MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella piezotolerans WP3 chromosome

Total Repeats: 83278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011566	ATA	2	6	293207	293212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633184
4502	NC_011566	GATC	2	8	293250	293257	25 %	25 %	25 %	25 %	212633184
4503	NC_011566	GCA	2	6	293303	293308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633184
4504	NC_011566	AACTT	2	10	293345	293354	40 %	40 %	0 %	20 %	212633184
4505	NC_011566	AG	3	6	293371	293376	50 %	0 %	50 %	0 %	212633184
4506	NC_011566	G	6	6	293378	293383	0 %	0 %	100 %	0 %	212633184
4507	NC_011566	TTG	2	6	293414	293419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633184
4508	NC_011566	GA	3	6	293923	293928	50 %	0 %	50 %	0 %	212633185
4509	NC_011566	GAT	2	6	293970	293975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633185
4510	NC_011566	TGA	2	6	294007	294012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633185
4511	NC_011566	GGC	2	6	294069	294074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633185
4512	NC_011566	GTG	2	6	294084	294089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633185
4513	NC_011566	TTG	2	6	294187	294192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633185
4514	NC_011566	TCTA	2	8	294200	294207	25 %	50 %	0 %	25 %	212633185
4515	NC_011566	AC	3	6	294217	294222	50 %	0 %	0 %	50 %	212633185
4516	NC_011566	TGC	2	6	294236	294241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633185
4517	NC_011566	A	6	6	294350	294355	100 %	0 %	0 %	0 %	212633186
4518	NC_011566	ACA	3	9	294531	294539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633186
4519	NC_011566	A	6	6	294754	294759	100 %	0 %	0 %	0 %	212633186
4520	NC_011566	CAC	2	6	295030	295035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633187
4521	NC_011566	ATCA	2	8	295157	295164	50 %	25 %	0 %	25 %	212633187
4522	NC_011566	T	6	6	295404	295409	0 %	100 %	0 %	0 %	212633188
4523	NC_011566	GCC	2	6	295431	295436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633188
4524	NC_011566	GTT	2	6	295446	295451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633188
4525	NC_011566	TCA	2	6	295454	295459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633188
4526	NC_011566	AGTC	2	8	295463	295470	25 %	25 %	25 %	25 %	212633188
4527	NC_011566	TCA	2	6	295565	295570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633188
4528	NC_011566	GAT	2	6	295639	295644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633188
4529	NC_011566	CTA	2	6	295847	295852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633188
4530	NC_011566	TGG	2	6	295997	296002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633188
4531	NC_011566	CCG	2	6	296050	296055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633188
4532	NC_011566	CTG	2	6	296137	296142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633188
4533	NC_011566	GTG	2	6	296143	296148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633188
4534	NC_011566	TG	4	8	296196	296203	0 %	50 %	50 %	0 %	212633188
4535	NC_011566	CAT	2	6	296205	296210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633188
4536	NC_011566	TAA	2	6	296333	296338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633188
4537	NC_011566	GTC	2	6	296343	296348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633188
4538	NC_011566	AGT	2	6	296435	296440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633188
4539	NC_011566	CA	3	6	296523	296528	50 %	0 %	0 %	50 %	212633188
4540	NC_011566	TTC	2	6	296530	296535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633188
4541	NC_011566	GCA	2	6	296676	296681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633189
4542	NC_011566	AAG	2	6	296694	296699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212633189
4543	NC_011566	ATG	2	6	296874	296879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633189
4544	NC_011566	GCCTT	2	10	296960	296969	0 %	40 %	20 %	40 %	212633189
4545	NC_011566	TGT	2	6	297123	297128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633189
4546	NC_011566	GCT	2	6	297156	297161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633189
4547	NC_011566	GCT	2	6	297208	297213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633189
4548	NC_011566	GCG	2	6	297237	297242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633189
4549	NC_011566	ATA	2	6	297254	297259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633189
4550	NC_011566	TAAT	2	8	297334	297341	50 %	50 %	0 %	0 %	212633189
4551	NC_011566	ACATTA	2	12	297477	297488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	212633190
4552	NC_011566	TAT	2	6	297508	297513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633190
4553	NC_011566	CAG	2	6	297635	297640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633190
4554	NC_011566	TAA	2	6	297652	297657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633190
4555	NC_011566	GGC	2	6	297692	297697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633190
4556	NC_011566	AT	3	6	297711	297716	50 %	50 %	0 %	0 %	212633190
4557	NC_011566	TCA	2	6	297753	297758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633190
4558	NC_011566	TGC	2	6	297772	297777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633190
4559	NC_011566	TGAG	2	8	297789	297796	25 %	25 %	50 %	0 %	212633190
4560	NC_011566	TCGC	2	8	297911	297918	0 %	25 %	25 %	50 %	212633191
4561	NC_011566	GTT	2	6	297922	297927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633191
4562	NC_011566	GCC	2	6	297963	297968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	212633191
4563	NC_011566	ATT	2	6	298041	298046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633191
4564	NC_011566	TTG	2	6	298053	298058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633191
4565	NC_011566	AGT	2	6	298108	298113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633191
4566	NC_011566	CTG	2	6	298142	298147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633191
4567	NC_011566	TGG	2	6	298191	298196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633191
4568	NC_011566	ATG	2	6	298197	298202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633191
4569	NC_011566	CAT	2	6	298238	298243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633191
4570	NC_011566	ATTGC	2	10	298319	298328	20 %	40 %	20 %	20 %	212633191
4571	NC_011566	GC	4	8	298426	298433	0 %	0 %	50 %	50 %	212633191
4572	NC_011566	CAA	2	6	298571	298576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633191
4573	NC_011566	TGC	2	6	298723	298728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633191
4574	NC_011566	CTG	2	6	298742	298747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633191
4575	NC_011566	GAT	2	6	298818	298823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633191
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4577	NC_011566	ATT	2	6	298908	298913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633191
4578	NC_011566	GCT	2	6	298959	298964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633191
4579	NC_011566	GTC	2	6	299001	299006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633191
4580	NC_011566	TTA	2	6	299044	299049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633191
4581	NC_011566	CGG	2	6	299054	299059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633191
4582	NC_011566	TATTGC	2	12	299100	299111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212633191
4583	NC_011566	TGA	3	9	299158	299166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633192
4584	NC_011566	TA	3	6	299324	299329	50 %	50 %	0 %	0 %	212633192
4585	NC_011566	TGAT	2	8	299346	299353	25 %	50 %	25 %	0 %	212633192
4586	NC_011566	TGA	2	6	299448	299453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633192
4587	NC_011566	AGTG	2	8	299462	299469	25 %	25 %	50 %	0 %	212633192
4588	NC_011566	AAT	2	6	299472	299477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633192
4589	NC_011566	CTG	2	6	299513	299518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633192
4590	NC_011566	GCA	2	6	299520	299525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633192
4591	NC_011566	TAA	2	6	299540	299545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633192
4592	NC_011566	TGG	2	6	299572	299577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633192
4593	NC_011566	AAT	2	6	299600	299605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633192
4594	NC_011566	AAT	2	6	299650	299655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633192
4595	NC_011566	GTCT	2	8	299682	299689	0 %	50 %	25 %	25 %	212633192
4596	NC_011566	AGC	3	9	299718	299726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633192
4597	NC_011566	CAA	2	6	299728	299733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633192
4598	NC_011566	ATC	2	6	299858	299863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633193
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4601	NC_011566	GGT	2	6	300136	300141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633193
4602	NC_011566	TAA	2	6	300199	300204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633193
4603	NC_011566	GA	3	6	300225	300230	50 %	0 %	50 %	0 %	212633193
4604	NC_011566	CAT	2	6	300246	300251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633193
4605	NC_011566	CCA	2	6	300291	300296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633193
4606	NC_011566	TAA	2	6	300369	300374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212633193
4607	NC_011566	CGTG	2	8	300436	300443	0 %	25 %	50 %	25 %	212633193
4608	NC_011566	CGTT	2	8	300576	300583	0 %	50 %	25 %	25 %	212633193
4609	NC_011566	CTTG	2	8	300627	300634	0 %	50 %	25 %	25 %	212633193
4610	NC_011566	GGT	2	6	300727	300732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212633193
4611	NC_011566	GCG	2	6	300755	300760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633193
4612	NC_011566	TTGA	2	8	300784	300791	25 %	50 %	25 %	0 %	212633193
4613	NC_011566	CAG	2	6	300830	300835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633193
4614	NC_011566	GCA	2	6	300912	300917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633193
4615	NC_011566	GCA	2	6	300923	300928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633193
4616	NC_011566	CTT	2	6	300969	300974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633193
4617	NC_011566	GA	3	6	301049	301054	50 %	0 %	50 %	0 %	212633194
4618	NC_011566	TAG	2	6	301080	301085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633194
4619	NC_011566	CAT	2	6	301176	301181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633194
4620	NC_011566	A	6	6	301212	301217	100 %	0 %	0 %	0 %	212633194
4621	NC_011566	CGATAC	2	12	301229	301240	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	212633194
4622	NC_011566	CAGC	2	8	301397	301404	25 %	0 %	25 %	50 %	212633194
4623	NC_011566	TCA	2	6	301445	301450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633194
4624	NC_011566	CTG	3	9	301610	301618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633194
4625	NC_011566	CT	3	6	301693	301698	0 %	50 %	0 %	50 %	212633194
4626	NC_011566	TAGA	2	8	301737	301744	50 %	25 %	25 %	0 %	212633194
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4632	NC_011566	ATC	2	6	302004	302009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633194
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4635	NC_011566	TAAG	2	8	302202	302209	50 %	25 %	25 %	0 %	212633194
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4862	NC_011566	ATG	2	6	314916	314921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633208
4863	NC_011566	CGG	2	6	314975	314980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633208
4864	NC_011566	GCA	2	6	314997	315002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633208
4865	NC_011566	CTC	2	6	315025	315030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212633208
4866	NC_011566	GCT	2	6	315042	315047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633208
4867	NC_011566	ATT	2	6	315091	315096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633208
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4870	NC_011566	CAT	2	6	315190	315195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633208
4871	NC_011566	GCTT	2	8	315227	315234	0 %	50 %	25 %	25 %	212633208
4872	NC_011566	GTT	2	6	315245	315250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633208
4873	NC_011566	TCA	2	6	315290	315295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633208
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4875	NC_011566	CGG	2	6	315347	315352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633208
4876	NC_011566	ATC	2	6	315445	315450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633208
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4878	NC_011566	TAGCG	2	10	315578	315587	20 %	20 %	40 %	20 %	212633208
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4882	NC_011566	AGCC	2	8	315786	315793	25 %	0 %	25 %	50 %	212633209
4883	NC_011566	TTG	2	6	315797	315802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212633209
4884	NC_011566	GGC	2	6	315812	315817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633209
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4886	NC_011566	GCA	2	6	315900	315905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633209
4887	NC_011566	ACCG	2	8	315980	315987	25 %	0 %	25 %	50 %	212633209
4888	NC_011566	TGCC	2	8	316021	316028	0 %	25 %	25 %	50 %	212633209
4889	NC_011566	CCA	2	6	316086	316091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212633209
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4891	NC_011566	TGA	2	6	316141	316146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633209
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4893	NC_011566	ACA	2	6	316318	316323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633209
4894	NC_011566	AGTG	2	8	316440	316447	25 %	25 %	50 %	0 %	212633210
4895	NC_011566	CAT	2	6	316520	316525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633210
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4898	NC_011566	CTTG	2	8	316828	316835	0 %	50 %	25 %	25 %	212633210
4899	NC_011566	ATT	2	6	316845	316850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633210
4900	NC_011566	GATG	2	8	316887	316894	25 %	25 %	50 %	0 %	212633210
4901	NC_011566	ATG	2	6	316909	316914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212633210
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4934	NC_011566	CAA	2	6	318723	318728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633212
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4939	NC_011566	CAG	2	6	318801	318806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212633212
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4945	NC_011566	ACTG	2	8	319072	319079	25 %	25 %	25 %	25 %	212633212
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4955	NC_011566	TCT	2	6	319925	319930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212633213
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4963	NC_011566	ATCT	2	8	320472	320479	25 %	50 %	0 %	25 %	212633213
4964	NC_011566	TAGC	2	8	320528	320535	25 %	25 %	25 %	25 %	212633213
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4968	NC_011566	AGAA	2	8	320896	320903	75 %	0 %	25 %	0 %	212633213
4969	NC_011566	TGC	2	6	320957	320962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633213
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4974	NC_011566	CAA	2	6	321395	321400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212633214
4975	NC_011566	GCG	2	6	321441	321446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	212633214
4976	NC_011566	AT	3	6	321459	321464	50 %	50 %	0 %	0 %	212633214
4977	NC_011566	TCA	2	6	321505	321510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212633214
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4980	NC_011566	ATT	2	6	321942	321947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212633214
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4982	NC_011566	TGC	2	6	322172	322177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212633215
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