MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	AAG	2	6	469	474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975548
2	NC_011664	TTG	2	6	522	527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975548
3	NC_011664	CGA	2	6	564	569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975548
4	NC_011664	GTT	2	6	580	585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975548
5	NC_011664	TTG	2	6	590	595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975548
6	NC_011664	CCA	2	6	624	629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975548
7	NC_011664	CAG	2	6	818	823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975548
8	NC_011664	TGC	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975548
9	NC_011664	AGG	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217975549
10	NC_011664	GCG	2	6	1687	1692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217975550
11	NC_011664	CAG	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975550
12	NC_011664	GAT	2	6	1797	1802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975550
13	NC_011664	GCA	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975551
14	NC_011664	CAG	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975551
15	NC_011664	TGA	2	6	2364	2369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975552
16	NC_011664	AGC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975552
17	NC_011664	TCA	2	6	2507	2512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975552
18	NC_011664	GAA	2	6	2685	2690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975552
19	NC_011664	ATT	2	6	2761	2766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975552
20	NC_011664	TCG	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975552
21	NC_011664	TGC	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975552
22	NC_011664	AAC	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975552
23	NC_011664	AGG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217975552
24	NC_011664	CAT	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975553
25	NC_011664	TTG	2	6	3655	3660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975553
26	NC_011664	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975553
27	NC_011664	CAA	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975553
28	NC_011664	GTC	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975553
29	NC_011664	TCT	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975553
30	NC_011664	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975553
31	NC_011664	TCA	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975553
32	NC_011664	TGG	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975553
33	NC_011664	TGA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975553
34	NC_011664	TAA	2	6	4418	4423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975553
35	NC_011664	CAA	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975554
36	NC_011664	ACA	2	6	7631	7636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975554
37	NC_011664	TGG	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975554
38	NC_011664	CAA	2	6	7790	7795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975554
39	NC_011664	GTA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975554
40	NC_011664	TTA	2	6	7857	7862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975554
41	NC_011664	TGA	2	6	7879	7884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975554
42	NC_011664	TGT	2	6	7894	7899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975554
43	NC_011664	TGA	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975554
44	NC_011664	CAG	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975554
45	NC_011664	CCA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975554
46	NC_011664	CGG	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217975554
47	NC_011664	TGG	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975554
48	NC_011664	TAA	2	6	8512	8517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975555
49	NC_011664	TAC	2	6	8592	8597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975555
50	NC_011664	ACA	2	6	8650	8655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975555
51	NC_011664	ATG	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975555
52	NC_011664	TAA	2	6	8747	8752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975555
53	NC_011664	CTC	2	6	8755	8760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217975555
54	NC_011664	ATC	2	6	8903	8908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975555
55	NC_011664	ATC	3	9	9044	9052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975555
56	NC_011664	AAT	2	6	9183	9188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975555
57	NC_011664	TCT	2	6	9217	9222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975555
58	NC_011664	ATT	2	6	9311	9316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975555
59	NC_011664	TTG	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975555
60	NC_011664	GAA	2	6	9511	9516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975555
61	NC_011664	ATG	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975555
62	NC_011664	TGA	2	6	9581	9586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975555
63	NC_011664	TAT	2	6	9624	9629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975555
64	NC_011664	TGA	2	6	9638	9643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975555
65	NC_011664	ACA	2	6	9666	9671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975555
66	NC_011664	AAT	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975555
67	NC_011664	CTG	2	6	9832	9837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975555
68	NC_011664	CAG	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975555
69	NC_011664	GAT	2	6	10053	10058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975555
70	NC_011664	TTC	2	6	10139	10144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975555
71	NC_011664	TAC	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975555
72	NC_011664	GAC	2	6	11345	11350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975556
73	NC_011664	CCA	2	6	11356	11361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975556
74	NC_011664	ATC	2	6	11365	11370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975556
75	NC_011664	ATG	2	6	11371	11376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975556
76	NC_011664	AGA	2	6	11421	11426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975556
77	NC_011664	TAT	2	6	11593	11598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975556
78	NC_011664	TAT	2	6	11622	11627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975556
79	NC_011664	CGA	2	6	11652	11657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975556
80	NC_011664	GCT	2	6	11662	11667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975556
81	NC_011664	CAA	2	6	11679	11684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975556
82	NC_011664	GTT	2	6	11716	11721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975556
83	NC_011664	TGC	3	9	11742	11750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975556
84	NC_011664	AAT	2	6	11830	11835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975556
85	NC_011664	GAT	2	6	11961	11966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975556
86	NC_011664	GGC	2	6	12009	12014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217975556
87	NC_011664	TAT	2	6	12196	12201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975557
88	NC_011664	ACC	2	6	12852	12857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975557
89	NC_011664	CAC	2	6	12883	12888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975557
90	NC_011664	GCT	2	6	13438	13443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975558
91	NC_011664	TTC	2	6	13467	13472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975558
92	NC_011664	GAT	2	6	13624	13629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975558
93	NC_011664	ATG	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975558
94	NC_011664	GAC	2	6	13701	13706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975558
95	NC_011664	TGC	2	6	13770	13775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975558
96	NC_011664	AGA	2	6	13981	13986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217975559
97	NC_011664	AGC	2	6	14107	14112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975559
98	NC_011664	GTA	2	6	14248	14253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975559
99	NC_011664	GCC	2	6	14472	14477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	217975560
100	NC_011664	TCA	2	6	14518	14523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975560
101	NC_011664	ATT	2	6	14651	14656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975560
102	NC_011664	GCA	3	9	14736	14744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975560
103	NC_011664	AAC	2	6	14765	14770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975560
104	NC_011664	TTG	2	6	14802	14807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975560
105	NC_011664	AGC	2	6	14819	14824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975560
106	NC_011664	TCG	2	6	14829	14834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975560
107	NC_011664	AAT	2	6	14858	14863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975560
108	NC_011664	ATA	2	6	14888	14893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975560
109	NC_011664	TCT	2	6	15060	15065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975560
110	NC_011664	TAA	2	6	15096	15101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975560
111	NC_011664	CAT	2	6	15110	15115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975560
112	NC_011664	GAT	2	6	15116	15121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975560
113	NC_011664	TGG	2	6	15125	15130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217975560
114	NC_011664	GTC	2	6	15136	15141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975560
115	NC_011664	CTT	2	6	16149	16154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975563
116	NC_011664	ATC	3	9	16222	16230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975563
117	NC_011664	TCA	2	6	16235	16240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975563
118	NC_011664	ATT	2	6	16268	16273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975563
119	NC_011664	CAT	2	6	16297	16302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975564
120	NC_011664	CCA	2	6	16377	16382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975564
121	NC_011664	TAA	2	6	16475	16480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975564
122	NC_011664	ACA	2	6	16520	16525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975564
123	NC_011664	TGC	2	6	16580	16585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975564
124	NC_011664	ATC	2	6	16724	16729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975564
125	NC_011664	ATT	2	6	16947	16952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975564
126	NC_011664	AAT	2	6	18525	18530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217975565
127	NC_011664	TGA	2	6	18672	18677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975565
128	NC_011664	TAT	2	6	18701	18706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217975565
129	NC_011664	CTG	2	6	18716	18721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217975565
130	NC_011664	TCA	2	6	18767	18772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975565
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133	NC_011664	CTT	2	6	19056	19061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975565
134	NC_011664	CAC	2	6	19074	19079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217975565
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251	NC_011664	ATC	2	6	31715	31720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975574
252	NC_011664	CTC	2	6	31739	31744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	217975574
253	NC_011664	TTC	2	6	32057	32062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217975575
254	NC_011664	AAC	2	6	32129	32134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217975575
255	NC_011664	GTA	2	6	32150	32155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975575
256	NC_011664	GTA	2	6	32254	32259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975575
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500	NC_011664	CTA	2	6	51317	51322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975597

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