MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011566	TGC	2	6	232503	232508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633121
3502	NC_011566	GAT	2	6	232533	232538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633121
3503	NC_011566	CAA	2	6	232544	232549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633121
3504	NC_011566	CAGC	2	8	232627	232634	25 %	0 %	25 %	50 %	212633121
3505	NC_011566	CAA	2	6	232652	232657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633121
3506	NC_011566	CTG	2	6	232670	232675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633121
3507	NC_011566	CT	3	6	232807	232812	0 %	50 %	0 %	50 %	212633121
3508	NC_011566	A	6	6	232877	232882	100 %	0 %	0 %	0 %	212633121
3509	NC_011566	CAC	2	6	232943	232948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633121
3510	NC_011566	AAG	2	6	233280	233285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633122
3511	NC_011566	TTC	2	6	233365	233370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633122
3512	NC_011566	GGT	2	6	233543	233548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633122
3513	NC_011566	GAT	2	6	233597	233602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633122
3514	NC_011566	CAG	2	6	233634	233639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633122
3515	NC_011566	GCA	2	6	233671	233676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633122
3516	NC_011566	GCGATG	2	12	233694	233705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212633122
3517	NC_011566	GGT	2	6	233726	233731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633122
3518	NC_011566	GTG	2	6	233777	233782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633122
3519	NC_011566	TAA	2	6	233923	233928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633122
3520	NC_011566	CGG	2	6	233962	233967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633122
3521	NC_011566	GCA	3	9	233969	233977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633122
3522	NC_011566	GGC	2	6	233993	233998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633122
3523	NC_011566	TCC	2	6	234030	234035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633122
3524	NC_011566	GCT	2	6	234092	234097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633122
3525	NC_011566	TAT	2	6	234285	234290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633123
3526	NC_011566	T	6	6	234315	234320	0 %	100 %	0 %	0 %	212633123
3527	NC_011566	TGC	2	6	234370	234375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3528	NC_011566	ATC	2	6	234383	234388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3529	NC_011566	TAG	2	6	234420	234425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633123
3530	NC_011566	GCA	2	6	234489	234494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3531	NC_011566	ATT	2	6	234527	234532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633123
3532	NC_011566	CAT	2	6	234580	234585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3533	NC_011566	GAA	2	6	234640	234645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633123
3534	NC_011566	CAC	2	6	234672	234677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633123
3535	NC_011566	AG	3	6	234833	234838	50 %	0 %	50 %	0 %	212633123
3536	NC_011566	ATC	2	6	234903	234908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3537	NC_011566	TA	3	6	234968	234973	50 %	50 %	0 %	0 %	212633123
3538	NC_011566	TGT	2	6	235217	235222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633123
3539	NC_011566	GAA	2	6	235242	235247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633123
3540	NC_011566	TA	3	6	235292	235297	50 %	50 %	0 %	0 %	212633123
3541	NC_011566	GCT	2	6	235301	235306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3542	NC_011566	TCT	2	6	235314	235319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633123
3543	NC_011566	AAAG	2	8	235406	235413	75 %	0 %	25 %	0 %	212633123
3544	NC_011566	TAC	2	6	235414	235419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3545	NC_011566	GTAA	2	8	235455	235462	50 %	25 %	25 %	0 %	212633123
3546	NC_011566	GGTAA	2	10	235523	235532	40 %	20 %	40 %	0 %	212633123
3547	NC_011566	TGC	2	6	235577	235582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3548	NC_011566	CAT	2	6	235615	235620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3549	NC_011566	GTT	2	6	235689	235694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633123
3550	NC_011566	ACT	2	6	235817	235822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3551	NC_011566	GTT	2	6	235837	235842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633123
3552	NC_011566	CAA	2	6	235858	235863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633123
3553	NC_011566	TCG	2	6	235948	235953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3554	NC_011566	AAG	2	6	236000	236005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633123
3555	NC_011566	CTG	2	6	236029	236034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3556	NC_011566	AGAT	2	8	236075	236082	50 %	25 %	25 %	0 %	212633123
3557	NC_011566	GCA	2	6	236097	236102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3558	NC_011566	TGTTC	2	10	236143	236152	0 %	60 %	20 %	20 %	212633123
3559	NC_011566	GCA	2	6	236181	236186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633123
3560	NC_011566	CAT	2	6	236194	236199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633123
3561	NC_011566	GCC	2	6	236256	236261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633123
3562	NC_011566	TTC	2	6	236564	236569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633124
3563	NC_011566	A	6	6	236614	236619	100 %	0 %	0 %	0 %	212633124
3564	NC_011566	AGGGG	2	10	236647	236656	20 %	0 %	80 %	0 %	212633124
3565	NC_011566	TGA	3	9	236713	236721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633124
3566	NC_011566	CTAT	2	8	236751	236758	25 %	50 %	0 %	25 %	212633124
3567	NC_011566	G	6	6	236761	236766	0 %	0 %	100 %	0 %	212633124
3568	NC_011566	GCA	2	6	236805	236810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633124
3569	NC_011566	TCG	2	6	236845	236850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633124
3570	NC_011566	TCT	2	6	236871	236876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633124
3571	NC_011566	AGC	2	6	236920	236925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633124
3572	NC_011566	ATGT	2	8	236947	236954	25 %	50 %	25 %	0 %	212633124
3573	NC_011566	GT	3	6	237033	237038	0 %	50 %	50 %	0 %	212633124
3574	NC_011566	TAA	2	6	237185	237190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633124
3575	NC_011566	GTTG	2	8	237207	237214	0 %	50 %	50 %	0 %	212633124
3576	NC_011566	TTG	2	6	237260	237265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633124
3577	NC_011566	ATC	2	6	237287	237292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633124
3578	NC_011566	CTC	2	6	237377	237382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633124
3579	NC_011566	TAG	2	6	237404	237409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633124
3580	NC_011566	TCT	2	6	237432	237437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633124
3581	NC_011566	GCT	2	6	237965	237970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633125
3582	NC_011566	AAG	2	6	238017	238022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633125
3583	NC_011566	ATT	2	6	238034	238039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633125
3584	NC_011566	GCA	2	6	238064	238069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633125
3585	NC_011566	A	6	6	238113	238118	100 %	0 %	0 %	0 %	212633125
3586	NC_011566	GGT	2	6	238130	238135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633125
3587	NC_011566	GGT	2	6	238151	238156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633125
3588	NC_011566	AAG	2	6	238191	238196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633125
3589	NC_011566	TGA	2	6	238258	238263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633125
3590	NC_011566	TGC	2	6	238269	238274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633125
3591	NC_011566	ACA	2	6	238348	238353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633125
3592	NC_011566	GGT	2	6	238358	238363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633125
3593	NC_011566	AATG	2	8	238430	238437	50 %	25 %	25 %	0 %	212633125
3594	NC_011566	ACTT	2	8	238654	238661	25 %	50 %	0 %	25 %	212633125
3595	NC_011566	CA	3	6	238749	238754	50 %	0 %	0 %	50 %	212633125
3596	NC_011566	GGT	2	6	238787	238792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633125
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3598	NC_011566	ATGA	2	8	238871	238878	50 %	25 %	25 %	0 %	212633125
3599	NC_011566	TGA	2	6	238924	238929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633125
3600	NC_011566	TCC	2	6	238945	238950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633125
3601	NC_011566	CCAAAG	2	12	239154	239165	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	212633125
3602	NC_011566	GGT	2	6	239228	239233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633125
3603	NC_011566	GTCA	2	8	239277	239284	25 %	25 %	25 %	25 %	212633125
3604	NC_011566	GCA	2	6	239300	239305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633125
3605	NC_011566	GT	3	6	239312	239317	0 %	50 %	50 %	0 %	212633125
3606	NC_011566	GGT	2	6	239318	239323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633125
3607	NC_011566	GCT	2	6	239349	239354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633125
3608	NC_011566	GCT	2	6	239387	239392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633125
3609	NC_011566	GAT	2	6	239441	239446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633126
3610	NC_011566	CAT	2	6	239523	239528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633126
3611	NC_011566	AAG	2	6	239530	239535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633126
3612	NC_011566	ATG	2	6	239614	239619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633126
3613	NC_011566	GAT	2	6	239622	239627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633126
3614	NC_011566	GAA	2	6	239652	239657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633126
3615	NC_011566	GTA	2	6	239752	239757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633126
3616	NC_011566	TAA	2	6	239793	239798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633126
3617	NC_011566	TTA	2	6	240136	240141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633127
3618	NC_011566	TAT	3	9	240149	240157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633127
3619	NC_011566	TGC	2	6	240171	240176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633127
3620	NC_011566	AAG	2	6	240203	240208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633127
3621	NC_011566	CTG	2	6	240215	240220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633127
3622	NC_011566	TTTG	3	12	240223	240234	0 %	75 %	25 %	0 %	212633127
3623	NC_011566	AAC	2	6	240239	240244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633127
3624	NC_011566	GTT	2	6	240350	240355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633127
3625	NC_011566	AAT	2	6	240463	240468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633127
3626	NC_011566	A	6	6	240481	240486	100 %	0 %	0 %	0 %	212633127
3627	NC_011566	AG	3	6	240499	240504	50 %	0 %	50 %	0 %	212633127
3628	NC_011566	GCA	2	6	240561	240566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633127
3629	NC_011566	T	6	6	240592	240597	0 %	100 %	0 %	0 %	212633127
3630	NC_011566	TGA	2	6	240675	240680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633127
3631	NC_011566	TGCC	2	8	240689	240696	0 %	25 %	25 %	50 %	212633127
3632	NC_011566	TATG	2	8	240762	240769	25 %	50 %	25 %	0 %	212633127
3633	NC_011566	GAA	2	6	240772	240777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633127
3634	NC_011566	TAA	2	6	240801	240806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633127
3635	NC_011566	TACGCC	2	12	240820	240831	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	212633127
3636	NC_011566	TTG	2	6	240853	240858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633127
3637	NC_011566	CAGT	2	8	240913	240920	25 %	25 %	25 %	25 %	212633127
3638	NC_011566	TAC	2	6	240964	240969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633127
3639	NC_011566	AAG	2	6	241049	241054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633127
3640	NC_011566	GC	3	6	241212	241217	0 %	0 %	50 %	50 %	212633127
3641	NC_011566	TCTG	2	8	241225	241232	0 %	50 %	25 %	25 %	212633127
3642	NC_011566	CAG	2	6	241292	241297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633127
3643	NC_011566	GTG	2	6	241322	241327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633127
3644	NC_011566	ATG	2	6	241530	241535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633128
3645	NC_011566	AAAAT	2	10	241537	241546	80 %	20 %	0 %	0 %	212633128
3646	NC_011566	GAT	2	6	241605	241610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633128
3647	NC_011566	TTATAG	2	12	241640	241651	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	212633128
3648	NC_011566	ATT	2	6	241654	241659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633128
3649	NC_011566	GGT	2	6	241680	241685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633128
3650	NC_011566	TGC	2	6	241745	241750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633128
3651	NC_011566	GTG	3	9	241831	241839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633128
3652	NC_011566	TGG	2	6	241884	241889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633128
3653	NC_011566	ACT	2	6	241900	241905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633128
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3655	NC_011566	GAT	2	6	242055	242060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633128
3656	NC_011566	GAA	2	6	242076	242081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633128
3657	NC_011566	GTC	2	6	242098	242103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633128
3658	NC_011566	CTATGA	2	12	242270	242281	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	212633128
3659	NC_011566	ATG	3	9	242287	242295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633128
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3661	NC_011566	CAT	2	6	242401	242406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633128
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3665	NC_011566	CGG	2	6	242561	242566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633128
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3723	NC_011566	CG	3	6	246503	246508	0 %	0 %	50 %	50 %	212633133
3724	NC_011566	TTG	2	6	246514	246519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633133
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3726	NC_011566	CAACC	2	10	246630	246639	40 %	0 %	0 %	60 %	212633133
3727	NC_011566	TGT	2	6	246645	246650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633133
3728	NC_011566	CAT	2	6	246700	246705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633133
3729	NC_011566	CA	3	6	246727	246732	50 %	0 %	0 %	50 %	212633133
3730	NC_011566	GAC	2	6	246739	246744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633133
3731	NC_011566	AGT	2	6	246803	246808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633133
3732	NC_011566	TA	3	6	246834	246839	50 %	50 %	0 %	0 %	212633133
3733	NC_011566	GAT	2	6	246863	246868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633134
3734	NC_011566	TGA	2	6	246910	246915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633134
3735	NC_011566	GAT	3	9	246923	246931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633134
3736	NC_011566	AAAC	2	8	247051	247058	75 %	0 %	0 %	25 %	212633134
3737	NC_011566	CAC	2	6	247112	247117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633134
3738	NC_011566	T	7	7	247175	247181	0 %	100 %	0 %	0 %	212633134
3739	NC_011566	GAA	2	6	247223	247228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633134
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3741	NC_011566	GGT	2	6	247487	247492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633134
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3983	NC_011566	A	6	6	262503	262508	100 %	0 %	0 %	0 %	212633151
3984	NC_011566	TCT	2	6	262530	262535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633151
3985	NC_011566	CGT	2	6	262536	262541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633151
3986	NC_011566	TCC	2	6	262593	262598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633151
3987	NC_011566	TTG	2	6	262610	262615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633151
3988	NC_011566	CCAC	2	8	262683	262690	25 %	0 %	0 %	75 %	212633151
3989	NC_011566	GCC	2	6	262778	262783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633151
3990	NC_011566	GC	3	6	262939	262944	0 %	0 %	50 %	50 %	212633151
3991	NC_011566	CTA	2	6	263100	263105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633151
3992	NC_011566	TCA	2	6	263154	263159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633151
3993	NC_011566	TAA	2	6	263285	263290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633151
3994	NC_011566	GCA	3	9	263376	263384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633151
3995	NC_011566	GCT	2	6	263393	263398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633151
3996	NC_011566	ATC	2	6	263447	263452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633151
3997	NC_011566	GGTAA	2	10	263510	263519	40 %	20 %	40 %	0 %	212633152
3998	NC_011566	CAAT	2	8	263552	263559	50 %	25 %	0 %	25 %	212633152
3999	NC_011566	GCC	2	6	263563	263568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633152
4000	NC_011566	AAT	2	6	263645	263650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633152

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