MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 36924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_012468	TTG	2	6	296260	296265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858126
5003	NC_012468	CT	4	8	296306	296313	0 %	50 %	0 %	50 %	225858126
5004	NC_012468	AAG	2	6	296354	296359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858126
5005	NC_012468	GAT	2	6	296401	296406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858126
5006	NC_012468	TCC	2	6	296426	296431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225858126
5007	NC_012468	GTTC	2	8	296521	296528	0 %	50 %	25 %	25 %	225858126
5008	NC_012468	AGC	2	6	296652	296657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858126
5009	NC_012468	GCT	2	6	296659	296664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858126
5010	NC_012468	TGC	2	6	296697	296702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858126
5011	NC_012468	CGA	2	6	296706	296711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858126
5012	NC_012468	TAA	2	6	296829	296834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858126
5013	NC_012468	AGA	2	6	296967	296972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858126
5014	NC_012468	CGT	2	6	296995	297000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858126
5015	NC_012468	CTG	2	6	297101	297106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858126
5016	NC_012468	TCAG	2	8	297204	297211	25 %	25 %	25 %	25 %	225858126
5017	NC_012468	CTT	2	6	297219	297224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858126
5018	NC_012468	GTT	2	6	297289	297294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858126
5019	NC_012468	ATA	2	6	297461	297466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858127
5020	NC_012468	TAT	2	6	297633	297638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858127
5021	NC_012468	T	6	6	297674	297679	0 %	100 %	0 %	0 %	225858127
5022	NC_012468	AT	3	6	297852	297857	50 %	50 %	0 %	0 %	225858128
5023	NC_012468	A	6	6	298057	298062	100 %	0 %	0 %	0 %	225858129
5024	NC_012468	TGA	2	6	298086	298091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858129
5025	NC_012468	A	6	6	298091	298096	100 %	0 %	0 %	0 %	225858129
5026	NC_012468	CTA	2	6	298146	298151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858129
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5028	NC_012468	TTG	2	6	298219	298224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858129
5029	NC_012468	ATG	2	6	298304	298309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858129
5030	NC_012468	TTC	2	6	298325	298330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858129
5031	NC_012468	AAG	2	6	298391	298396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858129
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5033	NC_012468	TGG	2	6	298544	298549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858129
5034	NC_012468	GTG	2	6	298567	298572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858129
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5036	NC_012468	ATT	2	6	298678	298683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858129
5037	NC_012468	TGC	2	6	298983	298988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858130
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5039	NC_012468	TCT	2	6	299198	299203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858130
5040	NC_012468	CTT	2	6	299286	299291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858130
5041	NC_012468	CAA	2	6	299305	299310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225858130
5042	NC_012468	TGG	2	6	299313	299318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858130
5043	NC_012468	AGC	2	6	299398	299403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858130
5044	NC_012468	TAA	2	6	299427	299432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858130
5045	NC_012468	CTTG	2	8	299466	299473	0 %	50 %	25 %	25 %	225858130
5046	NC_012468	AAGA	2	8	299506	299513	75 %	0 %	25 %	0 %	225858130
5047	NC_012468	CCA	2	6	299563	299568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225858130
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5051	NC_012468	CTG	2	6	299702	299707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858130
5052	NC_012468	TGGT	2	8	299753	299760	0 %	50 %	50 %	0 %	225858130
5053	NC_012468	GTTTG	2	10	299842	299851	0 %	60 %	40 %	0 %	225858130
5054	NC_012468	TGA	2	6	299981	299986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858130
5055	NC_012468	TTG	2	6	300092	300097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858130
5056	NC_012468	TGGA	2	8	300109	300116	25 %	25 %	50 %	0 %	225858130
5057	NC_012468	GTT	2	6	300136	300141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858130
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5059	NC_012468	ATG	2	6	300297	300302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858131
5060	NC_012468	GAA	2	6	300304	300309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858131
5061	NC_012468	ATA	2	6	300345	300350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858131
5062	NC_012468	T	6	6	300365	300370	0 %	100 %	0 %	0 %	225858131
5063	NC_012468	TAAG	2	8	300373	300380	50 %	25 %	25 %	0 %	225858131
5064	NC_012468	AAAGT	2	10	300388	300397	60 %	20 %	20 %	0 %	225858131
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5081	NC_012468	T	6	6	301067	301072	0 %	100 %	0 %	0 %	225858131
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5105	NC_012468	TGGT	2	8	301942	301949	0 %	50 %	50 %	0 %	225858132
5106	NC_012468	AAG	2	6	301988	301993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858132
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5109	NC_012468	CAAA	2	8	302088	302095	75 %	0 %	0 %	25 %	225858133
5110	NC_012468	T	6	6	302098	302103	0 %	100 %	0 %	0 %	225858133
5111	NC_012468	T	6	6	302154	302159	0 %	100 %	0 %	0 %	225858133
5112	NC_012468	TCT	2	6	302174	302179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858133
5113	NC_012468	TGAG	2	8	302221	302228	25 %	25 %	50 %	0 %	225858133
5114	NC_012468	CGC	2	6	302262	302267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225858133
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5119	NC_012468	GATT	2	8	302538	302545	25 %	50 %	25 %	0 %	225858133
5120	NC_012468	AGC	2	6	302602	302607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858133
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5122	NC_012468	CTT	2	6	302673	302678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858133
5123	NC_012468	AGC	2	6	302689	302694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858133
5124	NC_012468	GCA	2	6	302711	302716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858133
5125	NC_012468	TAAGT	2	10	302758	302767	40 %	40 %	20 %	0 %	225858133
5126	NC_012468	TGA	2	6	302772	302777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858133
5127	NC_012468	TCT	2	6	302870	302875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858133
5128	NC_012468	GCA	2	6	302885	302890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858133
5129	NC_012468	TTA	2	6	302897	302902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858133
5130	NC_012468	ATC	2	6	302917	302922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858133
5131	NC_012468	CTGA	2	8	302988	302995	25 %	25 %	25 %	25 %	225858133
5132	NC_012468	GCA	2	6	303005	303010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858133
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5135	NC_012468	ATTAG	2	10	303276	303285	40 %	40 %	20 %	0 %	225858134
5136	NC_012468	TCG	2	6	303334	303339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858134
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5142	NC_012468	CGA	2	6	303524	303529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858134
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5151	NC_012468	CCA	2	6	303784	303789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225858134
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5154	NC_012468	GTT	2	6	303850	303855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858134
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5170	NC_012468	TCCA	2	8	305420	305427	25 %	25 %	0 %	50 %	225858135
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5223	NC_012468	TTTTGG	2	12	308411	308422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225858138
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5225	NC_012468	AAGA	2	8	308580	308587	75 %	0 %	25 %	0 %	225858138
5226	NC_012468	CTT	2	6	308595	308600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225858138
5227	NC_012468	TCTT	2	8	308641	308648	0 %	75 %	0 %	25 %	225858138
5228	NC_012468	TCA	2	6	308671	308676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858138
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5230	NC_012468	GTG	2	6	308790	308795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858138
5231	NC_012468	ATG	2	6	308803	308808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858138
5232	NC_012468	TGA	2	6	308858	308863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858138
5233	NC_012468	GAAA	2	8	308901	308908	75 %	0 %	25 %	0 %	225858139
5234	NC_012468	CGGA	2	8	308938	308945	25 %	0 %	50 %	25 %	225858139
5235	NC_012468	TGG	2	6	308972	308977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858139
5236	NC_012468	GGA	2	6	309031	309036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225858139
5237	NC_012468	T	6	6	309063	309068	0 %	100 %	0 %	0 %	225858139
5238	NC_012468	TCAT	2	8	309125	309132	25 %	50 %	0 %	25 %	225858139
5239	NC_012468	GCT	2	6	309229	309234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225858139
5240	NC_012468	CAT	2	6	309315	309320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858139
5241	NC_012468	TGTC	2	8	309357	309364	0 %	50 %	25 %	25 %	225858139
5242	NC_012468	AGCAG	2	10	309438	309447	40 %	0 %	40 %	20 %	225858139
5243	NC_012468	TAT	2	6	309456	309461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858139
5244	NC_012468	TCA	2	6	309582	309587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858139
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5273	NC_012468	TGG	2	6	311034	311039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858141
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5347	NC_012468	CTTT	2	8	315240	315247	0 %	75 %	0 %	25 %	225858146
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5359	NC_012468	AAG	2	6	315678	315683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858147
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5361	NC_012468	TTA	2	6	315715	315720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225858147
5362	NC_012468	CT	3	6	315822	315827	0 %	50 %	0 %	50 %	225858148
5363	NC_012468	T	6	6	315893	315898	0 %	100 %	0 %	0 %	225858148
5364	NC_012468	ATG	2	6	315924	315929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858148
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5479	NC_012468	TA	3	6	321550	321555	50 %	50 %	0 %	0 %	225858156
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5490	NC_012468	AGA	2	6	322011	322016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858157
5491	NC_012468	CT	3	6	322059	322064	0 %	50 %	0 %	50 %	225858157
5492	NC_012468	TGA	2	6	322092	322097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858157
5493	NC_012468	GAA	2	6	322111	322116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225858157
5494	NC_012468	TGA	2	6	322143	322148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225858157
5495	NC_012468	TCA	2	6	322175	322180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225858157
5496	NC_012468	TGG	2	6	322224	322229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225858157
5497	NC_012468	ATTG	2	8	322245	322252	25 %	50 %	25 %	0 %	225858157
5498	NC_012468	AAT	2	6	322333	322338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858157
5499	NC_012468	ATA	2	6	322403	322408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225858157
5500	NC_012468	AGC	2	6	322428	322433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225858157

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