MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011274	TCGC	2	8	192941	192948	0 %	25 %	25 %	50 %	205351503
3502	NC_011274	GCT	2	6	192959	192964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351503
3503	NC_011274	CCGCT	2	10	192966	192975	0 %	20 %	20 %	60 %	205351503
3504	NC_011274	GCC	2	6	192980	192985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351503
3505	NC_011274	CAC	2	6	192994	192999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351503
3506	NC_011274	CCT	2	6	193023	193028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351503
3507	NC_011274	A	6	6	193037	193042	100 %	0 %	0 %	0 %	205351503
3508	NC_011274	CTT	2	6	193056	193061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351503
3509	NC_011274	GAT	2	6	193096	193101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351504
3510	NC_011274	GAA	2	6	193137	193142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351504
3511	NC_011274	CGC	2	6	193189	193194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351504
3512	NC_011274	GGC	2	6	193245	193250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351504
3513	NC_011274	GTG	2	6	193278	193283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351504
3514	NC_011274	A	7	7	193312	193318	100 %	0 %	0 %	0 %	205351504
3515	NC_011274	CGG	2	6	193358	193363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351504
3516	NC_011274	GC	3	6	193368	193373	0 %	0 %	50 %	50 %	205351504
3517	NC_011274	CGC	3	9	193398	193406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351504
3518	NC_011274	ACG	2	6	193426	193431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351504
3519	NC_011274	CGG	2	6	193587	193592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351504
3520	NC_011274	CTTA	2	8	193602	193609	25 %	50 %	0 %	25 %	205351504
3521	NC_011274	TCG	2	6	193640	193645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351504
3522	NC_011274	GCG	2	6	193687	193692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351504
3523	NC_011274	AAC	2	6	193697	193702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351504
3524	NC_011274	GCT	2	6	193713	193718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351504
3525	NC_011274	TGG	3	9	193793	193801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351504
3526	NC_011274	CG	3	6	193884	193889	0 %	0 %	50 %	50 %	205351504
3527	NC_011274	GC	3	6	193943	193948	0 %	0 %	50 %	50 %	205351504
3528	NC_011274	AGA	2	6	193995	194000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351504
3529	NC_011274	GCGA	2	8	194057	194064	25 %	0 %	50 %	25 %	205351504
3530	NC_011274	CGT	2	6	194082	194087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351504
3531	NC_011274	GTT	2	6	194124	194129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351504
3532	NC_011274	CGG	2	6	194136	194141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351504
3533	NC_011274	CCG	2	6	194153	194158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351504
3534	NC_011274	GC	3	6	194165	194170	0 %	0 %	50 %	50 %	205351504
3535	NC_011274	GCGG	2	8	194272	194279	0 %	0 %	75 %	25 %	205351504
3536	NC_011274	TG	3	6	194300	194305	0 %	50 %	50 %	0 %	205351504
3537	NC_011274	TAT	2	6	194314	194319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351504
3538	NC_011274	GAG	2	6	194323	194328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351504
3539	NC_011274	ATT	2	6	194393	194398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351505
3540	NC_011274	GC	3	6	194430	194435	0 %	0 %	50 %	50 %	205351505
3541	NC_011274	TGG	2	6	194439	194444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351505
3542	NC_011274	CAT	2	6	194551	194556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351505
3543	NC_011274	TGAT	2	8	194562	194569	25 %	50 %	25 %	0 %	205351505
3544	NC_011274	CAGGCG	2	12	194612	194623	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	205351505
3545	NC_011274	GC	3	6	194650	194655	0 %	0 %	50 %	50 %	205351505
3546	NC_011274	CGC	2	6	194700	194705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351505
3547	NC_011274	GCT	2	6	194758	194763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351505
3548	NC_011274	CG	3	6	194878	194883	0 %	0 %	50 %	50 %	205351505
3549	NC_011274	GCCA	2	8	195022	195029	25 %	0 %	25 %	50 %	205351505
3550	NC_011274	CCG	2	6	195074	195079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351505
3551	NC_011274	TGG	3	9	195120	195128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351505
3552	NC_011274	ATG	2	6	195177	195182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351505
3553	NC_011274	ACA	2	6	195337	195342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351506
3554	NC_011274	GCCA	2	8	195424	195431	25 %	0 %	25 %	50 %	205351506
3555	NC_011274	GGC	2	6	195488	195493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351506
3556	NC_011274	GCG	2	6	195502	195507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351506
3557	NC_011274	GCCCA	2	10	195518	195527	20 %	0 %	20 %	60 %	205351506
3558	NC_011274	CCA	3	9	195525	195533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351506
3559	NC_011274	AAC	2	6	195540	195545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351506
3560	NC_011274	CGT	2	6	195613	195618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351506
3561	NC_011274	ATG	2	6	195638	195643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351506
3562	NC_011274	TCA	2	6	195681	195686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351506
3563	NC_011274	CGG	2	6	195748	195753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351506
3564	NC_011274	CAG	2	6	195766	195771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351506
3565	NC_011274	G	6	6	195852	195857	0 %	0 %	100 %	0 %	205351506
3566	NC_011274	GAC	2	6	195871	195876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351506
3567	NC_011274	ATT	2	6	195911	195916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351506
3568	NC_011274	GCGCA	2	10	195923	195932	20 %	0 %	40 %	40 %	205351506
3569	NC_011274	CAG	2	6	195949	195954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351506
3570	NC_011274	GC	3	6	195963	195968	0 %	0 %	50 %	50 %	205351506
3571	NC_011274	ATG	2	6	196005	196010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351506
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3573	NC_011274	GC	3	6	196060	196065	0 %	0 %	50 %	50 %	205351506
3574	NC_011274	CCG	2	6	196131	196136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351507
3575	NC_011274	GTA	2	6	196150	196155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351507
3576	NC_011274	GCG	2	6	196181	196186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351507
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3580	NC_011274	TGG	2	6	196457	196462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351507
3581	NC_011274	CCA	2	6	196602	196607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351507
3582	NC_011274	CGG	2	6	197030	197035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351508
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3587	NC_011274	CGC	2	6	197136	197141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351508
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3589	NC_011274	ATCGG	2	10	197314	197323	20 %	20 %	40 %	20 %	205351508
3590	NC_011274	CGT	2	6	197381	197386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351508
3591	NC_011274	TCG	2	6	197410	197415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351508
3592	NC_011274	GGC	2	6	197447	197452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351508
3593	NC_011274	CGC	3	9	197540	197548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351508
3594	NC_011274	CAG	2	6	197583	197588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351508
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3597	NC_011274	TCG	2	6	197623	197628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351508
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3599	NC_011274	GCG	2	6	197677	197682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351508
3600	NC_011274	GAT	2	6	197691	197696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351508
3601	NC_011274	TGG	2	6	197704	197709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351508
3602	NC_011274	T	6	6	197714	197719	0 %	100 %	0 %	0 %	205351508
3603	NC_011274	T	6	6	197959	197964	0 %	100 %	0 %	0 %	205351509
3604	NC_011274	A	6	6	198070	198075	100 %	0 %	0 %	0 %	205351509
3605	NC_011274	ACA	2	6	198228	198233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351509
3606	NC_011274	GCCGC	2	10	198524	198533	0 %	0 %	40 %	60 %	205351510
3607	NC_011274	GCC	2	6	198538	198543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351510
3608	NC_011274	ACG	2	6	198748	198753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351510
3609	NC_011274	TCG	2	6	198785	198790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351510
3610	NC_011274	CGG	2	6	198792	198797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351510
3611	NC_011274	ATT	2	6	198808	198813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351510
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3616	NC_011274	GATT	2	8	199041	199048	25 %	50 %	25 %	0 %	205351510
3617	NC_011274	CCG	3	9	199067	199075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351510
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3620	NC_011274	GCA	2	6	199122	199127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351510
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3622	NC_011274	CGC	2	6	199194	199199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351510
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3742	NC_011274	CAT	2	6	210523	210528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351517
3743	NC_011274	GC	3	6	210578	210583	0 %	0 %	50 %	50 %	205351517
3744	NC_011274	CTG	2	6	210591	210596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351517
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3780	NC_011274	GGC	3	9	213476	213484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351520
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3863	NC_011274	CTC	2	6	217439	217444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351524
3864	NC_011274	ACG	2	6	217467	217472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351524
3865	NC_011274	GCCA	2	8	217615	217622	25 %	0 %	25 %	50 %	205351524
3866	NC_011274	TCG	2	6	217707	217712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351524
3867	NC_011274	ACC	2	6	217713	217718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351524
3868	NC_011274	CGG	2	6	217749	217754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351524
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3870	NC_011274	TCGC	2	8	217770	217777	0 %	25 %	25 %	50 %	205351524
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3977	NC_011274	CAGCG	2	10	222539	222548	20 %	0 %	40 %	40 %	205351528
3978	NC_011274	CG	3	6	222563	222568	0 %	0 %	50 %	50 %	205351528
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3985	NC_011274	GGCT	2	8	223014	223021	0 %	25 %	50 %	25 %	205351529
3986	NC_011274	A	6	6	223090	223095	100 %	0 %	0 %	0 %	205351529
3987	NC_011274	CGG	3	9	223132	223140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351529
3988	NC_011274	GAT	2	6	223283	223288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351529
3989	NC_011274	CGT	2	6	223290	223295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351529
3990	NC_011274	AAG	2	6	223318	223323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351529
3991	NC_011274	GC	4	8	223331	223338	0 %	0 %	50 %	50 %	205351529
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3994	NC_011274	TTC	2	6	223439	223444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351529
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