MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011566	AAACGT	2	12	390319	390330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	212633280
6002	NC_011566	CTGCT	2	10	390359	390368	0 %	40 %	20 %	40 %	212633280
6003	NC_011566	TAT	2	6	390377	390382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633280
6004	NC_011566	CTG	2	6	390393	390398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633280
6005	NC_011566	GCT	2	6	390470	390475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633280
6006	NC_011566	TGT	2	6	390501	390506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633280
6007	NC_011566	CTTA	2	8	390507	390514	25 %	50 %	0 %	25 %	212633280
6008	NC_011566	AAT	2	6	390520	390525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633280
6009	NC_011566	GCG	2	6	390536	390541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633280
6010	NC_011566	CCA	2	6	390563	390568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633280
6011	NC_011566	TTC	2	6	390618	390623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633280
6012	NC_011566	TCA	2	6	390697	390702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633280
6013	NC_011566	AGT	2	6	390709	390714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633280
6014	NC_011566	ATG	2	6	390746	390751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633280
6015	NC_011566	GCTT	2	8	390765	390772	0 %	50 %	25 %	25 %	212633280
6016	NC_011566	TGC	2	6	390790	390795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633280
6017	NC_011566	GT	3	6	390854	390859	0 %	50 %	50 %	0 %	212633280
6018	NC_011566	ATA	2	6	390973	390978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633280
6019	NC_011566	CAC	2	6	390987	390992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633280
6020	NC_011566	GA	4	8	390999	391006	50 %	0 %	50 %	0 %	212633280
6021	NC_011566	T	6	6	391014	391019	0 %	100 %	0 %	0 %	212633280
6022	NC_011566	CTT	2	6	391142	391147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633281
6023	NC_011566	CGT	2	6	391189	391194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633281
6024	NC_011566	TGC	3	9	391328	391336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633281
6025	NC_011566	GTA	2	6	391396	391401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633281
6026	NC_011566	AGCA	2	8	391415	391422	50 %	0 %	25 %	25 %	212633281
6027	NC_011566	ATC	2	6	391454	391459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633281
6028	NC_011566	TCA	2	6	391485	391490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633281
6029	NC_011566	CTT	2	6	391546	391551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633281
6030	NC_011566	CTC	2	6	391613	391618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633281
6031	NC_011566	ATT	2	6	391752	391757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633281
6032	NC_011566	CCAG	2	8	391768	391775	25 %	0 %	25 %	50 %	212633282
6033	NC_011566	CTTTG	2	10	391781	391790	0 %	60 %	20 %	20 %	212633282
6034	NC_011566	TGC	2	6	391904	391909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633282
6035	NC_011566	TTCC	2	8	391917	391924	0 %	50 %	0 %	50 %	212633282
6036	NC_011566	ACA	2	6	391953	391958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633282
6037	NC_011566	ATA	2	6	391998	392003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633282
6038	NC_011566	TGAT	2	8	392167	392174	25 %	50 %	25 %	0 %	212633283
6039	NC_011566	A	6	6	392180	392185	100 %	0 %	0 %	0 %	212633283
6040	NC_011566	CTGT	2	8	392214	392221	0 %	50 %	25 %	25 %	212633283
6041	NC_011566	TCA	2	6	392226	392231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633283
6042	NC_011566	TGAA	2	8	392314	392321	50 %	25 %	25 %	0 %	212633283
6043	NC_011566	GCA	2	6	392361	392366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633283
6044	NC_011566	TAGCG	2	10	392390	392399	20 %	20 %	40 %	20 %	212633283
6045	NC_011566	TTC	2	6	392582	392587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633283
6046	NC_011566	TAGG	2	8	392594	392601	25 %	25 %	50 %	0 %	212633283
6047	NC_011566	GGC	2	6	392672	392677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633283
6048	NC_011566	TGA	2	6	392745	392750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633283
6049	NC_011566	CAA	2	6	392758	392763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633283
6050	NC_011566	A	6	6	392762	392767	100 %	0 %	0 %	0 %	212633283
6051	NC_011566	ATAC	2	8	392780	392787	50 %	25 %	0 %	25 %	212633283
6052	NC_011566	TAA	2	6	392795	392800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633283
6053	NC_011566	TGG	2	6	392817	392822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633283
6054	NC_011566	GCC	2	6	392882	392887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633283
6055	NC_011566	TCA	2	6	392901	392906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633283
6056	NC_011566	GA	3	6	393010	393015	50 %	0 %	50 %	0 %	212633283
6057	NC_011566	TGT	2	6	393481	393486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633284
6058	NC_011566	CTG	2	6	393562	393567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633284
6059	NC_011566	TCA	2	6	393577	393582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633284
6060	NC_011566	TA	3	6	393737	393742	50 %	50 %	0 %	0 %	212633284
6061	NC_011566	CT	3	6	393774	393779	0 %	50 %	0 %	50 %	212633284
6062	NC_011566	TGA	2	6	393814	393819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633284
6063	NC_011566	TCTA	2	8	393876	393883	25 %	50 %	0 %	25 %	212633284
6064	NC_011566	TCT	2	6	393980	393985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633284
6065	NC_011566	GCT	2	6	394092	394097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633284
6066	NC_011566	GCT	2	6	394130	394135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633284
6067	NC_011566	TACT	2	8	394330	394337	25 %	50 %	0 %	25 %	212633284
6068	NC_011566	AAC	2	6	394447	394452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633284
6069	NC_011566	TACT	2	8	394483	394490	25 %	50 %	0 %	25 %	212633284
6070	NC_011566	CAT	2	6	394572	394577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633284
6071	NC_011566	AT	3	6	394576	394581	50 %	50 %	0 %	0 %	212633284
6072	NC_011566	TTTC	2	8	394620	394627	0 %	75 %	0 %	25 %	212633284
6073	NC_011566	GA	3	6	394650	394655	50 %	0 %	50 %	0 %	212633284
6074	NC_011566	CAC	2	6	394701	394706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633284
6075	NC_011566	CGAG	2	8	394825	394832	25 %	0 %	50 %	25 %	212633284
6076	NC_011566	ATA	2	6	394834	394839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633284
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6078	NC_011566	ATCC	2	8	394948	394955	25 %	25 %	0 %	50 %	212633284
6079	NC_011566	TTG	2	6	395052	395057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633284
6080	NC_011566	AGTT	2	8	395076	395083	25 %	50 %	25 %	0 %	212633284
6081	NC_011566	CTT	2	6	395087	395092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633284
6082	NC_011566	GCC	2	6	395100	395105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633284
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6085	NC_011566	TTG	2	6	395197	395202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633284
6086	NC_011566	ACT	2	6	395272	395277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633284
6087	NC_011566	GT	3	6	395300	395305	0 %	50 %	50 %	0 %	212633284
6088	NC_011566	ACT	2	6	395335	395340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633285
6089	NC_011566	TTTAG	2	10	395346	395355	20 %	60 %	20 %	0 %	212633285
6090	NC_011566	TTTA	2	8	395450	395457	25 %	75 %	0 %	0 %	212633285
6091	NC_011566	AGG	2	6	395560	395565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212633285
6092	NC_011566	ATA	2	6	395573	395578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633285
6093	NC_011566	TCT	2	6	395640	395645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633285
6094	NC_011566	CAC	3	9	395701	395709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633285
6095	NC_011566	AAT	2	6	395740	395745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633285
6096	NC_011566	ATC	2	6	395768	395773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633285
6097	NC_011566	A	7	7	395792	395798	100 %	0 %	0 %	0 %	212633285
6098	NC_011566	TTA	2	6	395799	395804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633285
6099	NC_011566	T	7	7	396011	396017	0 %	100 %	0 %	0 %	212633285
6100	NC_011566	TA	4	8	396091	396098	50 %	50 %	0 %	0 %	212633286
6101	NC_011566	CGG	2	6	396112	396117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633286
6102	NC_011566	GTC	2	6	396122	396127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633286
6103	NC_011566	TG	3	6	396163	396168	0 %	50 %	50 %	0 %	212633286
6104	NC_011566	CTG	2	6	396169	396174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633286
6105	NC_011566	AGT	2	6	396258	396263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633286
6106	NC_011566	CACT	2	8	396265	396272	25 %	25 %	0 %	50 %	212633286
6107	NC_011566	TAC	2	6	396325	396330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633286
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6109	NC_011566	ATCG	2	8	396497	396504	25 %	25 %	25 %	25 %	212633286
6110	NC_011566	CAA	2	6	396541	396546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633286
6111	NC_011566	CAT	2	6	396553	396558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633286
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6117	NC_011566	AGT	2	6	396807	396812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633287
6118	NC_011566	TCT	2	6	396942	396947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633287
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6122	NC_011566	GTT	2	6	397126	397131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633287
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6240	NC_011566	TTG	2	6	403501	403506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633290
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6479	NC_011566	CGA	2	6	415540	415545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633292
6480	NC_011566	GCA	2	6	415623	415628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633292
6481	NC_011566	TCA	2	6	415794	415799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633292
6482	NC_011566	ACC	2	6	415823	415828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633292
6483	NC_011566	CTG	2	6	415858	415863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633292
6484	NC_011566	GGC	2	6	415919	415924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633292
6485	NC_011566	TAAG	2	8	416083	416090	50 %	25 %	25 %	0 %	212633292
6486	NC_011566	TAA	2	6	416140	416145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633292
6487	NC_011566	CAT	2	6	416195	416200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633292
6488	NC_011566	TCT	2	6	416499	416504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633293
6489	NC_011566	CCA	2	6	416601	416606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633293
6490	NC_011566	GCT	2	6	416705	416710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633293
6491	NC_011566	GCT	2	6	416786	416791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633293
6492	NC_011566	GCA	2	6	416795	416800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633293
6493	NC_011566	TTCG	2	8	416873	416880	0 %	50 %	25 %	25 %	212633293
6494	NC_011566	AT	3	6	416981	416986	50 %	50 %	0 %	0 %	212633293
6495	NC_011566	T	6	6	417003	417008	0 %	100 %	0 %	0 %	212633293
6496	NC_011566	TGC	2	6	417049	417054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633293
6497	NC_011566	TA	3	6	417059	417064	50 %	50 %	0 %	0 %	212633293
6498	NC_011566	GCTTT	2	10	417091	417100	0 %	60 %	20 %	20 %	212633293
6499	NC_011566	CAA	2	6	417159	417164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633293
6500	NC_011566	GCGGGT	2	12	417168	417179	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	212633293

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