MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 34027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012004	TAA	2	6	28164	28169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152221
502	NC_012004	AGTGA	2	10	28180	28189	40 %	20 %	40 %	0 %	222152221
503	NC_012004	ATC	2	6	28195	28200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152221
504	NC_012004	TGAT	2	8	28241	28248	25 %	50 %	25 %	0 %	222152221
505	NC_012004	CTG	2	6	28250	28255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152221
506	NC_012004	CGC	2	6	28269	28274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222152221
507	NC_012004	ATA	2	6	28352	28357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152221
508	NC_012004	TGG	2	6	28382	28387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152221
509	NC_012004	GAA	2	6	28411	28416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152221
510	NC_012004	TGAT	2	8	28421	28428	25 %	50 %	25 %	0 %	222152221
511	NC_012004	TAT	2	6	28470	28475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152221
512	NC_012004	TAA	2	6	28522	28527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152221
513	NC_012004	TAA	2	6	28635	28640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152222
514	NC_012004	TA	3	6	28646	28651	50 %	50 %	0 %	0 %	222152222
515	NC_012004	ACA	2	6	28741	28746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152222
516	NC_012004	TTGA	2	8	28819	28826	25 %	50 %	25 %	0 %	222152222
517	NC_012004	CTTA	2	8	28870	28877	25 %	50 %	0 %	25 %	222152222
518	NC_012004	CT	3	6	28922	28927	0 %	50 %	0 %	50 %	222152222
519	NC_012004	AGA	2	6	28950	28955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152222
520	NC_012004	TTA	2	6	28969	28974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152222
521	NC_012004	TAC	2	6	29043	29048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152222
522	NC_012004	AGA	2	6	29097	29102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152222
523	NC_012004	GAG	2	6	29170	29175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152222
524	NC_012004	A	7	7	29199	29205	100 %	0 %	0 %	0 %	222152222
525	NC_012004	GTGA	2	8	29221	29228	25 %	25 %	50 %	0 %	222152222
526	NC_012004	GAATT	2	10	29242	29251	40 %	40 %	20 %	0 %	222152222
527	NC_012004	GGA	2	6	29345	29350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152222
528	NC_012004	TAA	2	6	29390	29395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152222
529	NC_012004	TCA	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152222
530	NC_012004	TGC	2	6	29442	29447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152222
531	NC_012004	A	6	6	29469	29474	100 %	0 %	0 %	0 %	222152222
532	NC_012004	CTTAT	2	10	29712	29721	20 %	60 %	0 %	20 %	222152222
533	NC_012004	AAG	2	6	29744	29749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152222
534	NC_012004	A	7	7	29792	29798	100 %	0 %	0 %	0 %	222152222
535	NC_012004	AGA	2	6	29833	29838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152223
536	NC_012004	ATG	2	6	29954	29959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152223
537	NC_012004	TGAA	2	8	29964	29971	50 %	25 %	25 %	0 %	222152223
538	NC_012004	ATTT	2	8	30033	30040	25 %	75 %	0 %	0 %	222152223
539	NC_012004	A	7	7	30128	30134	100 %	0 %	0 %	0 %	222152223
540	NC_012004	GGA	2	6	30148	30153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152223
541	NC_012004	AATG	2	8	30230	30237	50 %	25 %	25 %	0 %	222152223
542	NC_012004	T	6	6	30240	30245	0 %	100 %	0 %	0 %	222152223
543	NC_012004	TTAT	3	12	30351	30362	25 %	75 %	0 %	0 %	222152223
544	NC_012004	ATG	2	6	30459	30464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152223
545	NC_012004	TGA	2	6	30502	30507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152223
546	NC_012004	TAT	2	6	30526	30531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152223
547	NC_012004	A	7	7	30659	30665	100 %	0 %	0 %	0 %	222152224
548	NC_012004	GAG	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152224
549	NC_012004	TAT	2	6	30706	30711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152224
550	NC_012004	CTT	2	6	30735	30740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152224
551	NC_012004	ATT	2	6	30818	30823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152224
552	NC_012004	A	6	6	30834	30839	100 %	0 %	0 %	0 %	222152224
553	NC_012004	TGA	3	9	30847	30855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152224
554	NC_012004	TCG	2	6	30871	30876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152224
555	NC_012004	GTTT	2	8	30978	30985	0 %	75 %	25 %	0 %	222152224
556	NC_012004	ACT	2	6	31040	31045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152224
557	NC_012004	AAT	2	6	31184	31189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152224
558	NC_012004	AGA	2	6	31195	31200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152224
559	NC_012004	TTA	2	6	31238	31243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152224
560	NC_012004	TGT	3	9	31312	31320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152224
561	NC_012004	TAT	2	6	31378	31383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152224
562	NC_012004	ATC	2	6	31396	31401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152224
563	NC_012004	CATT	2	8	31472	31479	25 %	50 %	0 %	25 %	222152224
564	NC_012004	GGA	2	6	31496	31501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152224
565	NC_012004	TGT	2	6	31528	31533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152224
566	NC_012004	TAC	2	6	31568	31573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152224
567	NC_012004	GTAC	2	8	31586	31593	25 %	25 %	25 %	25 %	222152224
568	NC_012004	AGA	2	6	31664	31669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152225
569	NC_012004	TTA	2	6	31671	31676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152225
570	NC_012004	GAA	2	6	31686	31691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152225
571	NC_012004	ATC	2	6	31692	31697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152225
572	NC_012004	GAT	2	6	31752	31757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152225
573	NC_012004	TTA	2	6	31792	31797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152225
574	NC_012004	TGA	2	6	31849	31854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152225
575	NC_012004	AGA	2	6	31882	31887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152225
576	NC_012004	CCAA	2	8	32051	32058	50 %	0 %	0 %	50 %	222152226
577	NC_012004	AGAAA	2	10	32158	32167	80 %	0 %	20 %	0 %	222152226
578	NC_012004	TTG	2	6	32171	32176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152226
579	NC_012004	ATA	2	6	32192	32197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152226
580	NC_012004	TTC	2	6	32202	32207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152226
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582	NC_012004	TAAA	2	8	32282	32289	75 %	25 %	0 %	0 %	222152226
583	NC_012004	A	6	6	32287	32292	100 %	0 %	0 %	0 %	222152226
584	NC_012004	ATT	2	6	32299	32304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152226
585	NC_012004	CAG	2	6	32333	32338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152226
586	NC_012004	TTG	2	6	32363	32368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152226
587	NC_012004	TAT	2	6	32404	32409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152226
588	NC_012004	A	6	6	32410	32415	100 %	0 %	0 %	0 %	222152226
589	NC_012004	GAT	2	6	32425	32430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152226
590	NC_012004	ATG	2	6	32441	32446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152226
591	NC_012004	AGA	2	6	32499	32504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152226
592	NC_012004	ATT	2	6	32523	32528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152226
593	NC_012004	CAA	2	6	32542	32547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152226
594	NC_012004	ATTG	2	8	32559	32566	25 %	50 %	25 %	0 %	222152226
595	NC_012004	ATC	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152226
596	NC_012004	CGT	2	6	32686	32691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152226
597	NC_012004	A	8	8	32826	32833	100 %	0 %	0 %	0 %	222152227
598	NC_012004	ACA	2	6	32875	32880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152227
599	NC_012004	ATG	2	6	32928	32933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152227
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602	NC_012004	GAA	2	6	33014	33019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152227
603	NC_012004	TTCT	2	8	33024	33031	0 %	75 %	0 %	25 %	222152227
604	NC_012004	T	6	6	33050	33055	0 %	100 %	0 %	0 %	222152227
605	NC_012004	GCA	2	6	33092	33097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152227
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608	NC_012004	CAGCT	2	10	33153	33162	20 %	20 %	20 %	40 %	222152227
609	NC_012004	CAA	2	6	33172	33177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152227
610	NC_012004	TTAT	2	8	33214	33221	25 %	75 %	0 %	0 %	222152227
611	NC_012004	CTT	2	6	33313	33318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152227
612	NC_012004	GGA	2	6	33334	33339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222152227
613	NC_012004	ATT	2	6	33405	33410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222152227
614	NC_012004	GACTGA	2	12	33433	33444	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222152227
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616	NC_012004	AT	3	6	33568	33573	50 %	50 %	0 %	0 %	222152227
617	NC_012004	TGA	2	6	33688	33693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152227
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619	NC_012004	AC	3	6	33773	33778	50 %	0 %	0 %	50 %	222152227
620	NC_012004	TGG	2	6	33805	33810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152227
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623	NC_012004	GCG	2	6	33917	33922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222152227
624	NC_012004	GCG	2	6	33965	33970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222152227
625	NC_012004	TTC	2	6	33979	33984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152227
626	NC_012004	CAA	2	6	34008	34013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152227
627	NC_012004	TTG	2	6	34044	34049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152227
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629	NC_012004	AGC	2	6	34081	34086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152227
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634	NC_012004	A	6	6	34310	34315	100 %	0 %	0 %	0 %	222152227
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662	NC_012004	T	6	6	35906	35911	0 %	100 %	0 %	0 %	222152227
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669	NC_012004	TCA	2	6	36279	36284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152227
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