MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011566	TGT	2	6	31739	31744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632935
502	NC_011566	CTG	2	6	31951	31956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632936
503	NC_011566	TGA	2	6	32040	32045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632936
504	NC_011566	T	6	6	32141	32146	0 %	100 %	0 %	0 %	212632936
505	NC_011566	AAT	2	6	32197	32202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212632936
506	NC_011566	TAC	2	6	32233	32238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632936
507	NC_011566	GGCA	2	8	32304	32311	25 %	0 %	50 %	25 %	212632936
508	NC_011566	TGA	2	6	32336	32341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632936
509	NC_011566	T	6	6	32346	32351	0 %	100 %	0 %	0 %	212632936
510	NC_011566	GCC	2	6	32499	32504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212632937
511	NC_011566	GAA	2	6	32605	32610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212632937
512	NC_011566	CT	3	6	32640	32645	0 %	50 %	0 %	50 %	212632937
513	NC_011566	GATA	2	8	32651	32658	50 %	25 %	25 %	0 %	212632937
514	NC_011566	T	6	6	32876	32881	0 %	100 %	0 %	0 %	212632937
515	NC_011566	TGT	2	6	33220	33225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632938
516	NC_011566	TGT	2	6	33234	33239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632938
517	NC_011566	TAG	2	6	33274	33279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632938
518	NC_011566	AAG	2	6	33401	33406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212632938
519	NC_011566	TAT	2	6	33437	33442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632938
520	NC_011566	TAA	2	6	33445	33450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212632938
521	NC_011566	A	6	6	33449	33454	100 %	0 %	0 %	0 %	212632938
522	NC_011566	A	6	6	33656	33661	100 %	0 %	0 %	0 %	212632938
523	NC_011566	CCA	2	6	33789	33794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632938
524	NC_011566	GCT	2	6	33859	33864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632938
525	NC_011566	CTGC	2	8	33966	33973	0 %	25 %	25 %	50 %	212632939
526	NC_011566	CAA	2	6	33978	33983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632939
527	NC_011566	CAG	2	6	34100	34105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632940
528	NC_011566	CAG	2	6	34178	34183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632940
529	NC_011566	CAG	2	6	34215	34220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632940
530	NC_011566	CAG	2	6	34253	34258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632940
531	NC_011566	GCG	2	6	34307	34312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632940
532	NC_011566	CTC	2	6	34316	34321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212632940
533	NC_011566	CAA	2	6	34343	34348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632940
534	NC_011566	ACTC	2	8	34383	34390	25 %	25 %	0 %	50 %	212632940
535	NC_011566	TGG	2	6	34394	34399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632940
536	NC_011566	GAA	2	6	34402	34407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212632940
537	NC_011566	GAC	2	6	34417	34422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632940
538	NC_011566	GCA	2	6	34556	34561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632940
539	NC_011566	GAA	2	6	34582	34587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212632940
540	NC_011566	AAC	2	6	34643	34648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632940
541	NC_011566	TTAAT	2	10	34725	34734	40 %	60 %	0 %	0 %	212632940
542	NC_011566	ATT	2	6	34775	34780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632940
543	NC_011566	GCCAAT	2	12	34781	34792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212632940
544	NC_011566	CCG	2	6	34831	34836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212632940
545	NC_011566	A	6	6	34927	34932	100 %	0 %	0 %	0 %	212632941
546	NC_011566	TTG	2	6	34937	34942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632941
547	NC_011566	TGTT	2	8	34992	34999	0 %	75 %	25 %	0 %	212632941
548	NC_011566	TTA	2	6	35066	35071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632941
549	NC_011566	TCA	2	6	35130	35135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632941
550	NC_011566	TTG	2	6	35174	35179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632941
551	NC_011566	TAGCT	2	10	35184	35193	20 %	40 %	20 %	20 %	212632941
552	NC_011566	AGCG	2	8	35226	35233	25 %	0 %	50 %	25 %	212632941
553	NC_011566	TA	4	8	35235	35242	50 %	50 %	0 %	0 %	212632941
554	NC_011566	TC	3	6	35303	35308	0 %	50 %	0 %	50 %	212632941
555	NC_011566	GGC	2	6	35319	35324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632941
556	NC_011566	ACC	2	6	35485	35490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632941
557	NC_011566	TGA	2	6	35568	35573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632941
558	NC_011566	ATAGAA	2	12	35734	35745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	212632941
559	NC_011566	TTA	2	6	35771	35776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632941
560	NC_011566	AAACC	2	10	35797	35806	60 %	0 %	0 %	40 %	212632941
561	NC_011566	TTA	2	6	35816	35821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632941
562	NC_011566	GTG	2	6	35852	35857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632941
563	NC_011566	AAGTT	2	10	35867	35876	40 %	40 %	20 %	0 %	212632941
564	NC_011566	ATG	2	6	35924	35929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632941
565	NC_011566	ATTT	2	8	35963	35970	25 %	75 %	0 %	0 %	212632941
566	NC_011566	A	6	6	35992	35997	100 %	0 %	0 %	0 %	212632942
567	NC_011566	CAG	2	6	36008	36013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632942
568	NC_011566	TGG	2	6	36030	36035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632942
569	NC_011566	CAG	2	6	36067	36072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632942
570	NC_011566	AGTG	2	8	36102	36109	25 %	25 %	50 %	0 %	212632942
571	NC_011566	ATGTG	2	10	36123	36132	20 %	40 %	40 %	0 %	212632942
572	NC_011566	CCA	2	6	36212	36217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632942
573	NC_011566	ATG	2	6	36218	36223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632942
574	NC_011566	CAG	2	6	36241	36246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632942
575	NC_011566	CAAG	2	8	36273	36280	50 %	0 %	25 %	25 %	212632942
576	NC_011566	TGG	2	6	36414	36419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632942
577	NC_011566	TC	3	6	36468	36473	0 %	50 %	0 %	50 %	212632942
578	NC_011566	AGT	2	6	36477	36482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632942
579	NC_011566	GCC	2	6	36484	36489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212632942
580	NC_011566	AAGA	2	8	36496	36503	75 %	0 %	25 %	0 %	212632942
581	NC_011566	TAA	3	9	36525	36533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212632942
582	NC_011566	AGC	2	6	36537	36542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632942
583	NC_011566	ACG	2	6	36995	37000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632943
584	NC_011566	ACC	2	6	37033	37038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632943
585	NC_011566	GAA	2	6	37062	37067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212632943
586	NC_011566	AGC	2	6	37083	37088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632943
587	NC_011566	TTA	2	6	37115	37120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212632943
588	NC_011566	GCT	2	6	37144	37149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632943
589	NC_011566	GTA	2	6	37165	37170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632943
590	NC_011566	AACA	2	8	37214	37221	75 %	0 %	0 %	25 %	212632943
591	NC_011566	GATA	2	8	37239	37246	50 %	25 %	25 %	0 %	212632943
592	NC_011566	AGAAAA	2	12	37319	37330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	212632943
593	NC_011566	GAT	2	6	37372	37377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632943
594	NC_011566	GGC	2	6	37401	37406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632943
595	NC_011566	GA	3	6	37508	37513	50 %	0 %	50 %	0 %	212632943
596	NC_011566	ACG	2	6	37624	37629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212632943
597	NC_011566	ATG	2	6	37637	37642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632943
598	NC_011566	GTC	2	6	37677	37682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632943
599	NC_011566	AC	3	6	37694	37699	50 %	0 %	0 %	50 %	212632943
600	NC_011566	ATG	2	6	37772	37777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632943
601	NC_011566	ACA	2	6	37808	37813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632943
602	NC_011566	GGC	2	6	37872	37877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632943
603	NC_011566	TGA	2	6	37902	37907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632943
604	NC_011566	AGT	2	6	37972	37977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632943
605	NC_011566	GTC	2	6	38163	38168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632944
606	NC_011566	AAC	2	6	38185	38190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212632944
607	NC_011566	GTGG	2	8	38194	38201	0 %	25 %	75 %	0 %	212632944
608	NC_011566	CCA	2	6	38217	38222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632944
609	NC_011566	TCA	2	6	38325	38330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632944
610	NC_011566	TGC	2	6	38393	38398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632944
611	NC_011566	TCA	2	6	38604	38609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632944
612	NC_011566	CAT	2	6	38638	38643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632944
613	NC_011566	TGA	2	6	38706	38711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632944
614	NC_011566	TTG	2	6	38732	38737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632944
615	NC_011566	CAT	2	6	38786	38791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632944
616	NC_011566	ACC	2	6	38876	38881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212632944
617	NC_011566	TGC	2	6	38921	38926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632944
618	NC_011566	TGA	2	6	38928	38933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632944
619	NC_011566	TGC	2	6	39008	39013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632944
620	NC_011566	CACAT	2	10	39063	39072	40 %	20 %	0 %	40 %	212632944
621	NC_011566	TCA	2	6	39121	39126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212632944
622	NC_011566	AG	4	8	39134	39141	50 %	0 %	50 %	0 %	212632944
623	NC_011566	CTG	2	6	39251	39256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212632945
624	NC_011566	GTA	2	6	39257	39262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212632945
625	NC_011566	TTG	2	6	39270	39275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212632945
626	NC_011566	GCG	2	6	39276	39281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212632945
627	NC_011566	TGG	2	6	39401	39406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212632945
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