 %	25 %	50 %	25 %	225869668
3075	NC_012471	GGCTTT	2	12	182507	182518	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225869669
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3081	NC_012471	GTG	4	12	183025	183036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869670
3082	NC_012471	CAC	2	6	183075	183080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869670
3083	NC_012471	TGA	2	6	183107	183112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869670
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3088	NC_012471	TGA	2	6	183303	183308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3089	NC_012471	TTA	2	6	183398	183403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869671
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3091	NC_012471	GTC	2	6	183672	183677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869671
3092	NC_012471	ATG	2	6	183848	183853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3093	NC_012471	TTA	2	6	183923	183928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869671
3094	NC_012471	AAT	2	6	183995	184000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869671
3095	NC_012471	TTG	2	6	184008	184013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869671
3096	NC_012471	ATG	2	6	184121	184126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3097	NC_012471	TTTG	2	8	184216	184223	0 %	75 %	25 %	0 %	225869671
3098	NC_012471	AGCC	2	8	184296	184303	25 %	0 %	25 %	50 %	225869671
3099	NC_012471	TCG	2	6	184387	184392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869671
3100	NC_012471	ATTG	2	8	184405	184412	25 %	50 %	25 %	0 %	225869671
3101	NC_012471	GCTTG	2	10	184447	184456	0 %	40 %	40 %	20 %	225869671
3102	NC_012471	CTG	2	6	184512	184517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869671
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3104	NC_012471	TGA	2	6	184579	184584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3105	NC_012471	CAG	2	6	184728	184733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869671
3106	NC_012471	GAT	2	6	184742	184747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3107	NC_012471	AC	3	6	184753	184758	50 %	0 %	0 %	50 %	225869671
3108	NC_012471	AAGC	2	8	184762	184769	50 %	0 %	25 %	25 %	225869671
3109	NC_012471	AACT	2	8	184791	184798	50 %	25 %	0 %	25 %	225869671
3110	NC_012471	A	6	6	184811	184816	100 %	0 %	0 %	0 %	225869671
3111	NC_012471	GTT	2	6	184850	184855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869671
3112	NC_012471	TCG	2	6	184894	184899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869671
3113	NC_012471	CAGG	2	8	184920	184927	25 %	0 %	50 %	25 %	225869671
3114	NC_012471	TGA	3	9	185011	185019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3115	NC_012471	CTC	2	6	185088	185093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869671
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3117	NC_012471	GAG	2	6	185118	185123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869671
3118	NC_012471	TTC	2	6	185160	185165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869671
3119	NC_012471	TGA	2	6	185170	185175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
3120	NC_012471	CTG	2	6	185210	185215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869671
3121	NC_012471	TGA	2	6	185224	185229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
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3123	NC_012471	GAT	2	6	185321	185326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869671
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3241	NC_012471	TAT	2	6	191874	191879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869679
3242	NC_012471	TTCAA	2	10	191933	191942	40 %	40 %	0 %	20 %	225869679
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3245	NC_012471	ACG	2	6	192007	192012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869679
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3274	NC_012471	CT	3	6	193644	193649	0 %	50 %	0 %	50 %	225869681
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3489	NC_012471	TCA	2	6	206133	206138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869694
3490	NC_012471	TTC	2	6	206175	206180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869694
3491	NC_012471	TCA	2	6	206194	206199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869694
3492	NC_012471	GGT	2	6	206201	206206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869694
3493	NC_012471	ATT	2	6	206321	206326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869695
3494	NC_012471	T	6	6	206337	206342	0 %	100 %	0 %	0 %	225869695
3495	NC_012471	A	7	7	206345	206351	100 %	0 %	0 %	0 %	225869695
3496	NC_012471	AAAGG	2	10	206372	206381	60 %	0 %	40 %	0 %	225869695
3497	NC_012471	CTA	2	6	206410	206415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869695
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3499	NC_012471	CAGG	2	8	206454	206461	25 %	0 %	50 %	25 %	225869695
3500	NC_012471	GCA	2	6	206491	206496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869695

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