MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 85024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011294	CAA	2	6	184360	184365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855670
3502	NC_011294	GCC	2	6	184366	184371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855670
3503	NC_011294	TCA	2	6	184568	184573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855671
3504	NC_011294	GGCCA	2	10	184597	184606	20 %	0 %	40 %	40 %	207855671
3505	NC_011294	GCGCC	2	10	184610	184619	0 %	0 %	40 %	60 %	207855671
3506	NC_011294	CGT	2	6	184625	184630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855671
3507	NC_011294	ATA	2	6	184639	184644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855671
3508	NC_011294	TTGG	2	8	184726	184733	0 %	50 %	50 %	0 %	207855671
3509	NC_011294	GTAA	2	8	184796	184803	50 %	25 %	25 %	0 %	207855671
3510	NC_011294	CTG	2	6	184809	184814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855671
3511	NC_011294	GCAT	2	8	184828	184835	25 %	25 %	25 %	25 %	207855671
3512	NC_011294	GCC	2	6	184897	184902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855671
3513	NC_011294	GCC	2	6	184917	184922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855671
3514	NC_011294	TCA	2	6	184931	184936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855671
3515	NC_011294	TCT	2	6	184957	184962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855671
3516	NC_011294	CGG	2	6	185064	185069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855671
3517	NC_011294	GCC	2	6	185078	185083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855671
3518	NC_011294	CGTTT	2	10	185112	185121	0 %	60 %	20 %	20 %	207855671
3519	NC_011294	T	6	6	185119	185124	0 %	100 %	0 %	0 %	207855671
3520	NC_011294	CCG	2	6	185132	185137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855671
3521	NC_011294	GGC	2	6	185151	185156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855671
3522	NC_011294	GGGGA	2	10	185164	185173	20 %	0 %	80 %	0 %	207855671
3523	NC_011294	ATG	2	6	185271	185276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855672
3524	NC_011294	CG	3	6	185293	185298	0 %	0 %	50 %	50 %	207855672
3525	NC_011294	GCG	3	9	185296	185304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855672
3526	NC_011294	GCG	2	6	185441	185446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855672
3527	NC_011294	GGCG	2	8	185465	185472	0 %	0 %	75 %	25 %	207855672
3528	NC_011294	TC	3	6	185476	185481	0 %	50 %	0 %	50 %	207855672
3529	NC_011294	TGT	2	6	185485	185490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855672
3530	NC_011294	TGC	2	6	185500	185505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3531	NC_011294	TGC	3	9	185533	185541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3532	NC_011294	GTG	2	6	185542	185547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3533	NC_011294	CTG	2	6	185562	185567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3534	NC_011294	CGC	2	6	185568	185573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3535	NC_011294	CGA	2	6	185578	185583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3536	NC_011294	CTG	2	6	185584	185589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3537	NC_011294	ATT	2	6	185616	185621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855672
3538	NC_011294	CTG	2	6	185643	185648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3539	NC_011294	GCC	2	6	185653	185658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3540	NC_011294	AAG	2	6	185693	185698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855672
3541	NC_011294	GCC	2	6	185737	185742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3542	NC_011294	TGC	2	6	185773	185778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3543	NC_011294	CGC	2	6	185792	185797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3544	NC_011294	TGG	2	6	185804	185809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3545	NC_011294	TAT	2	6	185831	185836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855672
3546	NC_011294	TGC	2	6	185872	185877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3547	NC_011294	ATT	2	6	185925	185930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855672
3548	NC_011294	ACC	2	6	185973	185978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855672
3549	NC_011294	ATG	2	6	185979	185984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855672
3550	NC_011294	ATC	3	9	185988	185996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855672
3551	NC_011294	TGG	2	6	185998	186003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3552	NC_011294	TCG	2	6	186004	186009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3553	NC_011294	TGG	2	6	186013	186018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3554	NC_011294	TGA	2	6	186019	186024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855672
3555	NC_011294	TCA	2	6	186028	186033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855672
3556	NC_011294	TGC	2	6	186044	186049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3557	NC_011294	AAC	2	6	186052	186057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855672
3558	NC_011294	GGT	2	6	186063	186068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3559	NC_011294	CTG	2	6	186117	186122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3560	NC_011294	CGG	2	6	186147	186152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855672
3561	NC_011294	ACC	2	6	186211	186216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855672
3562	NC_011294	TGG	2	6	186278	186283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855672
3563	NC_011294	GTC	2	6	186286	186291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855672
3564	NC_011294	CGG	2	6	186296	186301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855672
3565	NC_011294	GAGC	2	8	186371	186378	25 %	0 %	50 %	25 %	207855672
3566	NC_011294	CATC	2	8	186398	186405	25 %	25 %	0 %	50 %	207855672
3567	NC_011294	TGGC	2	8	186526	186533	0 %	25 %	50 %	25 %	207855672
3568	NC_011294	CGC	2	6	186759	186764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855672
3569	NC_011294	CA	3	6	186835	186840	50 %	0 %	0 %	50 %	207855672
3570	NC_011294	TCG	2	6	187259	187264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855673
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3572	NC_011294	TGC	2	6	187299	187304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855673
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3579	NC_011294	ACA	2	6	187553	187558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855673
3580	NC_011294	TGAT	2	8	187568	187575	25 %	50 %	25 %	0 %	207855673
3581	NC_011294	TGC	2	6	187605	187610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855673
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3583	NC_011294	ACG	2	6	187652	187657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855673
3584	NC_011294	AGA	2	6	187659	187664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855673
3585	NC_011294	CCG	2	6	187741	187746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855673
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3587	NC_011294	TCACCG	2	12	187760	187771	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	207855673
3588	NC_011294	CGA	2	6	187800	187805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855673
3589	NC_011294	TC	4	8	187806	187813	0 %	50 %	0 %	50 %	207855673
3590	NC_011294	CAAA	2	8	187923	187930	75 %	0 %	0 %	25 %	207855673
3591	NC_011294	A	6	6	187945	187950	100 %	0 %	0 %	0 %	207855673
3592	NC_011294	GTG	2	6	187978	187983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855673
3593	NC_011294	TTC	2	6	187992	187997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855673
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3599	NC_011294	GGT	2	6	188287	188292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855673
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3601	NC_011294	AGC	2	6	188395	188400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855673
3602	NC_011294	TC	3	6	188408	188413	0 %	50 %	0 %	50 %	207855673
3603	NC_011294	GGTC	2	8	188427	188434	0 %	25 %	50 %	25 %	207855673
3604	NC_011294	TCCG	2	8	188456	188463	0 %	25 %	25 %	50 %	207855673
3605	NC_011294	TAC	2	6	188508	188513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855673
3606	NC_011294	CGA	2	6	188529	188534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855673
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3609	NC_011294	CAC	2	6	188632	188637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855673
3610	NC_011294	TC	3	6	188672	188677	0 %	50 %	0 %	50 %	207855673
3611	NC_011294	TGC	3	9	188720	188728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855673
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3613	NC_011294	CGG	2	6	188789	188794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855673
3614	NC_011294	CTGGT	2	10	188798	188807	0 %	40 %	40 %	20 %	207855673
3615	NC_011294	GCC	2	6	188815	188820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855673
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3985	NC_011294	TCG	3	9	207703	207711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
3986	NC_011294	TCA	2	6	207715	207720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855691
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3988	NC_011294	CTG	2	6	207828	207833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
3989	NC_011294	TCT	2	6	207850	207855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855691
3990	NC_011294	TCG	2	6	207955	207960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691
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4000	NC_011294	TCG	2	6	208547	208552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855691

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