MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 22960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860013
2	NC_012469	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860013
3	NC_012469	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860013
4	NC_012469	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860013
5	NC_012469	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860013
6	NC_012469	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860013
7	NC_012469	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860013
8	NC_012469	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860013
9	NC_012469	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860013
10	NC_012469	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860013
11	NC_012469	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860013
12	NC_012469	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860013
13	NC_012469	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860013
14	NC_012469	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860013
15	NC_012469	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860014
16	NC_012469	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860014
17	NC_012469	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860014
18	NC_012469	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860014
19	NC_012469	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860014
20	NC_012469	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860014
21	NC_012469	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860014
22	NC_012469	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860014
23	NC_012469	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860014
24	NC_012469	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860014
25	NC_012469	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860014
26	NC_012469	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860014
27	NC_012469	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860014
28	NC_012469	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860014
29	NC_012469	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860015
30	NC_012469	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860015
31	NC_012469	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860015
32	NC_012469	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860015
33	NC_012469	TTC	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860016
34	NC_012469	ATT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860016
35	NC_012469	ATA	2	6	3879	3884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860016
36	NC_012469	CAA	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860017
37	NC_012469	TCC	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860018
38	NC_012469	CTT	3	9	4684	4692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860018
39	NC_012469	TCA	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860018
40	NC_012469	ACC	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860018
41	NC_012469	TGT	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860019
42	NC_012469	GTA	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860019
43	NC_012469	GTT	2	6	5048	5053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860019
44	NC_012469	TAA	2	6	5341	5346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860020
45	NC_012469	ATC	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860020
46	NC_012469	AAT	2	6	5571	5576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860021
47	NC_012469	TTC	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860021
48	NC_012469	TCC	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860021
49	NC_012469	CTA	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860021
50	NC_012469	TAC	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860021
51	NC_012469	TGT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860021
52	NC_012469	TCA	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860022
53	NC_012469	TCT	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860022
54	NC_012469	GTT	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860023
55	NC_012469	AGC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860023
56	NC_012469	ACC	2	6	7206	7211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860023
57	NC_012469	ATC	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860023
58	NC_012469	ATT	2	6	7510	7515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860023
59	NC_012469	CTT	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860023
60	NC_012469	GGT	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860023
61	NC_012469	CTA	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860023
62	NC_012469	AGG	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860023
63	NC_012469	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860023
64	NC_012469	CTC	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860024
65	NC_012469	TTA	2	6	8367	8372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860024
66	NC_012469	CCT	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860024
67	NC_012469	AAT	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860024
68	NC_012469	AGT	2	6	8501	8506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860024
69	NC_012469	TGT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860024
70	NC_012469	TAC	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860024
71	NC_012469	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860024
72	NC_012469	GTT	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860024
73	NC_012469	CAC	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860024
74	NC_012469	GTC	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860024
75	NC_012469	GTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860024
76	NC_012469	TCC	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860024
77	NC_012469	CGG	2	6	9154	9159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225860025
78	NC_012469	CCT	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860026
79	NC_012469	TCA	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860026
80	NC_012469	CTC	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860026
81	NC_012469	TGT	2	6	9541	9546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860026
82	NC_012469	ACT	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860026
83	NC_012469	CTC	2	6	9699	9704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860027
84	NC_012469	CAA	2	6	9837	9842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860027
85	NC_012469	GGT	2	6	10096	10101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860028
86	NC_012469	CAG	2	6	10141	10146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860028
87	NC_012469	TCC	2	6	10183	10188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860029
88	NC_012469	ATC	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860029
89	NC_012469	TCT	2	6	10423	10428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860029
90	NC_012469	GTC	2	6	10457	10462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860030
91	NC_012469	TGA	2	6	10501	10506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860030
92	NC_012469	TCA	2	6	10551	10556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860030
93	NC_012469	CCT	2	6	10602	10607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860031
94	NC_012469	AAT	2	6	10724	10729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860031
95	NC_012469	TAA	2	6	10853	10858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860031
96	NC_012469	TTC	2	6	10870	10875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860031
97	NC_012469	TGT	2	6	10943	10948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860031
98	NC_012469	CAT	2	6	10983	10988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860031
99	NC_012469	TCT	2	6	11063	11068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860031
100	NC_012469	TTG	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860031
101	NC_012469	TCC	2	6	11111	11116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860032
102	NC_012469	ATA	2	6	11218	11223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860032
103	NC_012469	TGT	2	6	11229	11234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860032
104	NC_012469	TTC	2	6	11235	11240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860032
105	NC_012469	TAC	2	6	11680	11685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860033
106	NC_012469	TTC	2	6	11707	11712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860033
107	NC_012469	CAT	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860034
108	NC_012469	CGT	2	6	11862	11867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860034
109	NC_012469	TCT	2	6	12143	12148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860034
110	NC_012469	TAC	2	6	12199	12204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860034
111	NC_012469	TTC	2	6	12795	12800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860036
112	NC_012469	ATC	2	6	13100	13105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860037
113	NC_012469	TCA	2	6	13352	13357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860037
114	NC_012469	TTG	2	6	13444	13449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860037
115	NC_012469	GAT	2	6	13597	13602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860037
116	NC_012469	GTA	2	6	13610	13615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860037
117	NC_012469	ATC	2	6	13738	13743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860038
118	NC_012469	CAA	2	6	13854	13859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860038
119	NC_012469	GTT	2	6	13883	13888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860038
120	NC_012469	TTC	2	6	13915	13920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860038
121	NC_012469	GTT	2	6	13949	13954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860038
122	NC_012469	TGT	2	6	13983	13988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860038
123	NC_012469	ATC	2	6	14261	14266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860039
124	NC_012469	TGG	2	6	14325	14330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860039
125	NC_012469	CGC	2	6	14410	14415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225860039
126	NC_012469	TTG	2	6	14530	14535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860039
127	NC_012469	AGG	2	6	14538	14543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860039
128	NC_012469	ATC	2	6	14759	14764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860039
129	NC_012469	TAC	2	6	14956	14961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860039
130	NC_012469	CGT	2	6	15103	15108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860039
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372	NC_012469	CAA	2	6	43113	43118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860062
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500	NC_012469	GTT	2	6	55429	55434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860075

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