MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 34027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012004	AGC	2	6	254932	254937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152448
4502	NC_012004	CTT	2	6	254999	255004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152448
4503	NC_012004	CAAT	2	8	255054	255061	50 %	25 %	0 %	25 %	222152448
4504	NC_012004	GTT	2	6	255068	255073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152448
4505	NC_012004	CTG	2	6	255156	255161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152448
4506	NC_012004	GCT	2	6	255269	255274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152448
4507	NC_012004	T	8	8	255335	255342	0 %	100 %	0 %	0 %	222152449
4508	NC_012004	CTT	2	6	255361	255366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152449
4509	NC_012004	ACA	2	6	255441	255446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152449
4510	NC_012004	CAA	2	6	255607	255612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152449
4511	NC_012004	CTT	2	6	255649	255654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152449
4512	NC_012004	TGG	2	6	255656	255661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152449
4513	NC_012004	AGC	2	6	255731	255736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152449
4514	NC_012004	ACC	2	6	255746	255751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152449
4515	NC_012004	CAT	2	6	255806	255811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152449
4516	NC_012004	TCA	2	6	255834	255839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152449
4517	NC_012004	CTT	2	6	255865	255870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152449
4518	NC_012004	ATA	2	6	255897	255902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152449
4519	NC_012004	GCTT	2	8	255923	255930	0 %	50 %	25 %	25 %	222152449
4520	NC_012004	TAA	2	6	256064	256069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152450
4521	NC_012004	ATA	2	6	256070	256075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152450
4522	NC_012004	AAG	2	6	256096	256101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152450
4523	NC_012004	TAAA	2	8	256130	256137	75 %	25 %	0 %	0 %	222152450
4524	NC_012004	TAA	2	6	256235	256240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152450
4525	NC_012004	CAA	2	6	256241	256246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152450
4526	NC_012004	GAC	2	6	256312	256317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152450
4527	NC_012004	TCA	2	6	256375	256380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152450
4528	NC_012004	GCTT	3	12	256389	256400	0 %	50 %	25 %	25 %	222152450
4529	NC_012004	ATC	2	6	256476	256481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152450
4530	NC_012004	TCA	2	6	256546	256551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152450
4531	NC_012004	TAA	3	9	256564	256572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152450
4532	NC_012004	T	6	6	256922	256927	0 %	100 %	0 %	0 %	222152451
4533	NC_012004	TGA	2	6	256934	256939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152451
4534	NC_012004	ATGT	2	8	257149	257156	25 %	50 %	25 %	0 %	222152451
4535	NC_012004	T	7	7	257174	257180	0 %	100 %	0 %	0 %	222152451
4536	NC_012004	TCA	2	6	257228	257233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152451
4537	NC_012004	CTA	2	6	257420	257425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152451
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4539	NC_012004	TCAA	2	8	257506	257513	50 %	25 %	0 %	25 %	222152451
4540	NC_012004	TTG	2	6	257523	257528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152451
4541	NC_012004	TAA	2	6	257640	257645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152451
4542	NC_012004	TTC	2	6	257772	257777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152451
4543	NC_012004	CAGC	2	8	257797	257804	25 %	0 %	25 %	50 %	222152451
4544	NC_012004	TTC	2	6	257838	257843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152451
4545	NC_012004	GCT	2	6	257896	257901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152451
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4547	NC_012004	TTTC	2	8	257987	257994	0 %	75 %	0 %	25 %	222152451
4548	NC_012004	CAA	2	6	258002	258007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152451
4549	NC_012004	ATC	2	6	258018	258023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152451
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4551	NC_012004	TCT	2	6	258059	258064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152451
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4553	NC_012004	TTTTC	2	10	258297	258306	0 %	80 %	0 %	20 %	222152451
4554	NC_012004	AAT	2	6	258396	258401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152451
4555	NC_012004	TTTA	2	8	258405	258412	25 %	75 %	0 %	0 %	222152451
4556	NC_012004	TTC	2	6	258459	258464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152451
4557	NC_012004	TA	3	6	258471	258476	50 %	50 %	0 %	0 %	222152451
4558	NC_012004	TTG	2	6	258507	258512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152451
4559	NC_012004	TCT	2	6	258517	258522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152451
4560	NC_012004	AAGC	2	8	258531	258538	50 %	0 %	25 %	25 %	222152451
4561	NC_012004	T	6	6	258545	258550	0 %	100 %	0 %	0 %	222152451
4562	NC_012004	AATGT	2	10	258576	258585	40 %	40 %	20 %	0 %	222152451
4563	NC_012004	A	6	6	258598	258603	100 %	0 %	0 %	0 %	222152451
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4582	NC_012004	T	7	7	259332	259338	0 %	100 %	0 %	0 %	222152452
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4595	NC_012004	ATA	2	6	259894	259899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222152452
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4605	NC_012004	AAGT	2	8	260473	260480	50 %	25 %	25 %	0 %	222152453
4606	NC_012004	T	7	7	260674	260680	0 %	100 %	0 %	0 %	222152453
4607	NC_012004	AGC	2	6	260686	260691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152453
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4611	NC_012004	A	6	6	260899	260904	100 %	0 %	0 %	0 %	222152454
4612	NC_012004	CTA	2	6	260910	260915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
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4614	NC_012004	ATG	2	6	260928	260933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152454
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4619	NC_012004	ATC	2	6	261102	261107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
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4622	NC_012004	CAT	2	6	261236	261241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
4623	NC_012004	CTC	2	6	261290	261295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222152454
4624	NC_012004	TTC	2	6	261311	261316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222152454
4625	NC_012004	TTGG	2	8	261352	261359	0 %	50 %	50 %	0 %	222152454
4626	NC_012004	CTTTG	2	10	261383	261392	0 %	60 %	20 %	20 %	222152454
4627	NC_012004	CT	3	6	261403	261408	0 %	50 %	0 %	50 %	222152454
4628	NC_012004	CA	3	6	261458	261463	50 %	0 %	0 %	50 %	222152454
4629	NC_012004	TCA	2	6	261541	261546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
4630	NC_012004	A	6	6	261583	261588	100 %	0 %	0 %	0 %	222152454
4631	NC_012004	AAG	2	6	261607	261612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152454
4632	NC_012004	TGA	2	6	261631	261636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152454
4633	NC_012004	T	6	6	261695	261700	0 %	100 %	0 %	0 %	222152454
4634	NC_012004	GCT	2	6	261750	261755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152454
4635	NC_012004	A	6	6	261844	261849	100 %	0 %	0 %	0 %	222152454
4636	NC_012004	ACC	2	6	261851	261856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222152454
4637	NC_012004	CAA	2	6	261874	261879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222152454
4638	NC_012004	GGC	2	6	261912	261917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222152454
4639	NC_012004	T	6	6	261937	261942	0 %	100 %	0 %	0 %	222152454
4640	NC_012004	TCA	2	6	261950	261955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152454
4641	NC_012004	CTG	2	6	261987	261992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152454
4642	NC_012004	A	8	8	262210	262217	100 %	0 %	0 %	0 %	222152455
4643	NC_012004	ATC	2	6	262222	262227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222152455
4644	NC_012004	TACT	2	8	262283	262290	25 %	50 %	0 %	25 %	222152455
4645	NC_012004	A	6	6	262330	262335	100 %	0 %	0 %	0 %	222152455
4646	NC_012004	TGA	2	6	262358	262363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222152455
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4648	NC_012004	CGT	2	6	262378	262383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152455
4649	NC_012004	CGT	2	6	262402	262407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152455
4650	NC_012004	CGT	2	6	262453	262458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152455
4651	NC_012004	AAAC	2	8	263213	263220	75 %	0 %	0 %	25 %	222152456
4652	NC_012004	GTT	2	6	263252	263257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222152456
4653	NC_012004	GCT	2	6	263330	263335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222152456
4654	NC_012004	A	7	7	263345	263351	100 %	0 %	0 %	0 %	222152456
4655	NC_012004	GAA	2	6	263390	263395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152456
4656	NC_012004	A	6	6	263394	263399	100 %	0 %	0 %	0 %	222152456
4657	NC_012004	GGT	2	6	263423	263428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222152456
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4662	NC_012004	AAG	2	6	263748	263753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222152456
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4701	NC_012004	A	6	6	265714	265719	100 %	0 %	0 %	0 %	222152457
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4737	NC_012004	A	6	6	267742	267747	100 %	0 %	0 %	0 %	222152459
4738	NC_012004	AGC	2	6	267814	267819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222152459
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