MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 36889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012470	GAG	2	6	182455	182460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867770
3002	NC_012470	CAG	2	6	182504	182509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3003	NC_012470	CCT	2	6	182517	182522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867770
3004	NC_012470	AGC	2	6	182552	182557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3005	NC_012470	TGC	2	6	182591	182596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3006	NC_012470	ATG	2	6	182633	182638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867770
3007	NC_012470	GGT	2	6	182733	182738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867770
3008	NC_012470	TAG	2	6	182823	182828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867770
3009	NC_012470	TCAA	2	8	182939	182946	50 %	25 %	0 %	25 %	225867770
3010	NC_012470	GGT	2	6	182979	182984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867770
3011	NC_012470	AGC	2	6	183050	183055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3012	NC_012470	TTG	2	6	183170	183175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867770
3013	NC_012470	CAT	2	6	183243	183248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867770
3014	NC_012470	ATG	3	9	183389	183397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867770
3015	NC_012470	ATT	2	6	183416	183421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867770
3016	NC_012470	AATTG	2	10	183426	183435	40 %	40 %	20 %	0 %	225867770
3017	NC_012470	TGC	2	6	183474	183479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3018	NC_012470	AGG	2	6	183485	183490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867770
3019	NC_012470	TAA	2	6	183627	183632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867770
3020	NC_012470	CGT	3	9	183766	183774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3021	NC_012470	GAT	2	6	183882	183887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867770
3022	NC_012470	TAG	2	6	183905	183910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867770
3023	NC_012470	TGG	2	6	183912	183917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867770
3024	NC_012470	TGC	2	6	183932	183937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867770
3025	NC_012470	ATG	2	6	183947	183952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867770
3026	NC_012470	ATG	2	6	184329	184334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867771
3027	NC_012470	TGA	2	6	184358	184363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867771
3028	NC_012470	CTG	2	6	184432	184437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867771
3029	NC_012470	ATG	2	6	184441	184446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867771
3030	NC_012470	CGA	2	6	184584	184589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867771
3031	NC_012470	GTCAGG	2	12	184630	184641	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225867771
3032	NC_012470	GCTTG	2	10	184655	184664	0 %	40 %	40 %	20 %	225867771
3033	NC_012470	AAG	2	6	184672	184677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867771
3034	NC_012470	GAG	2	6	184680	184685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867771
3035	NC_012470	CAG	2	6	184696	184701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867771
3036	NC_012470	TAGT	2	8	184782	184789	25 %	50 %	25 %	0 %	225867771
3037	NC_012470	CATT	2	8	184826	184833	25 %	50 %	0 %	25 %	225867772
3038	NC_012470	TAA	2	6	185021	185026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867772
3039	NC_012470	TGA	2	6	185042	185047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867772
3040	NC_012470	GAC	2	6	185084	185089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867772
3041	NC_012470	TAT	2	6	185091	185096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867772
3042	NC_012470	TGT	2	6	185123	185128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867772
3043	NC_012470	GAA	2	6	185656	185661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3044	NC_012470	TTG	2	6	185694	185699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867773
3045	NC_012470	ATA	2	6	185736	185741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867773
3046	NC_012470	CTA	2	6	185775	185780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867773
3047	NC_012470	GAA	2	6	185795	185800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3048	NC_012470	GTG	2	6	185802	185807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867773
3049	NC_012470	CAA	2	6	185810	185815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867773
3050	NC_012470	GATTAC	2	12	185899	185910	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225867773
3051	NC_012470	GAA	2	6	185966	185971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3052	NC_012470	CAG	2	6	186000	186005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3053	NC_012470	ATG	2	6	186051	186056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867773
3054	NC_012470	GGA	2	6	186080	186085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867773
3055	NC_012470	A	7	7	186130	186136	100 %	0 %	0 %	0 %	225867773
3056	NC_012470	TGA	2	6	186241	186246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867773
3057	NC_012470	CAA	2	6	186311	186316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867773
3058	NC_012470	CTG	2	6	186348	186353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3059	NC_012470	TTG	2	6	186363	186368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867773
3060	NC_012470	AAG	2	6	186438	186443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3061	NC_012470	GCA	3	9	186470	186478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3062	NC_012470	AAG	3	9	186510	186518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3063	NC_012470	ACG	2	6	186554	186559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3064	NC_012470	CTG	2	6	186567	186572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3065	NC_012470	AGC	2	6	186688	186693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3066	NC_012470	AG	3	6	186727	186732	50 %	0 %	50 %	0 %	225867773
3067	NC_012470	AAAC	2	8	186774	186781	75 %	0 %	0 %	25 %	225867773
3068	NC_012470	GTT	2	6	186785	186790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867773
3069	NC_012470	TAAAGG	2	12	186801	186812	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225867773
3070	NC_012470	GAA	2	6	186824	186829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3071	NC_012470	CAG	2	6	186906	186911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3072	NC_012470	AGCT	2	8	186936	186943	25 %	25 %	25 %	25 %	225867773
3073	NC_012470	AGG	2	6	186951	186956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867773
3074	NC_012470	GCA	2	6	186959	186964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3075	NC_012470	GCA	2	6	187064	187069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3076	NC_012470	AAG	2	6	187217	187222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867773
3077	NC_012470	AGC	2	6	187234	187239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3078	NC_012470	AGC	2	6	187245	187250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3079	NC_012470	CTG	2	6	187266	187271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867773
3080	NC_012470	CAG	3	9	187293	187301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867773
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3083	NC_012470	CTG	2	6	187616	187621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867774
3084	NC_012470	AGC	2	6	187625	187630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867774
3085	NC_012470	TACAGC	2	12	187644	187655	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225867774
3086	NC_012470	AAG	2	6	187679	187684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867774
3087	NC_012470	CAA	2	6	187693	187698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867774
3088	NC_012470	ATCA	2	8	187706	187713	50 %	25 %	0 %	25 %	225867774
3089	NC_012470	CAG	2	6	187733	187738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867774
3090	NC_012470	CTC	2	6	187746	187751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867774
3091	NC_012470	AGT	2	6	187764	187769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867774
3092	NC_012470	AAC	2	6	187791	187796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867774
3093	NC_012470	GCA	2	6	187819	187824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867774
3094	NC_012470	CAGA	2	8	187870	187877	50 %	0 %	25 %	25 %	225867774
3095	NC_012470	ACC	2	6	187897	187902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867774
3096	NC_012470	TAG	2	6	188021	188026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867774
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3098	NC_012470	AC	3	6	188117	188122	50 %	0 %	0 %	50 %	225867774
3099	NC_012470	CCTA	2	8	188132	188139	25 %	25 %	0 %	50 %	225867774
3100	NC_012470	TAG	2	6	188151	188156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867774
3101	NC_012470	A	6	6	188322	188327	100 %	0 %	0 %	0 %	225867774
3102	NC_012470	ATG	2	6	188432	188437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867774
3103	NC_012470	CTG	2	6	188546	188551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867774
3104	NC_012470	AAGGTC	2	12	188566	188577	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225867774
3105	NC_012470	AGGC	2	8	188627	188634	25 %	0 %	50 %	25 %	225867774
3106	NC_012470	TGC	2	6	188688	188693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867774
3107	NC_012470	TAA	2	6	188694	188699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867774
3108	NC_012470	GGA	2	6	188709	188714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867774
3109	NC_012470	A	7	7	188737	188743	100 %	0 %	0 %	0 %	225867774
3110	NC_012470	TGG	2	6	188802	188807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867774
3111	NC_012470	AGA	2	6	188886	188891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867774
3112	NC_012470	GTGC	2	8	188917	188924	0 %	25 %	50 %	25 %	225867774
3113	NC_012470	GCTA	2	8	189004	189011	25 %	25 %	25 %	25 %	225867774
3114	NC_012470	TGG	2	6	189054	189059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867774
3115	NC_012470	TTG	2	6	189198	189203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867774
3116	NC_012470	GAT	2	6	189304	189309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867774
3117	NC_012470	CAACAG	2	12	189389	189400	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	225867774
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3119	NC_012470	GCTA	2	8	189457	189464	25 %	25 %	25 %	25 %	225867774
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3241	NC_012470	GAG	2	6	197915	197920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867780
3242	NC_012470	TGC	2	6	197932	197937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867780
3243	NC_012470	CAT	2	6	197987	197992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867780
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3245	NC_012470	GCC	2	6	198079	198084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225867780
3246	NC_012470	TGC	2	6	198117	198122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867780
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3253	NC_012470	TGA	2	6	198621	198626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867781
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3260	NC_012470	CTG	2	6	199152	199157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867782
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3273	NC_012470	CAT	2	6	199736	199741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867782
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3277	NC_012470	GCT	2	6	199861	199866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867782
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3361	NC_012470	TGA	2	6	204607	204612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867786
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3364	NC_012470	TGA	2	6	204716	204721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867786
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3390	NC_012470	GCA	2	6	206052	206057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867787
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3481	NC_012470	TCT	2	6	211737	211742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867791
3482	NC_012470	AGC	2	6	211815	211820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867791
3483	NC_012470	TTTA	2	8	211969	211976	25 %	75 %	0 %	0 %	225867792
3484	NC_012470	TGG	2	6	212026	212031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867792
3485	NC_012470	GGT	2	6	212068	212073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867792
3486	NC_012470	TGC	2	6	212079	212084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867792
3487	NC_012470	AATG	2	8	212092	212099	50 %	25 %	25 %	0 %	225867792
3488	NC_012470	TCAA	2	8	212130	212137	50 %	25 %	0 %	25 %	225867792
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3491	NC_012470	TTGT	2	8	212336	212343	0 %	75 %	25 %	0 %	225867792
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