MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 34948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012469	GTT	2	6	193740	193745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860212
3002	NC_012469	CAGG	2	8	193762	193769	25 %	0 %	50 %	25 %	225860212
3003	NC_012469	CAA	2	6	193791	193796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860212
3004	NC_012469	TGAC	2	8	193853	193860	25 %	25 %	25 %	25 %	225860212
3005	NC_012469	TTG	2	6	193997	194002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860212
3006	NC_012469	A	6	6	194089	194094	100 %	0 %	0 %	0 %	225860212
3007	NC_012469	TGA	2	6	194157	194162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860212
3008	NC_012469	ATG	2	6	194196	194201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860212
3009	NC_012469	CTT	2	6	194281	194286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860213
3010	NC_012469	CTT	2	6	194345	194350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860213
3011	NC_012469	CAA	2	6	194370	194375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860213
3012	NC_012469	TTC	2	6	194406	194411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860213
3013	NC_012469	TGA	2	6	194446	194451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860213
3014	NC_012469	TGT	2	6	194453	194458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860213
3015	NC_012469	AAC	2	6	194548	194553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860213
3016	NC_012469	ACT	2	6	194555	194560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860213
3017	NC_012469	AGA	2	6	194597	194602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860213
3018	NC_012469	ATT	2	6	194603	194608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860213
3019	NC_012469	ATT	2	6	194664	194669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860213
3020	NC_012469	GCCTT	2	10	194755	194764	0 %	40 %	20 %	40 %	225860213
3021	NC_012469	TAT	2	6	194768	194773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860213
3022	NC_012469	GAAA	2	8	194780	194787	75 %	0 %	25 %	0 %	225860213
3023	NC_012469	CTA	2	6	194798	194803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860213
3024	NC_012469	AAATG	2	10	194868	194877	60 %	20 %	20 %	0 %	225860213
3025	NC_012469	GTC	2	6	195166	195171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860214
3026	NC_012469	TGA	2	6	195213	195218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860214
3027	NC_012469	TCT	2	6	195266	195271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860214
3028	NC_012469	TTC	2	6	195283	195288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860214
3029	NC_012469	TTCCC	2	10	195311	195320	0 %	40 %	0 %	60 %	225860214
3030	NC_012469	ACC	2	6	195418	195423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860214
3031	NC_012469	CAA	2	6	195457	195462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860214
3032	NC_012469	TGAC	2	8	195482	195489	25 %	25 %	25 %	25 %	225860214
3033	NC_012469	GTTC	2	8	195524	195531	0 %	50 %	25 %	25 %	225860214
3034	NC_012469	TTC	2	6	195567	195572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860214
3035	NC_012469	TCAA	2	8	195578	195585	50 %	25 %	0 %	25 %	225860214
3036	NC_012469	AGT	2	6	195594	195599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860214
3037	NC_012469	GGT	2	6	195696	195701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860214
3038	NC_012469	T	6	6	195732	195737	0 %	100 %	0 %	0 %	225860214
3039	NC_012469	ATC	2	6	195835	195840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860214
3040	NC_012469	TAG	2	6	196029	196034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860214
3041	NC_012469	TGCACT	2	12	196320	196331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225860215
3042	NC_012469	AGG	2	6	196372	196377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860215
3043	NC_012469	GCT	2	6	196378	196383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860215
3044	NC_012469	AAT	2	6	196386	196391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860215
3045	NC_012469	TTG	2	6	196442	196447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860215
3046	NC_012469	AGA	2	6	196451	196456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860215
3047	NC_012469	AGT	2	6	196559	196564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860215
3048	NC_012469	CCA	2	6	196585	196590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860215
3049	NC_012469	AGA	2	6	196606	196611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860215
3050	NC_012469	AATC	2	8	196614	196621	50 %	25 %	0 %	25 %	225860215
3051	NC_012469	AAG	2	6	196648	196653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860215
3052	NC_012469	TGA	2	6	196688	196693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860215
3053	NC_012469	ATC	2	6	196711	196716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860215
3054	NC_012469	ATC	2	6	196725	196730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860215
3055	NC_012469	CTC	2	6	196836	196841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860215
3056	NC_012469	TGA	2	6	196904	196909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860215
3057	NC_012469	TTG	2	6	196911	196916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860215
3058	NC_012469	T	6	6	197000	197005	0 %	100 %	0 %	0 %	225860216
3059	NC_012469	AG	3	6	197017	197022	50 %	0 %	50 %	0 %	225860216
3060	NC_012469	ATG	2	6	197181	197186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860216
3061	NC_012469	GTT	2	6	197195	197200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860216
3062	NC_012469	GAGG	2	8	197381	197388	25 %	0 %	75 %	0 %	225860216
3063	NC_012469	T	6	6	197407	197412	0 %	100 %	0 %	0 %	225860216
3064	NC_012469	TCAA	2	8	197427	197434	50 %	25 %	0 %	25 %	225860216
3065	NC_012469	TTC	2	6	197435	197440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860216
3066	NC_012469	TTGA	2	8	197449	197456	25 %	50 %	25 %	0 %	225860216
3067	NC_012469	TGA	2	6	197653	197658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860216
3068	NC_012469	GTA	2	6	197681	197686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860216
3069	NC_012469	TTTC	2	8	197697	197704	0 %	75 %	0 %	25 %	225860216
3070	NC_012469	TTC	2	6	197768	197773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860216
3071	NC_012469	CAATAT	2	12	197800	197811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225860216
3072	NC_012469	GTT	2	6	197907	197912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860216
3073	NC_012469	AG	3	6	197915	197920	50 %	0 %	50 %	0 %	225860216
3074	NC_012469	T	7	7	198135	198141	0 %	100 %	0 %	0 %	225860217
3075	NC_012469	TA	4	8	198164	198171	50 %	50 %	0 %	0 %	225860217
3076	NC_012469	TCT	2	6	198321	198326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860217
3077	NC_012469	ATGA	2	8	198354	198361	50 %	25 %	25 %	0 %	225860217
3078	NC_012469	ATCTAT	2	12	198456	198467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225860217
3079	NC_012469	TAG	2	6	198637	198642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860217
3080	NC_012469	T	7	7	198687	198693	0 %	100 %	0 %	0 %	225860217
3081	NC_012469	T	6	6	198720	198725	0 %	100 %	0 %	0 %	225860217
3082	NC_012469	GCTTT	2	10	198728	198737	0 %	60 %	20 %	20 %	225860217
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3084	NC_012469	GTTT	2	8	198818	198825	0 %	75 %	25 %	0 %	225860217
3085	NC_012469	AGT	2	6	198918	198923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860217
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3087	NC_012469	AG	3	6	199034	199039	50 %	0 %	50 %	0 %	225860217
3088	NC_012469	T	6	6	199057	199062	0 %	100 %	0 %	0 %	225860217
3089	NC_012469	T	6	6	199109	199114	0 %	100 %	0 %	0 %	225860217
3090	NC_012469	CTTT	2	8	199172	199179	0 %	75 %	0 %	25 %	225860217
3091	NC_012469	T	7	7	199236	199242	0 %	100 %	0 %	0 %	225860217
3092	NC_012469	ATG	2	6	199261	199266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860217
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3094	NC_012469	TAA	2	6	199430	199435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860218
3095	NC_012469	T	7	7	199491	199497	0 %	100 %	0 %	0 %	225860218
3096	NC_012469	TTC	2	6	199536	199541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860218
3097	NC_012469	CT	3	6	199548	199553	0 %	50 %	0 %	50 %	225860218
3098	NC_012469	ATT	2	6	199573	199578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3099	NC_012469	CT	3	6	199699	199704	0 %	50 %	0 %	50 %	225860218
3100	NC_012469	ATT	2	6	199717	199722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3101	NC_012469	AGT	2	6	199784	199789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860218
3102	NC_012469	A	6	6	199815	199820	100 %	0 %	0 %	0 %	225860218
3103	NC_012469	AT	3	6	199859	199864	50 %	50 %	0 %	0 %	225860218
3104	NC_012469	ATTATC	2	12	199882	199893	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225860218
3105	NC_012469	AATG	2	8	199932	199939	50 %	25 %	25 %	0 %	225860218
3106	NC_012469	C	6	6	200072	200077	0 %	0 %	0 %	100 %	225860218
3107	NC_012469	CAT	2	6	200084	200089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860218
3108	NC_012469	TTTAT	2	10	200218	200227	20 %	80 %	0 %	0 %	225860218
3109	NC_012469	ATTT	2	8	200253	200260	25 %	75 %	0 %	0 %	225860218
3110	NC_012469	TTA	2	6	200261	200266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3111	NC_012469	TAT	2	6	200312	200317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3112	NC_012469	TA	3	6	200330	200335	50 %	50 %	0 %	0 %	225860218
3113	NC_012469	TGT	2	6	200489	200494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860218
3114	NC_012469	AT	3	6	200502	200507	50 %	50 %	0 %	0 %	225860218
3115	NC_012469	TTC	2	6	200586	200591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860218
3116	NC_012469	TTA	2	6	200614	200619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3117	NC_012469	TTA	2	6	200623	200628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3118	NC_012469	TA	3	6	200636	200641	50 %	50 %	0 %	0 %	225860218
3119	NC_012469	ATT	2	6	200733	200738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860218
3120	NC_012469	CTT	2	6	200795	200800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860218
3121	NC_012469	ATA	2	6	200828	200833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860218
3122	NC_012469	T	6	6	200861	200866	0 %	100 %	0 %	0 %	225860218
3123	NC_012469	ATC	2	6	201049	201054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860219
3124	NC_012469	TCTT	2	8	201068	201075	0 %	75 %	0 %	25 %	225860219
3125	NC_012469	CTT	2	6	201078	201083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860219
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3239	NC_012469	CTCG	2	8	211234	211241	0 %	25 %	25 %	50 %	225860233
3240	NC_012469	ACG	2	6	211251	211256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860233
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3242	NC_012469	A	6	6	211425	211430	100 %	0 %	0 %	0 %	225860233
3243	NC_012469	TGTTCG	2	12	211475	211486	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225860233
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3245	NC_012469	AGCA	2	8	211536	211543	50 %	0 %	25 %	25 %	225860233
3246	NC_012469	AGG	2	6	211582	211587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860233
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3248	NC_012469	GTT	3	9	211676	211684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860233
3249	NC_012469	TCTCT	2	10	211742	211751	0 %	60 %	0 %	40 %	225860233
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3367	NC_012469	TGTC	2	8	218011	218018	0 %	50 %	25 %	25 %	225860240
3368	NC_012469	A	6	6	218021	218026	100 %	0 %	0 %	0 %	225860240
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3487	NC_012469	CAAG	2	8	225064	225071	50 %	0 %	25 %	25 %	225860245
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3493	NC_012469	A	6	6	225312	225317	100 %	0 %	0 %	0 %	225860246
3494	NC_012469	ATG	2	6	225412	225417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860247
3495	NC_012469	ATG	2	6	225446	225451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860247
3496	NC_012469	CAGGAA	2	12	225505	225516	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	225860247
3497	NC_012469	CTA	2	6	225628	225633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860247
3498	NC_012469	GAA	2	6	225634	225639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860247
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3500	NC_012469	AGCAG	2	10	225781	225790	40 %	0 %	40 %	20 %	225860247

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