MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 34027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012004	A	6	6	52289	52294	100 %	0 %	0 %	0 %	222152241
1002	NC_012004	ATT	2	6	52333	52338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152242
1003	NC_012004	TGA	3	9	52425	52433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152242
1004	NC_012004	AAC	2	6	52441	52446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152242
1005	NC_012004	A	6	6	52454	52459	100 %	0 %	0 %	0 %	222152242
1006	NC_012004	ATA	2	6	52526	52531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152242
1007	NC_012004	TTG	2	6	52568	52573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152242
1008	NC_012004	GGA	2	6	52623	52628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152242
1009	NC_012004	TCT	2	6	52654	52659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152242
1010	NC_012004	TGT	2	6	52689	52694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152242
1011	NC_012004	TCAA	2	8	52725	52732	50 %	25 %	0 %	25 %	222152242
1012	NC_012004	ATA	2	6	52836	52841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152243
1013	NC_012004	TGG	2	6	52850	52855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152243
1014	NC_012004	ATTTT	2	10	52859	52868	20 %	80 %	0 %	0 %	222152243
1015	NC_012004	TAT	2	6	52957	52962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152243
1016	NC_012004	TGG	2	6	52993	52998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152243
1017	NC_012004	TGG	2	6	53035	53040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152243
1018	NC_012004	CAA	2	6	53187	53192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152243
1019	NC_012004	GGT	2	6	53324	53329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152243
1020	NC_012004	TAG	2	6	53346	53351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152243
1021	NC_012004	CAA	2	6	53360	53365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152243
1022	NC_012004	TTAC	2	8	53440	53447	25 %	50 %	0 %	25 %	222152243
1023	NC_012004	ATT	2	6	53466	53471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152243
1024	NC_012004	TGCTA	2	10	53494	53503	20 %	40 %	20 %	20 %	222152243
1025	NC_012004	CGG	2	6	53529	53534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222152243
1026	NC_012004	GCA	2	6	53618	53623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152243
1027	NC_012004	AGA	2	6	53704	53709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152243
1028	NC_012004	AACAA	2	10	53732	53741	80 %	0 %	0 %	20 %	222152244
1029	NC_012004	AAAT	2	8	53752	53759	75 %	25 %	0 %	0 %	222152244
1030	NC_012004	AT	3	6	53853	53858	50 %	50 %	0 %	0 %	222152244
1031	NC_012004	ATA	2	6	53863	53868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152244
1032	NC_012004	ATG	2	6	53886	53891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152244
1033	NC_012004	ATT	2	6	53937	53942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152244
1034	NC_012004	TCT	2	6	53982	53987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152244
1035	NC_012004	CAT	2	6	54058	54063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152244
1036	NC_012004	GCA	2	6	54090	54095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152244
1037	NC_012004	AAG	2	6	54106	54111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152244
1038	NC_012004	AAG	2	6	54205	54210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152244
1039	NC_012004	TGGT	2	8	54286	54293	0 %	50 %	50 %	0 %	222152244
1040	NC_012004	CAA	2	6	54304	54309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152244
1041	NC_012004	GCT	2	6	54330	54335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152244
1042	NC_012004	TGA	2	6	54373	54378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152244
1043	NC_012004	TAC	2	6	54397	54402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152244
1044	NC_012004	ATT	2	6	54407	54412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152244
1045	NC_012004	ATC	2	6	54480	54485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152244
1046	NC_012004	A	7	7	54534	54540	100 %	0 %	0 %	0 %	222152245
1047	NC_012004	AGA	2	6	54654	54659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152245
1048	NC_012004	G	6	6	54726	54731	0 %	0 %	100 %	0 %	222152245
1049	NC_012004	ATA	2	6	54875	54880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152245
1050	NC_012004	TCA	2	6	54882	54887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152245
1051	NC_012004	GAT	2	6	54919	54924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152245
1052	NC_012004	GAC	2	6	54925	54930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152245
1053	NC_012004	TGT	2	6	55236	55241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152246
1054	NC_012004	AGGAC	2	10	55260	55269	40 %	0 %	40 %	20 %	222152246
1055	NC_012004	CCA	2	6	55302	55307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152246
1056	NC_012004	TCC	2	6	55395	55400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152246
1057	NC_012004	GGCC	2	8	55525	55532	0 %	0 %	50 %	50 %	222152246
1058	NC_012004	TTG	2	6	55621	55626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152246
1059	NC_012004	TGA	2	6	55704	55709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152246
1060	NC_012004	TTC	2	6	55766	55771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152246
1061	NC_012004	CTG	2	6	55873	55878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152246
1062	NC_012004	CAA	2	6	55987	55992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152246
1063	NC_012004	ATA	2	6	56146	56151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152246
1064	NC_012004	GAA	2	6	56278	56283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152247
1065	NC_012004	ATG	2	6	56294	56299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152247
1066	NC_012004	AGTAA	2	10	56347	56356	60 %	20 %	20 %	0 %	222152247
1067	NC_012004	AGA	2	6	56357	56362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152247
1068	NC_012004	ATG	2	6	56401	56406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152247
1069	NC_012004	TAT	2	6	56423	56428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152247
1070	NC_012004	A	6	6	56456	56461	100 %	0 %	0 %	0 %	222152247
1071	NC_012004	TCC	2	6	56509	56514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152247
1072	NC_012004	TTA	2	6	56710	56715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152248
1073	NC_012004	ATTA	2	8	56727	56734	50 %	50 %	0 %	0 %	222152248
1074	NC_012004	TTG	2	6	56806	56811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152248
1075	NC_012004	ATT	2	6	56837	56842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152248
1076	NC_012004	ATGG	2	8	56869	56876	25 %	25 %	50 %	0 %	222152248
1077	NC_012004	CAA	2	6	56901	56906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152248
1078	NC_012004	AAT	3	9	56944	56952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152248
1079	NC_012004	AAT	2	6	56973	56978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152249
1080	NC_012004	TTTA	2	8	57001	57008	25 %	75 %	0 %	0 %	222152249
1081	NC_012004	TTA	2	6	57023	57028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152249
1082	NC_012004	TCTT	2	8	57067	57074	0 %	75 %	0 %	25 %	222152249
1083	NC_012004	TTTTA	2	10	57108	57117	20 %	80 %	0 %	0 %	222152249
1084	NC_012004	AAG	2	6	57147	57152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152249
1085	NC_012004	ATG	2	6	57184	57189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152249
1086	NC_012004	TTA	2	6	57268	57273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152249
1087	NC_012004	A	7	7	57291	57297	100 %	0 %	0 %	0 %	222152249
1088	NC_012004	GAA	2	6	57318	57323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152249
1089	NC_012004	GTT	2	6	57466	57471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152250
1090	NC_012004	GGT	2	6	57478	57483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152250
1091	NC_012004	TTA	2	6	57508	57513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152250
1092	NC_012004	ATG	2	6	57554	57559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152250
1093	NC_012004	TTGA	2	8	57616	57623	25 %	50 %	25 %	0 %	222152250
1094	NC_012004	AGC	2	6	57678	57683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152250
1095	NC_012004	GAT	2	6	57694	57699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152250
1096	NC_012004	GCA	2	6	57742	57747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152250
1097	NC_012004	CAG	2	6	57806	57811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152250
1098	NC_012004	GAA	2	6	57835	57840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152250
1099	NC_012004	GTT	2	6	57877	57882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152250
1100	NC_012004	TGGCT	2	10	57891	57900	0 %	40 %	40 %	20 %	222152250
1101	NC_012004	GTG	2	6	57913	57918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152250
1102	NC_012004	TGC	2	6	57948	57953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152250
1103	NC_012004	GAG	2	6	58027	58032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152250
1104	NC_012004	ATT	2	6	58038	58043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152250
1105	NC_012004	ATG	2	6	58106	58111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152250
1106	NC_012004	TC	3	6	58166	58171	0 %	50 %	0 %	50 %	222152250
1107	NC_012004	TGAT	2	8	58178	58185	25 %	50 %	25 %	0 %	222152250
1108	NC_012004	TTA	2	6	58214	58219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152250
1109	NC_012004	AAG	2	6	58232	58237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152250
1110	NC_012004	AGT	2	6	58443	58448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152250
1111	NC_012004	AGA	3	9	58509	58517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152250
1112	NC_012004	TTA	2	6	58527	58532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152250
1113	NC_012004	TGA	2	6	58548	58553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152250
1114	NC_012004	CAC	2	6	58602	58607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152250
1115	NC_012004	AGA	2	6	58608	58613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152250
1116	NC_012004	GCA	2	6	58697	58702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152250
1117	NC_012004	CAT	3	9	58779	58787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152251
1118	NC_012004	AGC	2	6	58821	58826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152251
1119	NC_012004	A	6	6	58861	58866	100 %	0 %	0 %	0 %	222152251
1120	NC_012004	GAA	2	6	58912	58917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152251
1121	NC_012004	ATT	3	9	58939	58947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152251
1122	NC_012004	GCT	2	6	58987	58992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152251
1123	NC_012004	AAC	2	6	58995	59000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152251
1124	NC_012004	GCA	2	6	59131	59136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152251
1125	NC_012004	ATT	2	6	59261	59266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152252
1126	NC_012004	ATG	2	6	59288	59293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152252
1127	NC_012004	GCT	2	6	59342	59347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152252
1128	NC_012004	CAT	2	6	59355	59360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152252
1129	NC_012004	ATG	2	6	59391	59396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152252
1130	NC_012004	TTA	2	6	59484	59489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152252
1131	NC_012004	ATG	2	6	59490	59495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152252
1132	NC_012004	TC	3	6	59529	59534	0 %	50 %	0 %	50 %	222152252
1133	NC_012004	CAA	2	6	59566	59571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152252
1134	NC_012004	TGG	2	6	59668	59673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152252
1135	NC_012004	ATG	2	6	59676	59681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152252
1136	NC_012004	GAT	2	6	59711	59716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152252
1137	NC_012004	GCT	2	6	59744	59749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152252
1138	NC_012004	AGAA	2	8	59814	59821	75 %	0 %	25 %	0 %	222152252
1139	NC_012004	ATA	2	6	59859	59864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152252
1140	NC_012004	CTGG	2	8	59957	59964	0 %	25 %	50 %	25 %	222152252
1141	NC_012004	CA	3	6	60030	60035	50 %	0 %	0 %	50 %	222152252
1142	NC_012004	TC	3	6	60069	60074	0 %	50 %	0 %	50 %	222152252
1143	NC_012004	ACA	2	6	60163	60168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152252
1144	NC_012004	CACCTT	2	12	60212	60223	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222152252
1145	NC_012004	TGA	2	6	60289	60294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152252
1146	NC_012004	GAG	2	6	60299	60304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152252
1147	NC_012004	AATA	2	8	60675	60682	75 %	25 %	0 %	0 %	222152253
1148	NC_012004	TGA	2	6	60713	60718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152253
1149	NC_012004	ATG	2	6	60826	60831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152253
1150	NC_012004	TGG	2	6	60832	60837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152253
1151	NC_012004	GTT	2	6	60912	60917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152253
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1153	NC_012004	CGT	2	6	60963	60968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152253
1154	NC_012004	ATG	2	6	61029	61034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152253
1155	NC_012004	ACA	2	6	61065	61070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152253
1156	NC_012004	TGC	2	6	61133	61138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152253
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1158	NC_012004	AAC	2	6	61363	61368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152253
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1162	NC_012004	GAA	2	6	61728	61733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152253
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1164	NC_012004	TGA	2	6	61847	61852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152253
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1167	NC_012004	A	6	6	62053	62058	100 %	0 %	0 %	0 %	222152254
1168	NC_012004	TGA	2	6	62085	62090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152254
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1222	NC_012004	CAAAT	2	10	65026	65035	60 %	20 %	0 %	20 %	222152258
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1245	NC_012004	TTA	2	6	65824	65829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152259
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1247	NC_012004	ATTT	2	8	65859	65866	25 %	75 %	0 %	0 %	222152259
1248	NC_012004	TCT	2	6	65893	65898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152259
1249	NC_012004	A	7	7	65953	65959	100 %	0 %	0 %	0 %	222152259
1250	NC_012004	A	6	6	65976	65981	100 %	0 %	0 %	0 %	222152259
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