MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012466	GGTT	2	8	299554	299561	0 %	50 %	50 %	0 %	225853914
5002	NC_012466	GAG	2	6	299582	299587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853914
5003	NC_012466	AGA	2	6	299590	299595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853914
5004	NC_012466	GAA	2	6	299659	299664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853914
5005	NC_012466	AGGAGT	2	12	299667	299678	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225853914
5006	NC_012466	ATGA	2	8	299744	299751	50 %	25 %	25 %	0 %	225853914
5007	NC_012466	AGT	2	6	299754	299759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853914
5008	NC_012466	CTAG	2	8	299760	299767	25 %	25 %	25 %	25 %	225853914
5009	NC_012466	CCT	2	6	299783	299788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853915
5010	NC_012466	T	6	6	299799	299804	0 %	100 %	0 %	0 %	225853915
5011	NC_012466	ATC	2	6	299839	299844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853915
5012	NC_012466	AAAG	2	8	299853	299860	75 %	0 %	25 %	0 %	225853915
5013	NC_012466	AGA	2	6	299896	299901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853915
5014	NC_012466	A	6	6	299955	299960	100 %	0 %	0 %	0 %	225853915
5015	NC_012466	TTTCT	2	10	300012	300021	0 %	80 %	0 %	20 %	225853915
5016	NC_012466	T	6	6	300021	300026	0 %	100 %	0 %	0 %	225853915
5017	NC_012466	T	6	6	300041	300046	0 %	100 %	0 %	0 %	225853916
5018	NC_012466	TCC	2	6	300055	300060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853916
5019	NC_012466	GTCT	2	8	300157	300164	0 %	50 %	25 %	25 %	225853916
5020	NC_012466	AGATA	2	10	300396	300405	60 %	20 %	20 %	0 %	225853917
5021	NC_012466	TCA	2	6	300419	300424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853917
5022	NC_012466	TATT	2	8	300522	300529	25 %	75 %	0 %	0 %	225853917
5023	NC_012466	AGCGTG	2	12	300748	300759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	225853917
5024	NC_012466	TTC	2	6	300870	300875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853917
5025	NC_012466	GTGAA	2	10	300931	300940	40 %	20 %	40 %	0 %	225853917
5026	NC_012466	AAG	3	9	301005	301013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853917
5027	NC_012466	ATG	2	6	301060	301065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853917
5028	NC_012466	TCCA	2	8	301086	301093	25 %	25 %	0 %	50 %	225853917
5029	NC_012466	AGA	2	6	301154	301159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853917
5030	NC_012466	GAT	2	6	301230	301235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853917
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5032	NC_012466	A	6	6	301383	301388	100 %	0 %	0 %	0 %	225853918
5033	NC_012466	TAC	2	6	301398	301403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853918
5034	NC_012466	TAT	2	6	301486	301491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853918
5035	NC_012466	GAAAA	2	10	301556	301565	80 %	0 %	20 %	0 %	225853918
5036	NC_012466	CAAG	2	8	301582	301589	50 %	0 %	25 %	25 %	225853918
5037	NC_012466	GAAA	2	8	301621	301628	75 %	0 %	25 %	0 %	225853918
5038	NC_012466	TAT	2	6	301779	301784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853919
5039	NC_012466	T	7	7	301803	301809	0 %	100 %	0 %	0 %	225853919
5040	NC_012466	ATT	2	6	301826	301831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853919
5041	NC_012466	GAAG	2	8	301864	301871	50 %	0 %	50 %	0 %	225853919
5042	NC_012466	AAG	2	6	301874	301879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853919
5043	NC_012466	TCA	2	6	301882	301887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853919
5044	NC_012466	ACC	2	6	301889	301894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225853919
5045	NC_012466	TGA	2	6	301987	301992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853919
5046	NC_012466	A	6	6	302031	302036	100 %	0 %	0 %	0 %	225853919
5047	NC_012466	GAA	2	6	302084	302089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853919
5048	NC_012466	AG	3	6	302099	302104	50 %	0 %	50 %	0 %	225853919
5049	NC_012466	CAAG	2	8	302125	302132	50 %	0 %	25 %	25 %	225853919
5050	NC_012466	ATG	2	6	302174	302179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853919
5051	NC_012466	A	6	6	302186	302191	100 %	0 %	0 %	0 %	225853919
5052	NC_012466	GATT	2	8	302218	302225	25 %	50 %	25 %	0 %	225853919
5053	NC_012466	AGCTC	2	10	302287	302296	20 %	20 %	20 %	40 %	225853919
5054	NC_012466	ATT	2	6	302384	302389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853919
5055	NC_012466	GAACA	2	10	302427	302436	60 %	0 %	20 %	20 %	225853919
5056	NC_012466	AACG	2	8	302445	302452	50 %	0 %	25 %	25 %	225853919
5057	NC_012466	GATG	2	8	302515	302522	25 %	25 %	50 %	0 %	225853919
5058	NC_012466	ACG	2	6	302597	302602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853919
5059	NC_012466	AAGG	2	8	302630	302637	50 %	0 %	50 %	0 %	225853919
5060	NC_012466	TTTG	2	8	302651	302658	0 %	75 %	25 %	0 %	225853919
5061	NC_012466	CGCT	2	8	302715	302722	0 %	25 %	25 %	50 %	225853919
5062	NC_012466	GCT	3	9	302720	302728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853919
5063	NC_012466	AGG	2	6	302749	302754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853919
5064	NC_012466	TAG	2	6	302767	302772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853919
5065	NC_012466	TGG	2	6	302830	302835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853919
5066	NC_012466	ATG	2	6	302840	302845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853919
5067	NC_012466	CCT	2	6	302890	302895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853919
5068	NC_012466	CTGA	2	8	302972	302979	25 %	25 %	25 %	25 %	225853919
5069	NC_012466	ATA	2	6	303006	303011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853919
5070	NC_012466	ATG	2	6	303096	303101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853919
5071	NC_012466	AAG	2	6	303201	303206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853919
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5073	NC_012466	AACTGT	2	12	303292	303303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225853919
5074	NC_012466	TTGG	2	8	303371	303378	0 %	50 %	50 %	0 %	225853919
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5093	NC_012466	CTTT	2	8	304135	304142	0 %	75 %	0 %	25 %	225853920
5094	NC_012466	TAG	2	6	304154	304159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853920
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5112	NC_012466	CAG	2	6	305736	305741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853921
5113	NC_012466	CGC	2	6	305816	305821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225853921
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5123	NC_012466	CAA	2	6	306174	306179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853921
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5231	NC_012466	A	6	6	313410	313415	100 %	0 %	0 %	0 %	225853925
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5238	NC_012466	CAAA	2	8	314001	314008	75 %	0 %	0 %	25 %	225853925
5239	NC_012466	CGGA	2	8	314103	314110	25 %	0 %	50 %	25 %	225853925
5240	NC_012466	CTTC	2	8	314112	314119	0 %	50 %	0 %	50 %	225853925
5241	NC_012466	GAT	2	6	314160	314165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853925
5242	NC_012466	AGT	2	6	314166	314171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853925
5243	NC_012466	AGC	2	6	314186	314191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853925
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5497	NC_012466	AT	3	6	324215	324220	50 %	50 %	0 %	0 %	225853936
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