MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 36889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012470	CAG	2	6	243316	243321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
4002	NC_012470	TTG	2	6	243387	243392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867816
4003	NC_012470	GCA	2	6	243397	243402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
4004	NC_012470	AGATGT	2	12	243465	243476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867816
4005	NC_012470	T	6	6	243481	243486	0 %	100 %	0 %	0 %	225867816
4006	NC_012470	AGC	2	6	243512	243517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
4007	NC_012470	AGA	2	6	243522	243527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867816
4008	NC_012470	GCA	2	6	243586	243591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867816
4009	NC_012470	CCT	2	6	243607	243612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867816
4010	NC_012470	AGG	2	6	243681	243686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867816
4011	NC_012470	TGTC	2	8	243735	243742	0 %	50 %	25 %	25 %	225867816
4012	NC_012470	T	6	6	243756	243761	0 %	100 %	0 %	0 %	225867816
4013	NC_012470	AAG	2	6	243805	243810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867816
4014	NC_012470	CTG	2	6	244266	244271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4015	NC_012470	AG	3	6	244348	244353	50 %	0 %	50 %	0 %	225867817
4016	NC_012470	GCA	2	6	244394	244399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4017	NC_012470	AATT	2	8	244435	244442	50 %	50 %	0 %	0 %	225867817
4018	NC_012470	GCT	2	6	244453	244458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4019	NC_012470	CTA	2	6	244465	244470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
4020	NC_012470	AAG	2	6	244473	244478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
4021	NC_012470	TCAGG	2	10	244534	244543	20 %	20 %	40 %	20 %	225867817
4022	NC_012470	CAT	2	6	244550	244555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
4023	NC_012470	AAT	2	6	244586	244591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867817
4024	NC_012470	GCTTTG	2	12	244641	244652	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225867817
4025	NC_012470	TGG	2	6	244734	244739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867817
4026	NC_012470	ATA	2	6	244755	244760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867817
4027	NC_012470	GCA	2	6	244763	244768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4028	NC_012470	CCA	2	6	244793	244798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867817
4029	NC_012470	GAG	2	6	244802	244807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867817
4030	NC_012470	CCAAGC	2	12	244814	244825	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	225867817
4031	NC_012470	AG	3	6	244835	244840	50 %	0 %	50 %	0 %	225867817
4032	NC_012470	CAAG	2	8	244856	244863	50 %	0 %	25 %	25 %	225867817
4033	NC_012470	AGA	2	6	244906	244911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
4034	NC_012470	GAC	2	6	244957	244962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4035	NC_012470	GCC	2	6	244971	244976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225867817
4036	NC_012470	CCT	3	9	245007	245015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867817
4037	NC_012470	AAC	2	6	245111	245116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867817
4038	NC_012470	GCA	2	6	245146	245151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4039	NC_012470	CA	3	6	245223	245228	50 %	0 %	0 %	50 %	225867817
4040	NC_012470	AGA	2	6	245263	245268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
4041	NC_012470	TGAT	2	8	245271	245278	25 %	50 %	25 %	0 %	225867817
4042	NC_012470	CAG	2	6	245280	245285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4043	NC_012470	GC	3	6	245360	245365	0 %	0 %	50 %	50 %	225867817
4044	NC_012470	TGT	2	6	245470	245475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867817
4045	NC_012470	ACC	2	6	245489	245494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867817
4046	NC_012470	TGATT	2	10	245515	245524	20 %	60 %	20 %	0 %	225867817
4047	NC_012470	TGA	2	6	245572	245577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
4048	NC_012470	ACA	2	6	245612	245617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867817
4049	NC_012470	CAG	2	6	245666	245671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4050	NC_012470	CAGC	2	8	245785	245792	25 %	0 %	25 %	50 %	225867817
4051	NC_012470	TGG	2	6	246006	246011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867817
4052	NC_012470	GGA	2	6	246013	246018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867817
4053	NC_012470	TGC	2	6	246241	246246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4054	NC_012470	GCC	2	6	246286	246291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225867817
4055	NC_012470	ATT	2	6	246353	246358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867817
4056	NC_012470	TTGA	2	8	246365	246372	25 %	50 %	25 %	0 %	225867817
4057	NC_012470	TCGT	2	8	246459	246466	0 %	50 %	25 %	25 %	225867817
4058	NC_012470	AGC	2	6	246514	246519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4059	NC_012470	AAC	2	6	246553	246558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867817
4060	NC_012470	TGA	2	6	246571	246576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
4061	NC_012470	GTT	2	6	246611	246616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867817
4062	NC_012470	GAG	2	6	246650	246655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867817
4063	NC_012470	GTT	2	6	246662	246667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867817
4064	NC_012470	TA	3	6	246678	246683	50 %	50 %	0 %	0 %	225867817
4065	NC_012470	AT	3	6	246688	246693	50 %	50 %	0 %	0 %	225867817
4066	NC_012470	AGA	2	6	246703	246708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
4067	NC_012470	AGCTG	2	10	246715	246724	20 %	20 %	40 %	20 %	225867817
4068	NC_012470	CTAT	2	8	246744	246751	25 %	50 %	0 %	25 %	225867817
4069	NC_012470	ATT	2	6	246770	246775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867817
4070	NC_012470	TTG	2	6	246915	246920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867817
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4072	NC_012470	TCGG	2	8	247010	247017	0 %	25 %	50 %	25 %	225867817
4073	NC_012470	GGAC	2	8	247075	247082	25 %	0 %	50 %	25 %	225867817
4074	NC_012470	CCTT	2	8	247101	247108	0 %	50 %	0 %	50 %	225867817
4075	NC_012470	GAT	2	6	247157	247162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
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4078	NC_012470	TGG	2	6	247369	247374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867817
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4080	NC_012470	CAG	2	6	247431	247436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4081	NC_012470	ATG	2	6	247437	247442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
4082	NC_012470	GAC	2	6	247459	247464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
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4084	NC_012470	ATG	2	6	247521	247526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
4085	NC_012470	CCA	2	6	247530	247535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867817
4086	NC_012470	CAG	2	6	247584	247589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4087	NC_012470	T	6	6	247611	247616	0 %	100 %	0 %	0 %	225867817
4088	NC_012470	GAAC	2	8	247692	247699	50 %	0 %	25 %	25 %	225867817
4089	NC_012470	ACCC	2	8	247724	247731	25 %	0 %	0 %	75 %	225867817
4090	NC_012470	TGC	2	6	247749	247754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4091	NC_012470	CTGG	2	8	247786	247793	0 %	25 %	50 %	25 %	225867817
4092	NC_012470	AAG	2	6	247815	247820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867817
4093	NC_012470	CAT	2	6	247861	247866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
4094	NC_012470	CATG	2	8	247876	247883	25 %	25 %	25 %	25 %	225867817
4095	NC_012470	CAT	2	6	247912	247917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
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4099	NC_012470	TCA	2	6	248107	248112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
4100	NC_012470	CAT	2	6	248116	248121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867817
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4102	NC_012470	GCT	2	6	248189	248194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4103	NC_012470	GGA	2	6	248209	248214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867817
4104	NC_012470	CAA	2	6	248221	248226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867817
4105	NC_012470	GCGCAA	2	12	248227	248238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867817
4106	NC_012470	GA	3	6	248300	248305	50 %	0 %	50 %	0 %	225867817
4107	NC_012470	GTG	3	9	248484	248492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867817
4108	NC_012470	TGA	2	6	248572	248577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867817
4109	NC_012470	ATGA	2	8	248709	248716	50 %	25 %	25 %	0 %	225867818
4110	NC_012470	GTT	2	6	248748	248753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867818
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4112	NC_012470	TC	3	6	248889	248894	0 %	50 %	0 %	50 %	225867818
4113	NC_012470	GA	3	6	248937	248942	50 %	0 %	50 %	0 %	225867818
4114	NC_012470	TTGA	2	8	249021	249028	25 %	50 %	25 %	0 %	225867818
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4118	NC_012470	AAGGC	2	10	249352	249361	40 %	0 %	40 %	20 %	225867819
4119	NC_012470	AAGC	2	8	249415	249422	50 %	0 %	25 %	25 %	225867819
4120	NC_012470	AGC	2	6	249461	249466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867819
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4122	NC_012470	CAAT	2	8	249583	249590	50 %	25 %	0 %	25 %	225867819
4123	NC_012470	GGT	2	6	249596	249601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867819
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4487	NC_012470	GCCT	2	8	267640	267647	0 %	25 %	25 %	50 %	225867840
4488	NC_012470	CT	3	6	267685	267690	0 %	50 %	0 %	50 %	225867840
4489	NC_012470	GAAT	2	8	267707	267714	50 %	25 %	25 %	0 %	225867840
4490	NC_012470	ATC	2	6	267715	267720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867840
4491	NC_012470	A	6	6	267731	267736	100 %	0 %	0 %	0 %	225867840
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