MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011566	CAG	2	6	166226	166231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633066
2502	NC_011566	CCT	2	6	166234	166239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633066
2503	NC_011566	GA	3	6	166252	166257	50 %	0 %	50 %	0 %	212633066
2504	NC_011566	GTG	2	6	166280	166285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633066
2505	NC_011566	TGG	2	6	166295	166300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633066
2506	NC_011566	TGA	2	6	166361	166366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633066
2507	NC_011566	GGT	2	6	166473	166478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633066
2508	NC_011566	CAG	2	6	166498	166503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633066
2509	NC_011566	ATT	3	9	166510	166518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633066
2510	NC_011566	ATG	3	9	166522	166530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633066
2511	NC_011566	GGC	2	6	166575	166580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633066
2512	NC_011566	TTG	2	6	166792	166797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633066
2513	NC_011566	TGC	2	6	166811	166816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633066
2514	NC_011566	TGA	2	6	166859	166864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633066
2515	NC_011566	TGA	2	6	166895	166900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633066
2516	NC_011566	TGGC	2	8	166936	166943	0 %	25 %	50 %	25 %	212633066
2517	NC_011566	AAC	2	6	167010	167015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633066
2518	NC_011566	TGA	2	6	167021	167026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633066
2519	NC_011566	GCC	2	6	167048	167053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633066
2520	NC_011566	TGC	2	6	167078	167083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633066
2521	NC_011566	GTT	2	6	167085	167090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633066
2522	NC_011566	ATC	2	6	167253	167258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633067
2523	NC_011566	TTC	2	6	167274	167279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633067
2524	NC_011566	GGA	2	6	167280	167285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212633067
2525	NC_011566	CAA	2	6	167348	167353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633067
2526	NC_011566	GTT	2	6	167372	167377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633067
2527	NC_011566	ATC	2	6	167436	167441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633067
2528	NC_011566	CTG	2	6	167471	167476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633067
2529	NC_011566	CAC	2	6	167582	167587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633067
2530	NC_011566	AT	3	6	167589	167594	50 %	50 %	0 %	0 %	212633067
2531	NC_011566	AGTA	2	8	167694	167701	50 %	25 %	25 %	0 %	212633067
2532	NC_011566	CTCG	2	8	167703	167710	0 %	25 %	25 %	50 %	212633067
2533	NC_011566	CT	3	6	167740	167745	0 %	50 %	0 %	50 %	212633067
2534	NC_011566	TTC	2	6	167757	167762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633067
2535	NC_011566	ATTCG	2	10	167945	167954	20 %	40 %	20 %	20 %	212633067
2536	NC_011566	AGT	2	6	167961	167966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633067
2537	NC_011566	CAC	2	6	168011	168016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633067
2538	NC_011566	TCA	2	6	168022	168027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633067
2539	NC_011566	TGT	2	6	168154	168159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633067
2540	NC_011566	TCT	2	6	168204	168209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633067
2541	NC_011566	T	6	6	168209	168214	0 %	100 %	0 %	0 %	212633067
2542	NC_011566	TGA	2	6	168247	168252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633067
2543	NC_011566	ATT	2	6	168354	168359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633067
2544	NC_011566	ATC	2	6	168372	168377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633067
2545	NC_011566	AT	3	6	168422	168427	50 %	50 %	0 %	0 %	212633067
2546	NC_011566	GCTGTT	2	12	168479	168490	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212633067
2547	NC_011566	ACC	2	6	168645	168650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633067
2548	NC_011566	ATA	2	6	168666	168671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633067
2549	NC_011566	AAAG	2	8	168727	168734	75 %	0 %	25 %	0 %	212633067
2550	NC_011566	CCT	2	6	168835	168840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633067
2551	NC_011566	AGT	2	6	168871	168876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633067
2552	NC_011566	A	9	9	169024	169032	100 %	0 %	0 %	0 %	212633067
2553	NC_011566	A	6	6	169059	169064	100 %	0 %	0 %	0 %	212633067
2554	NC_011566	ATT	2	6	169096	169101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633068
2555	NC_011566	TCT	2	6	169173	169178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633068
2556	NC_011566	TCA	2	6	169209	169214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633068
2557	NC_011566	CTG	2	6	169228	169233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633068
2558	NC_011566	AATA	2	8	169319	169326	75 %	25 %	0 %	0 %	212633068
2559	NC_011566	T	6	6	169337	169342	0 %	100 %	0 %	0 %	212633068
2560	NC_011566	CGA	2	6	169424	169429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2561	NC_011566	AAG	2	6	169463	169468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633069
2562	NC_011566	AG	3	6	169472	169477	50 %	0 %	50 %	0 %	212633069
2563	NC_011566	CTTT	2	8	169487	169494	0 %	75 %	0 %	25 %	212633069
2564	NC_011566	TGATAG	2	12	169626	169637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633069
2565	NC_011566	TTGTC	2	10	169641	169650	0 %	60 %	20 %	20 %	212633069
2566	NC_011566	TTG	2	6	169710	169715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2567	NC_011566	CAG	2	6	169785	169790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2568	NC_011566	AT	3	6	169935	169940	50 %	50 %	0 %	0 %	212633069
2569	NC_011566	GCA	2	6	170024	170029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2570	NC_011566	AGC	2	6	170083	170088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2571	NC_011566	ATC	2	6	170092	170097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2572	NC_011566	TGTT	2	8	170214	170221	0 %	75 %	25 %	0 %	212633069
2573	NC_011566	TCAT	2	8	170237	170244	25 %	50 %	0 %	25 %	212633069
2574	NC_011566	AAT	2	6	170248	170253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633069
2575	NC_011566	TCT	2	6	170345	170350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633069
2576	NC_011566	TTG	2	6	170422	170427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2577	NC_011566	ACC	2	6	170521	170526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633069
2578	NC_011566	AT	3	6	170563	170568	50 %	50 %	0 %	0 %	212633069
2579	NC_011566	GCAGCG	2	12	170585	170596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	212633069
2580	NC_011566	AGC	2	6	170675	170680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2581	NC_011566	CGA	2	6	170832	170837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2582	NC_011566	GTCT	2	8	170956	170963	0 %	50 %	25 %	25 %	212633069
2583	NC_011566	CGC	2	6	171084	171089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633069
2584	NC_011566	T	6	6	171130	171135	0 %	100 %	0 %	0 %	212633069
2585	NC_011566	CAT	2	6	171183	171188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2586	NC_011566	CTG	2	6	171249	171254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2587	NC_011566	TCA	2	6	171287	171292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2588	NC_011566	ACA	3	9	171389	171397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633069
2589	NC_011566	GTT	2	6	171480	171485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2590	NC_011566	CGT	2	6	171553	171558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2591	NC_011566	CGG	2	6	171645	171650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633069
2592	NC_011566	TAG	2	6	171662	171667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633069
2593	NC_011566	CAT	2	6	171669	171674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2594	NC_011566	AAC	2	6	171709	171714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633069
2595	NC_011566	GCT	2	6	171718	171723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2596	NC_011566	CTG	2	6	171744	171749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2597	NC_011566	ACT	2	6	171757	171762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
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2599	NC_011566	CGT	2	6	171801	171806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2600	NC_011566	TA	3	6	171841	171846	50 %	50 %	0 %	0 %	212633069
2601	NC_011566	CAG	2	6	171888	171893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2602	NC_011566	GTT	2	6	172007	172012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2603	NC_011566	CAT	2	6	172041	172046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2604	NC_011566	TGT	3	9	172048	172056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2605	NC_011566	CTG	2	6	172062	172067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2606	NC_011566	AAG	2	6	172097	172102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633069
2607	NC_011566	ACC	2	6	172186	172191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633069
2608	NC_011566	ATCAC	2	10	172325	172334	40 %	20 %	0 %	40 %	212633069
2609	NC_011566	CTG	2	6	172476	172481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2610	NC_011566	TTC	2	6	172489	172494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633069
2611	NC_011566	GCA	2	6	172586	172591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
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2613	NC_011566	TGT	2	6	172747	172752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2614	NC_011566	GATA	2	8	172818	172825	50 %	25 %	25 %	0 %	212633069
2615	NC_011566	ATC	2	6	172885	172890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2616	NC_011566	GCA	2	6	172904	172909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
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2618	NC_011566	TCA	2	6	173006	173011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2619	NC_011566	TTG	2	6	173026	173031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2620	NC_011566	TTGCA	2	10	173215	173224	20 %	40 %	20 %	20 %	212633069
2621	NC_011566	CATTC	2	10	173235	173244	20 %	40 %	0 %	40 %	212633069
2622	NC_011566	AG	3	6	173255	173260	50 %	0 %	50 %	0 %	212633069
2623	NC_011566	ATA	2	6	173354	173359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633069
2624	NC_011566	GAT	2	6	173452	173457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633069
2625	NC_011566	CACC	2	8	173472	173479	25 %	0 %	0 %	75 %	212633069
2626	NC_011566	CGA	2	6	173502	173507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633069
2627	NC_011566	AAT	2	6	173526	173531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633069
2628	NC_011566	ATA	2	6	173635	173640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633069
2629	NC_011566	TTA	2	6	173715	173720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633069
2630	NC_011566	TGT	2	6	173736	173741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
2631	NC_011566	TACAA	2	10	173744	173753	60 %	20 %	0 %	20 %	212633069
2632	NC_011566	CAT	2	6	173763	173768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2633	NC_011566	TAC	2	6	173835	173840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633069
2634	NC_011566	TGG	2	6	173917	173922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633069
2635	NC_011566	GTT	2	6	173966	173971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633069
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2637	NC_011566	GCT	2	6	174138	174143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633069
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2643	NC_011566	AACT	2	8	174610	174617	50 %	25 %	0 %	25 %	212633070
2644	NC_011566	TC	3	6	174634	174639	0 %	50 %	0 %	50 %	212633070
2645	NC_011566	ATC	2	6	174663	174668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633070
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2650	NC_011566	GCT	2	6	174928	174933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633070
2651	NC_011566	ATC	2	6	175004	175009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633070
2652	NC_011566	ACTG	2	8	175195	175202	25 %	25 %	25 %	25 %	212633070
2653	NC_011566	GCAGC	2	10	175203	175212	20 %	0 %	40 %	40 %	212633070
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2657	NC_011566	GAT	2	6	175453	175458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633071
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2661	NC_011566	CCA	2	6	175850	175855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633071
2662	NC_011566	GCT	2	6	175880	175885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633071
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2692	NC_011566	TCT	2	6	177987	177992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633073
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2696	NC_011566	GA	3	6	178249	178254	50 %	0 %	50 %	0 %	212633073
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2711	NC_011566	TGCT	2	8	179282	179289	0 %	50 %	25 %	25 %	212633073
2712	NC_011566	CAT	2	6	179419	179424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633073
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2726	NC_011566	TGC	2	6	180073	180078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633073
2727	NC_011566	GTGA	2	8	180131	180138	25 %	25 %	50 %	0 %	212633073
2728	NC_011566	TGT	2	6	180139	180144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633073
2729	NC_011566	GTC	2	6	180278	180283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633073
2730	NC_011566	GA	3	6	180301	180306	50 %	0 %	50 %	0 %	212633073
2731	NC_011566	AAT	2	6	180337	180342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633073
2732	NC_011566	CAC	2	6	180355	180360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633073
2733	NC_011566	AGT	2	6	180393	180398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633073
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2736	NC_011566	GCCA	2	8	180531	180538	25 %	0 %	25 %	50 %	212633073
2737	NC_011566	TGT	3	9	180540	180548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633073
2738	NC_011566	CTG	2	6	180576	180581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633073
2739	NC_011566	GGT	2	6	180653	180658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633073
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2741	NC_011566	AG	3	6	180744	180749	50 %	0 %	50 %	0 %	212633073
2742	NC_011566	ATT	2	6	181508	181513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633074
2743	NC_011566	CGA	2	6	181580	181585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633074
2744	NC_011566	TCA	2	6	181664	181669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633074
2745	NC_011566	ACC	2	6	181710	181715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633074
2746	NC_011566	AGC	2	6	181785	181790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633074
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2850	NC_011566	TTGAA	2	10	189261	189270	40 %	40 %	20 %	0 %	212633080
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2859	NC_011566	AAGCT	2	10	190242	190251	40 %	20 %	20 %	20 %	212633081
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