MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012466	TGG	2	6	209964	209969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853832
3502	NC_012466	GAA	2	6	210094	210099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853832
3503	NC_012466	TGC	2	6	210102	210107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853832
3504	NC_012466	AAATTA	2	12	210162	210173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853833
3505	NC_012466	TGT	2	6	210220	210225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853833
3506	NC_012466	ACTTGG	2	12	210229	210240	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225853833
3507	NC_012466	TTA	2	6	210258	210263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853833
3508	NC_012466	AAG	2	6	210264	210269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853833
3509	NC_012466	GCT	2	6	210275	210280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853833
3510	NC_012466	CAG	2	6	210297	210302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853833
3511	NC_012466	GAA	2	6	210323	210328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853833
3512	NC_012466	TCA	2	6	210551	210556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853834
3513	NC_012466	CGT	2	6	210656	210661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853834
3514	NC_012466	GTT	2	6	210761	210766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853834
3515	NC_012466	AGC	2	6	210853	210858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853834
3516	NC_012466	GAA	2	6	210878	210883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853834
3517	NC_012466	GGT	2	6	210899	210904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853834
3518	NC_012466	AG	3	6	210922	210927	50 %	0 %	50 %	0 %	225853834
3519	NC_012466	T	6	6	210938	210943	0 %	100 %	0 %	0 %	225853835
3520	NC_012466	ATT	2	6	210946	210951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853835
3521	NC_012466	TTTA	2	8	210991	210998	25 %	75 %	0 %	0 %	225853835
3522	NC_012466	CTT	2	6	211090	211095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853835
3523	NC_012466	A	6	6	211129	211134	100 %	0 %	0 %	0 %	225853835
3524	NC_012466	TTG	2	6	211182	211187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853835
3525	NC_012466	GAA	2	6	211254	211259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853835
3526	NC_012466	ATC	2	6	211400	211405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853835
3527	NC_012466	GTA	2	6	211416	211421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853835
3528	NC_012466	TTGG	2	8	211432	211439	0 %	50 %	50 %	0 %	225853835
3529	NC_012466	GAT	2	6	211519	211524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853835
3530	NC_012466	ACT	2	6	211542	211547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853835
3531	NC_012466	ATT	2	6	211604	211609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853835
3532	NC_012466	TTG	2	6	211616	211621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853835
3533	NC_012466	ATT	2	6	211622	211627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853835
3534	NC_012466	CAA	2	6	211646	211651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853835
3535	NC_012466	TCCAA	2	10	211666	211675	40 %	20 %	0 %	40 %	225853835
3536	NC_012466	CTG	2	6	211734	211739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853835
3537	NC_012466	TTC	2	6	211791	211796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853835
3538	NC_012466	ACT	2	6	211859	211864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853835
3539	NC_012466	ATT	2	6	211898	211903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853835
3540	NC_012466	TTC	2	6	211913	211918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853835
3541	NC_012466	AGC	2	6	211948	211953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853835
3542	NC_012466	AG	3	6	211954	211959	50 %	0 %	50 %	0 %	225853835
3543	NC_012466	GTG	2	6	211971	211976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853835
3544	NC_012466	AGA	2	6	212011	212016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853835
3545	NC_012466	AT	3	6	212017	212022	50 %	50 %	0 %	0 %	225853835
3546	NC_012466	CTT	2	6	212030	212035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853835
3547	NC_012466	CGT	2	6	212036	212041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853835
3548	NC_012466	TGT	2	6	212122	212127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853835
3549	NC_012466	TGG	2	6	212134	212139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853835
3550	NC_012466	ACAGA	2	10	212232	212241	60 %	0 %	20 %	20 %	225853835
3551	NC_012466	AGC	2	6	212443	212448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853836
3552	NC_012466	AT	3	6	212548	212553	50 %	50 %	0 %	0 %	225853836
3553	NC_012466	GAT	2	6	212618	212623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853836
3554	NC_012466	TAT	2	6	212725	212730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853836
3555	NC_012466	ATC	2	6	212780	212785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853836
3556	NC_012466	CCA	2	6	212825	212830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853836
3557	NC_012466	AGA	3	9	212842	212850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853836
3558	NC_012466	TAC	2	6	212852	212857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853836
3559	NC_012466	GAT	2	6	212867	212872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853836
3560	NC_012466	CGT	2	6	212891	212896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853836
3561	NC_012466	ATG	2	6	212988	212993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853836
3562	NC_012466	TCT	2	6	212994	212999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853836
3563	NC_012466	TTGAAG	2	12	213170	213181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853837
3564	NC_012466	AGT	2	6	213186	213191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853837
3565	NC_012466	AAT	2	6	213365	213370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853837
3566	NC_012466	TCG	2	6	213444	213449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853838
3567	NC_012466	ACAA	2	8	213491	213498	75 %	0 %	0 %	25 %	225853838
3568	NC_012466	GTA	2	6	213570	213575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853839
3569	NC_012466	GCT	3	9	213630	213638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853839
3570	NC_012466	AGA	2	6	213647	213652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853839
3571	NC_012466	AAG	2	6	213682	213687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853839
3572	NC_012466	CGT	2	6	213696	213701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853839
3573	NC_012466	TCG	2	6	213734	213739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853839
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3576	NC_012466	GTAAAG	2	12	213853	213864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225853839
3577	NC_012466	A	6	6	213885	213890	100 %	0 %	0 %	0 %	225853839
3578	NC_012466	CGT	2	6	213932	213937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853840
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3580	NC_012466	TCA	2	6	214037	214042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853840
3581	NC_012466	GCT	2	6	214088	214093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853840
3582	NC_012466	GCT	3	9	214109	214117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853840
3583	NC_012466	TGC	2	6	214204	214209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853840
3584	NC_012466	CA	3	6	214254	214259	50 %	0 %	0 %	50 %	225853840
3585	NC_012466	TCC	2	6	214270	214275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853840
3586	NC_012466	ATC	2	6	214294	214299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853840
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3588	NC_012466	CT	3	6	214444	214449	0 %	50 %	0 %	50 %	225853841
3589	NC_012466	TCG	2	6	214450	214455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853841
3590	NC_012466	AGC	2	6	214480	214485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853841
3591	NC_012466	GT	3	6	214509	214514	0 %	50 %	50 %	0 %	225853841
3592	NC_012466	A	6	6	214611	214616	100 %	0 %	0 %	0 %	225853841
3593	NC_012466	CTG	2	6	214641	214646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853841
3594	NC_012466	TTC	2	6	214729	214734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853841
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3596	NC_012466	GTAG	2	8	214883	214890	25 %	25 %	50 %	0 %	225853841
3597	NC_012466	ATG	2	6	214893	214898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853841
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3599	NC_012466	AGA	2	6	214948	214953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853841
3600	NC_012466	TGA	2	6	215037	215042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853841
3601	NC_012466	AAG	2	6	215043	215048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853841
3602	NC_012466	GAC	2	6	215063	215068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853841
3603	NC_012466	GAT	2	6	215182	215187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853841
3604	NC_012466	GAA	2	6	215219	215224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853841
3605	NC_012466	AAACTC	2	12	215228	215239	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225853841
3606	NC_012466	ATAA	2	8	215265	215272	75 %	25 %	0 %	0 %	225853841
3607	NC_012466	AATC	2	8	215366	215373	50 %	25 %	0 %	25 %	225853842
3608	NC_012466	A	6	6	215417	215422	100 %	0 %	0 %	0 %	225853842
3609	NC_012466	GTG	2	6	215441	215446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853842
3610	NC_012466	TGCA	2	8	215450	215457	25 %	25 %	25 %	25 %	225853842
3611	NC_012466	CGT	2	6	215458	215463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853842
3612	NC_012466	AGC	2	6	215466	215471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853842
3613	NC_012466	CGTA	2	8	215478	215485	25 %	25 %	25 %	25 %	225853842
3614	NC_012466	ATG	2	6	215507	215512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853842
3615	NC_012466	CTA	2	6	215534	215539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853842
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3617	NC_012466	ATC	2	6	215653	215658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853842
3618	NC_012466	TGT	2	6	215952	215957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853843
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3620	NC_012466	TC	3	6	216032	216037	0 %	50 %	0 %	50 %	225853843
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3989	NC_012466	GAA	3	9	241204	241212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853863
3990	NC_012466	A	6	6	241211	241216	100 %	0 %	0 %	0 %	225853863
3991	NC_012466	GTT	2	6	241369	241374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853863
3992	NC_012466	T	6	6	241373	241378	0 %	100 %	0 %	0 %	225853863
3993	NC_012466	GTG	2	6	241400	241405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853863
3994	NC_012466	ACAA	2	8	241607	241614	75 %	0 %	0 %	25 %	225853863
3995	NC_012466	GGT	2	6	241702	241707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853863
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3998	NC_012466	AGT	2	6	241816	241821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853863
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