MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 24112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012468	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857810
2	NC_012468	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225857810
3	NC_012468	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857810
4	NC_012468	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857810
5	NC_012468	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857810
6	NC_012468	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857810
7	NC_012468	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857810
8	NC_012468	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857810
9	NC_012468	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857810
10	NC_012468	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857810
11	NC_012468	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857810
12	NC_012468	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857810
13	NC_012468	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857810
14	NC_012468	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857810
15	NC_012468	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857811
16	NC_012468	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857811
17	NC_012468	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857811
18	NC_012468	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857811
19	NC_012468	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857811
20	NC_012468	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857811
21	NC_012468	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857811
22	NC_012468	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857811
23	NC_012468	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857811
24	NC_012468	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857811
25	NC_012468	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857811
26	NC_012468	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857811
27	NC_012468	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857811
28	NC_012468	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857811
29	NC_012468	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857812
30	NC_012468	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857812
31	NC_012468	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857812
32	NC_012468	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857812
33	NC_012468	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
34	NC_012468	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
35	NC_012468	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
36	NC_012468	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225857813
37	NC_012468	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857813
38	NC_012468	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857813
39	NC_012468	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
40	NC_012468	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
41	NC_012468	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857813
42	NC_012468	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
43	NC_012468	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
44	NC_012468	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225857813
45	NC_012468	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
46	NC_012468	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857813
47	NC_012468	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
48	NC_012468	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
49	NC_012468	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857814
50	NC_012468	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857814
51	NC_012468	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857814
52	NC_012468	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857814
53	NC_012468	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857814
54	NC_012468	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857814
55	NC_012468	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857814
56	NC_012468	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857814
57	NC_012468	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857814
58	NC_012468	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
59	NC_012468	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857815
60	NC_012468	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
61	NC_012468	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
62	NC_012468	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225857815
63	NC_012468	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857815
64	NC_012468	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
65	NC_012468	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857815
66	NC_012468	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
67	NC_012468	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
68	NC_012468	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
69	NC_012468	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
70	NC_012468	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
71	NC_012468	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
72	NC_012468	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
73	NC_012468	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857815
74	NC_012468	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857815
75	NC_012468	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225857815
76	NC_012468	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857815
77	NC_012468	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857815
78	NC_012468	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
79	NC_012468	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
80	NC_012468	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
81	NC_012468	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
82	NC_012468	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
83	NC_012468	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857815
84	NC_012468	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857815
85	NC_012468	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
86	NC_012468	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
87	NC_012468	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
88	NC_012468	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225857815
89	NC_012468	TAT	2	6	7424	7429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
90	NC_012468	ACA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225857815
91	NC_012468	GAC	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857815
92	NC_012468	TAT	2	6	7594	7599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
93	NC_012468	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
94	NC_012468	GTA	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
95	NC_012468	ATA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857815
96	NC_012468	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
97	NC_012468	TTA	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
98	NC_012468	GAA	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
99	NC_012468	CGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857816
100	NC_012468	TGC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857816
101	NC_012468	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857816
102	NC_012468	AGA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857816
103	NC_012468	AAT	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857817
104	NC_012468	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857817
105	NC_012468	TGA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857817
106	NC_012468	TAT	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857817
107	NC_012468	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857817
108	NC_012468	TGC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857817
109	NC_012468	TAT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857817
110	NC_012468	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857818
111	NC_012468	GAA	2	6	9208	9213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857818
112	NC_012468	ATT	2	6	9231	9236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857818
113	NC_012468	AAG	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857818
114	NC_012468	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857819
115	NC_012468	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857819
116	NC_012468	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857819
117	NC_012468	TTA	2	6	9364	9369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857819
118	NC_012468	TAG	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857819
119	NC_012468	ATC	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857819
120	NC_012468	CAA	2	6	9615	9620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225857819
121	NC_012468	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857819
122	NC_012468	ATC	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857819
123	NC_012468	GAA	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857819
124	NC_012468	ACT	2	6	9887	9892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857819
125	NC_012468	AAG	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857819
126	NC_012468	TAT	2	6	9962	9967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857819
127	NC_012468	ATA	2	6	10092	10097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857819
128	NC_012468	GAT	2	6	10232	10237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857819
129	NC_012468	TCT	2	6	10262	10267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857819
130	NC_012468	AAG	2	6	10564	10569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857820
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255	NC_012468	GTA	2	6	25760	25765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857830
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