MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 85024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011294	GAT	3	9	51342	51350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855558
1002	NC_011294	ATA	2	6	51379	51384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	207855558
1003	NC_011294	CAG	3	9	51390	51398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855558
1004	NC_011294	CAG	2	6	51477	51482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855558
1005	NC_011294	GTA	2	6	51521	51526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855558
1006	NC_011294	ATG	2	6	51533	51538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855558
1007	NC_011294	TTG	2	6	52044	52049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855559
1008	NC_011294	AGC	2	6	52109	52114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855559
1009	NC_011294	GCA	2	6	52158	52163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855559
1010	NC_011294	TGA	2	6	52201	52206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855559
1011	NC_011294	CAT	2	6	52214	52219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855559
1012	NC_011294	GC	3	6	52266	52271	0 %	0 %	50 %	50 %	207855559
1013	NC_011294	GCA	2	6	52405	52410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855560
1014	NC_011294	GCG	2	6	52491	52496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855560
1015	NC_011294	TCT	2	6	52536	52541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855560
1016	NC_011294	TCA	2	6	52549	52554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855560
1017	NC_011294	TTAACC	2	12	52568	52579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855560
1018	NC_011294	CATA	2	8	52643	52650	50 %	25 %	0 %	25 %	207855561
1019	NC_011294	TCAG	2	8	52654	52661	25 %	25 %	25 %	25 %	207855561
1020	NC_011294	GT	3	6	52673	52678	0 %	50 %	50 %	0 %	207855561
1021	NC_011294	GAA	2	6	52743	52748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855561
1022	NC_011294	GGT	3	9	52769	52777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855561
1023	NC_011294	GCCC	2	8	52826	52833	0 %	0 %	25 %	75 %	207855561
1024	NC_011294	GCG	2	6	52876	52881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855561
1025	NC_011294	TGTGC	2	10	52889	52898	0 %	40 %	40 %	20 %	207855561
1026	NC_011294	CGC	2	6	52911	52916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855561
1027	NC_011294	CTG	2	6	52953	52958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855561
1028	NC_011294	GAT	2	6	52995	53000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855561
1029	NC_011294	CG	3	6	53019	53024	0 %	0 %	50 %	50 %	207855561
1030	NC_011294	TTA	2	6	53037	53042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	207855561
1031	NC_011294	GGC	2	6	53100	53105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855561
1032	NC_011294	AGT	2	6	53115	53120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855561
1033	NC_011294	CTG	2	6	53172	53177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855561
1034	NC_011294	CGA	2	6	53216	53221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855561
1035	NC_011294	TGGC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	207855561
1036	NC_011294	CAA	2	6	53382	53387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855561
1037	NC_011294	CTG	2	6	53400	53405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855561
1038	NC_011294	AGC	2	6	53470	53475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855561
1039	NC_011294	TGA	2	6	53489	53494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855561
1040	NC_011294	T	6	6	53538	53543	0 %	100 %	0 %	0 %	207855561
1041	NC_011294	TGA	2	6	53607	53612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1042	NC_011294	GCG	2	6	53661	53666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855562
1043	NC_011294	GAT	3	9	53708	53716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1044	NC_011294	CAT	2	6	53725	53730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855562
1045	NC_011294	A	6	6	53741	53746	100 %	0 %	0 %	0 %	207855562
1046	NC_011294	A	7	7	53750	53756	100 %	0 %	0 %	0 %	207855562
1047	NC_011294	ATG	2	6	53769	53774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1048	NC_011294	GCA	2	6	53793	53798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1049	NC_011294	TGC	2	6	53995	54000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1050	NC_011294	CAT	2	6	54100	54105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855562
1051	NC_011294	CG	3	6	54107	54112	0 %	0 %	50 %	50 %	207855562
1052	NC_011294	GCGGAA	2	12	54194	54205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	207855562
1053	NC_011294	ACC	2	6	54329	54334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855562
1054	NC_011294	CTG	2	6	54515	54520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1055	NC_011294	CTG	2	6	54764	54769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1056	NC_011294	GC	3	6	54780	54785	0 %	0 %	50 %	50 %	207855562
1057	NC_011294	A	6	6	54798	54803	100 %	0 %	0 %	0 %	207855562
1058	NC_011294	GCA	2	6	54805	54810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1059	NC_011294	CG	3	6	54854	54859	0 %	0 %	50 %	50 %	207855562
1060	NC_011294	AAG	2	6	54888	54893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855562
1061	NC_011294	GCT	2	6	55060	55065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1062	NC_011294	GGC	2	6	55084	55089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855562
1063	NC_011294	GTG	2	6	55135	55140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855562
1064	NC_011294	GTTTG	2	10	55211	55220	0 %	60 %	40 %	0 %	207855562
1065	NC_011294	CCA	2	6	55230	55235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	207855562
1066	NC_011294	TCC	2	6	55328	55333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	207855562
1067	NC_011294	TGA	2	6	55335	55340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1068	NC_011294	CGC	2	6	55449	55454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855562
1069	NC_011294	TGA	2	6	55461	55466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1070	NC_011294	TCG	2	6	55570	55575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1071	NC_011294	CG	3	6	55588	55593	0 %	0 %	50 %	50 %	207855562
1072	NC_011294	CTG	2	6	55598	55603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
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1074	NC_011294	GCA	2	6	55699	55704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1075	NC_011294	CAT	2	6	55801	55806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855562
1076	NC_011294	CG	3	6	55843	55848	0 %	0 %	50 %	50 %	207855562
1077	NC_011294	TGA	2	6	55927	55932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1078	NC_011294	ACG	2	6	55989	55994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855562
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1081	NC_011294	CAA	2	6	56071	56076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855562
1082	NC_011294	AAG	2	6	56168	56173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855562
1083	NC_011294	G	6	6	56242	56247	0 %	0 %	100 %	0 %	207855562
1084	NC_011294	TGA	3	9	56251	56259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1085	NC_011294	GCT	2	6	56334	56339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	207855562
1086	NC_011294	CACTA	2	10	56342	56351	40 %	20 %	0 %	40 %	207855562
1087	NC_011294	AAC	2	6	56424	56429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	207855562
1088	NC_011294	TGA	2	6	56441	56446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855562
1089	NC_011294	GTA	2	6	56488	56493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855563
1090	NC_011294	GCA	2	6	56516	56521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855563
1091	NC_011294	TCC	2	6	56531	56536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	207855563
1092	NC_011294	GCG	2	6	56633	56638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855563
1093	NC_011294	TGA	2	6	56696	56701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855563
1094	NC_011294	ATC	2	6	56752	56757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855563
1095	NC_011294	GGC	2	6	56758	56763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855563
1096	NC_011294	GC	3	6	56762	56767	0 %	0 %	50 %	50 %	207855563
1097	NC_011294	TGT	2	6	56802	56807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855563
1098	NC_011294	CGGCG	2	10	56880	56889	0 %	0 %	60 %	40 %	207855563
1099	NC_011294	TTCAC	2	10	57135	57144	20 %	40 %	0 %	40 %	207855564
1100	NC_011294	GAT	2	6	57155	57160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	207855564
1101	NC_011294	CGG	2	6	57168	57173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855564
1102	NC_011294	AGCC	2	8	57195	57202	25 %	0 %	25 %	50 %	207855564
1103	NC_011294	AGC	3	9	57243	57251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855564
1104	NC_011294	AAG	2	6	57264	57269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855564
1105	NC_011294	AAAG	2	8	57274	57281	75 %	0 %	25 %	0 %	207855564
1106	NC_011294	CGC	2	6	57301	57306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855564
1107	NC_011294	GGC	2	6	57361	57366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855564
1108	NC_011294	ATGG	2	8	57407	57414	25 %	25 %	50 %	0 %	207855564
1109	NC_011294	TTG	2	6	57611	57616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	207855565
1110	NC_011294	GC	3	6	57638	57643	0 %	0 %	50 %	50 %	207855565
1111	NC_011294	TCT	2	6	57758	57763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	207855565
1112	NC_011294	GC	4	8	57868	57875	0 %	0 %	50 %	50 %	207855565
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1115	NC_011294	TGG	2	6	57977	57982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855565
1116	NC_011294	TGAT	2	8	58079	58086	25 %	50 %	25 %	0 %	207855565
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1120	NC_011294	TGG	2	6	58202	58207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	207855565
1121	NC_011294	TCTAAC	2	12	58225	58236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	207855565
1122	NC_011294	GAA	2	6	58265	58270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855565
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1124	NC_011294	GCG	2	6	58291	58296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	207855565
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1497	NC_011294	CGCA	2	8	77780	77787	25 %	0 %	25 %	50 %	207855581
1498	NC_011294	CGA	2	6	77860	77865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	207855581
1499	NC_011294	CCG	2	6	77887	77892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	207855581
1500	NC_011294	GAA	2	6	78014	78019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	207855581

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