MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 85024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011294	GGCG	2	8	78130	78137	0 %	0 %	75 %	25 %	207855581
1502	NC_011294	GCG	2	6	78212	78217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1503	NC_011294	GCGAA	2	10	78267	78276	40 %	0 %	40 %	20 %	207855581
1504	NC_011294	CCGT	2	8	78278	78285	0 %	25 %	25 %	50 %	207855581
1505	NC_011294	CGG	3	9	78310	78318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1506	NC_011294	ACT	2	6	78351	78356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855581
1507	NC_011294	CAT	2	6	78403	78408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855581
1508	NC_011294	CGG	2	6	78541	78546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1509	NC_011294	GC	5	10	78566	78575	0 %	0 %	50 %	50 %	207855581
1510	NC_011294	TGAAGC	2	12	78669	78680	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	207855581
1511	NC_011294	GAAA	2	8	78730	78737	75 %	0 %	25 %	0 %	207855581
1512	NC_011294	TGG	2	6	78750	78755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855581
1513	NC_011294	CTT	2	6	78762	78767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855581
1514	NC_011294	GGC	2	6	78776	78781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1515	NC_011294	ACG	2	6	78801	78806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1516	NC_011294	CTG	2	6	78866	78871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1517	NC_011294	TGA	2	6	78883	78888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855581
1518	NC_011294	GTGGAC	2	12	78899	78910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	207855581
1519	NC_011294	GGCG	2	8	78967	78974	0 %	0 %	75 %	25 %	207855581
1520	NC_011294	CAG	2	6	79046	79051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1521	NC_011294	TGA	2	6	79089	79094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855581
1522	NC_011294	GCG	2	6	79151	79156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1523	NC_011294	CGTAC	2	10	79157	79166	20 %	20 %	20 %	40 %	207855581
1524	NC_011294	GGC	2	6	79207	79212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1525	NC_011294	GC	3	6	79211	79216	0 %	0 %	50 %	50 %	207855581
1526	NC_011294	TAC	2	6	79274	79279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855581
1527	NC_011294	GTG	2	6	79292	79297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855581
1528	NC_011294	CAA	2	6	79306	79311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855581
1529	NC_011294	CCA	2	6	79425	79430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855581
1530	NC_011294	GAA	2	6	79432	79437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855581
1531	NC_011294	GCT	2	6	79450	79455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1532	NC_011294	GTG	2	6	79484	79489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855581
1533	NC_011294	GCT	2	6	79504	79509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1534	NC_011294	GTC	2	6	79605	79610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1535	NC_011294	ATC	2	6	79652	79657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855581
1536	NC_011294	ACC	2	6	79661	79666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855581
1537	NC_011294	CGC	2	6	79703	79708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855581
1538	NC_011294	GC	3	6	79710	79715	0 %	0 %	50 %	50 %	207855581
1539	NC_011294	CGG	2	6	79750	79755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855581
1540	NC_011294	ACG	2	6	79763	79768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1541	NC_011294	TG	3	6	80118	80123	0 %	50 %	50 %	0 %	207855582
1542	NC_011294	GAT	2	6	80167	80172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855582
1543	NC_011294	TTGT	2	8	80280	80287	0 %	75 %	25 %	0 %	207855582
1544	NC_011294	GAT	2	6	80296	80301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855582
1545	NC_011294	TGCCAG	2	12	80327	80338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	207855582
1546	NC_011294	GAAA	2	8	80402	80409	75 %	0 %	25 %	0 %	207855582
1547	NC_011294	C	6	6	80447	80452	0 %	0 %	0 %	100 %	207855582
1548	NC_011294	GAT	2	6	80482	80487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855582
1549	NC_011294	CGTC	2	8	80613	80620	0 %	25 %	25 %	50 %	207855583
1550	NC_011294	TTC	2	6	80644	80649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855583
1551	NC_011294	GTA	2	6	80763	80768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855583
1552	NC_011294	CG	3	6	80769	80774	0 %	0 %	50 %	50 %	207855583
1553	NC_011294	CAG	2	6	80788	80793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855583
1554	NC_011294	TTGCC	2	10	80794	80803	0 %	40 %	20 %	40 %	207855583
1555	NC_011294	GGC	2	6	80836	80841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855583
1556	NC_011294	CT	3	6	80849	80854	0 %	50 %	0 %	50 %	207855583
1557	NC_011294	CGTCC	2	10	80904	80913	0 %	20 %	20 %	60 %	207855583
1558	NC_011294	CAC	2	6	80914	80919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855583
1559	NC_011294	GGTATC	2	12	80971	80982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	207855583
1560	NC_011294	GCCT	2	8	81022	81029	0 %	25 %	25 %	50 %	207855583
1561	NC_011294	CAC	2	6	81148	81153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855583
1562	NC_011294	TCT	2	6	81357	81362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855584
1563	NC_011294	CGC	2	6	81394	81399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855584
1564	NC_011294	CTT	2	6	81418	81423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855584
1565	NC_011294	CG	3	6	81443	81448	0 %	0 %	50 %	50 %	207855584
1566	NC_011294	GTT	2	6	81496	81501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855584
1567	NC_011294	CG	4	8	81511	81518	0 %	0 %	50 %	50 %	207855584
1568	NC_011294	CTT	2	6	81574	81579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855584
1569	NC_011294	GCA	2	6	81631	81636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855584
1570	NC_011294	CGC	3	9	81655	81663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855584
1571	NC_011294	CCG	2	6	81733	81738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855584
1572	NC_011294	CCG	2	6	81756	81761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855584
1573	NC_011294	GCC	2	6	81833	81838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855584
1574	NC_011294	CAGC	2	8	81891	81898	25 %	0 %	25 %	50 %	207855584
1575	NC_011294	CGC	2	6	81916	81921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855584
1576	NC_011294	GGTC	2	8	82020	82027	0 %	25 %	50 %	25 %	207855584
1577	NC_011294	ACTC	2	8	82072	82079	25 %	25 %	0 %	50 %	207855584
1578	NC_011294	T	8	8	82145	82152	0 %	100 %	0 %	0 %	207855585
1579	NC_011294	ATT	2	6	82154	82159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855585
1580	NC_011294	TCA	2	6	82307	82312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855585
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1582	NC_011294	ATA	2	6	82370	82375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855585
1583	NC_011294	CGC	2	6	82407	82412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855585
1584	NC_011294	CATCCT	2	12	82455	82466	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	207855585
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1586	NC_011294	CGT	2	6	82676	82681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1587	NC_011294	ATA	2	6	82703	82708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855585
1588	NC_011294	CGA	2	6	82710	82715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1589	NC_011294	AGG	2	6	82734	82739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	207855585
1590	NC_011294	CAG	2	6	82741	82746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1591	NC_011294	TGC	2	6	82826	82831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1592	NC_011294	GCG	2	6	82844	82849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855585
1593	NC_011294	ATC	3	9	82871	82879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855585
1594	NC_011294	TGC	2	6	82965	82970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1595	NC_011294	CGG	2	6	82971	82976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855585
1596	NC_011294	GCG	2	6	82991	82996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855585
1597	NC_011294	TCA	2	6	83045	83050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855585
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1599	NC_011294	CAC	2	6	83113	83118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855585
1600	NC_011294	GGT	2	6	83134	83139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855585
1601	NC_011294	CCG	2	6	83160	83165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855585
1602	NC_011294	GCT	2	6	83259	83264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1603	NC_011294	CAGA	2	8	83272	83279	50 %	0 %	25 %	25 %	207855585
1604	NC_011294	CAG	2	6	83350	83355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1605	NC_011294	TTC	2	6	83389	83394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855585
1606	NC_011294	ATA	2	6	83423	83428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855585
1607	NC_011294	A	6	6	83526	83531	100 %	0 %	0 %	0 %	207855585
1608	NC_011294	GTC	2	6	83644	83649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855585
1609	NC_011294	GGC	2	6	83829	83834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855586
1610	NC_011294	GTT	2	6	83880	83885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855586
1611	NC_011294	ATG	2	6	83899	83904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855586
1612	NC_011294	TCAGC	2	10	84023	84032	20 %	20 %	20 %	40 %	207855586
1613	NC_011294	GC	3	6	84036	84041	0 %	0 %	50 %	50 %	207855586
1614	NC_011294	GT	4	8	84058	84065	0 %	50 %	50 %	0 %	207855586
1615	NC_011294	GCCA	2	8	84067	84074	25 %	0 %	25 %	50 %	207855586
1616	NC_011294	CGA	2	6	84092	84097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855586
1617	NC_011294	GATG	2	8	84122	84129	25 %	25 %	50 %	0 %	207855586
1618	NC_011294	GGCCA	2	10	84171	84180	20 %	0 %	40 %	40 %	207855586
1619	NC_011294	GTA	2	6	84270	84275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855586
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1621	NC_011294	AGT	2	6	84323	84328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855586
1622	NC_011294	CAT	2	6	84330	84335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855586
1623	NC_011294	GCA	2	6	84353	84358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855586
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1997	NC_011294	TTC	2	6	105318	105323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855605
1998	NC_011294	GTT	2	6	105501	105506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855606
1999	NC_011294	AGC	2	6	105558	105563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855606
2000	NC_011294	AGT	2	6	105621	105626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855606

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