MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 2430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011274	AGGTA	2	10	2443	2452	40 %	20 %	40 %	0 %	205351348
2	NC_011274	ATTGC	2	10	3286	3295	20 %	40 %	20 %	20 %	205351349
3	NC_011274	CGGCG	2	10	4034	4043	0 %	0 %	60 %	40 %	205351350
4	NC_011274	CCGCG	2	10	7074	7083	0 %	0 %	40 %	60 %	205351352
5	NC_011274	GCGTG	2	10	13881	13890	0 %	20 %	60 %	20 %	205351358
6	NC_011274	CTTTT	2	10	23282	23291	0 %	80 %	0 %	20 %	205351363
7	NC_011274	CGGTA	2	10	24450	24459	20 %	20 %	40 %	20 %	205351364
8	NC_011274	CTGTT	2	10	24489	24498	0 %	60 %	20 %	20 %	205351364
9	NC_011274	TATTT	2	10	25323	25332	20 %	80 %	0 %	0 %	205351365
10	NC_011274	ATCTG	2	10	30854	30863	20 %	40 %	20 %	20 %	205351370
11	NC_011274	TTACG	2	10	30909	30918	20 %	40 %	20 %	20 %	205351370
12	NC_011274	GGGCG	2	10	31677	31686	0 %	0 %	80 %	20 %	205351371
13	NC_011274	TGCGT	2	10	32056	32065	0 %	40 %	40 %	20 %	205351372
14	NC_011274	AAAAG	2	10	32450	32459	80 %	0 %	20 %	0 %	205351373
15	NC_011274	TATAA	2	10	34053	34062	60 %	40 %	0 %	0 %	205351374
16	NC_011274	AGCGA	2	10	35479	35488	40 %	0 %	40 %	20 %	205351376
17	NC_011274	TCCTG	2	10	35689	35698	0 %	40 %	20 %	40 %	205351376
18	NC_011274	GGTCA	2	10	37924	37933	20 %	20 %	40 %	20 %	205351377
19	NC_011274	TTCAT	2	10	39196	39205	20 %	60 %	0 %	20 %	205351378
20	NC_011274	TGAAA	2	10	40012	40021	60 %	20 %	20 %	0 %	205351379
21	NC_011274	ACGGC	2	10	44372	44381	20 %	0 %	40 %	40 %	205351382
22	NC_011274	TTTTA	2	10	44698	44707	20 %	80 %	0 %	0 %	205351382
23	NC_011274	GGGCT	2	10	46446	46455	0 %	20 %	60 %	20 %	205351383
24	NC_011274	GCGTA	2	10	48322	48331	20 %	20 %	40 %	20 %	205351385
25	NC_011274	GACCA	2	10	48927	48936	40 %	0 %	20 %	40 %	205351385
26	NC_011274	CCGGC	2	10	49069	49078	0 %	0 %	40 %	60 %	205351385
27	NC_011274	CAGAC	2	10	50259	50268	40 %	0 %	20 %	40 %	205351385
28	NC_011274	TGTGC	2	10	53019	53028	0 %	40 %	40 %	20 %	205351388
29	NC_011274	GTTTG	2	10	55341	55350	0 %	60 %	40 %	0 %	205351389
30	NC_011274	CACTA	2	10	56472	56481	40 %	20 %	0 %	40 %	205351389
31	NC_011274	CGGCG	2	10	57010	57019	0 %	0 %	60 %	40 %	205351390
32	NC_011274	TTCAC	2	10	57265	57274	20 %	40 %	0 %	40 %	205351391
33	NC_011274	AAAAT	2	10	58836	58845	80 %	20 %	0 %	0 %	205351393
34	NC_011274	GGAAA	2	10	59623	59632	60 %	0 %	40 %	0 %	205351393
35	NC_011274	CGCTG	2	10	60113	60122	0 %	20 %	40 %	40 %	205351394
36	NC_011274	CGGCG	2	10	63876	63885	0 %	0 %	60 %	40 %	205351397
37	NC_011274	GCCTG	2	10	64669	64678	0 %	20 %	40 %	40 %	205351397
38	NC_011274	GCGCG	2	10	64823	64832	0 %	0 %	60 %	40 %	205351398
39	NC_011274	CGTGC	2	10	71241	71250	0 %	20 %	40 %	40 %	205351404
40	NC_011274	TTGAT	2	10	71411	71420	20 %	60 %	20 %	0 %	205351404
41	NC_011274	ACCGC	2	10	71971	71980	20 %	0 %	20 %	60 %	205351404
42	NC_011274	CGATG	2	10	77454	77463	20 %	20 %	40 %	20 %	205351409
43	NC_011274	GCGAA	2	10	78395	78404	40 %	0 %	40 %	20 %	205351409
44	NC_011274	CGTAC	2	10	79285	79294	20 %	20 %	20 %	40 %	205351409
45	NC_011274	TTGCC	2	10	80922	80931	0 %	40 %	20 %	40 %	205351411
46	NC_011274	CGTCC	2	10	81032	81041	0 %	20 %	20 %	60 %	205351411
47	NC_011274	TCAGC	2	10	84151	84160	20 %	20 %	20 %	40 %	205351413
48	NC_011274	GGCCA	2	10	84299	84308	20 %	0 %	40 %	40 %	205351413
49	NC_011274	GTACG	2	10	86870	86879	20 %	20 %	40 %	20 %	205351415
50	NC_011274	CAGAA	2	10	87583	87592	60 %	0 %	20 %	20 %	205351415
51	NC_011274	CCGCA	2	10	89702	89711	20 %	0 %	20 %	60 %	205351417
52	NC_011274	CGGTT	2	10	90207	90216	0 %	40 %	40 %	20 %	205351418
53	NC_011274	GCTCC	2	10	91343	91352	0 %	20 %	20 %	60 %	205351418
54	NC_011274	TGGCG	2	10	91987	91996	0 %	20 %	60 %	20 %	205351420
55	NC_011274	TTTCC	2	10	95899	95908	0 %	60 %	0 %	40 %	205351424
56	NC_011274	GTGGC	2	10	96468	96477	0 %	20 %	60 %	20 %	205351424
57	NC_011274	TGCAC	2	10	98385	98394	20 %	20 %	20 %	40 %	205351425
58	NC_011274	TGGCA	2	10	98454	98463	20 %	20 %	40 %	20 %	205351425
59	NC_011274	TCTGT	2	10	98780	98789	0 %	60 %	20 %	20 %	205351426
60	NC_011274	GCGCT	2	10	99090	99099	0 %	20 %	40 %	40 %	205351426
61	NC_011274	GGCGC	2	10	99504	99513	0 %	0 %	60 %	40 %	205351426
62	NC_011274	AACGT	2	10	102286	102295	40 %	20 %	20 %	20 %	205351429
63	NC_011274	CCCAA	2	10	104436	104445	40 %	0 %	0 %	60 %	205351432
64	NC_011274	TTGTT	2	10	105143	105152	0 %	80 %	20 %	0 %	205351432
65	NC_011274	GCTTC	2	10	106523	106532	0 %	40 %	20 %	40 %	205351433
66	NC_011274	TGCGT	2	10	106810	106819	0 %	40 %	40 %	20 %	205351433
67	NC_011274	TGATC	2	10	108510	108519	20 %	40 %	20 %	20 %	205351434
68	NC_011274	TGGCG	2	10	111670	111679	0 %	20 %	60 %	20 %	205351436
69	NC_011274	AGCGC	2	10	112230	112239	20 %	0 %	40 %	40 %	205351436
70	NC_011274	CCGCG	2	10	113315	113324	0 %	0 %	40 %	60 %	205351437
71	NC_011274	GGGGT	2	10	114711	114720	0 %	20 %	80 %	0 %	205351437
72	NC_011274	ACAGA	2	10	116441	116450	60 %	0 %	20 %	20 %	205351439
73	NC_011274	CAGCG	2	10	117616	117625	20 %	0 %	40 %	40 %	205351441
74	NC_011274	GCCGG	2	10	117916	117925	0 %	0 %	60 %	40 %	205351441
75	NC_011274	CGAGC	2	10	118041	118050	20 %	0 %	40 %	40 %	205351441
76	NC_011274	ATTTG	2	10	118484	118493	20 %	60 %	20 %	0 %	205351441
77	NC_011274	TTGCC	2	10	122987	122996	0 %	40 %	20 %	40 %	205351445
78	NC_011274	AGCAG	2	10	123664	123673	40 %	0 %	40 %	20 %	205351446
79	NC_011274	AGTTT	2	10	125894	125903	20 %	60 %	20 %	0 %	205351447
80	NC_011274	TCGAT	2	10	127742	127751	20 %	40 %	20 %	20 %	205351448
81	NC_011274	CGGCG	2	10	130372	130381	0 %	0 %	60 %	40 %	205351450
82	NC_011274	CGTTT	2	10	130834	130843	0 %	60 %	20 %	20 %	205351450
83	NC_011274	ATTGG	2	10	131098	131107	20 %	40 %	40 %	0 %	205351451
84	NC_011274	ATTCC	2	10	135946	135955	20 %	40 %	0 %	40 %	205351455
85	NC_011274	AAAGC	2	10	138243	138252	60 %	0 %	20 %	20 %	205351457
86	NC_011274	CCGCA	2	10	138776	138785	20 %	0 %	20 %	60 %	205351457
87	NC_011274	AGTTC	2	10	141147	141156	20 %	40 %	20 %	20 %	205351459
88	NC_011274	TGCCT	2	10	141247	141256	0 %	40 %	20 %	40 %	205351460
89	NC_011274	AAGCG	2	10	145900	145909	40 %	0 %	40 %	20 %	205351463
90	NC_011274	GTTTG	2	10	147803	147812	0 %	60 %	40 %	0 %	205351465
91	NC_011274	CGTAT	2	10	149274	149283	20 %	40 %	20 %	20 %	205351466
92	NC_011274	ATCAG	2	10	151110	151119	40 %	20 %	20 %	20 %	205351468
93	NC_011274	CTGCC	2	10	153119	153128	0 %	20 %	20 %	60 %	205351469
94	NC_011274	CGGCG	2	10	155849	155858	0 %	0 %	60 %	40 %	205351472
95	NC_011274	CCGGC	2	10	159203	159212	0 %	0 %	40 %	60 %	205351475
96	NC_011274	CGCTG	2	10	160095	160104	0 %	20 %	40 %	40 %	205351475
97	NC_011274	GATCA	2	10	164246	164255	40 %	20 %	20 %	20 %	205351480
98	NC_011274	CGTCA	2	10	164992	165001	20 %	20 %	20 %	40 %	205351481
99	NC_011274	ATCCC	2	10	166692	166701	20 %	20 %	0 %	60 %	205351483
100	NC_011274	AGCGC	2	10	167400	167409	20 %	0 %	40 %	40 %	205351483
101	NC_011274	TGAGC	2	10	169249	169258	20 %	20 %	40 %	20 %	205351484
102	NC_011274	CGCAT	2	10	169511	169520	20 %	20 %	20 %	40 %	205351485
103	NC_011274	CGAAC	2	10	170240	170249	40 %	0 %	20 %	40 %	205351486
104	NC_011274	GTTCA	2	10	170506	170515	20 %	40 %	20 %	20 %	205351486
105	NC_011274	ATGAC	2	10	171472	171481	40 %	20 %	20 %	20 %	205351487
106	NC_011274	CTGGA	2	10	172062	172071	20 %	20 %	40 %	20 %	205351488
107	NC_011274	CAGAA	2	10	174181	174190	60 %	0 %	20 %	20 %	205351490
108	NC_011274	CGAAG	2	10	177052	177061	40 %	0 %	40 %	20 %	205351492
109	NC_011274	GACTG	2	10	178853	178862	20 %	20 %	40 %	20 %	205351493
110	NC_011274	AGCAA	2	10	179265	179274	60 %	0 %	20 %	20 %	205351493
111	NC_011274	GGCAT	2	10	184327	184336	20 %	20 %	40 %	20 %	205351496
112	NC_011274	GGCCA	2	10	184749	184758	20 %	0 %	40 %	40 %	205351497
113	NC_011274	GCGCC	2	10	184762	184771	0 %	0 %	40 %	60 %	205351497
114	NC_011274	CGTTT	2	10	185264	185273	0 %	60 %	20 %	20 %	205351497
115	NC_011274	GGGGA	2	10	185316	185325	20 %	0 %	80 %	0 %	205351497
116	NC_011274	CTGGT	2	10	188950	188959	0 %	40 %	40 %	20 %	205351499
117	NC_011274	CGGCG	2	10	192259	192268	0 %	0 %	60 %	40 %	205351503
118	NC_011274	CCGCT	2	10	192966	192975	0 %	20 %	20 %	60 %	205351503
119	NC_011274	GCCCA	2	10	195518	195527	20 %	0 %	20 %	60 %	205351506
120	NC_011274	GCGCA	2	10	195923	195932	20 %	0 %	40 %	40 %	205351506
121	NC_011274	ATCGG	2	10	197314	197323	20 %	20 %	40 %	20 %	205351508
122	NC_011274	GCCGC	2	10	198524	198533	0 %	0 %	40 %	60 %	205351510
123	NC_011274	ATCCA	2	10	203874	203883	40 %	20 %	0 %	40 %	205351512
124	NC_011274	CGGCG	2	10	205994	206003	0 %	0 %	60 %	40 %	205351515
125	NC_011274	TGGTC	2	10	206860	206869	0 %	40 %	40 %	20 %	205351515
126	NC_011274	GTGTT	2	10	209893	209902	0 %	60 %	40 %	0 %	205351516
127	NC_011274	TTCGG	2	10	212292	212301	0 %	40 %	40 %	20 %	205351518
128	NC_011274	CTTGC	2	10	213301	213310	0 %	40 %	20 %	40 %	205351519
129	NC_011274	TGAGC	2	10	213713	213722	20 %	20 %	40 %	20 %	205351520
130	NC_011274	CGGCA	2	10	214798	214807	20 %	0 %	40 %	40 %	205351521
131	NC_011274	GCACG	2	10	214977	214986	20 %	0 %	40 %	40 %	205351521
132	NC_011274	AGATC	2	10	215382	215391	40 %	20 %	20 %	20 %	205351522
133	NC_011274	CGCGG	2	10	215804	215813	0 %	0 %	60 %	40 %	205351523
134	NC_011274	CGCGG	2	10	215988	215997	0 %	0 %	60 %	40 %	205351523
135	NC_011274	GCCAG	2	10	217972	217981	20 %	0 %	40 %	40 %	205351524
136	NC_011274	GCGCG	2	10	218538	218547	0 %	0 %	60 %	40 %	205351525
137	NC_011274	CGGGG	2	10	220356	220365	0 %	0 %	80 %	20 %	205351528
138	NC_011274	GCGAA	2	10	222476	222485	40 %	0 %	40 %	20 %	205351528
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140	NC_011274	GGCGG	2	10	224289	224298	0 %	0 %	80 %	20 %	205351529
141	NC_011274	GTTGA	2	10	226138	226147	20 %	40 %	40 %	0 %	205351530
142	NC_011274	TTCAA	2	10	226244	226253	40 %	40 %	0 %	20 %	205351530
143	NC_011274	GGAAT	2	10	226998	227007	40 %	20 %	40 %	0 %	205351530
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148	NC_011274	GCACC	2	10	235250	235259	20 %	0 %	20 %	60 %	205351535
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152	NC_011274	CGGCG	2	10	241120	241129	0 %	0 %	60 %	40 %	205351540
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162	NC_011274	TACGG	2	10	265825	265834	20 %	20 %	40 %	20 %	205351561
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165	NC_011274	ATGCC	2	10	270231	270240	20 %	20 %	20 %	40 %	205351566
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169	NC_011274	TGCTC	2	10	279995	280004	0 %	40 %	20 %	40 %	205351571
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252	NC_011274	GCGCT	2	10	440733	440742	0 %	20 %	40 %	40 %	205351704
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259	NC_011274	ATTAC	2	10	448897	448906	40 %	40 %	0 %	20 %	205351709
260	NC_011274	CGTAT	2	10	450103	450112	20 %	40 %	20 %	20 %	205351710
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262	NC_011274	CGGCG	2	10	451844	451853	0 %	0 %	60 %	40 %	205351711
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389	NC_011274	TTATT	2	10	663985	663994	20 %	80 %	0 %	0 %	205351899
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