MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012471	ATT	2	6	60238	60243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869530
1002	NC_012471	A	6	6	60264	60269	100 %	0 %	0 %	0 %	225869530
1003	NC_012471	TAC	2	6	60280	60285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869530
1004	NC_012471	CTT	2	6	60361	60366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869530
1005	NC_012471	T	6	6	60398	60403	0 %	100 %	0 %	0 %	225869530
1006	NC_012471	AAT	2	6	60410	60415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869530
1007	NC_012471	CTA	2	6	60416	60421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869530
1008	NC_012471	TTA	2	6	60452	60457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869530
1009	NC_012471	AAG	2	6	60540	60545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869530
1010	NC_012471	TA	3	6	60575	60580	50 %	50 %	0 %	0 %	225869530
1011	NC_012471	ATAA	2	8	60623	60630	75 %	25 %	0 %	0 %	225869530
1012	NC_012471	ATT	2	6	60707	60712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869530
1013	NC_012471	ACA	2	6	60734	60739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869530
1014	NC_012471	ATT	2	6	60759	60764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869530
1015	NC_012471	ATG	2	6	60780	60785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869530
1016	NC_012471	GAA	2	6	60804	60809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869530
1017	NC_012471	AAG	2	6	60842	60847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869530
1018	NC_012471	A	7	7	60861	60867	100 %	0 %	0 %	0 %	225869530
1019	NC_012471	TGA	2	6	60958	60963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869530
1020	NC_012471	A	6	6	60977	60982	100 %	0 %	0 %	0 %	225869530
1021	NC_012471	TGA	2	6	61075	61080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869530
1022	NC_012471	ATC	2	6	61151	61156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869530
1023	NC_012471	TTTG	2	8	61212	61219	0 %	75 %	25 %	0 %	225869530
1024	NC_012471	A	7	7	62506	62512	100 %	0 %	0 %	0 %	225869531
1025	NC_012471	AGA	2	6	62592	62597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1026	NC_012471	TAT	2	6	62627	62632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869531
1027	NC_012471	ATA	2	6	62672	62677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869531
1028	NC_012471	AT	3	6	62756	62761	50 %	50 %	0 %	0 %	225869531
1029	NC_012471	AGTA	2	8	62772	62779	50 %	25 %	25 %	0 %	225869531
1030	NC_012471	ATTTA	2	10	62784	62793	40 %	60 %	0 %	0 %	225869531
1031	NC_012471	GAA	3	9	62803	62811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1032	NC_012471	A	6	6	62822	62827	100 %	0 %	0 %	0 %	225869531
1033	NC_012471	AGA	2	6	62925	62930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1034	NC_012471	TAT	2	6	62931	62936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869531
1035	NC_012471	AGA	2	6	63051	63056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1036	NC_012471	ATT	2	6	63064	63069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869531
1037	NC_012471	AAAT	2	8	63072	63079	75 %	25 %	0 %	0 %	225869531
1038	NC_012471	GAA	2	6	63089	63094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1039	NC_012471	T	6	6	63119	63124	0 %	100 %	0 %	0 %	225869531
1040	NC_012471	GTG	2	6	63128	63133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869531
1041	NC_012471	GAAA	2	8	63143	63150	75 %	0 %	25 %	0 %	225869531
1042	NC_012471	ACA	2	6	63199	63204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869531
1043	NC_012471	ATG	2	6	63212	63217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869531
1044	NC_012471	AGG	2	6	63273	63278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869531
1045	NC_012471	TA	3	6	63305	63310	50 %	50 %	0 %	0 %	225869531
1046	NC_012471	AGT	2	6	63393	63398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869531
1047	NC_012471	AGA	2	6	63411	63416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1048	NC_012471	AGA	2	6	63429	63434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869531
1049	NC_012471	A	6	6	63438	63443	100 %	0 %	0 %	0 %	225869531
1050	NC_012471	ATT	2	6	63450	63455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869531
1051	NC_012471	A	7	7	63466	63472	100 %	0 %	0 %	0 %	225869531
1052	NC_012471	TGAAG	2	10	63501	63510	40 %	20 %	40 %	0 %	225869531
1053	NC_012471	ATT	2	6	63546	63551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869531
1054	NC_012471	TC	3	6	63598	63603	0 %	50 %	0 %	50 %	225869531
1055	NC_012471	TCATA	2	10	63654	63663	40 %	40 %	0 %	20 %	225869531
1056	NC_012471	AT	3	6	63675	63680	50 %	50 %	0 %	0 %	225869531
1057	NC_012471	TTTA	2	8	63716	63723	25 %	75 %	0 %	0 %	225869532
1058	NC_012471	CTT	2	6	63745	63750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869532
1059	NC_012471	TG	3	6	63773	63778	0 %	50 %	50 %	0 %	225869532
1060	NC_012471	A	7	7	63833	63839	100 %	0 %	0 %	0 %	225869532
1061	NC_012471	CTT	2	6	63889	63894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869532
1062	NC_012471	AGA	2	6	63921	63926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869532
1063	NC_012471	AGT	2	6	63936	63941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869532
1064	NC_012471	TTA	2	6	63957	63962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869532
1065	NC_012471	GAATT	2	10	63967	63976	40 %	40 %	20 %	0 %	225869532
1066	NC_012471	T	7	7	63989	63995	0 %	100 %	0 %	0 %	225869532
1067	NC_012471	AAT	2	6	64017	64022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869532
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1069	NC_012471	ATAA	2	8	64096	64103	75 %	25 %	0 %	0 %	225869532
1070	NC_012471	AATTT	2	10	64183	64192	40 %	60 %	0 %	0 %	225869532
1071	NC_012471	ATTT	2	8	64222	64229	25 %	75 %	0 %	0 %	225869532
1072	NC_012471	TTA	2	6	64246	64251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869532
1073	NC_012471	TAT	2	6	64264	64269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869532
1074	NC_012471	TTA	2	6	64294	64299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869532
1075	NC_012471	TTC	2	6	64346	64351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869532
1076	NC_012471	ATA	2	6	64381	64386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869532
1077	NC_012471	TC	3	6	64408	64413	0 %	50 %	0 %	50 %	225869532
1078	NC_012471	GAA	2	6	64464	64469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869532
1079	NC_012471	TTC	2	6	64484	64489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869532
1080	NC_012471	ATG	2	6	65164	65169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1081	NC_012471	CAA	2	6	65177	65182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869533
1082	NC_012471	TAA	2	6	65193	65198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869533
1083	NC_012471	GAT	2	6	65236	65241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1084	NC_012471	GAG	2	6	65290	65295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869533
1085	NC_012471	T	6	6	65344	65349	0 %	100 %	0 %	0 %	225869533
1086	NC_012471	TCT	2	6	65386	65391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869533
1087	NC_012471	ATG	2	6	65396	65401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1088	NC_012471	CAG	2	6	65414	65419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869533
1089	NC_012471	CTAT	2	8	65503	65510	25 %	50 %	0 %	25 %	225869533
1090	NC_012471	CTG	2	6	65531	65536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869533
1091	NC_012471	GCA	2	6	65602	65607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869533
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1093	NC_012471	ATT	2	6	65641	65646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869533
1094	NC_012471	GAT	2	6	65691	65696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1095	NC_012471	CA	3	6	65697	65702	50 %	0 %	0 %	50 %	225869533
1096	NC_012471	TGT	2	6	65721	65726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869533
1097	NC_012471	TGA	2	6	65745	65750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1098	NC_012471	AGC	2	6	65805	65810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869533
1099	NC_012471	TAT	2	6	65875	65880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869533
1100	NC_012471	TTATGC	2	12	65883	65894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225869533
1101	NC_012471	GA	3	6	65927	65932	50 %	0 %	50 %	0 %	225869533
1102	NC_012471	TAG	2	6	65942	65947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1103	NC_012471	CTA	2	6	65982	65987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869533
1104	NC_012471	GGTA	2	8	66070	66077	25 %	25 %	50 %	0 %	225869533
1105	NC_012471	ACT	2	6	66103	66108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869533
1106	NC_012471	T	6	6	66155	66160	0 %	100 %	0 %	0 %	225869533
1107	NC_012471	ATG	2	6	66173	66178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869533
1108	NC_012471	CAG	2	6	66188	66193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869533
1109	NC_012471	AGCT	2	8	66230	66237	25 %	25 %	25 %	25 %	225869533
1110	NC_012471	ATTT	2	8	66260	66267	25 %	75 %	0 %	0 %	225869533
1111	NC_012471	TTG	2	6	66416	66421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869533
1112	NC_012471	CAG	2	6	66478	66483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869533
1113	NC_012471	AT	3	6	66521	66526	50 %	50 %	0 %	0 %	225869533
1114	NC_012471	AGG	2	6	66563	66568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869533
1115	NC_012471	GCA	2	6	66609	66614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869533
1116	NC_012471	AGG	2	6	66641	66646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869533
1117	NC_012471	A	6	6	66696	66701	100 %	0 %	0 %	0 %	225869534
1118	NC_012471	AT	3	6	66737	66742	50 %	50 %	0 %	0 %	225869534
1119	NC_012471	ATT	2	6	66770	66775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869534
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1121	NC_012471	TAA	2	6	66822	66827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869534
1122	NC_012471	TGC	2	6	66867	66872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869534
1123	NC_012471	TTC	2	6	66971	66976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869534
1124	NC_012471	AGC	2	6	67026	67031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869534
1125	NC_012471	TGG	2	6	67050	67055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869534
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