MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011566	CTT	2	6	96452	96457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212632994
1502	NC_011566	T	6	6	96502	96507	0 %	100 %	0 %	0 %	212632994
1503	NC_011566	AGG	2	6	96511	96516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212632994
1504	NC_011566	GTT	2	6	96617	96622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632995
1505	NC_011566	GCA	2	6	96660	96665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1506	NC_011566	GAC	2	6	96676	96681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1507	NC_011566	A	6	6	96734	96739	100 %	0 %	0 %	0 %	212632995
1508	NC_011566	CTG	2	6	96761	96766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1509	NC_011566	TGG	2	6	96779	96784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632995
1510	NC_011566	TA	3	6	96863	96868	50 %	50 %	0 %	0 %	212632995
1511	NC_011566	GTT	2	6	96888	96893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632995
1512	NC_011566	ATG	2	6	96932	96937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632995
1513	NC_011566	GCG	2	6	97039	97044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632995
1514	NC_011566	CAGAG	2	10	97061	97070	40 %	0 %	40 %	20 %	212632995
1515	NC_011566	CTG	2	6	97223	97228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1516	NC_011566	TGGAT	2	10	97238	97247	20 %	40 %	40 %	0 %	212632995
1517	NC_011566	GCA	2	6	97329	97334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1518	NC_011566	AT	3	6	97382	97387	50 %	50 %	0 %	0 %	212632995
1519	NC_011566	ACC	2	6	97408	97413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632995
1520	NC_011566	ATCA	2	8	97426	97433	50 %	25 %	0 %	25 %	212632995
1521	NC_011566	TG	3	6	97471	97476	0 %	50 %	50 %	0 %	212632995
1522	NC_011566	CAG	2	6	97552	97557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1523	NC_011566	GT	4	8	97772	97779	0 %	50 %	50 %	0 %	212632995
1524	NC_011566	CAA	2	6	97813	97818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632995
1525	NC_011566	CAG	2	6	97825	97830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1526	NC_011566	CAGC	2	8	97832	97839	25 %	0 %	25 %	50 %	212632995
1527	NC_011566	ACT	2	6	97886	97891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632995
1528	NC_011566	AGG	2	6	98045	98050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212632995
1529	NC_011566	ACA	2	6	98076	98081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632995
1530	NC_011566	TAA	2	6	98115	98120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212632995
1531	NC_011566	GCA	2	6	98226	98231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632995
1532	NC_011566	CTTC	2	8	98247	98254	0 %	50 %	0 %	50 %	212632995
1533	NC_011566	GA	3	6	98258	98263	50 %	0 %	50 %	0 %	212632995
1534	NC_011566	GAA	2	6	98274	98279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212632995
1535	NC_011566	A	6	6	98302	98307	100 %	0 %	0 %	0 %	212632995
1536	NC_011566	ATG	2	6	98448	98453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632995
1537	NC_011566	A	6	6	98455	98460	100 %	0 %	0 %	0 %	212632996
1538	NC_011566	TG	3	6	98512	98517	0 %	50 %	50 %	0 %	212632996
1539	NC_011566	A	6	6	98543	98548	100 %	0 %	0 %	0 %	212632996
1540	NC_011566	ATG	2	6	98562	98567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632996
1541	NC_011566	TAT	2	6	98595	98600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632996
1542	NC_011566	GCC	2	6	98601	98606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212632996
1543	NC_011566	AGG	2	6	98675	98680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212632996
1544	NC_011566	CCA	2	6	98696	98701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632996
1545	NC_011566	TGG	2	6	98729	98734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632996
1546	NC_011566	AGC	2	6	98845	98850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632996
1547	NC_011566	TGC	2	6	98948	98953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632996
1548	NC_011566	GA	3	6	98981	98986	50 %	0 %	50 %	0 %	212632996
1549	NC_011566	TGG	2	6	99013	99018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632996
1550	NC_011566	CTG	2	6	99021	99026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632996
1551	NC_011566	A	6	6	99108	99113	100 %	0 %	0 %	0 %	212632996
1552	NC_011566	GGT	2	6	99156	99161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632996
1553	NC_011566	GCA	2	6	99188	99193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632996
1554	NC_011566	TTAA	2	8	99234	99241	50 %	50 %	0 %	0 %	212632996
1555	NC_011566	CTA	2	6	99308	99313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632996
1556	NC_011566	A	8	8	99336	99343	100 %	0 %	0 %	0 %	212632996
1557	NC_011566	CGG	2	6	99371	99376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632996
1558	NC_011566	CACC	2	8	99377	99384	25 %	0 %	0 %	75 %	212632996
1559	NC_011566	GCG	2	6	99399	99404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632996
1560	NC_011566	T	6	6	99423	99428	0 %	100 %	0 %	0 %	212632996
1561	NC_011566	AGC	2	6	99434	99439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632996
1562	NC_011566	GCA	2	6	99557	99562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632996
1563	NC_011566	GAT	2	6	99585	99590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632996
1564	NC_011566	CCA	2	6	99660	99665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632996
1565	NC_011566	T	6	6	99672	99677	0 %	100 %	0 %	0 %	212632996
1566	NC_011566	T	6	6	99751	99756	0 %	100 %	0 %	0 %	212632997
1567	NC_011566	GTTGCT	2	12	99977	99988	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	212632997
1568	NC_011566	GGTTTA	2	12	100010	100021	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	212632997
1569	NC_011566	TTC	2	6	100029	100034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212632997
1570	NC_011566	T	6	6	100121	100126	0 %	100 %	0 %	0 %	212632997
1571	NC_011566	CTT	2	6	100242	100247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212632997
1572	NC_011566	ATC	2	6	100419	100424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632998
1573	NC_011566	TCA	2	6	100443	100448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632998
1574	NC_011566	TGAGC	2	10	100535	100544	20 %	20 %	40 %	20 %	212632998
1575	NC_011566	GA	3	6	101457	101462	50 %	0 %	50 %	0 %	212632999
1576	NC_011566	GCAAG	2	10	101472	101481	40 %	0 %	40 %	20 %	212632999
1577	NC_011566	GGC	2	6	101499	101504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632999
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1580	NC_011566	T	8	8	101636	101643	0 %	100 %	0 %	0 %	212632999
1581	NC_011566	ATT	2	6	101725	101730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632999
1582	NC_011566	TTA	2	6	101759	101764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632999
1583	NC_011566	TTTG	2	8	101817	101824	0 %	75 %	25 %	0 %	212632999
1584	NC_011566	GC	3	6	101871	101876	0 %	0 %	50 %	50 %	212632999
1585	NC_011566	GTT	2	6	101907	101912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632999
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1588	NC_011566	TCA	2	6	102014	102019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632999
1589	NC_011566	TGGCA	2	10	102095	102104	20 %	20 %	40 %	20 %	212632999
1590	NC_011566	TGC	2	6	102134	102139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632999
1591	NC_011566	TGG	2	6	102140	102145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632999
1592	NC_011566	G	7	7	102144	102150	0 %	0 %	100 %	0 %	212632999
1593	NC_011566	ACTC	2	8	102242	102249	25 %	25 %	0 %	50 %	212632999
1594	NC_011566	GTT	2	6	102304	102309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632999
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1596	NC_011566	GGTTA	2	10	102506	102515	20 %	40 %	40 %	0 %	212633000
1597	NC_011566	TGC	2	6	102549	102554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633001
1598	NC_011566	CTG	2	6	102575	102580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633001
1599	NC_011566	GAGT	2	8	102682	102689	25 %	25 %	50 %	0 %	212633001
1600	NC_011566	AT	3	6	102699	102704	50 %	50 %	0 %	0 %	212633001
1601	NC_011566	GGC	2	6	102728	102733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633001
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1603	NC_011566	GTA	2	6	102875	102880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633001
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1605	NC_011566	AGTG	2	8	103154	103161	25 %	25 %	50 %	0 %	212633001
1606	NC_011566	CAC	2	6	103358	103363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633001
1607	NC_011566	CTTG	2	8	103449	103456	0 %	50 %	25 %	25 %	212633002
1608	NC_011566	TTTA	2	8	103475	103482	25 %	75 %	0 %	0 %	212633002
1609	NC_011566	CTG	2	6	103594	103599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1610	NC_011566	GCA	2	6	103633	103638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1611	NC_011566	AGC	2	6	103722	103727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1612	NC_011566	CTG	2	6	103809	103814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1613	NC_011566	TGG	2	6	103827	103832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633002
1614	NC_011566	CAT	2	6	103846	103851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633002
1615	NC_011566	TCGA	2	8	103865	103872	25 %	25 %	25 %	25 %	212633002
1616	NC_011566	TTC	2	6	103934	103939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633002
1617	NC_011566	TAA	2	6	104032	104037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633002
1618	NC_011566	A	6	6	104036	104041	100 %	0 %	0 %	0 %	212633002
1619	NC_011566	AGC	2	6	104062	104067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1620	NC_011566	CTG	2	6	104116	104121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1621	NC_011566	AGC	2	6	104160	104165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1622	NC_011566	TAT	2	6	104249	104254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633002
1623	NC_011566	GCT	2	6	104255	104260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633002
1624	NC_011566	GAT	2	6	104267	104272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633002
1625	NC_011566	ACA	2	6	104704	104709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633003
1626	NC_011566	AGC	2	6	104713	104718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633003
1627	NC_011566	TCCA	2	8	104771	104778	25 %	25 %	0 %	50 %	212633003
1628	NC_011566	CAT	2	6	104779	104784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633003
1629	NC_011566	TGA	2	6	104813	104818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
1630	NC_011566	CA	3	6	104822	104827	50 %	0 %	0 %	50 %	212633003
1631	NC_011566	TCA	2	6	104848	104853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633003
1632	NC_011566	TTTC	2	8	104903	104910	0 %	75 %	0 %	25 %	212633003
1633	NC_011566	AGC	2	6	105098	105103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633003
1634	NC_011566	TGT	2	6	105326	105331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633003
1635	NC_011566	CTG	2	6	105334	105339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633003
1636	NC_011566	TAC	2	6	105343	105348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633003
1637	NC_011566	TGA	2	6	105443	105448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
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1639	NC_011566	CTA	2	6	105637	105642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633003
1640	NC_011566	AGA	2	6	105647	105652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633003
1641	NC_011566	AGC	2	6	105658	105663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633003
1642	NC_011566	AGC	2	6	105759	105764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633003
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1644	NC_011566	GGT	2	6	105903	105908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633003
1645	NC_011566	CGG	2	6	105986	105991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633003
1646	NC_011566	TGA	2	6	106013	106018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
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1653	NC_011566	TGA	2	6	106265	106270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
1654	NC_011566	AGC	2	6	106285	106290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633003
1655	NC_011566	TGA	2	6	106448	106453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
1656	NC_011566	CTG	2	6	106506	106511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633003
1657	NC_011566	TGA	2	6	106562	106567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
1658	NC_011566	TTGA	2	8	106728	106735	25 %	50 %	25 %	0 %	212633003
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1662	NC_011566	G	6	6	106901	106906	0 %	0 %	100 %	0 %	212633003
1663	NC_011566	TGA	2	6	106955	106960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
1664	NC_011566	GATT	2	8	107029	107036	25 %	50 %	25 %	0 %	212633003
1665	NC_011566	GAT	2	6	107088	107093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
1666	NC_011566	TGA	2	6	107234	107239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
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1668	NC_011566	TGA	2	6	107345	107350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633003
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1680	NC_011566	TGA	2	6	108058	108063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633004
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1729	NC_011566	TTA	2	6	111892	111897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633007
1730	NC_011566	TGA	2	6	111924	111929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633007
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1733	NC_011566	TGA	2	6	112128	112133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633007
1734	NC_011566	T	7	7	112190	112196	0 %	100 %	0 %	0 %	212633007
1735	NC_011566	ACACG	2	10	112213	112222	40 %	0 %	20 %	40 %	212633007
1736	NC_011566	TGA	2	6	112277	112282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633007
1737	NC_011566	AGCAA	2	10	112610	112619	60 %	0 %	20 %	20 %	212633008
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1739	NC_011566	ATT	2	6	112688	112693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633008
1740	NC_011566	CAC	2	6	112819	112824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633008
1741	NC_011566	GGC	2	6	112826	112831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633008
1742	NC_011566	ATG	2	6	112889	112894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633008
1743	NC_011566	ATGG	2	8	113075	113082	25 %	25 %	50 %	0 %	212633008
1744	NC_011566	TGA	2	6	113098	113103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633008
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1865	NC_011566	GTAAT	2	10	121346	121355	40 %	40 %	20 %	0 %	212633017
1866	NC_011566	TGG	2	6	121479	121484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633017
1867	NC_011566	GCT	2	6	121518	121523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633017
1868	NC_011566	TAT	2	6	121535	121540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633017
1869	NC_011566	CT	3	6	121582	121587	0 %	50 %	0 %	50 %	212633017
1870	NC_011566	GTT	2	6	121613	121618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633018
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1873	NC_011566	TGT	3	9	122009	122017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633019
1874	NC_011566	T	6	6	122045	122050	0 %	100 %	0 %	0 %	212633019
1875	NC_011566	T	8	8	122084	122091	0 %	100 %	0 %	0 %	212633019
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1878	NC_011566	CTAT	2	8	122465	122472	25 %	50 %	0 %	25 %	212633020
1879	NC_011566	GCT	2	6	122494	122499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633020
1880	NC_011566	GCT	2	6	122664	122669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633020
1881	NC_011566	A	6	6	122708	122713	100 %	0 %	0 %	0 %	212633020
1882	NC_011566	TGA	2	6	122733	122738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633020
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1968	NC_011566	TTC	2	6	129607	129612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633030
1969	NC_011566	TGAG	2	8	129629	129636	25 %	25 %	50 %	0 %	212633030
1970	NC_011566	CGTCAT	2	12	129674	129685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	212633030
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1972	NC_011566	T	6	6	129761	129766	0 %	100 %	0 %	0 %	212633030
1973	NC_011566	GGTTG	2	10	129774	129783	0 %	40 %	60 %	0 %	212633030
1974	NC_011566	TGT	2	6	129792	129797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633030
1975	NC_011566	AGC	2	6	129888	129893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633030
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1977	NC_011566	TATC	2	8	129920	129927	25 %	50 %	0 %	25 %	212633030
1978	NC_011566	CGA	2	6	129948	129953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633030
1979	NC_011566	TTGG	2	8	129976	129983	0 %	50 %	50 %	0 %	212633030
1980	NC_011566	AGGC	2	8	129997	130004	25 %	0 %	50 %	25 %	212633030
1981	NC_011566	GTG	2	6	130124	130129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633030
1982	NC_011566	AGC	2	6	130144	130149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633030
1983	NC_011566	TCA	3	9	130169	130177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633030
1984	NC_011566	CTG	2	6	130867	130872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633031
1985	NC_011566	GCC	2	6	130893	130898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633031
1986	NC_011566	TAA	2	6	131296	131301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633032
1987	NC_011566	CTAA	2	8	131344	131351	50 %	25 %	0 %	25 %	212633032
1988	NC_011566	TATCTT	2	12	131354	131365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	212633032
1989	NC_011566	AAT	2	6	131432	131437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633032
1990	NC_011566	TGT	2	6	131487	131492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633032
1991	NC_011566	TTG	2	6	131595	131600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633032
1992	NC_011566	ATAG	2	8	131619	131626	50 %	25 %	25 %	0 %	212633032
1993	NC_011566	T	6	6	131675	131680	0 %	100 %	0 %	0 %	212633032
1994	NC_011566	AAGC	2	8	132189	132196	50 %	0 %	25 %	25 %	212633033
1995	NC_011566	TTTA	2	8	132202	132209	25 %	75 %	0 %	0 %	212633033
1996	NC_011566	TC	3	6	132245	132250	0 %	50 %	0 %	50 %	212633033
1997	NC_011566	TTC	2	6	132268	132273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633033
1998	NC_011566	TGC	2	6	132316	132321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633033
1999	NC_011566	GTG	2	6	132390	132395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633033
2000	NC_011566	TTG	2	6	132402	132407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633033

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