MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011566	TCA	2	6	263684	263689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633152
4002	NC_011566	GGTTA	2	10	263884	263893	20 %	40 %	40 %	0 %	212633152
4003	NC_011566	AAC	2	6	263990	263995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633152
4004	NC_011566	CAA	2	6	264000	264005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633152
4005	NC_011566	TGCT	2	8	264022	264029	0 %	50 %	25 %	25 %	212633152
4006	NC_011566	AAT	2	6	264031	264036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633152
4007	NC_011566	ATA	2	6	264081	264086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633152
4008	NC_011566	GCG	2	6	264092	264097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633152
4009	NC_011566	TTG	2	6	264163	264168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633152
4010	NC_011566	TGAG	2	8	264179	264186	25 %	25 %	50 %	0 %	212633152
4011	NC_011566	CGT	2	6	264200	264205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633152
4012	NC_011566	TGC	2	6	264284	264289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633152
4013	NC_011566	TGG	2	6	264392	264397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633152
4014	NC_011566	TGT	2	6	264420	264425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633152
4015	NC_011566	ACTC	2	8	264427	264434	25 %	25 %	0 %	50 %	212633152
4016	NC_011566	TCA	2	6	264479	264484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633152
4017	NC_011566	TCTA	2	8	264716	264723	25 %	50 %	0 %	25 %	212633153
4018	NC_011566	GAA	2	6	264746	264751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633153
4019	NC_011566	TGG	2	6	264762	264767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633153
4020	NC_011566	AGT	2	6	264778	264783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633153
4021	NC_011566	ATA	2	6	264808	264813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633153
4022	NC_011566	CCAT	2	8	264886	264893	25 %	25 %	0 %	50 %	212633153
4023	NC_011566	GAG	2	6	264913	264918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212633153
4024	NC_011566	CCA	2	6	265103	265108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633153
4025	NC_011566	TGG	2	6	265247	265252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633153
4026	NC_011566	A	6	6	265442	265447	100 %	0 %	0 %	0 %	212633154
4027	NC_011566	TGG	2	6	265476	265481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633154
4028	NC_011566	ATT	2	6	265487	265492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633154
4029	NC_011566	GA	3	6	265597	265602	50 %	0 %	50 %	0 %	212633154
4030	NC_011566	AAT	2	6	265649	265654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633154
4031	NC_011566	TTG	2	6	265740	265745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633154
4032	NC_011566	AGA	2	6	265786	265791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633154
4033	NC_011566	GC	3	6	265812	265817	0 %	0 %	50 %	50 %	212633154
4034	NC_011566	TCAA	2	8	265905	265912	50 %	25 %	0 %	25 %	212633154
4035	NC_011566	CCG	2	6	265945	265950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633154
4036	NC_011566	TGT	2	6	265954	265959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633154
4037	NC_011566	CCACAA	2	12	266040	266051	50 %	0 %	0 %	50 %	212633155
4038	NC_011566	TAA	2	6	266114	266119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633155
4039	NC_011566	ATC	2	6	266197	266202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633155
4040	NC_011566	CTG	2	6	266221	266226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633155
4041	NC_011566	GCA	2	6	266228	266233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633155
4042	NC_011566	AG	3	6	266248	266253	50 %	0 %	50 %	0 %	212633155
4043	NC_011566	CAT	2	6	266330	266335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633155
4044	NC_011566	TAGTG	2	10	266375	266384	20 %	40 %	40 %	0 %	212633155
4045	NC_011566	CGA	2	6	266393	266398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633155
4046	NC_011566	CTG	2	6	266413	266418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633155
4047	NC_011566	TAT	2	6	266421	266426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633155
4048	NC_011566	GCTA	2	8	266481	266488	25 %	25 %	25 %	25 %	212633155
4049	NC_011566	GTG	2	6	266503	266508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633155
4050	NC_011566	CAT	2	6	266544	266549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633155
4051	NC_011566	CGA	2	6	266581	266586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633155
4052	NC_011566	AAT	2	6	266602	266607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633155
4053	NC_011566	TAT	2	6	266654	266659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633156
4054	NC_011566	CTA	2	6	266692	266697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633156
4055	NC_011566	GT	3	6	266698	266703	0 %	50 %	50 %	0 %	212633156
4056	NC_011566	CAC	2	6	266753	266758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633156
4057	NC_011566	CAT	2	6	266787	266792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633156
4058	NC_011566	TTGA	2	8	266847	266854	25 %	50 %	25 %	0 %	212633156
4059	NC_011566	T	6	6	266867	266872	0 %	100 %	0 %	0 %	212633156
4060	NC_011566	CTG	2	6	267007	267012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633156
4061	NC_011566	CTG	2	6	267035	267040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633156
4062	NC_011566	TGG	2	6	267147	267152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633156
4063	NC_011566	AAG	2	6	267157	267162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633156
4064	NC_011566	TAGTC	2	10	267196	267205	20 %	40 %	20 %	20 %	212633156
4065	NC_011566	GAT	2	6	267254	267259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633156
4066	NC_011566	GCT	2	6	267349	267354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633157
4067	NC_011566	TGA	2	6	267355	267360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633157
4068	NC_011566	AGA	2	6	267380	267385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633157
4069	NC_011566	ATC	2	6	267440	267445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633157
4070	NC_011566	CAT	2	6	267476	267481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633157
4071	NC_011566	CAA	2	6	267487	267492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633157
4072	NC_011566	CAG	2	6	267520	267525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633157
4073	NC_011566	CTT	2	6	267526	267531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633157
4074	NC_011566	T	6	6	267554	267559	0 %	100 %	0 %	0 %	212633157
4075	NC_011566	CTG	2	6	267583	267588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633157
4076	NC_011566	GACA	2	8	267619	267626	50 %	0 %	25 %	25 %	212633157
4077	NC_011566	CTTG	2	8	267642	267649	0 %	50 %	25 %	25 %	212633157
4078	NC_011566	CAT	2	6	267682	267687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633157
4079	NC_011566	A	6	6	267724	267729	100 %	0 %	0 %	0 %	212633157
4080	NC_011566	CGT	2	6	267733	267738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633157
4081	NC_011566	GTT	2	6	267781	267786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633157
4082	NC_011566	TGC	2	6	267821	267826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633157
4083	NC_011566	GTG	2	6	267862	267867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633157
4084	NC_011566	GCC	2	6	267872	267877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633157
4085	NC_011566	GTT	2	6	268196	268201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633158
4086	NC_011566	CTG	2	6	268219	268224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633158
4087	NC_011566	A	6	6	268273	268278	100 %	0 %	0 %	0 %	212633158
4088	NC_011566	GCA	2	6	268297	268302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633158
4089	NC_011566	AAT	2	6	268305	268310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633158
4090	NC_011566	TCG	2	6	268312	268317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633158
4091	NC_011566	CGATAG	2	12	268412	268423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	212633158
4092	NC_011566	T	6	6	268564	268569	0 %	100 %	0 %	0 %	212633158
4093	NC_011566	TCAA	2	8	268597	268604	50 %	25 %	0 %	25 %	212633158
4094	NC_011566	GCA	2	6	268642	268647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633158
4095	NC_011566	CAGTA	2	10	268863	268872	40 %	20 %	20 %	20 %	212633158
4096	NC_011566	TGC	2	6	268944	268949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633158
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4098	NC_011566	ATCA	2	8	268971	268978	50 %	25 %	0 %	25 %	212633158
4099	NC_011566	CCA	2	6	268984	268989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633158
4100	NC_011566	TCT	2	6	269012	269017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633158
4101	NC_011566	TGC	2	6	269109	269114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633158
4102	NC_011566	T	6	6	269138	269143	0 %	100 %	0 %	0 %	212633158
4103	NC_011566	CTGCG	2	10	269144	269153	0 %	20 %	40 %	40 %	212633158
4104	NC_011566	CCA	2	6	269155	269160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633158
4105	NC_011566	TG	3	6	269234	269239	0 %	50 %	50 %	0 %	212633158
4106	NC_011566	TAA	2	6	269248	269253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633158
4107	NC_011566	CAG	2	6	269412	269417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633159
4108	NC_011566	T	6	6	269473	269478	0 %	100 %	0 %	0 %	212633159
4109	NC_011566	TTG	2	6	269534	269539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633159
4110	NC_011566	T	6	6	269705	269710	0 %	100 %	0 %	0 %	212633159
4111	NC_011566	TCA	2	6	269729	269734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633159
4112	NC_011566	TAC	2	6	269780	269785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633159
4113	NC_011566	AGT	2	6	269846	269851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633159
4114	NC_011566	ATA	2	6	269950	269955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633159
4115	NC_011566	TAC	2	6	270135	270140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633160
4116	NC_011566	T	7	7	270208	270214	0 %	100 %	0 %	0 %	212633160
4117	NC_011566	ACC	2	6	270281	270286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633160
4118	NC_011566	ACG	2	6	270383	270388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633160
4119	NC_011566	AGC	2	6	270418	270423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633160
4120	NC_011566	CAGA	2	8	270826	270833	50 %	0 %	25 %	25 %	212633162
4121	NC_011566	GAT	2	6	270897	270902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633162
4122	NC_011566	GGC	2	6	270984	270989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633162
4123	NC_011566	CAC	2	6	271034	271039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633162
4124	NC_011566	ACC	2	6	271117	271122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633162
4125	NC_011566	ACCT	2	8	271163	271170	25 %	25 %	0 %	50 %	212633162
4126	NC_011566	TTG	2	6	271184	271189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633162
4127	NC_011566	ACA	2	6	271193	271198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633162
4128	NC_011566	TCAC	2	8	271262	271269	25 %	25 %	0 %	50 %	212633162
4129	NC_011566	AAGC	2	8	271300	271307	50 %	0 %	25 %	25 %	212633162
4130	NC_011566	AATCA	2	10	271325	271334	60 %	20 %	0 %	20 %	212633162
4131	NC_011566	TGA	2	6	271359	271364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633162
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4133	NC_011566	GTG	2	6	271424	271429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633162
4134	NC_011566	TGT	2	6	271469	271474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633162
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4142	NC_011566	ATG	2	6	271871	271876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633162
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4242	NC_011566	ATA	2	6	278148	278153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633169
4243	NC_011566	ATTT	2	8	278160	278167	25 %	75 %	0 %	0 %	212633169
4244	NC_011566	CAT	2	6	278240	278245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633169
4245	NC_011566	CCA	2	6	278356	278361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633169
4246	NC_011566	CTT	2	6	278435	278440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633169
4247	NC_011566	T	7	7	278439	278445	0 %	100 %	0 %	0 %	212633169
4248	NC_011566	AGA	2	6	278487	278492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633169
4249	NC_011566	CT	3	6	278496	278501	0 %	50 %	0 %	50 %	212633169
4250	NC_011566	CAG	2	6	278615	278620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633169
4251	NC_011566	T	6	6	278635	278640	0 %	100 %	0 %	0 %	212633169
4252	NC_011566	ATC	2	6	278649	278654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633169
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4254	NC_011566	CTG	2	6	278726	278731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633169
4255	NC_011566	GTTT	2	8	278770	278777	0 %	75 %	25 %	0 %	212633169
4256	NC_011566	GC	3	6	278781	278786	0 %	0 %	50 %	50 %	212633169
4257	NC_011566	GCTC	2	8	278809	278816	0 %	25 %	25 %	50 %	212633169
4258	NC_011566	TC	3	6	278834	278839	0 %	50 %	0 %	50 %	212633169
4259	NC_011566	CAT	2	6	278855	278860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633169
4260	NC_011566	AGGAG	2	10	278861	278870	40 %	0 %	60 %	0 %	212633169
4261	NC_011566	AAT	2	6	278892	278897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633169
4262	NC_011566	CAT	2	6	278906	278911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633169
4263	NC_011566	GCTTT	2	10	278928	278937	0 %	60 %	20 %	20 %	212633169
4264	NC_011566	GCT	2	6	278991	278996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633169
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4266	NC_011566	TCGGTT	2	12	279040	279051	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212633169
4267	NC_011566	GCG	2	6	279184	279189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633169
4268	NC_011566	A	6	6	279329	279334	100 %	0 %	0 %	0 %	212633169
4269	NC_011566	CAG	2	6	279359	279364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633169
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4272	NC_011566	TCAACA	2	12	279614	279625	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	212633170
4273	NC_011566	CAC	2	6	279672	279677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633170
4274	NC_011566	GCT	2	6	279752	279757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633170
4275	NC_011566	CAG	2	6	279762	279767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633170
4276	NC_011566	GCCA	2	8	279832	279839	25 %	0 %	25 %	50 %	212633170
4277	NC_011566	GCT	2	6	279956	279961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633170
4278	NC_011566	AAGC	2	8	279966	279973	50 %	0 %	25 %	25 %	212633170
4279	NC_011566	AGTT	2	8	280014	280021	25 %	50 %	25 %	0 %	212633170
4280	NC_011566	TGA	2	6	280059	280064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633170
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4283	NC_011566	TCA	2	6	280265	280270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633170
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4288	NC_011566	TGC	2	6	280495	280500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633170
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4292	NC_011566	CAAT	2	8	280587	280594	50 %	25 %	0 %	25 %	212633170
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4318	NC_011566	CTGT	2	8	282609	282616	0 %	50 %	25 %	25 %	212633172
4319	NC_011566	TGA	2	6	282617	282622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633172
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4322	NC_011566	TTGA	2	8	282816	282823	25 %	50 %	25 %	0 %	212633172
4323	NC_011566	CGT	2	6	282831	282836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633172
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4328	NC_011566	GTC	2	6	283234	283239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633172
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4335	NC_011566	TAG	2	6	283441	283446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633172
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4343	NC_011566	T	6	6	284331	284336	0 %	100 %	0 %	0 %	212633174
4344	NC_011566	TGAA	2	8	284343	284350	50 %	25 %	25 %	0 %	212633174
4345	NC_011566	AG	3	6	284463	284468	50 %	0 %	50 %	0 %	212633174
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4348	NC_011566	GCCA	2	8	284522	284529	25 %	0 %	25 %	50 %	212633175
4349	NC_011566	TGG	2	6	284555	284560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633175
4350	NC_011566	GTA	2	6	284580	284585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633175
4351	NC_011566	TCA	2	6	284588	284593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633175
4352	NC_011566	TA	3	6	284630	284635	50 %	50 %	0 %	0 %	212633175
4353	NC_011566	GTT	3	9	284703	284711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633175
4354	NC_011566	CT	3	6	284925	284930	0 %	50 %	0 %	50 %	212633175
4355	NC_011566	TCG	2	6	285001	285006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633175
4356	NC_011566	GGCT	2	8	285017	285024	0 %	25 %	50 %	25 %	212633175
4357	NC_011566	GATT	2	8	285061	285068	25 %	50 %	25 %	0 %	212633175
4358	NC_011566	CTG	2	6	285097	285102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633175
4359	NC_011566	ATC	2	6	285108	285113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633175
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4361	NC_011566	CT	3	6	285187	285192	0 %	50 %	0 %	50 %	212633175
4362	NC_011566	ATCT	2	8	285219	285226	25 %	50 %	0 %	25 %	212633175
4363	NC_011566	TGC	2	6	285229	285234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633175
4364	NC_011566	CTG	2	6	285246	285251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633175
4365	NC_011566	TGC	2	6	285279	285284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633175
4366	NC_011566	TGC	2	6	285381	285386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633175
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4472	NC_011566	GTTG	2	8	291867	291874	0 %	50 %	50 %	0 %	212633182
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4485	NC_011566	GCTG	2	8	292458	292465	0 %	25 %	50 %	25 %	212633183
4486	NC_011566	GCT	2	6	292481	292486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633183
4487	NC_011566	CTG	2	6	292497	292502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633183
4488	NC_011566	TGA	2	6	292534	292539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633183
4489	NC_011566	T	7	7	292553	292559	0 %	100 %	0 %	0 %	212633183
4490	NC_011566	CGT	2	6	292616	292621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633183
4491	NC_011566	TCAG	2	8	292686	292693	25 %	25 %	25 %	25 %	212633183
4492	NC_011566	AGCA	2	8	292699	292706	50 %	0 %	25 %	25 %	212633183
4493	NC_011566	TAA	2	6	292726	292731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633183
4494	NC_011566	TGC	2	6	292738	292743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633183
4495	NC_011566	GGC	2	6	292892	292897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633183
4496	NC_011566	GTG	2	6	292934	292939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633183
4497	NC_011566	ACT	2	6	292998	293003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633184
4498	NC_011566	GCA	2	6	293038	293043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633184
4499	NC_011566	AG	3	6	293046	293051	50 %	0 %	50 %	0 %	212633184
4500	NC_011566	A	6	6	293170	293175	100 %	0 %	0 %	0 %	212633184

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