MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 78970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011274	GGC	2	6	114981	114986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351437
2003	NC_011274	CTGG	2	8	114996	115003	0 %	25 %	50 %	25 %	205351437
2004	NC_011274	TGTC	2	8	115058	115065	0 %	50 %	25 %	25 %	205351437
2005	NC_011274	GCCA	2	8	115066	115073	25 %	0 %	25 %	50 %	205351437
2006	NC_011274	GCG	2	6	115094	115099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351437
2007	NC_011274	CCTG	2	8	115129	115136	0 %	25 %	25 %	50 %	205351437
2008	NC_011274	TAA	2	6	115244	115249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351438
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2011	NC_011274	TGA	2	6	115315	115320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351438
2012	NC_011274	GCA	2	6	115362	115367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351438
2013	NC_011274	TTG	3	9	115405	115413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351438
2014	NC_011274	CG	3	6	115446	115451	0 %	0 %	50 %	50 %	205351438
2015	NC_011274	CGC	2	6	115525	115530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351438
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2018	NC_011274	TGT	2	6	115589	115594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351438
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2020	NC_011274	CTGA	2	8	115708	115715	25 %	25 %	25 %	25 %	205351438
2021	NC_011274	TGCC	2	8	115770	115777	0 %	25 %	25 %	50 %	205351438
2022	NC_011274	TGA	2	6	115785	115790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351438
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2034	NC_011274	AT	3	6	116692	116697	50 %	50 %	0 %	0 %	205351439
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2052	NC_011274	CAGCG	2	10	117616	117625	20 %	0 %	40 %	40 %	205351441
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2054	NC_011274	GC	3	6	117743	117748	0 %	0 %	50 %	50 %	205351441
2055	NC_011274	GCCA	2	8	117750	117757	25 %	0 %	25 %	50 %	205351441
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2059	NC_011274	GCCGG	2	10	117916	117925	0 %	0 %	60 %	40 %	205351441
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2062	NC_011274	CGAGC	2	10	118041	118050	20 %	0 %	40 %	40 %	205351441
2063	NC_011274	TCC	2	6	118087	118092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351441
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2069	NC_011274	GGCG	2	8	118362	118369	0 %	0 %	75 %	25 %	205351441
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2109	NC_011274	CGG	2	6	120285	120290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351442
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2118	NC_011274	TGG	2	6	120720	120725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351442
2119	NC_011274	TCG	2	6	120731	120736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351442
2120	NC_011274	GC	3	6	120761	120766	0 %	0 %	50 %	50 %	205351442
2121	NC_011274	CAATTG	2	12	120792	120803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	205351442
2122	NC_011274	T	7	7	121245	121251	0 %	100 %	0 %	0 %	205351443
2123	NC_011274	ATCG	2	8	121252	121259	25 %	25 %	25 %	25 %	205351443
2124	NC_011274	AT	3	6	121278	121283	50 %	50 %	0 %	0 %	205351443
2125	NC_011274	TAA	3	9	121317	121325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	205351443
2126	NC_011274	TGTC	2	8	121338	121345	0 %	50 %	25 %	25 %	205351443
2127	NC_011274	AT	3	6	121355	121360	50 %	50 %	0 %	0 %	205351443
2128	NC_011274	CCG	2	6	121369	121374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351443
2129	NC_011274	TCA	2	6	121383	121388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351443
2130	NC_011274	GC	3	6	121519	121524	0 %	0 %	50 %	50 %	205351443
2131	NC_011274	ATC	2	6	121555	121560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351443
2132	NC_011274	CTG	2	6	121609	121614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351443
2133	NC_011274	GTT	2	6	121620	121625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	205351443
2134	NC_011274	TAAT	2	8	121643	121650	50 %	50 %	0 %	0 %	205351443
2135	NC_011274	CCG	2	6	121663	121668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351443
2136	NC_011274	TGCC	2	8	121689	121696	0 %	25 %	25 %	50 %	205351443
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2140	NC_011274	CTG	2	6	122120	122125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351444
2141	NC_011274	CGCTGG	2	12	122193	122204	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	205351444
2142	NC_011274	GC	3	6	122247	122252	0 %	0 %	50 %	50 %	205351444
2143	NC_011274	GCG	2	6	122262	122267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351444
2144	NC_011274	CTGG	2	8	122287	122294	0 %	25 %	50 %	25 %	205351444
2145	NC_011274	TAT	2	6	122299	122304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	205351444
2146	NC_011274	CTGG	2	8	122335	122342	0 %	25 %	50 %	25 %	205351444
2147	NC_011274	A	8	8	122384	122391	100 %	0 %	0 %	0 %	205351444
2148	NC_011274	GCT	2	6	122398	122403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351444
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2151	NC_011274	GCT	3	9	122647	122655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351444
2152	NC_011274	TGC	2	6	122667	122672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351444
2153	NC_011274	GGCT	2	8	122684	122691	0 %	25 %	50 %	25 %	205351444
2154	NC_011274	GGC	2	6	122697	122702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351444
2155	NC_011274	GCG	2	6	122793	122798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351444
2156	NC_011274	TGG	2	6	122808	122813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351444
2157	NC_011274	TA	3	6	122841	122846	50 %	50 %	0 %	0 %	205351444
2158	NC_011274	TAG	2	6	122971	122976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351445
2159	NC_011274	TTGCC	2	10	122987	122996	0 %	40 %	20 %	40 %	205351445
2160	NC_011274	CGTC	2	8	123005	123012	0 %	25 %	25 %	50 %	205351445
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2178	NC_011274	AGCAG	2	10	123664	123673	40 %	0 %	40 %	20 %	205351446
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2229	NC_011274	CAGCCC	2	12	125677	125688	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	205351447
2230	NC_011274	CGG	2	6	125764	125769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351447
2231	NC_011274	GCTT	2	8	125778	125785	0 %	50 %	25 %	25 %	205351447
2232	NC_011274	GCC	2	6	125845	125850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351447
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2234	NC_011274	AGTTT	2	10	125894	125903	20 %	60 %	20 %	0 %	205351447
2235	NC_011274	CAG	2	6	125917	125922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351447
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2240	NC_011274	CCA	2	6	126012	126017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	205351447
2241	NC_011274	T	6	6	126052	126057	0 %	100 %	0 %	0 %	205351447
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2357	NC_011274	ATG	2	6	132801	132806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351452
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2365	NC_011274	TCA	2	6	133161	133166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351452
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2367	NC_011274	TGC	2	6	133225	133230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	205351452
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2479	NC_011274	CAT	2	6	141316	141321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351460
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2481	NC_011274	GGT	2	6	141337	141342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	205351460
2482	NC_011274	ACG	2	6	141344	141349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351460
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2485	NC_011274	AGC	2	6	141568	141573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	205351461
2486	NC_011274	GAA	2	6	141602	141607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351461
2487	NC_011274	TCA	2	6	141618	141623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351461
2488	NC_011274	T	7	7	141669	141675	0 %	100 %	0 %	0 %	205351461
2489	NC_011274	CG	3	6	141683	141688	0 %	0 %	50 %	50 %	205351461
2490	NC_011274	ACCG	2	8	141785	141792	25 %	0 %	25 %	50 %	205351461
2491	NC_011274	AAG	2	6	141849	141854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	205351461
2492	NC_011274	CGG	2	6	141865	141870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	205351461
2493	NC_011274	TTTA	2	8	141968	141975	25 %	75 %	0 %	0 %	205351461
2494	NC_011274	GC	3	6	141980	141985	0 %	0 %	50 %	50 %	205351461
2495	NC_011274	A	6	6	142016	142021	100 %	0 %	0 %	0 %	205351461
2496	NC_011274	CGC	2	6	142058	142063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	205351461
2497	NC_011274	TAC	2	6	142064	142069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	205351461
2498	NC_011274	GCGA	2	8	142176	142183	25 %	0 %	50 %	25 %	205351461
2499	NC_011274	TCC	2	6	142226	142231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	205351461
2500	NC_011274	TGA	2	6	142270	142275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	205351461

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