MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012471	TGA	2	6	30921	30926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869510
502	NC_012471	ATT	2	6	30965	30970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869510
503	NC_012471	TAA	2	6	31289	31294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869511
504	NC_012471	TTA	2	6	31351	31356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869511
505	NC_012471	TAAA	2	8	31381	31388	75 %	25 %	0 %	0 %	225869511
506	NC_012471	ATT	2	6	31398	31403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869511
507	NC_012471	GTT	2	6	31413	31418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869511
508	NC_012471	AAG	2	6	31465	31470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869511
509	NC_012471	ATT	2	6	31491	31496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869511
510	NC_012471	TTA	2	6	31502	31507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869511
511	NC_012471	GAT	2	6	31524	31529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869511
512	NC_012471	ATG	2	6	31540	31545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869511
513	NC_012471	TGA	2	6	31574	31579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869511
514	NC_012471	AGG	2	6	31693	31698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869511
515	NC_012471	TGA	2	6	31715	31720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869511
516	NC_012471	TCG	2	6	31784	31789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869511
517	NC_012471	TTG	2	6	32051	32056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
518	NC_012471	AAG	2	6	32059	32064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869512
519	NC_012471	ATG	2	6	32159	32164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869512
520	NC_012471	GCT	2	6	32184	32189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
521	NC_012471	AGA	2	6	32244	32249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869512
522	NC_012471	T	6	6	32281	32286	0 %	100 %	0 %	0 %	225869512
523	NC_012471	TTG	2	6	32347	32352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
524	NC_012471	TCAA	2	8	32402	32409	50 %	25 %	0 %	25 %	225869512
525	NC_012471	TGC	2	6	32415	32420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
526	NC_012471	GAA	2	6	32422	32427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869512
527	NC_012471	TGA	2	6	32496	32501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869512
528	NC_012471	GGA	2	6	32613	32618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869512
529	NC_012471	CTG	2	6	32620	32625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
530	NC_012471	ATT	2	6	32636	32641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869512
531	NC_012471	GTC	2	6	32711	32716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
532	NC_012471	AGC	2	6	32774	32779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869512
533	NC_012471	ACCT	2	8	32797	32804	25 %	25 %	0 %	50 %	225869512
534	NC_012471	TGA	2	6	32814	32819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869512
535	NC_012471	GCT	2	6	32982	32987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
536	NC_012471	TGC	2	6	33042	33047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
537	NC_012471	TGG	2	6	33057	33062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
538	NC_012471	CAG	2	6	33175	33180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869512
539	NC_012471	AGC	2	6	33195	33200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869512
540	NC_012471	ACT	2	6	33241	33246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869512
541	NC_012471	TTG	2	6	33275	33280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
542	NC_012471	TGC	2	6	33312	33317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
543	NC_012471	GTG	2	6	33361	33366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
544	NC_012471	TGG	2	6	33375	33380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
545	NC_012471	TGG	2	6	33402	33407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
546	NC_012471	ATC	2	6	33417	33422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869512
547	NC_012471	GAG	2	6	33487	33492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869512
548	NC_012471	TCG	2	6	33513	33518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
549	NC_012471	TCA	2	6	33536	33541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869512
550	NC_012471	TGG	2	6	33564	33569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
551	NC_012471	TGC	2	6	33594	33599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
552	NC_012471	TGC	2	6	33756	33761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
553	NC_012471	TGT	2	6	33762	33767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
554	NC_012471	TTG	2	6	33821	33826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
555	NC_012471	TGC	2	6	33873	33878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
556	NC_012471	GTT	2	6	33883	33888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
557	NC_012471	GTG	2	6	33893	33898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
558	NC_012471	ACT	2	6	33922	33927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869512
559	NC_012471	TGG	2	6	34047	34052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
560	NC_012471	TA	3	6	34153	34158	50 %	50 %	0 %	0 %	225869512
561	NC_012471	TGC	2	6	34182	34187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
562	NC_012471	GCAG	2	8	34287	34294	25 %	0 %	50 %	25 %	225869512
563	NC_012471	CTTG	2	8	34320	34327	0 %	50 %	25 %	25 %	225869512
564	NC_012471	GCTTG	2	10	34350	34359	0 %	40 %	40 %	20 %	225869512
565	NC_012471	GCC	2	6	34413	34418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869512
566	NC_012471	GAC	2	6	34440	34445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869512
567	NC_012471	GCT	2	6	34483	34488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
568	NC_012471	TGAT	2	8	34532	34539	25 %	50 %	25 %	0 %	225869512
569	NC_012471	ATA	2	6	34592	34597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869512
570	NC_012471	TGG	2	6	34623	34628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
571	NC_012471	TGT	2	6	34629	34634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869512
572	NC_012471	TGC	2	6	34650	34655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
573	NC_012471	TG	3	6	34678	34683	0 %	50 %	50 %	0 %	225869512
574	NC_012471	CAGCT	2	10	34712	34721	20 %	20 %	20 %	40 %	225869512
575	NC_012471	TGG	2	6	34722	34727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
576	NC_012471	ATG	2	6	34808	34813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869512
577	NC_012471	CAG	2	6	34885	34890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869512
578	NC_012471	ACA	2	6	34921	34926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869512
579	NC_012471	TGC	2	6	34932	34937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
580	NC_012471	A	6	6	34949	34954	100 %	0 %	0 %	0 %	225869512
581	NC_012471	AACT	2	8	34992	34999	50 %	25 %	0 %	25 %	225869512
582	NC_012471	AG	3	6	35029	35034	50 %	0 %	50 %	0 %	225869512
583	NC_012471	TCA	2	6	35118	35123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869512
584	NC_012471	GGT	2	6	35146	35151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
585	NC_012471	CTG	2	6	35203	35208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
586	NC_012471	GGT	2	6	35251	35256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869512
587	NC_012471	GCT	2	6	35304	35309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869512
588	NC_012471	ATG	2	6	35363	35368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869512
589	NC_012471	TGGC	2	8	35425	35432	0 %	25 %	50 %	25 %	225869512
590	NC_012471	TAA	2	6	35706	35711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869512
591	NC_012471	ATT	2	6	35741	35746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869512
592	NC_012471	TAT	2	6	36022	36027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869513
593	NC_012471	TCA	2	6	36049	36054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869513
594	NC_012471	ATCTG	2	10	36097	36106	20 %	40 %	20 %	20 %	225869513
595	NC_012471	TGC	2	6	36124	36129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
596	NC_012471	CTG	2	6	36153	36158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
597	NC_012471	TAA	2	6	36172	36177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869513
598	NC_012471	A	6	6	36260	36265	100 %	0 %	0 %	0 %	225869513
599	NC_012471	AG	3	6	36271	36276	50 %	0 %	50 %	0 %	225869513
600	NC_012471	TCG	2	6	36331	36336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
601	NC_012471	TCA	2	6	36340	36345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869513
602	NC_012471	CTG	2	6	36407	36412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
603	NC_012471	AGC	2	6	36433	36438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869513
604	NC_012471	GTC	2	6	36497	36502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
605	NC_012471	TGGT	2	8	36528	36535	0 %	50 %	50 %	0 %	225869513
606	NC_012471	TGA	2	6	36580	36585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869513
607	NC_012471	ACT	2	6	36614	36619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869513
608	NC_012471	AT	3	6	36646	36651	50 %	50 %	0 %	0 %	225869513
609	NC_012471	TGGT	2	8	36759	36766	0 %	50 %	50 %	0 %	225869513
610	NC_012471	CAG	2	6	36786	36791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869513
611	NC_012471	AAATG	2	10	36823	36832	60 %	20 %	20 %	0 %	225869513
612	NC_012471	CCAA	2	8	36871	36878	50 %	0 %	0 %	50 %	225869513
613	NC_012471	GAT	2	6	36962	36967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869513
614	NC_012471	ACG	2	6	36991	36996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869513
615	NC_012471	TGC	2	6	37008	37013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
616	NC_012471	CTG	3	9	37128	37136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869513
617	NC_012471	TGG	2	6	37228	37233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869513
618	NC_012471	TG	3	6	37238	37243	0 %	50 %	50 %	0 %	225869513
619	NC_012471	CGC	2	6	37269	37274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869513
620	NC_012471	GAG	2	6	37286	37291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869513
621	NC_012471	AGA	2	6	37309	37314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869513
622	NC_012471	TTG	2	6	37463	37468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869514
623	NC_012471	A	6	6	37476	37481	100 %	0 %	0 %	0 %	225869514
624	NC_012471	AGG	2	6	37524	37529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869514
625	NC_012471	TGG	2	6	37533	37538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869514
626	NC_012471	TG	3	6	37660	37665	0 %	50 %	50 %	0 %	225869514
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