MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 2621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011566	CATTT	2	10	7285	7294	20 %	60 %	0 %	20 %	212632918
2	NC_011566	TTGTG	2	10	8178	8187	0 %	60 %	40 %	0 %	212632919
3	NC_011566	TGCGC	2	10	9301	9310	0 %	20 %	40 %	40 %	212632920
4	NC_011566	TCCAG	2	10	13429	13438	20 %	20 %	20 %	40 %	212632922
5	NC_011566	GTTTT	2	10	16350	16359	0 %	80 %	20 %	0 %	212632925
6	NC_011566	CGTAG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	212632925
7	NC_011566	TAAAG	2	10	19137	19146	60 %	20 %	20 %	0 %	212632927
8	NC_011566	AAGCT	2	10	21039	21048	40 %	20 %	20 %	20 %	212632928
9	NC_011566	GTCTG	2	10	21664	21673	0 %	40 %	40 %	20 %	212632928
10	NC_011566	GTCTG	2	10	21821	21830	0 %	40 %	40 %	20 %	212632928
11	NC_011566	TCGAT	2	10	24744	24753	20 %	40 %	20 %	20 %	212632930
12	NC_011566	TCAGC	2	10	25551	25560	20 %	20 %	20 %	40 %	212632930
13	NC_011566	ACCAC	2	10	27232	27241	40 %	0 %	0 %	60 %	212632932
14	NC_011566	AAATT	2	10	27590	27599	60 %	40 %	0 %	0 %	212632933
15	NC_011566	ACCGT	2	10	28776	28785	20 %	20 %	20 %	40 %	212632933
16	NC_011566	TTAAT	2	10	34725	34734	40 %	60 %	0 %	0 %	212632940
17	NC_011566	TAGCT	2	10	35184	35193	20 %	40 %	20 %	20 %	212632941
18	NC_011566	AAACC	2	10	35797	35806	60 %	0 %	0 %	40 %	212632941
19	NC_011566	AAGTT	2	10	35867	35876	40 %	40 %	20 %	0 %	212632941
20	NC_011566	ATGTG	2	10	36123	36132	20 %	40 %	40 %	0 %	212632942
21	NC_011566	CACAT	2	10	39063	39072	40 %	20 %	0 %	40 %	212632944
22	NC_011566	ACATC	2	10	39673	39682	40 %	20 %	0 %	40 %	212632945
23	NC_011566	TAGTT	2	10	40973	40982	20 %	60 %	20 %	0 %	212632945
24	NC_011566	CAAAC	2	10	42127	42136	60 %	0 %	0 %	40 %	212632946
25	NC_011566	AAGAG	2	10	43727	43736	60 %	0 %	40 %	0 %	212632947
26	NC_011566	GGCTT	2	10	47838	47847	0 %	40 %	40 %	20 %	212632952
27	NC_011566	GTGAT	2	10	51589	51598	20 %	40 %	40 %	0 %	212632954
28	NC_011566	GCTGA	2	10	52926	52935	20 %	20 %	40 %	20 %	212632955
29	NC_011566	TTTGT	2	10	55453	55462	0 %	80 %	20 %	0 %	212632958
30	NC_011566	GTGCC	2	10	55577	55586	0 %	20 %	40 %	40 %	212632958
31	NC_011566	TGCGC	2	10	62176	62185	0 %	20 %	40 %	40 %	212632964
32	NC_011566	TTGTG	2	10	63753	63762	0 %	60 %	40 %	0 %	212632965
33	NC_011566	TTGGC	2	10	64292	64301	0 %	40 %	40 %	20 %	212632966
34	NC_011566	CGAAA	2	10	66279	66288	60 %	0 %	20 %	20 %	212632968
35	NC_011566	GATCT	2	10	67183	67192	20 %	40 %	20 %	20 %	212632969
36	NC_011566	TATTT	2	10	72810	72819	20 %	80 %	0 %	0 %	212632976
37	NC_011566	GCTGT	2	10	82158	82167	0 %	40 %	40 %	20 %	212632983
38	NC_011566	CACTT	2	10	82960	82969	20 %	40 %	0 %	40 %	212632984
39	NC_011566	TTGAT	2	10	83451	83460	20 %	60 %	20 %	0 %	212632984
40	NC_011566	TCCCT	2	10	84703	84712	0 %	40 %	0 %	60 %	212632985
41	NC_011566	TGCAC	2	10	84998	85007	20 %	20 %	20 %	40 %	212632985
42	NC_011566	AAGTT	2	10	86359	86368	40 %	40 %	20 %	0 %	212632987
43	NC_011566	ACCGC	2	10	88874	88883	20 %	0 %	20 %	60 %	212632989
44	NC_011566	GCAGG	2	10	89041	89050	20 %	0 %	60 %	20 %	212632989
45	NC_011566	AACCA	2	10	89813	89822	60 %	0 %	0 %	40 %	212632990
46	NC_011566	ATTGA	2	10	90785	90794	40 %	40 %	20 %	0 %	212632990
47	NC_011566	ATGTG	2	10	92506	92515	20 %	40 %	40 %	0 %	212632992
48	NC_011566	CAGAG	2	10	97061	97070	40 %	0 %	40 %	20 %	212632995
49	NC_011566	TGGAT	2	10	97238	97247	20 %	40 %	40 %	0 %	212632995
50	NC_011566	TGAGC	2	10	100535	100544	20 %	20 %	40 %	20 %	212632998
51	NC_011566	GCAAG	2	10	101472	101481	40 %	0 %	40 %	20 %	212632999
52	NC_011566	TGGCA	2	10	102095	102104	20 %	20 %	40 %	20 %	212632999
53	NC_011566	GGTTA	2	10	102506	102515	20 %	40 %	40 %	0 %	212633000
54	NC_011566	AGTGC	2	10	106035	106044	20 %	20 %	40 %	20 %	212633003
55	NC_011566	TCGGT	2	10	110482	110491	0 %	40 %	40 %	20 %	212633005
56	NC_011566	ACACG	2	10	112213	112222	40 %	0 %	20 %	40 %	212633007
57	NC_011566	AGCAA	2	10	112610	112619	60 %	0 %	20 %	20 %	212633008
58	NC_011566	CAAAG	2	10	113128	113137	60 %	0 %	20 %	20 %	212633008
59	NC_011566	TGAGT	2	10	117980	117989	20 %	40 %	40 %	0 %	212633014
60	NC_011566	TTCTC	2	10	120014	120023	0 %	60 %	0 %	40 %	212633016
61	NC_011566	TGTAT	2	10	120741	120750	20 %	60 %	20 %	0 %	212633017
62	NC_011566	GTAAT	2	10	121346	121355	40 %	40 %	20 %	0 %	212633017
63	NC_011566	TTCAA	2	10	127582	127591	40 %	40 %	0 %	20 %	212633027
64	NC_011566	GGTTG	2	10	129774	129783	0 %	40 %	60 %	0 %	212633030
65	NC_011566	TTTAA	2	10	133701	133710	40 %	60 %	0 %	0 %	212633034
66	NC_011566	AAATG	2	10	136202	136211	60 %	20 %	20 %	0 %	212633035
67	NC_011566	GATTT	2	10	137486	137495	20 %	60 %	20 %	0 %	212633037
68	NC_011566	GTTGG	2	10	140215	140224	0 %	40 %	60 %	0 %	212633039
69	NC_011566	TGATG	2	10	156774	156783	20 %	40 %	40 %	0 %	212633058
70	NC_011566	ATAGA	2	10	157488	157497	60 %	20 %	20 %	0 %	212633058
71	NC_011566	GTATT	2	10	163278	163287	20 %	60 %	20 %	0 %	212633064
72	NC_011566	GTTGA	2	10	163386	163395	20 %	40 %	40 %	0 %	212633064
73	NC_011566	ATTCG	2	10	167945	167954	20 %	40 %	20 %	20 %	212633067
74	NC_011566	TTGTC	2	10	169641	169650	0 %	60 %	20 %	20 %	212633069
75	NC_011566	ATCAC	2	10	172325	172334	40 %	20 %	0 %	40 %	212633069
76	NC_011566	TTGCA	2	10	173215	173224	20 %	40 %	20 %	20 %	212633069
77	NC_011566	CATTC	2	10	173235	173244	20 %	40 %	0 %	40 %	212633069
78	NC_011566	TACAA	2	10	173744	173753	60 %	20 %	0 %	20 %	212633069
79	NC_011566	TACTT	2	10	174196	174205	20 %	60 %	0 %	20 %	212633069
80	NC_011566	GCAGC	2	10	175203	175212	20 %	0 %	40 %	40 %	212633070
81	NC_011566	TTGAA	2	10	189261	189270	40 %	40 %	20 %	0 %	212633080
82	NC_011566	AAGCT	2	10	190242	190251	40 %	20 %	20 %	20 %	212633081
83	NC_011566	GCGCT	2	10	190693	190702	0 %	20 %	40 %	40 %	212633082
84	NC_011566	CGCTC	2	10	194124	194133	0 %	20 %	20 %	60 %	212633085
85	NC_011566	AGCAG	2	10	195729	195738	40 %	0 %	40 %	20 %	212633087
86	NC_011566	TACGC	2	10	199964	199973	20 %	20 %	20 %	40 %	212633091
87	NC_011566	GTTAA	2	10	200701	200710	40 %	40 %	20 %	0 %	212633091
88	NC_011566	GCGTG	2	10	201048	201057	0 %	20 %	60 %	20 %	212633091
89	NC_011566	GCCGT	2	10	201969	201978	0 %	20 %	40 %	40 %	212633092
90	NC_011566	CTATC	2	10	203392	203401	20 %	40 %	0 %	40 %	212633093
91	NC_011566	TCTTA	2	10	203551	203560	20 %	60 %	0 %	20 %	212633093
92	NC_011566	ATACG	2	10	203629	203638	40 %	20 %	20 %	20 %	212633093
93	NC_011566	GCGTT	2	10	206365	206374	0 %	40 %	40 %	20 %	212633098
94	NC_011566	TCGTT	2	10	210000	210009	0 %	60 %	20 %	20 %	212633103
95	NC_011566	CCATT	2	10	210373	210382	20 %	40 %	0 %	40 %	212633103
96	NC_011566	GTGTA	2	10	211569	211578	20 %	40 %	40 %	0 %	212633105
97	NC_011566	CCGAC	2	10	212887	212896	20 %	0 %	20 %	60 %	212633106
98	NC_011566	TGGCT	2	10	214300	214309	0 %	40 %	40 %	20 %	212633107
99	NC_011566	GGTTT	2	10	215824	215833	0 %	60 %	40 %	0 %	212633108
100	NC_011566	CTTTT	2	10	216204	216213	0 %	80 %	0 %	20 %	212633109
101	NC_011566	CGCTT	2	10	219135	219144	0 %	40 %	20 %	40 %	212633111
102	NC_011566	ATTGA	2	10	220511	220520	40 %	40 %	20 %	0 %	212633113
103	NC_011566	TGGAG	2	10	225441	225450	20 %	20 %	60 %	0 %	212633116
104	NC_011566	TTTGA	2	10	227725	227734	20 %	60 %	20 %	0 %	212633117
105	NC_011566	ATTGG	2	10	230074	230083	20 %	40 %	40 %	0 %	212633120
106	NC_011566	TGCCA	2	10	230334	230343	20 %	20 %	20 %	40 %	212633120
107	NC_011566	GGTAA	2	10	235523	235532	40 %	20 %	40 %	0 %	212633123
108	NC_011566	TGTTC	2	10	236143	236152	0 %	60 %	20 %	20 %	212633123
109	NC_011566	AGGGG	2	10	236647	236656	20 %	0 %	80 %	0 %	212633124
110	NC_011566	AAAAT	2	10	241537	241546	80 %	20 %	0 %	0 %	212633128
111	NC_011566	TGCAG	2	10	245507	245516	20 %	20 %	40 %	20 %	212633133
112	NC_011566	CAACC	2	10	246630	246639	40 %	0 %	0 %	60 %	212633133
113	NC_011566	CAGTT	2	10	248380	248389	20 %	40 %	20 %	20 %	212633136
114	NC_011566	AAAGA	2	10	248482	248491	80 %	0 %	20 %	0 %	212633136
115	NC_011566	TGTAT	2	10	251267	251276	20 %	60 %	20 %	0 %	212633140
116	NC_011566	TACTC	2	10	254088	254097	20 %	40 %	0 %	40 %	212633143
117	NC_011566	TGTGC	2	10	254767	254776	0 %	40 %	40 %	20 %	212633143
118	NC_011566	GATGA	2	10	259166	259175	40 %	20 %	40 %	0 %	212633147
119	NC_011566	TTTTA	2	10	259824	259833	20 %	80 %	0 %	0 %	212633148
120	NC_011566	GCTTA	2	10	260630	260639	20 %	40 %	20 %	20 %	212633149
121	NC_011566	GGTAA	2	10	263510	263519	40 %	20 %	40 %	0 %	212633152
122	NC_011566	GGTTA	2	10	263884	263893	20 %	40 %	40 %	0 %	212633152
123	NC_011566	TAGTG	2	10	266375	266384	20 %	40 %	40 %	0 %	212633155
124	NC_011566	TAGTC	2	10	267196	267205	20 %	40 %	20 %	20 %	212633156
125	NC_011566	CAGTA	2	10	268863	268872	40 %	20 %	20 %	20 %	212633158
126	NC_011566	CTGCG	2	10	269144	269153	0 %	20 %	40 %	40 %	212633158
127	NC_011566	AATCA	2	10	271325	271334	60 %	20 %	0 %	20 %	212633162
128	NC_011566	ACCCC	2	10	276306	276315	20 %	0 %	0 %	80 %	212633168
129	NC_011566	CCATG	2	10	277214	277223	20 %	20 %	20 %	40 %	212633169
130	NC_011566	AGGAG	2	10	278861	278870	40 %	0 %	60 %	0 %	212633169
131	NC_011566	GCTTT	2	10	278928	278937	0 %	60 %	20 %	20 %	212633169
132	NC_011566	AAAGC	2	10	289079	289088	60 %	0 %	20 %	20 %	212633179
133	NC_011566	TCAAT	2	10	290951	290960	40 %	40 %	0 %	20 %	212633181
134	NC_011566	AACTT	2	10	293345	293354	40 %	40 %	0 %	20 %	212633184
135	NC_011566	GCCTT	2	10	296960	296969	0 %	40 %	20 %	40 %	212633189
136	NC_011566	ATTGC	2	10	298319	298328	20 %	40 %	20 %	20 %	212633191
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173	NC_011566	GTGTT	2	10	369335	369344	0 %	60 %	40 %	0 %	212633262
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