MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011274	TGGCGA	2	12	142380	142391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	205351461
2502	NC_011274	CAA	2	6	142411	142416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351461
2503	NC_011274	TGG	2	6	142497	142502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351461
2504	NC_011274	TGA	2	6	142503	142508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351461
2505	NC_011274	GC	3	6	142595	142600	0 %	0 %	50 %	50 %	205351461
2506	NC_011274	TAG	2	6	142689	142694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351461
2507	NC_011274	TACT	2	8	142696	142703	25 %	50 %	0 %	25 %	205351461
2508	NC_011274	GGT	2	6	142779	142784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351461
2509	NC_011274	AG	3	6	142792	142797	50 %	0 %	50 %	0 %	205351461
2510	NC_011274	GTG	2	6	142961	142966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351461
2511	NC_011274	ATG	2	6	142970	142975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351461
2512	NC_011274	GCG	4	12	142995	143006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351461
2513	NC_011274	GGC	2	6	143011	143016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351461
2514	NC_011274	A	6	6	143057	143062	100 %	0 %	0 %	0 %	205351461
2515	NC_011274	CAA	2	6	143086	143091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351461
2516	NC_011274	TGG	2	6	143145	143150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351461
2517	NC_011274	TCA	2	6	143154	143159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351461
2518	NC_011274	TAC	2	6	143180	143185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351461
2519	NC_011274	GGC	2	6	143186	143191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351461
2520	NC_011274	CAT	2	6	143218	143223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351461
2521	NC_011274	GCG	2	6	143226	143231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351461
2522	NC_011274	A	7	7	143277	143283	100 %	0 %	0 %	0 %	205351461
2523	NC_011274	TAAT	2	8	143292	143299	50 %	50 %	0 %	0 %	205351461
2524	NC_011274	CTT	2	6	143340	143345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351462
2525	NC_011274	GTGG	2	8	143351	143358	0 %	25 %	75 %	0 %	205351462
2526	NC_011274	CG	3	6	143369	143374	0 %	0 %	50 %	50 %	205351462
2527	NC_011274	GA	3	6	143383	143388	50 %	0 %	50 %	0 %	205351462
2528	NC_011274	GCG	2	6	143412	143417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351462
2529	NC_011274	GTG	2	6	143436	143441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351462
2530	NC_011274	TCA	2	6	143444	143449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351462
2531	NC_011274	AT	3	6	143465	143470	50 %	50 %	0 %	0 %	205351462
2532	NC_011274	ATT	2	6	143502	143507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351462
2533	NC_011274	GCGA	2	8	143526	143533	25 %	0 %	50 %	25 %	205351462
2534	NC_011274	GTC	2	6	143565	143570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2535	NC_011274	CAGC	2	8	143576	143583	25 %	0 %	25 %	50 %	205351462
2536	NC_011274	TGG	2	6	143647	143652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351462
2537	NC_011274	ACC	4	12	143676	143687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351462
2538	NC_011274	ACT	2	6	143690	143695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351462
2539	NC_011274	TCT	2	6	143868	143873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	205351462
2540	NC_011274	GCA	2	6	143885	143890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2541	NC_011274	GGC	2	6	143897	143902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351462
2542	NC_011274	GCC	2	6	143913	143918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351462
2543	NC_011274	GGC	2	6	143981	143986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351462
2544	NC_011274	CCAC	2	8	144004	144011	25 %	0 %	0 %	75 %	205351462
2545	NC_011274	GAT	2	6	144039	144044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351462
2546	NC_011274	CGC	2	6	144054	144059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351462
2547	NC_011274	TGGC	2	8	144060	144067	0 %	25 %	50 %	25 %	205351462
2548	NC_011274	CGA	2	6	144172	144177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2549	NC_011274	GCC	2	6	144217	144222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351462
2550	NC_011274	CTG	2	6	144252	144257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2551	NC_011274	GCT	2	6	144269	144274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2552	NC_011274	CCG	2	6	144310	144315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351462
2553	NC_011274	CG	3	6	144314	144319	0 %	0 %	50 %	50 %	205351462
2554	NC_011274	GGT	3	9	144374	144382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351462
2555	NC_011274	GGC	2	6	144425	144430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351462
2556	NC_011274	GAA	2	6	144522	144527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351462
2557	NC_011274	TCG	2	6	144538	144543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2558	NC_011274	TGAC	2	8	144547	144554	25 %	25 %	25 %	25 %	205351462
2559	NC_011274	GAG	2	6	144570	144575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	205351462
2560	NC_011274	CG	3	6	144577	144582	0 %	0 %	50 %	50 %	205351462
2561	NC_011274	CGT	2	6	144692	144697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351462
2562	NC_011274	ATT	2	6	144754	144759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351462
2563	NC_011274	AC	3	6	144888	144893	50 %	0 %	0 %	50 %	205351463
2564	NC_011274	CTG	2	6	144992	144997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351463
2565	NC_011274	GCC	2	6	145070	145075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351463
2566	NC_011274	GTG	2	6	145103	145108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351463
2567	NC_011274	CCG	2	6	145152	145157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351463
2568	NC_011274	AAC	2	6	145205	145210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	205351463
2569	NC_011274	GCT	2	6	145231	145236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351463
2570	NC_011274	GCG	2	6	145331	145336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351463
2571	NC_011274	GGC	3	9	145351	145359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351463
2572	NC_011274	GCGAAA	2	12	145394	145405	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	205351463
2573	NC_011274	ATA	2	6	145458	145463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351463
2574	NC_011274	ATT	2	6	145487	145492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351463
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2578	NC_011274	GGC	2	6	145660	145665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351463
2579	NC_011274	GCT	2	6	145667	145672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351463
2580	NC_011274	GGC	2	6	145720	145725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351463
2581	NC_011274	CCG	2	6	145821	145826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351463
2582	NC_011274	TGG	2	6	145866	145871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351463
2583	NC_011274	AAGCG	2	10	145900	145909	40 %	0 %	40 %	20 %	205351463
2584	NC_011274	GCG	2	6	145940	145945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351463
2585	NC_011274	TCAG	2	8	145977	145984	25 %	25 %	25 %	25 %	205351463
2586	NC_011274	GCG	2	6	146001	146006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351463
2587	NC_011274	ATG	2	6	146075	146080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351463
2588	NC_011274	TGGC	2	8	146161	146168	0 %	25 %	50 %	25 %	205351464
2589	NC_011274	ATT	2	6	146186	146191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351464
2590	NC_011274	ATGG	2	8	146265	146272	25 %	25 %	50 %	0 %	205351464
2591	NC_011274	CT	3	6	146302	146307	0 %	50 %	0 %	50 %	205351464
2592	NC_011274	GGT	2	6	146316	146321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351464
2593	NC_011274	CGA	2	6	146366	146371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351464
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2595	NC_011274	GTGC	2	8	146448	146455	0 %	25 %	50 %	25 %	205351464
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2598	NC_011274	GC	3	6	146539	146544	0 %	0 %	50 %	50 %	205351464
2599	NC_011274	TCG	2	6	146600	146605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351464
2600	NC_011274	TGG	2	6	146630	146635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351464
2601	NC_011274	CTG	2	6	146683	146688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351464
2602	NC_011274	TCG	2	6	146702	146707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351464
2603	NC_011274	GCC	2	6	146776	146781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351464
2604	NC_011274	TGG	2	6	146792	146797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351464
2605	NC_011274	TGC	3	9	146996	147004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351464
2606	NC_011274	CTG	2	6	147016	147021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351464
2607	NC_011274	GCG	2	6	147032	147037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351464
2608	NC_011274	TGG	2	6	147044	147049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351464
2609	NC_011274	CAC	2	6	147127	147132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351464
2610	NC_011274	CG	3	6	147158	147163	0 %	0 %	50 %	50 %	205351464
2611	NC_011274	ATT	2	6	147181	147186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351464
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2615	NC_011274	T	6	6	147306	147311	0 %	100 %	0 %	0 %	205351465
2616	NC_011274	CTCG	2	8	147312	147319	0 %	25 %	25 %	50 %	205351465
2617	NC_011274	CGC	2	6	147328	147333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351465
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2621	NC_011274	GCG	2	6	147429	147434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351465
2622	NC_011274	TCG	2	6	147442	147447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351465
2623	NC_011274	GCC	2	6	147489	147494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351465
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2984	NC_011274	TGA	2	6	166773	166778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351483
2985	NC_011274	GCCAGC	2	12	166817	166828	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	205351483
2986	NC_011274	GCA	2	6	166860	166865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351483
2987	NC_011274	T	6	6	166937	166942	0 %	100 %	0 %	0 %	205351483
2988	NC_011274	GAA	2	6	167049	167054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351483
2989	NC_011274	AGA	2	6	167150	167155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351483
2990	NC_011274	CGCTGC	2	12	167156	167167	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	205351483
2991	NC_011274	AAT	2	6	167272	167277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351483
2992	NC_011274	CG	3	6	167280	167285	0 %	0 %	50 %	50 %	205351483
2993	NC_011274	AGA	2	6	167288	167293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351483
2994	NC_011274	GGC	2	6	167323	167328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
2995	NC_011274	GGC	2	6	167371	167376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483
2996	NC_011274	AAT	2	6	167386	167391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351483
2997	NC_011274	AGCGC	2	10	167400	167409	20 %	0 %	40 %	40 %	205351483
2998	NC_011274	AGC	2	6	167466	167471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351483
2999	NC_011274	ATC	2	6	167507	167512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351483
3000	NC_011274	GCG	2	6	167523	167528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351483

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