MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 23407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853612
2	NC_012466	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853612
3	NC_012466	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
4	NC_012466	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
5	NC_012466	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
6	NC_012466	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
7	NC_012466	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
8	NC_012466	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
9	NC_012466	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
10	NC_012466	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
11	NC_012466	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
12	NC_012466	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853612
13	NC_012466	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
14	NC_012466	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
15	NC_012466	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853613
16	NC_012466	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
17	NC_012466	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
18	NC_012466	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
19	NC_012466	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
20	NC_012466	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
21	NC_012466	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853613
22	NC_012466	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853613
23	NC_012466	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
24	NC_012466	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
25	NC_012466	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
26	NC_012466	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853613
27	NC_012466	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853613
28	NC_012466	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853613
29	NC_012466	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
30	NC_012466	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
31	NC_012466	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853614
32	NC_012466	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853614
33	NC_012466	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
34	NC_012466	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
35	NC_012466	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
36	NC_012466	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853615
37	NC_012466	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
38	NC_012466	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853615
39	NC_012466	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
40	NC_012466	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
41	NC_012466	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
42	NC_012466	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
43	NC_012466	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
44	NC_012466	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
45	NC_012466	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853615
46	NC_012466	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
47	NC_012466	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
48	NC_012466	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
49	NC_012466	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
50	NC_012466	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853616
51	NC_012466	TTA	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
52	NC_012466	GAT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
53	NC_012466	CAG	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853616
54	NC_012466	TAT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
55	NC_012466	GTT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853616
56	NC_012466	CAT	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
57	NC_012466	GAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
58	NC_012466	ACT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
59	NC_012466	TTA	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
60	NC_012466	CTA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
61	NC_012466	AGA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
62	NC_012466	GAT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
63	NC_012466	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853617
64	NC_012466	GAA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
65	NC_012466	GAG	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
66	NC_012466	TGA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
67	NC_012466	AGA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
68	NC_012466	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
69	NC_012466	TGA	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
70	NC_012466	AGA	2	6	5918	5923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
71	NC_012466	AGA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
72	NC_012466	ATT	2	6	6150	6155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
73	NC_012466	GGA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
74	NC_012466	CGT	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853617
75	NC_012466	ACA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853617
76	NC_012466	TGT	2	6	6434	6439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
77	NC_012466	CAT	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
78	NC_012466	TGA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
79	NC_012466	TGA	4	12	6743	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
80	NC_012466	TGA	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
81	NC_012466	GAT	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
82	NC_012466	GTA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
83	NC_012466	CGA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853617
84	NC_012466	TGT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
85	NC_012466	TGA	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
86	NC_012466	TGA	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
87	NC_012466	GAA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
88	NC_012466	CCG	2	6	7323	7328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225853617
89	NC_012466	TAT	2	6	7425	7430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
90	NC_012466	ACA	2	6	7435	7440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853617
91	NC_012466	GAC	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853617
92	NC_012466	TAT	2	6	7595	7600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
93	NC_012466	TTA	2	6	7920	7925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
94	NC_012466	GTA	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
95	NC_012466	ATA	2	6	8227	8232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853617
96	NC_012466	ATT	2	6	8284	8289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
97	NC_012466	CTG	2	6	8400	8405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853617
98	NC_012466	TTA	2	6	8421	8426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
99	NC_012466	GAA	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
100	NC_012466	CGT	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853618
101	NC_012466	TGC	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853618
102	NC_012466	GCA	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853618
103	NC_012466	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853618
104	NC_012466	AAT	2	6	8803	8808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853619
105	NC_012466	CGT	2	6	8833	8838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853619
106	NC_012466	TGA	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853619
107	NC_012466	TAT	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853619
108	NC_012466	TGA	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853619
109	NC_012466	TGC	2	6	9063	9068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853619
110	NC_012466	TAT	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853619
111	NC_012466	TTA	2	6	9161	9166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853620
112	NC_012466	GAA	2	6	9209	9214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853620
113	NC_012466	ATT	2	6	9232	9237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853620
114	NC_012466	AAG	2	6	9246	9251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853620
115	NC_012466	ATT	2	6	9282	9287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853621
116	NC_012466	TTG	2	6	9288	9293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853621
117	NC_012466	GTC	2	6	9342	9347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853621
118	NC_012466	TTA	2	6	9365	9370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853621
119	NC_012466	TAG	2	6	9463	9468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853621
120	NC_012466	ATC	2	6	9559	9564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853621
121	NC_012466	CAA	2	6	9616	9621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853621
122	NC_012466	AAG	2	6	9679	9684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853621
123	NC_012466	ATC	2	6	9689	9694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853621
124	NC_012466	GAA	2	6	9801	9806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853621
125	NC_012466	ACT	2	6	9888	9893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853621
126	NC_012466	AAG	2	6	9898	9903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853621
127	NC_012466	TAT	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853621
128	NC_012466	ATA	2	6	10093	10098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853621
129	NC_012466	GAT	2	6	10233	10238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853621
130	NC_012466	TCT	2	6	10263	10268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853621
131	NC_012466	AAG	2	6	10565	10570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853622
132	NC_012466	TGG	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853622
133	NC_012466	GAA	2	6	10727	10732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853622
134	NC_012466	GCT	2	6	10751	10756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853622
135	NC_012466	CCA	2	6	10885	10890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853622
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139	NC_012466	ATT	2	6	11076	11081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853622
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243	NC_012466	ATA	2	6	25321	25326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853634
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245	NC_012466	CAA	2	6	25658	25663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853634
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247	NC_012466	TTC	2	6	25919	25924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853635
248	NC_012466	TGT	2	6	25959	25964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853635
249	NC_012466	TTC	2	6	26123	26128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853635
250	NC_012466	AAC	2	6	26426	26431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853636
251	NC_012466	CAG	2	6	26449	26454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853636
252	NC_012466	GTT	2	6	26523	26528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853636
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