MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Paratyphi C strain RKS4594 plasmid pSPCV

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012124	A	6	6	19	24	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
2	NC_012124	A	6	6	318	323	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
3	NC_012124	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
4	NC_012124	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	224504236
5	NC_012124	T	7	7	618	624	0 %	100 %	0 %	0 %	224504236
6	NC_012124	A	6	6	5444	5449	100 %	0 %	0 %	0 %	224504240
7	NC_012124	A	6	6	5910	5915	100 %	0 %	0 %	0 %	224504240
8	NC_012124	A	7	7	5978	5984	100 %	0 %	0 %	0 %	224504240
9	NC_012124	A	6	6	6833	6838	100 %	0 %	0 %	0 %	224504242
10	NC_012124	T	6	6	7893	7898	0 %	100 %	0 %	0 %	224504244
11	NC_012124	C	6	6	9602	9607	0 %	0 %	0 %	100 %	224504247
12	NC_012124	T	6	6	10882	10887	0 %	100 %	0 %	0 %	224504249
13	NC_012124	T	6	6	13279	13284	0 %	100 %	0 %	0 %	224504253
14	NC_012124	T	6	6	15927	15932	0 %	100 %	0 %	0 %	224504257
15	NC_012124	T	6	6	16020	16025	0 %	100 %	0 %	0 %	224504258
16	NC_012124	T	6	6	16229	16234	0 %	100 %	0 %	0 %	224504258
17	NC_012124	T	7	7	16378	16384	0 %	100 %	0 %	0 %	224504258
18	NC_012124	T	6	6	16801	16806	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
19	NC_012124	T	6	6	16808	16813	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
20	NC_012124	T	6	6	16863	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
21	NC_012124	T	8	8	16925	16932	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
22	NC_012124	T	6	6	16935	16940	0 %	100 %	0 %	0 %	224504259
23	NC_012124	A	6	6	19472	19477	100 %	0 %	0 %	0 %	224504262
24	NC_012124	G	6	6	19612	19617	0 %	0 %	100 %	0 %	224504262
25	NC_012124	G	6	6	20130	20135	0 %	0 %	100 %	0 %	224504262
26	NC_012124	G	6	6	20742	20747	0 %	0 %	100 %	0 %	224504262
27	NC_012124	G	9	9	21844	21852	0 %	0 %	100 %	0 %	224504264
28	NC_012124	G	7	7	22309	22315	0 %	0 %	100 %	0 %	224504265
29	NC_012124	A	6	6	22992	22997	100 %	0 %	0 %	0 %	224504265
30	NC_012124	G	6	6	23535	23540	0 %	0 %	100 %	0 %	224504266
31	NC_012124	T	6	6	26768	26773	0 %	100 %	0 %	0 %	224504272
32	NC_012124	T	8	8	28188	28195	0 %	100 %	0 %	0 %	224504275
33	NC_012124	A	6	6	28465	28470	100 %	0 %	0 %	0 %	224504276
34	NC_012124	T	6	6	35332	35337	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
35	NC_012124	T	7	7	36179	36185	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
36	NC_012124	T	6	6	36318	36323	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
37	NC_012124	T	6	6	36820	36825	0 %	100 %	0 %	0 %	224504277
38	NC_012124	A	6	6	36931	36936	100 %	0 %	0 %	0 %	224504277
39	NC_012124	T	7	7	38402	38408	0 %	100 %	0 %	0 %	224504278
40	NC_012124	A	8	8	38734	38741	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
41	NC_012124	A	7	7	38750	38756	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
42	NC_012124	A	7	7	38819	38825	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
43	NC_012124	A	6	6	38849	38854	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
44	NC_012124	A	7	7	38876	38882	100 %	0 %	0 %	0 %	224504280
45	NC_012124	T	6	6	38913	38918	0 %	100 %	0 %	0 %	224504280
46	NC_012124	T	7	7	38936	38942	0 %	100 %	0 %	0 %	224504280
47	NC_012124	T	6	6	38986	38991	0 %	100 %	0 %	0 %	224504281
48	NC_012124	T	6	6	39078	39083	0 %	100 %	0 %	0 %	224504281
49	NC_012124	T	7	7	39092	39098	0 %	100 %	0 %	0 %	224504281
50	NC_012124	A	7	7	40515	40521	100 %	0 %	0 %	0 %	224504283
51	NC_012124	C	6	6	41110	41115	0 %	0 %	0 %	100 %	224504283
52	NC_012124	A	6	6	44670	44675	100 %	0 %	0 %	0 %	224504286
53	NC_012124	A	6	6	50070	50075	100 %	0 %	0 %	0 %	224504293
54	NC_012124	A	6	6	52970	52975	100 %	0 %	0 %	0 %	224504296

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.