MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 85024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011294	GCTG	2	8	208565	208572	0 %	25 %	50 %	25 %	207855691
4002	NC_011294	CGG	2	6	208658	208663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855691
4003	NC_011294	TCG	2	6	208825	208830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
4004	NC_011294	CCT	2	6	208898	208903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	207855691
4005	NC_011294	CGG	2	6	208914	208919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855691
4006	NC_011294	GTT	2	6	208935	208940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855691
4007	NC_011294	GCTG	2	8	208997	209004	0 %	25 %	50 %	25 %	207855691
4008	NC_011294	TATTGA	2	12	209183	209194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	207855691
4009	NC_011294	CG	3	6	209309	209314	0 %	0 %	50 %	50 %	207855691
4010	NC_011294	GT	3	6	209325	209330	0 %	50 %	50 %	0 %	207855691
4011	NC_011294	TGC	2	6	209336	209341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
4012	NC_011294	AC	3	6	209352	209357	50 %	0 %	0 %	50 %	207855691
4013	NC_011294	AGCGC	2	10	209358	209367	20 %	0 %	40 %	40 %	207855691
4014	NC_011294	ATAA	2	8	209369	209376	75 %	25 %	0 %	0 %	207855691
4015	NC_011294	GTTT	2	8	209436	209443	0 %	75 %	25 %	0 %	207855692
4016	NC_011294	TGA	2	6	209473	209478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855692
4017	NC_011294	GGC	3	9	209501	209509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855692
4018	NC_011294	ATA	2	6	209600	209605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855692
4019	NC_011294	TTC	2	6	209616	209621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855692
4020	NC_011294	ATCG	2	8	209656	209663	25 %	25 %	25 %	25 %	207855692
4021	NC_011294	GT	3	6	209740	209745	0 %	50 %	50 %	0 %	207855692
4022	NC_011294	TGC	2	6	209764	209769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855692
4023	NC_011294	CCAG	2	8	209788	209795	25 %	0 %	25 %	50 %	207855692
4024	NC_011294	CCG	2	6	209826	209831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855692
4025	NC_011294	T	7	7	209853	209859	0 %	100 %	0 %	0 %	207855692
4026	NC_011294	GCG	2	6	209881	209886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855692
4027	NC_011294	CAA	2	6	210078	210083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855692
4028	NC_011294	GCGG	2	8	210235	210242	0 %	0 %	75 %	25 %	207855693
4029	NC_011294	CTG	2	6	210273	210278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855693
4030	NC_011294	CAT	2	6	210372	210377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855693
4031	NC_011294	GC	3	6	210427	210432	0 %	0 %	50 %	50 %	207855693
4032	NC_011294	CTG	2	6	210440	210445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855693
4033	NC_011294	AG	3	6	210521	210526	50 %	0 %	50 %	0 %	207855693
4034	NC_011294	TTC	2	6	210532	210537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855693
4035	NC_011294	GCG	2	6	210638	210643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855693
4036	NC_011294	GGC	2	6	210658	210663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855693
4037	NC_011294	AGTG	2	8	210673	210680	25 %	25 %	50 %	0 %	207855693
4038	NC_011294	AAG	2	6	211132	211137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855694
4039	NC_011294	ATG	2	6	211207	211212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855694
4040	NC_011294	TG	3	6	211211	211216	0 %	50 %	50 %	0 %	207855694
4041	NC_011294	CGGCG	2	10	211272	211281	0 %	0 %	60 %	40 %	207855694
4042	NC_011294	TGA	2	6	211301	211306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855694
4043	NC_011294	GGA	2	6	211359	211364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855694
4044	NC_011294	GC	3	6	211427	211432	0 %	0 %	50 %	50 %	207855694
4045	NC_011294	CAG	3	9	211456	211464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855694
4046	NC_011294	TGC	2	6	211484	211489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855694
4047	NC_011294	AT	3	6	211567	211572	50 %	50 %	0 %	0 %	207855695
4048	NC_011294	GTT	2	6	211583	211588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855695
4049	NC_011294	ACG	2	6	211652	211657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855695
4050	NC_011294	GCC	2	6	211664	211669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855695
4051	NC_011294	ATT	2	6	211755	211760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855695
4052	NC_011294	TGG	2	6	211950	211955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855695
4053	NC_011294	ATT	2	6	211973	211978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855695
4054	NC_011294	GGCT	2	8	212034	212041	0 %	25 %	50 %	25 %	207855695
4055	NC_011294	ATC	2	6	212094	212099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855695
4056	NC_011294	TGA	2	6	212110	212115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855695
4057	NC_011294	CCA	2	6	212142	212147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855695
4058	NC_011294	TTCGG	2	10	212152	212161	0 %	40 %	40 %	20 %	207855695
4059	NC_011294	GGA	2	6	212227	212232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855695
4060	NC_011294	GC	4	8	212261	212268	0 %	0 %	50 %	50 %	207855695
4061	NC_011294	TGA	2	6	212284	212289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855695
4062	NC_011294	TAT	2	6	212359	212364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855695
4063	NC_011294	T	6	6	212479	212484	0 %	100 %	0 %	0 %	207855695
4064	NC_011294	CGC	2	6	212504	212509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855695
4065	NC_011294	TA	3	6	212517	212522	50 %	50 %	0 %	0 %	207855695
4066	NC_011294	ATA	2	6	212535	212540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855695
4067	NC_011294	CA	3	6	212575	212580	50 %	0 %	0 %	50 %	207855695
4068	NC_011294	TCTT	2	8	212602	212609	0 %	75 %	0 %	25 %	207855695
4069	NC_011294	GGC	2	6	212618	212623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855695
4070	NC_011294	AGC	2	6	212644	212649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855695
4071	NC_011294	CAC	2	6	212677	212682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855695
4072	NC_011294	TGC	2	6	212718	212723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855695
4073	NC_011294	CTT	2	6	212896	212901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855696
4074	NC_011294	GCC	2	6	212961	212966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855696
4075	NC_011294	GAT	2	6	212981	212986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855696
4076	NC_011294	CTTGC	2	10	213161	213170	0 %	40 %	20 %	40 %	207855696
4077	NC_011294	GGC	3	9	213336	213344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855697
4078	NC_011294	GTC	2	6	213411	213416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4079	NC_011294	TTCA	2	8	213432	213439	25 %	50 %	0 %	25 %	207855697
4080	NC_011294	GGCAAT	2	12	213450	213461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	207855697
4081	NC_011294	TCA	2	6	213512	213517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855697
4082	NC_011294	GCT	2	6	213545	213550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4083	NC_011294	TGAGC	2	10	213573	213582	20 %	20 %	40 %	20 %	207855697
4084	NC_011294	AAT	2	6	213603	213608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855697
4085	NC_011294	CGA	2	6	213617	213622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4086	NC_011294	CCA	2	6	213647	213652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855697
4087	NC_011294	CGC	2	6	213749	213754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855697
4088	NC_011294	AG	3	6	213792	213797	50 %	0 %	50 %	0 %	207855697
4089	NC_011294	ACGT	2	8	213811	213818	25 %	25 %	25 %	25 %	207855697
4090	NC_011294	CCGG	2	8	213941	213948	0 %	0 %	50 %	50 %	207855697
4091	NC_011294	CAC	2	6	213984	213989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855697
4092	NC_011294	CGT	2	6	214031	214036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4093	NC_011294	TGG	2	6	214049	214054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855697
4094	NC_011294	GAC	2	6	214088	214093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4095	NC_011294	GCA	2	6	214106	214111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855697
4096	NC_011294	CAA	2	6	214136	214141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855697
4097	NC_011294	TTC	2	6	214277	214282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855698
4098	NC_011294	CTG	2	6	214319	214324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855698
4099	NC_011294	CGG	2	6	214327	214332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855698
4100	NC_011294	CGCC	2	8	214342	214349	0 %	0 %	25 %	75 %	207855698
4101	NC_011294	GCC	2	6	214385	214390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855698
4102	NC_011294	GCCGAT	2	12	214448	214459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	207855698
4103	NC_011294	GCAC	2	8	214507	214514	25 %	0 %	25 %	50 %	207855698
4104	NC_011294	CCAGCA	2	12	214516	214527	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	207855698
4105	NC_011294	CAG	2	6	214565	214570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855698
4106	NC_011294	CGC	2	6	214585	214590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855698
4107	NC_011294	GCC	2	6	214607	214612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855698
4108	NC_011294	CCAG	2	8	214696	214703	25 %	0 %	25 %	50 %	207855698
4109	NC_011294	GCC	2	6	214706	214711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855698
4110	NC_011294	CGCA	2	8	214736	214743	25 %	0 %	25 %	50 %	207855698
4111	NC_011294	GC	3	6	214825	214830	0 %	0 %	50 %	50 %	207855698
4112	NC_011294	GCACG	2	10	214837	214846	20 %	0 %	40 %	40 %	207855698
4113	NC_011294	TCG	2	6	214947	214952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855698
4114	NC_011294	T	6	6	215003	215008	0 %	100 %	0 %	0 %	207855698
4115	NC_011294	CTTG	2	8	215011	215018	0 %	50 %	25 %	25 %	207855698
4116	NC_011294	GCA	2	6	215026	215031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855698
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4118	NC_011294	GCA	2	6	215193	215198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855699
4119	NC_011294	AGATC	2	10	215242	215251	40 %	20 %	20 %	20 %	207855699
4120	NC_011294	TTC	2	6	215447	215452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855699
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4122	NC_011294	GAA	2	6	215538	215543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855699
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4365	NC_011294	AGCA	2	8	226589	226596	50 %	0 %	25 %	25 %	207855707
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4486	NC_011294	CGG	2	6	231478	231483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855710
4487	NC_011294	GC	3	6	231505	231510	0 %	0 %	50 %	50 %	207855710
4488	NC_011294	A	8	8	231547	231554	100 %	0 %	0 %	0 %	207855710
4489	NC_011294	CAG	2	6	232492	232497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855711
4490	NC_011294	TGC	2	6	232511	232516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855711
4491	NC_011294	TGC	2	6	232550	232555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855711
4492	NC_011294	CGA	2	6	232625	232630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855711
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