MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012466	TGG	2	6	241920	241925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853863
4002	NC_012466	TCA	2	6	242012	242017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853863
4003	NC_012466	TGA	2	6	242027	242032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853863
4004	NC_012466	T	6	6	242065	242070	0 %	100 %	0 %	0 %	225853863
4005	NC_012466	CAG	2	6	242195	242200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853864
4006	NC_012466	CAT	2	6	242253	242258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853864
4007	NC_012466	CTT	2	6	242308	242313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853864
4008	NC_012466	A	6	6	242376	242381	100 %	0 %	0 %	0 %	225853864
4009	NC_012466	GAA	2	6	242419	242424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853864
4010	NC_012466	TGA	2	6	242508	242513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853864
4011	NC_012466	CTT	2	6	242533	242538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853864
4012	NC_012466	ATG	2	6	242609	242614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853864
4013	NC_012466	AGC	2	6	242622	242627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853864
4014	NC_012466	TAT	2	6	242670	242675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853864
4015	NC_012466	GGT	2	6	242695	242700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853864
4016	NC_012466	AAG	2	6	242810	242815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853864
4017	NC_012466	CAA	2	6	242909	242914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853864
4018	NC_012466	GAA	3	9	242947	242955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853864
4019	NC_012466	TGA	2	6	242991	242996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853864
4020	NC_012466	AGA	2	6	243021	243026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853864
4021	NC_012466	TTG	2	6	243068	243073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853864
4022	NC_012466	GAA	3	9	243157	243165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853864
4023	NC_012466	TGT	2	6	243174	243179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853864
4024	NC_012466	ATT	2	6	243232	243237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853864
4025	NC_012466	AGCA	2	8	243456	243463	50 %	0 %	25 %	25 %	225853864
4026	NC_012466	ATC	2	6	243505	243510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853864
4027	NC_012466	TCT	2	6	243540	243545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853864
4028	NC_012466	CAG	2	6	243548	243553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853864
4029	NC_012466	TGTCAA	2	12	243669	243680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225853864
4030	NC_012466	GAA	2	6	243685	243690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853864
4031	NC_012466	AAGC	2	8	243716	243723	50 %	0 %	25 %	25 %	225853864
4032	NC_012466	AACG	2	8	243763	243770	50 %	0 %	25 %	25 %	225853864
4033	NC_012466	A	6	6	243832	243837	100 %	0 %	0 %	0 %	225853864
4034	NC_012466	CAGA	2	8	244093	244100	50 %	0 %	25 %	25 %	225853865
4035	NC_012466	CA	3	6	244255	244260	50 %	0 %	0 %	50 %	225853865
4036	NC_012466	GATGGT	2	12	244429	244440	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225853865
4037	NC_012466	TTTTG	2	10	244486	244495	0 %	80 %	20 %	0 %	225853865
4038	NC_012466	ATG	2	6	244571	244576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853865
4039	NC_012466	CAG	2	6	244641	244646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853865
4040	NC_012466	CTG	2	6	244739	244744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853865
4041	NC_012466	TCTT	2	8	244786	244793	0 %	75 %	0 %	25 %	225853865
4042	NC_012466	ATA	2	6	244898	244903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853865
4043	NC_012466	ACT	2	6	244925	244930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853865
4044	NC_012466	CTC	2	6	244952	244957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853865
4045	NC_012466	GAA	2	6	245155	245160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853865
4046	NC_012466	GAT	2	6	245188	245193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853865
4047	NC_012466	CTG	2	6	245292	245297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853865
4048	NC_012466	CGT	2	6	245362	245367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853865
4049	NC_012466	GAA	2	6	245370	245375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853865
4050	NC_012466	ATA	2	6	245405	245410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853865
4051	NC_012466	TG	3	6	245614	245619	0 %	50 %	50 %	0 %	225853866
4052	NC_012466	TTG	2	6	245623	245628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853866
4053	NC_012466	GTT	2	6	245631	245636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853866
4054	NC_012466	AAC	2	6	245801	245806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853866
4055	NC_012466	AGA	2	6	245936	245941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853866
4056	NC_012466	CAC	2	6	245955	245960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853866
4057	NC_012466	GAA	2	6	246015	246020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853866
4058	NC_012466	TC	3	6	246026	246031	0 %	50 %	0 %	50 %	225853866
4059	NC_012466	A	6	6	246048	246053	100 %	0 %	0 %	0 %	225853866
4060	NC_012466	TGCCTT	2	12	246080	246091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225853866
4061	NC_012466	GCTATG	2	12	246189	246200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225853866
4062	NC_012466	ACCA	2	8	246210	246217	50 %	0 %	0 %	50 %	225853866
4063	NC_012466	ATG	2	6	246283	246288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853866
4064	NC_012466	GCTA	2	8	246306	246313	25 %	25 %	25 %	25 %	225853866
4065	NC_012466	ACTTG	2	10	246323	246332	20 %	40 %	20 %	20 %	225853866
4066	NC_012466	TAC	2	6	246360	246365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853866
4067	NC_012466	TGA	2	6	246380	246385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853866
4068	NC_012466	CAAC	2	8	246387	246394	50 %	0 %	0 %	50 %	225853866
4069	NC_012466	GAT	2	6	246426	246431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853866
4070	NC_012466	AGT	2	6	246440	246445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853866
4071	NC_012466	GAA	2	6	246549	246554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853866
4072	NC_012466	CATCT	2	10	246581	246590	20 %	40 %	0 %	40 %	225853866
4073	NC_012466	GTC	2	6	246670	246675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853866
4074	NC_012466	CCTT	2	8	246841	246848	0 %	50 %	0 %	50 %	225853866
4075	NC_012466	AGAA	2	8	246952	246959	75 %	0 %	25 %	0 %	225853866
4076	NC_012466	CTT	2	6	246984	246989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853866
4077	NC_012466	AAC	2	6	246992	246997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853866
4078	NC_012466	TAC	2	6	247032	247037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853866
4079	NC_012466	TTGA	2	8	247131	247138	25 %	50 %	25 %	0 %	225853866
4080	NC_012466	CT	3	6	247159	247164	0 %	50 %	0 %	50 %	225853866
4081	NC_012466	GTG	2	6	247222	247227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853866
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4083	NC_012466	CGA	2	6	247271	247276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853866
4084	NC_012466	TGG	2	6	247631	247636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853867
4085	NC_012466	GCTG	2	8	247647	247654	0 %	25 %	50 %	25 %	225853867
4086	NC_012466	GGTT	2	8	247659	247666	0 %	50 %	50 %	0 %	225853867
4087	NC_012466	CT	3	6	247932	247937	0 %	50 %	0 %	50 %	225853867
4088	NC_012466	TGA	2	6	247941	247946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853867
4089	NC_012466	AAG	2	6	248027	248032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853867
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4091	NC_012466	TAT	2	6	248139	248144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853867
4092	NC_012466	TGG	2	6	248145	248150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853867
4093	NC_012466	GAAGC	2	10	248198	248207	40 %	0 %	40 %	20 %	225853867
4094	NC_012466	ATT	2	6	248288	248293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853867
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4100	NC_012466	T	6	6	248705	248710	0 %	100 %	0 %	0 %	225853868
4101	NC_012466	AGG	2	6	248738	248743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853868
4102	NC_012466	GTTT	2	8	248763	248770	0 %	75 %	25 %	0 %	225853868
4103	NC_012466	CTT	2	6	248868	248873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853868
4104	NC_012466	CTT	2	6	248883	248888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853868
4105	NC_012466	CTT	2	6	248892	248897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853868
4106	NC_012466	GTT	2	6	248904	248909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853868
4107	NC_012466	TAG	2	6	248976	248981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853868
4108	NC_012466	TCT	2	6	249074	249079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853868
4109	NC_012466	GA	3	6	249108	249113	50 %	0 %	50 %	0 %	225853868
4110	NC_012466	GAA	2	6	249117	249122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853868
4111	NC_012466	AAATT	2	10	249260	249269	60 %	40 %	0 %	0 %	225853868
4112	NC_012466	TGA	2	6	249384	249389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853868
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4116	NC_012466	ACG	2	6	249763	249768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853868
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4118	NC_012466	T	6	6	249805	249810	0 %	100 %	0 %	0 %	225853868
4119	NC_012466	ATG	2	6	249824	249829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853868
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4122	NC_012466	GTT	2	6	250000	250005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853868
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4244	NC_012466	ATG	2	6	256035	256040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853871
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4246	NC_012466	TCG	2	6	256100	256105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853871
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4248	NC_012466	TTC	2	6	256195	256200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853871
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4253	NC_012466	TGA	2	6	256436	256441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853872
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4256	NC_012466	GAA	2	6	256606	256611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853872
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4259	NC_012466	AAG	2	6	256825	256830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853872
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4351	NC_012466	AGC	2	6	262073	262078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853876
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4360	NC_012466	CTG	2	6	262522	262527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853876
4361	NC_012466	TCAG	2	8	262625	262632	25 %	25 %	25 %	25 %	225853876
4362	NC_012466	T	6	6	262641	262646	0 %	100 %	0 %	0 %	225853876
4363	NC_012466	GTT	2	6	262710	262715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853876
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4487	NC_012466	ACC	2	6	268999	269004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853883
4488	NC_012466	CAG	2	6	269049	269054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853883
4489	NC_012466	CTC	2	6	269073	269078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853883
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4491	NC_012466	CTT	2	6	269151	269156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853883
4492	NC_012466	TTG	2	6	269177	269182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853883
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